dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

69
dsDNA

  • date post

    22-Dec-2015

  • Category

    Documents

  • view

    220

  • download

    0

Transcript of dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

Page 1: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

dsDNA

Page 2: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

כיווניותפוספו קשר

A:T and G:C

= 10-10

Page 3: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

basepairingזיווגי בסיסים - בסיס

משלים

Page 4: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

שאלת תירגול: מדוע בחרת ללמוד רפואה

. אני מעוניין לעזור לאנושות1•

. הנושא מעניין2•

. קידום אישי3•

. המשפחה לחצה4•

שניות לענות תשובה!30יש לך •

Page 5: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

And Denaturationורנטורציה דנטורציה

Page 6: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.
Page 7: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.
Page 8: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

של ורנטורציה DNAדנטורציה

Page 9: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

דנטורציה

Page 10: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.
Page 11: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

ספקטרופוטומטר

Glass cell filled with concentration of solution (C)

IILight

0

Page 12: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

DNA Denatures at High Temperatures

Page 13: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.
Page 14: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

טרליון זווגי בסיסים, לעומתו 3שאלה: אורך הגנום ההומני הוא מליון זיווגי בסיסים. 1.5הוא e. coli aאורך הגנום של חיידק ה- ולעומתו GC זיווגי בסיסים של 47%הגנום ההומני מורכב מ-

יותר Tm. למי טמפרטורת GC של 52%הגנום של החיידק בעל גבוה?

. לאדם1•

. לחיידק2•

. אין מספיק מידע3•

זההTm. לשניהם 4•

Page 15: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

רנטורציה

Page 16: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

Less complex DNA renatures fasterDNA 1 DNA 2 DNA 3

ab

cdefghijklmnopqrstuv

izyajczkblqfreighttrainrunninsofastelizabethcottonqwftzxvbifyoudontbelieveimleavingyoujustcountthedaysimgonerxcvwpowentdowntothecrossroadstriedtocatchariderobertjohnsonpzvmwcomeonhomeintomykitchentrad

ab ab ab ab

ab ab ab ab ab

ab ab ab ab ab

ab ab ab ab ab

ab ab ab ab ab

ab ab ab ab ab

ab ab ab ab ab

ab ab ab ab ab

etc.

cdefghijklmnopqrstuv

cdefghijklmnopqrstuv

cdefghijklmnopqrstuv

Molar concentration of each sequence:150 microM 15 microM 1.5 microM

For an equal mass/vol:

Page 17: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.
Page 18: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

Census of human repeats

IHGSC. Nature (2001) 409 860-921

Over 40% of the human genome corresponds to interspersed repeats

Page 19: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

Types of DNA in each kinetic componentHuman genomic DNA: kinetic components and classes of sequences

0

0.25

0.50

0.75

1.00

fra

ctio

n r

ea

sso

cia

ted

10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 102 3 410-1-2-3-4-5-6 510

About a million copies of Alu repeats, each 0.3 kb

About 50,000 copies of L1 repeats (0.2 to 7 kb in length), plus 1000 to 10,000 copies of at least 10 other familes of interspersed middle repetitive DNA (e.g. THE LTR repeats)

Thousands of copies of rRNA genes

About 50,000 to 100,000 "single copy" genes

C to

"Foldback"

Human genomic DNA

Page 20: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

פטריות

30-40,000 genes

אצות

Page 21: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.
Page 22: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.
Page 23: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

מבנה הכרומוזום בשלב חלוקת התא

גן – אזור ב-ד.נ.א מימנו מתורגמת מולקולת ר.נ.א בעלת פעילות ביולוגית

Gene 3

Page 24: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

אינטרונים – רצפים שמוסרים

בגרעין ולא נשארים

במולקולת הרנא הבוגר

אקסונים – רצפים

שנשארים במולקולת הרנא

הבשלה

אינטרונים נמצאים רק באוקריוטים

Page 25: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

פרומוטר אקסון

אינטרון

רצף – שנשאר ברנא לאחר העיבוד ועובר לציטופלזמהאקסוןרצף – המוסר מהרנא בגרעיןאינטרון

Page 26: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.
Page 27: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

מהם הכרומוזומים?

. אתרי עיגון של הדנא בגרעין1•

. מבנה הגרעין2•

. מיכלי אריזה של הדנא3•

. מיכלי אריזה של החלבונים4•

Page 28: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.
Page 29: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

2.91 billion base pairs

24,000 protein coding genes

(~32,000 non-coding genes)

1.5% exons (127 nucleotides)

24% introns (~3,000 nucleotides)

75% intergenic (no genes)

Average size of a gene is 27,894 bases

Contains an average of 8.8 exons

Titin contains 234 exons.

Human genome

Page 30: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

We humans are 99.9% identical at the DNA sequence level

• There are still ~3 million nucleotide differences among us called SNPs (60,000 within the exons)---that presumably account for differences in disease susceptibility, drug responses, etc.

• Polymorphic variation between and within populations

• Implications for concepts of “race,” “individuality”

Page 31: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

24,000

Page 32: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.
Page 33: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.
Page 34: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

MOLECULAR BIOLOGY OF THE DISEASE

Duchenne Muscular Dystrophy is one of more than twenty different types of muscular dystrophy. The Duchenne type affects only boys and is known to result from a defect in a single important protein in muscle fibers called Dystrophin. The muscle fiber will break down if the Dystrophin is missing and is unable to function properly. As a result, the reduction in the number of good muscle fibers and the whole muscle becomes weak.

Duchenne Muscular Dystrophy

שרירים ניוון

Page 35: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

כמה מחלות גנטיות יכולות להיות?

100. לא יותר מ-1•

מחלות1000. כ-2•

מחלות10000. כ-3•

. כמספר הגנים.4•

Page 36: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.
Page 37: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.
Page 38: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

Chromatin PackingCondensin plays important roles

Page 39: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.
Page 40: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

Histone היסטונים

Page 41: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

HDAC

HAT

HDAC activity

Page 42: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

הנוקלאוזום מבנה

ביטחון סיכת

Page 43: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

Nucleosome StructuresHistone octamer

2 H2A2 H2B2 H32 H4

Page 44: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

Histones binding to DNA

Page 45: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

The bending of DNA in a nucleosome1. Flexibility of DNAs: A-T riched minor groove inside and G-C

riched groove outside2. DNA bound protein can also help

Page 46: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

Structural Organization of the Core Histones

Page 47: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

The Assembly of the Core Histones

Page 48: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

Notice the long tails of the octamer

מה המשמעות של זנבות ההיסטונים?

Page 49: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

H2A H2B

H3 H4

Page 50: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

The function of Histone tails

Page 51: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

Covalent Modification of core histone tails

Acetylation of lysines (K)Mythylation of lysines

Phosphorylation of serines (S)

Histone acetyl transferase (HAT)

Histone deacetylase (HDAC)

Acetylation

Mythylation

HDAC activity

אפיגנטיקה

Page 52: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

שאלה: איזה מבין ההיסטונים עובר ?הכי הרבה מודיפיקציות

1. H2a

2. H2b

3. H3

4. H4

Page 53: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.
Page 54: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

Zigzag model of the 30-nm chromatin fiber

Page 55: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

לסלנואיד מנוקלאוזום

solenoid

Page 56: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

המטפזי בשלב הכרומוזום מבנה

Page 57: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

ה אריזת DNAאופןמהנוקלאוזום: בתא

לכרומוזום.

Page 58: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

Histon assembly movie

DNA to chromatin

Page 59: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

4Penicillin mold46Human

32Yeast42Macaque

40Mouse

38Cat

48Potato26Frog

20Algae16Planaria

20Corn8Fruit fly

SpeciesSpecies

Total number of chromosomes/somatic (body) cell

Dog 78

There is no connection between the number of chromosomes and the genome size, gene content, or any other feature of genomes. It is and essentially independent characteristic.

Page 60: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

Smallest number of chromosomes known in a eukaryote:1 pair (2 total per somatic cell)

Myrmecia pilosula

Page 61: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

Largest number of chromosomes known in a eukaryote:630 pairs (1260 total per somatic cell)

Ophioglossum reticulatum, a fern

Page 62: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

Chromatine compartment

Page 63: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

Cockayne syndrome group B (CSB) cells that fail to express CSB protein which causes profound neurological and developmental defects

ה DAPIצביעת לגן- DNAשל סמן (נקודה לבנה)עם

Page 64: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

Chromosomal fragile sites are loci that are especially prone to forming gaps or breaks on metaphase chromosomes when cells are cultured under conditions that inhibit DNA replication or repair. The relationship of "rare" folate sensitive fragile sites with (CCG)n expansion and, in some cases,

genetic disease is well established .

Page 65: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

Fragile X syndrome

What is Fragile X syndrome?  Fragile X syndrome is the most common inherited cause of mental impairment, affecting approximately 1 in 2,000 males

and 1 in 4,000 females worldwide . Cytogenetic analysis of metaphase spreads demonstrates the presence of the fragile

site in less than 60% of cells in most affected individuals .(.In 1991, the fragile X gene (FMR1) was characterized and found to contain a tandem repeated trinucleotide sequence (CGG) near its 5' end. The mutation responsible for fragile X syndrome involves expansion of this repeat segment. The number of CGG repeats in the FMR1 genes of the normal population varies from six to approximately 50. There are two main categories of mutation, premutations of approximately 50 to 200 repeats and full mutations of more than approximately 200 repeats. There is no clear boundary between the upper limit of normal and the lower limit of the premutation range. For this reason, alleles with approximately 45-55 copies of the repeat are said to be in the "grey zone." Some alleles in this size range are unstable and expand from generation to generation, while others are stably inherited. A premutation is susceptible to expansion after passage through a female meiosis. The larger the size of a woman's

premutation, the more the risk of expansion to a full mutation in her offspring ..  

Page 66: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.
Page 67: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

Mitosis animation

Page 68: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.
Page 69: dsDNA כיווניות קשר פוספו A:T and G:C = 10 -10.

J A:t -rpantheon.ufrj.br/bitstream/11422/3510/1/162349.pdf · existentes para cãlculo da capacidade de carga, e com os obti dos atravês de um programa desenvolvido que utiliza a

J A:t -rpantheon.ufrj.br/bitstream/11422/3510/1/162349.pdf · existentes para cãlculo da capacidade de carga, e com os obti dos atravês de um programa desenvolvido que utiliza a

סמינריון בנושא : משפחת הלופיים - ARACEAE שאלת המחקר : האם קיים קשר בין יצירת חום במינים

סמינריון בנושא : משפחת הלופיים - ARACEAE שאלת המחקר : האם קיים קשר בין יצירת חום במינים

קשר רב דורי

קשר רב דורי

פתרונות קשר מבית מוטורולה

פתרונות קשר מבית מוטורולה

€¦ · Web viewאיך 3.א. מיפוי ויצירת ה קשר ה ראשוני 5 3.ב. פגישות עבודה שוטפות 7 3.ג. הכשרה לצוות השכיר בארגון

€¦ · Web viewאיך 3.א. מיפוי ויצירת ה קשר ה ראשוני 5 3.ב. פגישות עבודה שוטפות 7 3.ג. הכשרה לצוות השכיר בארגון

J@!!;C9F ABC;D$;C$E;FD;9GF;H;FCD$9H5IECBFC;D //89:)*+..+;2$ ))afirse.ie.ul.pt/wp-content/uploads/2014/06/AFIRSE... · .j\m>nb>ef=?):ce)b?:)a@>efab:)a@\c:?e:)g>?c)e=bc) n:c)g=9>f?:c)g:)nj>hefmfe\)lb9>f?:u)g)e@>m:@c)g:c)

J@!!;C9F ABC;D$;C$E;FD;9GF;H;FCD$9H5IECBFC;D //89:)*+..+;2$ ))afirse.ie.ul.pt/wp-content/uploads/2014/06/AFIRSE... · .j\m>nb>ef=?):ce)b?:)a@>efab:)a@\c:?e:)g>?c)e=bc) n:c)g=9>f?:c)g:)nj>hefmfe\)lb9>f?:u)g)e@>m:@c)g:c)

AULA 13 FProbabilidades e · Eventos certo, impossível e ... 9. (G:C) A prefeitura de Rio Claro, município de São ... (UFPE-CTG) Em um grupo de cinco torcedores, três

AULA 13 FProbabilidades e · Eventos certo, impossível e ... 9. (G:C) A prefeitura de Rio Claro, município de São ... (UFPE-CTG) Em um grupo de cinco torcedores, três

UNIV::II:113IDADi5 FEDTI:R.t'l.L DI~ BAHIA DŒl)A:t~T::~iEl~horizon.documentation.ird.fr/exl-doc/pleins_textes/divers16-03/... · das em pequenos fragBentos e ma.is ou menos transformados

UNIV::II:113IDADi5 FEDTI:R.t'l.L DI~ BAHIA DŒl)A:t~T::~iEl~horizon.documentation.ird.fr/exl-doc/pleins_textes/divers16-03/... · das em pequenos fragBentos e ma.is ou menos transformados

ÅV iÅyc*Š gzZVz zÆh+].q- - Islam Ahmadiyya · 5 ÅV iÅyc*Š‡ gzZVz °zÆh+].q-’ gñ Z~gz ¢‰0Æ|#zÛzh+y (Y 1947 ~gz ÛB7 {ŠñÛ) åg

ÅV iÅyc*Š gzZVz zÆh+].q- - Islam Ahmadiyya · 5 ÅV iÅyc*Š‡ gzZVz °zÆh+].q-’ gñ Z~gz ¢‰0Æ|#zÛzh+y (Y 1947 ~gz ÛB7 {ŠñÛ) åg

narzedziabest.plnarzedziabest.pl/userfiles/infomarket-_odkurzacze.pdf · gyrra rnc&i sis w rich i sis me wan cczcz-azat. *die Sta. grace i a:t-rori Mrcwie Možr-è sadzit, meco bralem

narzedziabest.plnarzedziabest.pl/userfiles/infomarket-_odkurzacze.pdf · gyrra rnc&i sis w rich i sis me wan cczcz-azat. *die Sta. grace i a:t-rori Mrcwie Možr-è sadzit, meco bralem

economics.huji.ac.il · Web viewקורות חיים יש לשלוח לכתובת מייל: jobs@hadassah.org.il ולציין את שם המשרה . ניתן ליצור קשר בטל':

economics.huji.ac.il · Web viewקורות חיים יש לשלוח לכתובת מייל: [email protected] ולציין את שם המשרה . ניתן ליצור קשר בטל':

ידע - elonmoreh.co.ilªשעט קשר ק יט... · 08:30-12:30 תועשה ןיב 'ד-'א םימי :בושייה דרשמב להק תלבק misrad@gmail.com :דרשמה ליימ

ידע - elonmoreh.co.ilªשעט קשר ק יט... · 08:30-12:30 תועשה ןיב 'ד-'א םימי :בושייה דרשמב להק תלבק [email protected] :דרשמה ליימ

תכנות תרגול 1 שבוע : 30.10.05. צור קשר מתרגל – ליעם רודיטי, ביה " ס למדעי המחשב. מתרגל – ליעם רודיטי, ביה " ס

תכנות תרגול 1 שבוע : 30.10.05. צור קשר מתרגל – ליעם רודיטי, ביה " ס למדעי המחשב. מתרגל – ליעם רודיטי, ביה " ס

,*6735+*5 - Egestorfer Gemeindeblattgemeindeblatt-egestorf.de/images/hefte_pdf/Nr23-internet.pdf · %jc9:ine>h8=:h

,*6735+*5 - Egestorfer Gemeindeblattgemeindeblatt-egestorf.de/images/hefte_pdf/Nr23-internet.pdf · %jc9:ine>h8=:h

UUl,St Vb,t4*i,r ih-Vuo-lr...,Jt a:t 1'14?AsT 1C\Si?vff v14tr1"1{,f1 Y{EYAf.V t.s1f{v'lt lttlttt eHntl *.+r,\f f At t i1iffrAAllf I €YAY1 t I&f f - 1qA!ql1tAE.i I.t!{ilt 11At&o?

UUl,St Vb,t4*i,r ih-Vuo-lr...,Jt a:t 1'14?AsT 1C\Si?vff v14tr1"1{,f1 Y{EYAf.V t.s1f{v'lt lttlttt eHntl *.+r,\f f At t i1iffrAAllf I €YAY1 t I&f f - 1qA!ql1tAE.i I.t!{ilt 11At&o?

אנשי קשר נטעים

אנשי קשר נטעים

c I!~ '1~d' Se/MO~ F4 -G:c-, . . z~ !51fJ,repositorio.ufpa.br/jspui/bitstream/2011/9674/1/... · !1.3.4 - coeficientes de transferência simultineos cap!tulo lll - funda~!entos teclricos:

c I!~ '1~d' Se/MO~ F4 -G:c-, . . z~ !51fJ,repositorio.ufpa.br/jspui/bitstream/2011/9674/1/... · !1.3.4 - coeficientes de transferência simultineos cap!tulo lll - funda~!entos teclricos:

חומרים עם קשר קוולנטי

חומרים עם קשר קוולנטי

תיעוד נדיר על מרכז קשר תל אביב Rare footage on the contact center in Tel Aviv where Rafael Rubin sent with daughters

תיעוד נדיר על מרכז קשר תל אביב Rare footage on the contact center in Tel Aviv where Rafael Rubin sent with daughters

דילמות לגבי קשר זוגי או אובססיות לגבי מערכות יחסים ( ROCD )?

דילמות לגבי קשר זוגי או אובססיות לגבי מערכות יחסים ( ROCD )?