ワーバーグ効果を制御するPKMスプライサー PTB1 …...PKM isoforms...
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赤尾幸博 岐阜大学大学院連合創薬医療情報研究科
創薬科学
ワーバーグ効果を制御するPKMスプライサーPTB1の癌病態への関与
H28.7.24 JST.東京
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SCIENCE 2009
Introduction Warburg effect
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Cancer research, 2010
PTB1 associated miRs
エネルギー代謝機構
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Table 1
PKM isoforms の組織発現
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PKM isoforms のがん細胞における発現
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Tissue PKM1/PKM2 ratio Skeletal muscle 28.49507 Brain 4.530955 Heart 3.38437 F-Brain 1.450338 Spinal cord 0.828757 Testis 0.508398 Uterus 0.298704 Lung 0.235336 Trachea 0.133593 Thymus 0.116841 F-Liver 0.112939 Spleen 0.099795 Stomach 0.08402 Bone marrow 0.064059 Small intestine 0.057837 Colon 0.05469 Liver 0.053422 Kidney 0.049505 Placenta 0.041559
**
** p value < 0.001
PTB1 miR-1,133 miR-9,124,137
PKM2 PKM1
High energy demanded organ Brain, Skeletal muscle, Heart
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miR-1, miR-124, miR-133b
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Eugene, et al. Molecular Cell, 2007 Li-Chun Cheng, et al. Nature neuroscience, 2009
miR-1 miR-133 miR-206
miR-9 miR-124 miR-137
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miR-1, miR-133b Muscle-specific microRNAs
0
2
4
6
8
10
12
14
Rel
ativ
e ex
pres
sion
of
miR
-1/R
NU
6B
***
***
miR-1
0
200
400
600
800
1000
1200
1400
1600
1800
2000
2200
Rel
ativ
e ex
pres
sion
of
miR
-133
b/R
NU
6B
***
miR-133b
***
miR-1 and -133b are muscle-specific microRNAs
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miR-1 and/or -133b were highly expressed in colon tissue except muscle
0
0.5
1
1.5
2
2.5
3
3.5
4
MiR
-1 re
lativ
e ex
pres
sion
/RN
U6B
***
0
2
4
6
8
10
12
14
16
18
MiR
-133
b re
lativ
e ex
pres
sion
/RN
U6B
**
***
miR-1 miR-133b
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0
2
4
6
8
10
12
14
16
MiR
-1 a
nd m
iR-1
33b
rela
tive
ex
pres
sion
/RN
U6B
*** *** *** *** ***
***
***
*
miR-133b miR-1
miR-1 and -133b were frequently down-regulated in clinical colorectal tumor samples and colon cancer cells
The expression of miR-1 and -133b in clinical samples.
Colon cancer cell lines
Colon cancer cell lines
Charactaristic nExpression of
miR-1(↓)case(%)
Expression ofmiR-
133b(↓)case(%)
75 67(89%) 73(97%)
Cancer 51 45(88%) 50(98%)Adenoma 24 22(92%) 23(96%)
Total
Tumor
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n Expression of PTB1 (↑) case (%)
Cancer 25 23(92%)
Adenoma 5 5(100%)
N:Normal T:Tumor
case8 N T
case9 N T
case10 N T
case7 N T
β-actin
case1 N T
PTB1
case4 N T
case5 N T
case6 N T
case2 N T
case3 N T
case19 N T
β-actin
case11 N T
PTB1
case12 N T
case14 N T
case15 N T
case16 N T
case17 N T
case20 N T
PTB1
case21 N T
case22 N T
case23 N T
case24 N T
case25 N T
case26 N T
β-actin
case13 N T
case18 N T
case30 N T
case29 N T
case28 N T
case27 N T
PTB1 was highly expressed in colorectal tumor samples
PTB1
β-actin
Cancer samples
Adenoma samples
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・・・siR-PTB1-1
3340 3’-UTR 107 1780 ORF
ORF: open reading frame 3’-UTR: Three prime untranslated region
212 GCTTCTGCAGCAAACGGAAATGACA
1857 GAAGTGACCTTAGCAGACCAGAGAT
5’ 3’
・・・siR-PTB1-2
We examined the function of PTB1 by gene silencing PTB1
(48 h)
C C
DLD-1 WiDr
PTB1
β-actin
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siR-PTB1 induced growth inhibition in colon cancer cells DLD-1
***
***
0
100
200
300
400
500
600
700
800
24 48 72 96
Viab
le c
ell r
ate
(%) o
f con
trol
h
control
siR-PTB1-1
siR-PTB1-2
*** ***
***
*** ***
***
***
**
**
***
WiDr
Control siR-PTB1-1 siR-PTB1-2
(60h)
Control siR-PTB1-1 siR-PTB1-2
(60h)
0
100
200
300
400
500
600
700
24 48 72 96
Viab
le c
ell r
ate
(%) o
f con
trol
h
control
siR-PTB1-1
siR-PTB1-2
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Control siR-PTB1-2 (5 nM)
siR-PTB1 induced a slight apoptotic cell death
00.5
11.5
22.5
33.5
44.5
5Ap
opto
tic c
ell r
ate
(%) o
f con
trol
***
***
***
DLD-1
C (5 nM)
(48 h) WiDr
C (5 nM)
(48 h)
*** ***
**
00.5
11.5
22.5
33.5
44.5
55.5
66.5
Apop
totic
cel
l rat
e
(%) o
f con
trol
Control siR-PTB1-2 (5 nM)
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siR-PTB1 induced autophagy in colon cancer cells
DLD-1
siR-PTB1-2
WiDr
siR-PTB1-2
C C
LC3I
LC3II
β-actin
DLD-1 WiDr (48 h)
(48 h)
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Autophagy
3MA ULK1
complex
PI3K class Ⅲ
Beclin-1
LC3-1
LC3-2
Lysosome
Fusion
Viab
le c
ell c
ount
Time
Autophasic cell death
Viab
le c
ell c
ount
Time
Autophasic cell survival
Phagopher Autophagosome Autolysosome
Includes cytoplasm or organelle
Breaks down contents
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control siR-PTB1-2
DLD-1 (48 h)
0
20
40
60
80
100
120
Varia
ble
cell
rate
(%) o
f con
trol
*** **
LC3I
LC3II
1 0.73 1.31 1.75
β-actin
control siR-PTB1-2
(48 h)
siR-PTB1 induced an autophagic cell survival in colon cancer cells
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0
10
20
30
40
50
60
70
80
subG1 G0/G1 S G2/M
Cell
cycl
e di
strib
utio
n (%
)
Control
siR-PTB1-1
siR-PTB1-2
*
* **
** *
(48 h) WiDr
0
10
20
30
40
50
60
subG1 G0/G1 S G2/M
Cell
cycl
e di
strib
utio
n (%
)
Control
siR-PTB1-1
siR-PTB1-2
siR-PTB1 induced cell-cycle arrest in colon cancer cells
DLD-1
**
**
**
** **
***
(48 h)
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Pre (0 h) Post (24 h)
siR-PTB1 inhibited cell invasion in colon cancer cells
** **
60
65
70
75
80
85
90
95
100
Wou
nd a
rea
rem
aini
ng (%
)
C siR-PTB1-1 siR-PTB1-2 60
65
70
75
80
85
90
95
100
Wou
nd a
rea
rem
aini
ng (%
)
*** ***
DLD-1 WiDr
Control
siR-PTB1-2
Pre (0 h) Post (24 h)
C siR-PTB1-1 siR-PTB1-2
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E-cadherin
C C
β-actin
DLD-1 WiDr
Down-regulation of E-cadherin contributed to inhibition of cell migration
E-cadherin
(48 h)
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Gl ucose
PEP
Pyruvat e
Lact ate
Gl ucose
PEP
Pyruvat e
Lact ate
Bi osynt hesi s
TCA cycl e
Hi gh act i vi ty
TCA cycl e
Low act i vi ty
Bi osynt hesi s
8 10 11 8 9 11
PKM1 PKM2
Di f f erent i ated Cel l s Tumor Cel l s
ON OFF
PTB1
ROS
miR-1 miR-133b
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siR-PTB1 induced switching PKM isoforms expression from PKM2 to PKM1 and affected the Warburg effect
PKM1
PKM2
Control siR-PTB1-2
Two upper pictures Green:PKM1 , Red:cytoskeleton , Blue:nucleus Two lower pictures Green:PKM2 , Red:cytoskeleton , Blue:nucleus
(48 h)
DLD-1
Western blotting Immunochemistry
(48 h)
C C
DLD-1 WiDr
PTB1
β-actin
PKM1
PKM2
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Gl ucose
PEP
Pyruvat e
Lact ate
Gl ucose
PEP
Pyruvat e
Lact ate
Bi osynt hesi s
TCA cycl e
Hi gh act i vi ty
TCA cycl e
Low act i vi ty
Bi osynt hesi s
8 10 11 8 9 11
PKM1 PKM2
Di f f erent i ated Cel l s Tumor Cel l s
ON OFF
PTB1
ROS
miR-1 miR-133b
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-1500
-1000
-500
0
500
1000
1500
miRs-1 and -133b increased oxidative stress estimated by ESR
Control miR-1
v
miR-133b
v
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NAC canceled a part of apoptosis and autophagy induced by siR-PTB1
(48 h)
DLD-1
PTB1
ROS
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siR-PTB1 significantly decreased Lactate production
(48 h)
C siR-PTB1-2
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-50
0
50
100
150
200
250
300
350
400
450
Tum
or v
olum
e (m
m3 )
系列1
系列2
0 10 12 14 17 19 21 24 days
* ** **
Control
siR-PTB1-2
control
siR-PTB1-2 PKM1
PKM2
β-actin
PTB1
siR-PTB1 topical injection exhibited anti-tumor activity and switched the expression of PKM isoforms in tumor samples in vivo
(24days)
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Gl ucose
PEP
Pyruvat e
Lact ate
Gl ucose
PEP
Pyruvat e
Lact ate
Bi osynt hesi s
TCA cycl e
Hi gh act i vi ty
TCA cycl e
Low act i vi ty
Bi osynt hesi s
8 10 11 8 9 11
PKM1 PKM2
Di f f erent i ated Cel l s Tumor Cel l s
ON OFF
PTB1
ROS
miR-1 miR-133b
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Colorectal Tumor
ROS
PTB1
Autophagy
miR-1 miR-133b Oncogene
Promotion of TCA cycle
PKM1 PKM2
PKM2 PKM1
Promotion of glycolysis
PTB1
miR-1 miR-133b Oncogene
Introduction of miR-1 and -133b
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Conclusion
Inhibition of cell migration
Colorectal Tumor
PTB1 associated miRs (miR-1,124,133b ,…)
Modulate Warburg effects
ROS
PTB1
Apoptosis and/or Autophagy
PTB1
Cell cycle arrest
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① PTB1はがん細胞に比較的高発現していることから 標的分子になり得る。これまでの分子標的薬とは異なり、がんのエネルギー代謝を標的にしていることから代償機構を誘導しにくい。 ② PTB1が高発現のがんにおいてはVEGFを標的にした薬物が
効果的である可能性があり、使用適応のバイオマーカーになる可能性がある。
PTB1を標的にした創薬、バイオマーカーの利点・欠点
新技術の特徴・従来技術との比較
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本技術に関する知的財産権 •発明の名称 :抗がん剤 •出願番号 :特願2014-127560 •出願人 :岐阜大学、シーシーアイ株式会社 •発明者 :赤尾幸博、村瀬博宣
今後の研究 現在、バイオインフォマティックスによるPTB1のRNA-binding 領域と特異的に結合する 低分子化合物候補を検索し、その活性を検証中である。---------共同研究を
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