Facoltà di Medicina e Chirurgia Scuola di Specializzazione in Genetica Medica Dottorato di Ricerca...
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Facoltà di Medicina e ChirurgiaFacoltà di Medicina e ChirurgiaScuola di Specializzazione in GenScuola di Specializzazione in Geneticaetica Medica Medica
Dottorato di Ricerca in Malattie Genetiche dell’EtàDottorato di Ricerca in Malattie Genetiche dell’Età
Centro di Riferimento Regionale per la Diagnosi e Cura delle Malattie Genetiche
Teresa MattinaTeresa Mattina
Università degli Studi di CataniaUniversità degli Studi di Catania
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Integrità del genoma
L’integrità del genoma è fondamentale per la sopravvivenza e la funzione e la riproduzione cellulare.
Anche una singola mutazione può impedire o danneggiare gravemente lo sviluppo di un organismo
![Page 3: Facoltà di Medicina e Chirurgia Scuola di Specializzazione in Genetica Medica Dottorato di Ricerca in Malattie Genetiche dellEtà Centro di Riferimento.](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062701/5542eb67497959361e8d314a/html5/thumbnails/3.jpg)
Nuove mutazioniNuove mutazioni
Frequenza proporzionale alla gravità della patologia
Un terzo delle DMD sono nuove mutazioni
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La cellula possiede meccanismi intrinseci, codificati nel DNA, che le garantiscano la capacità di mantenere l’integrità del genoma riparando i danni del DNA.
Integrità del genomaIntegrità del genoma
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Integrità del genoma
Plasticità del genoma
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Integrità del genomaIntegrità del genoma
Un sistema rigido nel mantenimento della sequenza
del DNA non permette l’evoluzione.
La sopravvivenza delle specie nel lungo periodo
richiede la possibilità di adattamento a nuove
condizioni fisiche e biologiche dell’ambiente
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La cellula possiede meccanismi intrinseci al DNA, che le garantiscano la capacità di adattarsi ai cambiamenti ambientali.
Integrità del genomaIntegrità del genoma
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Mutazioni e selezioneMutazioni e selezione
Il DNA è soggetto fisiologicamente al verificarsi continuo di rimaneggiamenti casuali.
I rimaneggiamenti del DNA vengono continuamente corretti: ciò tutela dell’integrità del genoma, ma consente l’evoluzione.
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Le Mutazioni- la selezioneLe Mutazioni- la selezione
I rimaneggiamenti del DNA che si integrano nel genoma cellulare: mutazioni
comportano danno cellulare vengono selettivamente perduti nelle successive generazioni cellulari.
conferiscono vantaggio cellulare vengono mantenuti nelle successive generazioni cellulari.
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Le Mutazioni- la selezioneLe Mutazioni- la selezione
Mutazioni che causano danno cellulare
•Ridotta o anomala funzione cellulare•Ridotta velocità di replicazione cellulare
•Alterazione delle caratteristiche antigeniche•Generazione di anticorpi•Attivazione dei macrofagi
Morte cellulareInvecchiamento tissutale
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Le Mutazioni- la selezioneLe Mutazioni- la selezione
•Ridotta o anomala funzione cellulare•Aumentata velocità di replicazione cellulare
Mutazioni che conferiscono vantaggio cellulare
•Alterazione delle caratteristiche antigeniche•Generazione di anticorpi•Attivazione dei macrofagi
IperplasiaNeoplasia
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Danno sul DNADanno sul DNA
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MetabolismoCellulare
UV IRAgenti Chimici
Errori diReplicazione
Attivazione dei fattori
trascrizionali
Sistemi di riparo:BER, NER, MMR, HER
Apoptosi
Attivazione dei
Checkpoints
MetabolismoCellulare
UV IRAgenti Chimici
Errori diReplicazione
Attivazione dei fattori
trascrizionali
Sistemi di riparo:BER, NER, MMR, HER
Apoptosi
Attivazione dei
Checkpoints
MetabolismoCellulare
UV IRAgenti Chimici
Errori diReplicazione
MetabolismoCellulare
UV IRAgenti Chimici
Errori diReplicazione
1.1 Danni al genoma umano e attivazione di sistemi di riparo
Attivazione dei fattori
trascrizionali
Sistemi di riparo:BER, NER, MMR, HER
Apoptosi
Attivazione dei
Checkpoints
Attivazione dei fattori
trascrizionali
Sistemi di riparo:BER, NER, MMR, HER
Apoptosi
MetabolismoCellulare
UV IRAgenti Chimici
Errori diReplicazione
MetabolismoCellulare
UV IRAgenti Chimici
Errori diReplicazione
MetabolismoCellulare
UV IRAgenti Chimici
Virus
Attivazione dei fattori
trascrizionali
Sistemi di riparo:BER, NER, MMR, HER
Apoptosi
Attivazione dei
Checkpoints
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Induzione di APOPTOSIInduzione di APOPTOSI
Attivazione sistemi di riparoAttivazione sistemi di riparo
DNA RIPARODNA RIPARO
Arresto ai checkpointsArresto ai checkpoints
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G1 S
G2
M p21ATM
p16ARFpRbp53p21ATM
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MetabolismoCellulare
UV IRAgenti Chimici
Errori diReplicazione
Attivazione dei fattori
trascrizionali
Sistemi di riparo:BER, NER, MMR, HER
Apoptosi
Attivazione dei
Checkpoints
MetabolismoCellulare
UV IRAgenti Chimici
Errori diReplicazione
Attivazione dei fattori
trascrizionali
Sistemi di riparo:BER, NER, MMR, HER
Apoptosi
Attivazione dei
Checkpoints
MetabolismoCellulare
UV IRAgenti Chimici
Errori diReplicazione
MetabolismoCellulare
UV IRAgenti Chimici
Errori diReplicazione
1.1 Danni al genoma umano e attivazione di sistemi di riparo
Attivazione dei fattori
trascrizionali
Sistemi di riparo:BER, NER, MMR, HER
Apoptosi
Attivazione dei
Checkpoints
Attivazione dei fattori
trascrizionali
Sistemi di riparo:BER, NER, MMR, HER
Apoptosi
MetabolismoCellulare
UV IRAgenti Chimici
Errori diReplicazione
MetabolismoCellulare
UV IRAgenti Chimici
Errori diReplicazione
MetabolismoCellulare
UV IRAgenti Chimici
Virus
Attivazione dei fattori
trascrizionali
Sistemi di riparo:BER, NER, MMR, HER
Apoptosi
Attivazione dei
Checkpoints
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MetabolismoCellulare
UV IRAgenti Chimici
Errori diReplicazione
Attivazione dei fattori
trascrizionali
Sistemi di riparo:BER, NER, MMR, HER
Apoptosi
Attivazione dei
Checkpoints
MetabolismoCellulare
UV IRAgenti Chimici
Errori diReplicazione
Attivazione dei fattori
trascrizionali
Sistemi di riparo:BER, NER, MMR, HER
Apoptosi
Attivazione dei
Checkpoints
MetabolismoCellulare
UV IRAgenti Chimici
Errori diReplicazione
MetabolismoCellulare
UV IRAgenti Chimici
Errori diReplicazione
1.1 Danni al genoma umano e attivazione di sistemi di riparo
Attivazione dei fattori
trascrizionali
Sistemi di riparo:BER, NER, MMR, HER
Apoptosi
Attivazione dei
Checkpoints
Attivazione dei fattori
trascrizionali
Sistemi di riparo:BER, NER, MMR, HER
Apoptosi
MetabolismoCellulare
UV IRAgenti Chimici
Errori diReplicazione
MetabolismoCellulare
UV IRAgenti Chimici
Errori diReplicazione
MetabolismoCellulare
UV IRAgenti Chimici
Virus
Attivazione dei fattori
trascrizionali
Sistemi di riparo:BER, NER, MMR, HER
Apoptosi
Attivazione dei
CheckpointsAnomalie della riparazione del DNA
Esposizione ad agenti mutageni
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DNA RIPARODNA RIPARO
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Difetti del DNA RIPARODifetti del DNA RIPARO
Invecchiamento precoce dei tessuti a rapida proliferazione – Cute– Mucose– Linfociti
Degenerazione tessuti – SNC
Neoplasie
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Difetti del DNA RIPARO Difetti del DNA RIPARO S. BloomS. Bloom
![Page 22: Facoltà di Medicina e Chirurgia Scuola di Specializzazione in Genetica Medica Dottorato di Ricerca in Malattie Genetiche dellEtà Centro di Riferimento.](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062701/5542eb67497959361e8d314a/html5/thumbnails/22.jpg)
Acrosteolisi?Acrosteolisi?
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Atassia telangectasiaAtassia telangectasia
![Page 24: Facoltà di Medicina e Chirurgia Scuola di Specializzazione in Genetica Medica Dottorato di Ricerca in Malattie Genetiche dellEtà Centro di Riferimento.](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062701/5542eb67497959361e8d314a/html5/thumbnails/24.jpg)
Metodi di studioMetodi di studio
Studio di crescita clonale
Studio dei cromosomi
Studio dei micronuclei
COMET
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Metodi di studio cromosomicoMetodi di studio cromosomico
Ricerca delle rotture cromosomiche/cromatidiche spontanee
Ricerca delle rotture cromosomiche/cromatidiche indotte
Analisi degli scambi fra cromatidi fratelli SCE
Analisi citogenetica costituzionale Studio cromosomico del tessuto neoplastico
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Metodi di studio cromosomicoMetodi di studio cromosomico
Ricerca delle rotture cromosomiche/cromatidiche spontanee o indotte su 100 metafasi
Indice mitoticoPercentuale di cellule con rotture Numero di rotture per cellula
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Metodi di studio cromosomicoMetodi di studio cromosomico
Ricerca delle rotture cromosomiche/cromatidiche spontanee o indotte su 100 metafasi
Conta delle rotture per cellulaNumero di rotture/100
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Conta delle rotture per cellulaConta delle rotture per cellulaPercentuale di cellule con rotturePercentuale di cellule con rotture
![Page 29: Facoltà di Medicina e Chirurgia Scuola di Specializzazione in Genetica Medica Dottorato di Ricerca in Malattie Genetiche dellEtà Centro di Riferimento.](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062701/5542eb67497959361e8d314a/html5/thumbnails/29.jpg)
Conta delle rotture per cellulaConta delle rotture per cellulaPercentuale di cellule con rotturePercentuale di cellule con rotture
Conta delle rotture per cellulaConta delle rotture per cellulaPercentuale di cellule con rotturePercentuale di cellule con rotture
![Page 30: Facoltà di Medicina e Chirurgia Scuola di Specializzazione in Genetica Medica Dottorato di Ricerca in Malattie Genetiche dellEtà Centro di Riferimento.](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062701/5542eb67497959361e8d314a/html5/thumbnails/30.jpg)
Conta delle rotture per cellulaConta delle rotture per cellulaPercentuale di cellule con rotturePercentuale di cellule con rotture
Conta delle rotture per cellulaConta delle rotture per cellulaPercentuale di cellule con rotturePercentuale di cellule con rotture
![Page 31: Facoltà di Medicina e Chirurgia Scuola di Specializzazione in Genetica Medica Dottorato di Ricerca in Malattie Genetiche dellEtà Centro di Riferimento.](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062701/5542eb67497959361e8d314a/html5/thumbnails/31.jpg)
Tipo di danno cellulareTipo di danno cellulare
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25
CGG-CGG-CGG-CGG
CGG-CGG-CGG-CGGCGG-CGG-CGG
CGG-CGG- CGG-CGG-CGG
![Page 33: Facoltà di Medicina e Chirurgia Scuola di Specializzazione in Genetica Medica Dottorato di Ricerca in Malattie Genetiche dellEtà Centro di Riferimento.](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062701/5542eb67497959361e8d314a/html5/thumbnails/33.jpg)
SCESCE
![Page 34: Facoltà di Medicina e Chirurgia Scuola di Specializzazione in Genetica Medica Dottorato di Ricerca in Malattie Genetiche dellEtà Centro di Riferimento.](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062701/5542eb67497959361e8d314a/html5/thumbnails/34.jpg)
SCESCE
![Page 35: Facoltà di Medicina e Chirurgia Scuola di Specializzazione in Genetica Medica Dottorato di Ricerca in Malattie Genetiche dellEtà Centro di Riferimento.](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062701/5542eb67497959361e8d314a/html5/thumbnails/35.jpg)
SCE Ciclo cellulare SCE Ciclo cellulare
I divisione II divisione III divisione
![Page 36: Facoltà di Medicina e Chirurgia Scuola di Specializzazione in Genetica Medica Dottorato di Ricerca in Malattie Genetiche dellEtà Centro di Riferimento.](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062701/5542eb67497959361e8d314a/html5/thumbnails/36.jpg)
SCESCE
![Page 37: Facoltà di Medicina e Chirurgia Scuola di Specializzazione in Genetica Medica Dottorato di Ricerca in Malattie Genetiche dellEtà Centro di Riferimento.](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062701/5542eb67497959361e8d314a/html5/thumbnails/37.jpg)
Tipo di danno cellulare
25
![Page 38: Facoltà di Medicina e Chirurgia Scuola di Specializzazione in Genetica Medica Dottorato di Ricerca in Malattie Genetiche dellEtà Centro di Riferimento.](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062701/5542eb67497959361e8d314a/html5/thumbnails/38.jpg)
Metodi di studio cromosomico
SCE normali
SCE aumentati
Rotture normali
Rotture aumentate
Analisi degli scambi fra cromatidi fratelli SCE
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Metodi di studio cromosomico
Analisi citogenetica costituzionale Studio cromosomico del tessuto
neoplastico
![Page 40: Facoltà di Medicina e Chirurgia Scuola di Specializzazione in Genetica Medica Dottorato di Ricerca in Malattie Genetiche dellEtà Centro di Riferimento.](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062701/5542eb67497959361e8d314a/html5/thumbnails/40.jpg)
Cariotipo standard
![Page 41: Facoltà di Medicina e Chirurgia Scuola di Specializzazione in Genetica Medica Dottorato di Ricerca in Malattie Genetiche dellEtà Centro di Riferimento.](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062701/5542eb67497959361e8d314a/html5/thumbnails/41.jpg)
Riarrangiamenti clonali clonali
![Page 42: Facoltà di Medicina e Chirurgia Scuola di Specializzazione in Genetica Medica Dottorato di Ricerca in Malattie Genetiche dellEtà Centro di Riferimento.](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062701/5542eb67497959361e8d314a/html5/thumbnails/42.jpg)
FISHFISH
•Denaturazione
•Scelta della sonda
•Ibridazione
•Lettura
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SONDE FISHSONDE FISH
YacYac: 100-150kb-2Mb BacBac: fino a 330kb di DNA CosmidiCosmidi: fino a 40kb di DNA FagiFagi: fino a 14-15kb di DNA PlasmidiPlasmidi: fino a 4-5kb di DNA
![Page 44: Facoltà di Medicina e Chirurgia Scuola di Specializzazione in Genetica Medica Dottorato di Ricerca in Malattie Genetiche dellEtà Centro di Riferimento.](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062701/5542eb67497959361e8d314a/html5/thumbnails/44.jpg)
Painting:identificare
materiale da uno specifico cromosoma
Sonde per FISHSonde per FISH
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FISHFISH
![Page 46: Facoltà di Medicina e Chirurgia Scuola di Specializzazione in Genetica Medica Dottorato di Ricerca in Malattie Genetiche dellEtà Centro di Riferimento.](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062701/5542eb67497959361e8d314a/html5/thumbnails/46.jpg)
M-FISH• Immagini catturate separatamente per
ciascun fluorocromo utilizzando filtri ottici modificati
• Immagini elaborate da uno specifico software
![Page 47: Facoltà di Medicina e Chirurgia Scuola di Specializzazione in Genetica Medica Dottorato di Ricerca in Malattie Genetiche dellEtà Centro di Riferimento.](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062701/5542eb67497959361e8d314a/html5/thumbnails/47.jpg)
SKY• Acquisizione delle
immagini: microscopio ad epifluorescenza, immagini charge-coupled device (CCD) e spettroscopio Fourier
• Misurazione dell’intera emissione dello spettro con una singola esposizione di tutte le immagini
![Page 48: Facoltà di Medicina e Chirurgia Scuola di Specializzazione in Genetica Medica Dottorato di Ricerca in Malattie Genetiche dellEtà Centro di Riferimento.](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062701/5542eb67497959361e8d314a/html5/thumbnails/48.jpg)
SKY-M-FISHSono particolarmente utili per:
• Evidenziare traslocazioni
• Identificare marker cromosomici, regioni colorate in modo omogeneo, duplicazioni cromosomiche
• Individuare alcuni riarrangiamenti complessi
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Array CGH
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Array CGH
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M-CGH
Array-CGH
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Metodi di studioMetodi di studio
Studio dei micronuclei
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Metodi di studio cromosomicoMetodi di studio cromosomico
COMET
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Cellule inglobate in agarosio su vetrino
Lisi delle cellule in situ
Elettroforesi su vetrini
Colorazione del DNA
Analisi con microscopio a fluorescenza
Diametro della testa circa 40 m
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Strumentazione per l’analisi del danno al Strumentazione per l’analisi del danno al DNA medianteDNA mediante
COMET ASSAYCOMET ASSAY
Microscopio a fluorescenzacollegato con il computer
che analizza i risultati tramite software opportuno
A: Esempio di “cometa”B: Cellula con DNA integro
A
B
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![Page 57: Facoltà di Medicina e Chirurgia Scuola di Specializzazione in Genetica Medica Dottorato di Ricerca in Malattie Genetiche dellEtà Centro di Riferimento.](https://reader035.fdocument.pub/reader035/viewer/2022062701/5542eb67497959361e8d314a/html5/thumbnails/57.jpg)
Studi genotossiciRiparazione del DNAAnalisi di apoptosiBiologia dei radicali liberiTossicologia alimentareBiomonitoraggiIndagini clinicheAnalisi del ciclo cellulare
VERSIONE ALCALINA
VERSIONE NEUTRA
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0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
7000
8000
TEMPO 0 TEMPO 1 TEMPO 2 TEMPO 3 TEMPO 4
A
B
C
D
CTRL
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DNA in equilibrioDNA in equilibrio
Predisposizione Genetica
• Checkpoint• Enzimi del DNA riparo• Metabolismo
Fattori ambientali
• Metabolismo cellulare• Agenti fisici UV, RI, • Agenti chimici: ossidanti,
benzene, fumo di sigaretta, caffè, farmaci
• Virus• Carenze vitaminiche (vit. C,
acido folico)
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Genotipo
Fenotipo
DNAReplicazio
neTrascrizione
Traduzione
Riparo
Recettori
Proteine
RNA
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ROMA (ANSA 11.05.06) - Sono circa 14.000 l'anno i casi stimati di tumore tra gli adolescenti e i giovani adulti (tra 15 e 39 anni) in Italia, ……..………….crescono i tumori in qualche modo legati ai cattivi stili di vita, a partire dal fumo di sigaretta e la mania per l'abbronzatura.
Fattori ambientaliFattori ambientali