PubMed 활용

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1. NCBI Database

• PubMed

• PubMed Central : Open Access Journal (free)

• Bookself : 단행본 정보와 일부 원문 제공

• GenBank : NIH 유전자 서열 Database로 DNA 서열 정보 제공

• PubMed Health : Clinical effectiveness research 제공

• OMIM : 유전자와 유전자 표현형 정보 제공

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2. PubMed

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미국 국립의학도서관에서 1996년에 서비스 시작된 의학분야 최고의 Database

medicine, nursing, dentistry, veterinary medicine, health care systems, and preclinical sciences.

1947~65년 16,000건, 1966년 이후 2,800만 건 이상의 Citation

Adds citations Tuesday through Saturday E-Journal 원문과 연결

- 480개 정도의 원문 Database와 출판사에서 약 8,511 여종 원문 제

공(2018.02)

- 2010년 4월부터는 NCBI Bookshelf에서 제공하는 Book도 검색 가능

3. 우리도서관 PubMed

우리도서관에서 E-J을 구독해서 원문을 바로 볼 수 있는 경우

의료원 내에서만 이용 가능

우리도서관에서 구독하는 E-J 연결 뿐만 아니라 다양한 링크정보 제공

Full text 연결 Link, Print J 소장 정보, 원문복사신청,

SCIE 등재된 경우 다른 논문 검색 기능,

JCR impact factor 값 확인

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4. PubMed Searching

• Keywords 첫 검색 창에 검색어를 넣어서 검색하는 방법으로 가장 기본적인 방법

• Author Advanced에서 Author를 선택해서 검색

• Journal

Advanced에서 journal을 선택해서 검색

• 주제어 MeSH(Medical Subject Heading) 검색

주제어의 상하 개념을 확인할 수 있고 subheading을 지정하여 검색

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Keywords 검색 (1)

1. AND, OR, NOT 검색 • lung AND cancer : lung과 cancer가 모두 포함된 논문 검색

• lung OR cancer: lung이나 cancer 둘 중 하나만 포함되어 있으면 검색

• lung NOT cancer: lung 검색 결과에서 cancer가 포함된 논문은 제외

2. Phrase 검색

단어 구로 검색하기 위해서는 “ “ 사이에 구를 입력

3. Nesting 검색 ( )가 있으면 우선 검색

Keywords 검색 (2)

4. Truncation

절단 검색을 원할 때는 *를 사용하여 검색

예: child* (child, children, childhood 등)

5. Stopwords

6. Field Tag 이용 검색

[ ]에 Tag 약어를 넣어 검색. 해당 field에 제한하여 검색 가능

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5. Filters

1. Article Type : Publication types

2. Text availability

3. PubMed Commons

4. Publication Dates

5. Species: Humans / Other animals

6. Journal Categories : Core clinical, Dental, Nursing Journal

5. Additional filter

Languages

Sex

Subjects

Ages

Search Fields 10

6. Advanced Search

• Search Builder

- 특정 field로 제한, 결합 검색

- keyword 입력 시 index 기능이 있어서 용어 선택 시 도움이 됨

• Search History

- 검색했던 검색 기록을 확인 (100개 까지)

- Inactivity 8시간 후 삭제됨

- 이전 검색 질의어의 결합 검색이 가능

- My NCBI에 저장하여 활용

- Clear History (삭제 기능)

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7. Documents (1)

검색된 결과 논문을 보는 형식을 지정 가능

1. Format : Summary, Abstract, MEDLINE, XML

2. Sort by : 논문 배열 순서 설정

Most Recent, Best Match, Publication Date, First Author,

Last Author, Journal, Title

3. Items per Page : 페이지당 보여지는 논문 수 설정

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1. Similar Articles 관련 문헌으로 재 검색

2. Results by Year - 검색 결과에서 오른쪽 상단에 Result by Year 그래프

- 검색어의 년도 별 논문 수를 한눈에 파악할 수 있으며, 마우스를 그래프 위에 올리면 년도 별 논문 수를 확인

3. PMC Images Search 검색된 논문이 PMC에 수록되어 있을 때에는 그 논문에 실려있는 이미지를 볼 수 있다. 이미지는 PMC에 등재된 Journal만 가능

4. Cited by # PubMed Central articles 검색 논문 중 PMC 논문에서 1회 이상 인용된 논문이면 상세검색 결과화면에서 해당 논문을 인용한 논문을 검색 (#: 인용된 횟수)

5. PubMed Identifier (PMID)

7. Documents (2)

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8. Clipboard

• 특정 논문을 선택해서 모아둘 수 있음

• 이 화면에서 Save를 실행

• 500개의 논문까지 저장 가능

- 단 inactivity 8시간 후 삭제됨

• My NCBI에 저장 가능 (Save Collection)

• Remove from Clipboard (선택한 논문 삭제)

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9. More Resources

1. MeSH Database

2. Journals Database

3. Clinical Trials

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10. PubMed Tools

1. Single Citation Matcher

2. Batch Citation Matcher

3. Clinical Queries

4. Topic Specific Queries

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11. My NCBI

1. Register ID를 등록한 후 사용 가능하므로 처음 이용 시에는 NCBI에 ID 신청

2. My Bibliography 자신의 논문을 관리

3. Recent Activity 최근 6개월간 PubMed에서 실행한 검색 기록 확인

4. Save Search

5. Collections

6. NCBI site Preferences 1) Account settings: e-mail 주소, password 2) Common Preferences : Links Display, Highlighting

3) PubMed Preferences : Result Display Settings

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My NCBI

• Register

1. 신청양식을 작성 (Register account)

2. 신청서에 입력한 메일에 가서 NCBI에서 보낸 메일 확인 My NCBI automatic updates confirmation 에서 연결된 주소 방문

3. Keep me signed in : PubMed 연결 시 항상 My NCBI에 자동으로

로그인 되도록 설정하는 기능

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1. My Bibliography

• 자신의 논문을 입력하고 관리

• 논문 설정 private / Public : settings

연세대학교의학도서관 19

* Add citation ① Add from PubMed : PubMed 수록 논문인 경우 저자명으로 검색 ② Add manually : PubMed 수록 논문이 아닌 경우 ③ Upload a file : MEDLINE format으로 반입

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1. This bibliography is private (make it public)

Public settings 시 My Bibliography 페이지를 볼 수 있는 URL 형성

2. Edit settings for My Bibliography

3. Save My Bibliography to a text (MEDLINE format)

서지관리 도구 프로그램으로 반입 가능

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1. This bibliography is private (make it public)

Public settings 시 My Bibliography 페이지를 볼 수 있는 URL 형성

My Bibliography : Related article 정보 제공 (매주 update)

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2. Saved Searches (1)

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• 관심 keywords를 등록해놓고, PubMed에서 해당 검색어 결과가 Update되면 계정으로 알려주는 기능 (메일 alert 가능)

2. Saved Searches (2)

1. 검색 결과 화면 검색창 하단에 Create alert 링크가 생성

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새로운 검색 결과를 e-mail로 자동으로 받도록 기간, format, 최소 items 수 설정 후 Save

2. Saved Searches (3)

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2. Create Alert (4)

2. Advances Search > Search History에 입력된 검색어에 왼쪽 마우스를 클릭하면 option 메뉴가 생성 --> Save in My NCBI를 선택하면 저장 입력창이 생성 --> 저장할 이름을 지정하고 save setting

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4) Collections (1)

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* Type 1. My Bibliography / Other Citation 2. PubMed PubMed 검색 결과를 My NCBI에 저장 저장된 논문을 Private / Public setting 가능 (블로그 등에 논문을 올릴 때 자동으로 URL을 생성)

4) Collections (2)

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1. PubMed 검색 결과에서 저장하고 싶은 논문을 선택한 후 Clipboard에 저장

2. Clipboard 선택 --> send to > Collections 선택

3. Add to Collections

1. 새로운 collection 생성, 기존 collection에 추가할 것인지 선택

2. Save

4) Collections (3)

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4) Collections (4)

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• 저장한 collection을 sharing : collection에 저장된 논문만 보이는 URL을 생성

4) Collections (5)

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4) Collections (6)

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4. Filters (1)

• PubMed 검색 결과에서 특정 검색어나 Limit, 결합 검색을 원하는 경우 Filter로 등록해 놓으면 검색 결과를 바로 확인 가능

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4. Filters (2)

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4. Filters (3)

1. My Filters

자신이 설정해놓은 filter 확인

15개까지 설정 가능

2. Custom Filters

자신이 등록하고 싶은 filter를 직접 등록하고 싶을 때

3. Browse / Search for PubMed Filters

Filter를 검색 해서 바로 등록

Category : Popular, Linkout, Properties, Links

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4. Filters (4)

. Custom Filters 설정

Filter 명 지정 -->Query terms 에 검색식 입력

4. Filters (5)

1. Category > Popular

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2. Category > Linkout

4. Filters (6)

3. Category > Properties

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4. Category > Links

5. Preferences

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Pubmed Central (1)

• http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/

• NLM에서 제공하는 생의학 및 생명과학 학술지의 무료 아카이브. 2000년 2월 PubMed Central로 서비스 시작 현재 PMC라는 명칭으로 2016년 9월 기준 3,905종 학술지 제공

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Medline Plus

• NLM에서 일반인을 위해 제공하는 의학 Database

• 증상별, 질병별 topic, 약품 정보, 의학 이미지, 의학용어 사전, 최신 뉴스, 인명 정보, 병원 주소 등 다양한 정보 모음

• http://medlineplus.gov/

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PubMed Health

• NLM에서 제공하는 DB로 질병과 건강, 질환 등에 관한 예방과 치료 정보 제공

• Clinical effectiveness research finds answers to the question “What works?” in medical and health care

• clinical trials의 systematic reviews를 기반으로 제공

• http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmedhealth/

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1.Reference에서 찾은 논문을 보고 싶어요!

2. SR 논문만 찾고 싶어요 !

• PubMed Clinical Queries

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/clinical

• PubMed Health

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmedhealth/

PubMed Clinical Queries

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3. Impact Factor를 확인하고 싶어요 !

1.

2. Chrome 사용

4. Chrome 활용 – 확장 프로그램 추가

1. The paper link for PubMed

: Impact factor, Peak

2. Lazy Scholar : Impact factor, Wos 인용횟수 등

3. Eigenfactorizer

: Journal Influence 정보 등

감사합니다.

김나원 nwkim@yuhs.ac (82915)