Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ......
Transcript of Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ......
![Page 1: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/1.jpg)
Die PRAEGNANT Studie – einelebenslange, klinische und molekulare StudiePeter A. Fasching
![Page 2: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/2.jpg)
Integration von molekularen Tests in die Krankenversorgung und Forschung
1. Diagnose und molekulare
Charakterisierung
5. Krankenversorgung
3. Herstellung der Therapie7. Machine Deep Learning
2. Festlegung der Therapie
4. Koordination der Krankenversorgung
6. Überwachen der Therapie und des Outcomes
8. Prädiktive Modellierung
![Page 3: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/3.jpg)
Integration von molekularen Tests in die Krankenversorgung und Forschung
1. Diagnose und molekulare
Charakterisierung
5. Krankenversorgung
3. Herstellung der Therapie7. Machine Deep Learning
2. Festlegung der Therapie
4. Koordination der Krankenversorgung
6. Überwachen der Therapie und des Outcomes
8. Prädiktive Modellierung
![Page 4: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/4.jpg)
Integration von molekularen Tests in die Krankenversorgung und Forschung
1. Diagnose und molekulare
Charakterisierung
5. Krankenversorgung
3. Herstellung der Therapie7. Machine Deep Learning
2. Festlegung der Therapie
4. Koordination der Krankenversorgung
6. Überwachen der Therapie und des Outcomes
8. Prädiktive Modellierung
![Page 5: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/5.jpg)
Wie kann diese Krankenversorgung angeboten werden
n Was ist die beste Behandlung mit der niedrigsten Toxizität
n Wie kann ich Lebensqualität verbessern
Welche molekularen
Tests?
WelcheNicht-molekularen
Tests?
KlinsicheStudien
MedikamenteVon anderenKrankheiten
Kombinations-Therapien
Prädiktion vonSeiteneffekten
Bezahlung?
PatientinnenKommunikation
![Page 6: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/6.jpg)
Wie kann diese Krankenversorgung angeboten werden
n Was ist die beste Behandlung mit der niedrigsten Toxizität
n Wie kann ich Lebensqualität verbessern
Welche molekularen
Tests?
WelcheNicht-molekularen
Tests?
KlinsicheStudien
MedikamenteVon anderenKrankheiten
Kombinations-Therapien
Prädiktion vonSeiteneffekten
Bezahlung?
PatientinnenKommunikation
![Page 7: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/7.jpg)
Wie kann diese Krankenversorgung angeboten werden
n Was ist die beste Behandlung mit der niedrigsten Toxizität
n Wie kann ich Lebensqualität verbessern
Welche molekularen
Tests?
WelcheNicht-molekularen
Tests?
KlinsicheStudien
MedikamenteVon anderenKrankheiten
Kombinations-Therapien
Prädiktion vonSeiteneffekten
Bezahlung?
PatientinnenKommunikation
![Page 8: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/8.jpg)
Nutzung von Daten ähnlich kinischer Studienfür die Krankenversorgung
Central Biobank
Central Database
Biomaterials
Data
Patient Data andBiomaterial
Operator (PDBO)
SpecializedPartners
Clinical Studies
Big DataAnalysis
MolecularDiagnostics
othersPatientsdirectly enter
QoL Data
![Page 9: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/9.jpg)
![Page 10: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/10.jpg)
Warum eine Studienumgebung
n In Zeiten von Wiki und Facebook ist es einfach selbständig multizentrische Studien mit eigenem Datenmanagement aufzubauen
n Patientinnen werden im Rahmen einer Studie aufgeklärt, welche Ergebnisse, Vorteile und Nachteile auf sie zukommen können.
![Page 11: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/11.jpg)
The PRAEGNANT Study Network
Praegnant (german) = concise (english)pregnant (english) = schwanger (german)
n Prospective Registry study of metastastic breastcancer patients in 60 hospitals
n N=1750, Recruitment since Aug 2015: n=1080n Objectives: OS, PFS, QoL, Adverse Eventsn Comprehensive Biomaterials at study entry and
every 3 months§ FFPE of primary tumor and metastasis§ Serum, Plasma§ ctDNA, CTCs§ Leukocyte RNA (PaxGene)
![Page 12: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/12.jpg)
Plasma ProteinanalysisSerum ProteinanalysisGermline DNA Chromosomal Abberationen,
Mutations, AmplificationsDeletions
micro-RNA amount, patterns, regulationof gene expression
circulating Tumor DNA
Chromosomal Abberationen, Mutations, AmplificationsDeletions
Leukocyte RNA Expression of Leukocyte-RNACTCs Chromosomal Abberationen,
Mutations, AmplificationsDeletions, RNA Expressio, Protein-Analysis, Cell culture
FFPE DNA-Analysis, RNA-Analysis, Proteinanalysis
![Page 13: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/13.jpg)
1stline Therapy ………
FirstdiagnosisOf metastases
1stProgress
2ndProgress
3rdProgress
2ndline Therapy 3rdline Therapy
Studyentry possibly atanytimepoint
Comprehen-sive
biomaterialsampling
Comprehen-sive
biomaterialsampling
Comprehen-sive
biomaterialsampling
Comprehen-sive
biomaterialsampling
Progressassessment and QoL
all3months
Progressassessment and QoL
all3months
Progressassessment and QoL
all3months
Progressassessment and QoLateveryprogress
Progressassessment and QoLateveryprogress
Progressassessment and QoLateveryprogress
Continuous AdverseEventand SevereAdverseEventReporting
Continuous PatientReported OutcomesReporting(Tabletbased inpreparation)
Death
![Page 14: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/14.jpg)
RECRUITMENT
12.07.16 14
![Page 15: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/15.jpg)
Data Management
Data Warehouse
ClinicalData
Capture
RDE-System(eCRF)
PiiaPatient
reportedInteractiveoutcomes
![Page 16: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/16.jpg)
Data Management
Data Warehouse
ClinicalData
Capture
RDE-System(eCRF)
PiiaPatient
reportedInteractiveoutcomes
![Page 17: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/17.jpg)
PiiA– SelfRatedHealth
![Page 18: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/18.jpg)
PiiA– SmartvisitAdverseeventstracking
![Page 19: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/19.jpg)
PiiA– SmartvisitAdverseeventstracking– extendedversion
LaunchQ2/2016
![Page 20: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/20.jpg)
PiiAInSights– Patient/Doctorpointofcarereport
LaunchQ2/2016
![Page 21: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/21.jpg)
VersatilecloudbasedQOLtrackingplatform
Assessmenttoolbox
Patient-reportedoutcomes (PRO)Qualityoflife(EORTCQLC30,EQ-5D,FACT-B)
PROMISPatientReported OutcomesMeasurementInformationSystem
PROCTCAEAdverseeventstracking
Psychological(Distress-Thermometers,PHQ-9)
PhysicalActivityIPAQ
Nutrition(FoodFrequencyAssessment)
ComplianceAssessmentoffactorsinfluencingtreatmentadherence
AssessmentWizard1.Set-up tools 2.SmartVisits 3.Collect PROdata 4.Analyze
InformationIn-depth guidance andedutainment
ScreeningDetection of patients at risk forAEs
TakeActionIndividualized tipps and alerts
MonitoringQoL,Lifestyleand Adverseevents
Benefits
![Page 22: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/22.jpg)
Data Management
Data Warehouse
ClinicalData
Capture
RDE-System(eCRF)
PiiaPatient
reportedInteractiveoutcomes
![Page 23: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/23.jpg)
eCRF
n Umfangreiche Datensammlungn Ko-Morbiditäten
n Behandlung von Ko-Morbiditätenn Epidemiologische Datenn Alle Krebstherapien
n Aktuelle Adverse Eventsn State of the Art eCRF (aber viel mehr Daten)
![Page 24: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/24.jpg)
Screenshots
![Page 25: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/25.jpg)
Data Structure was designed witht the mainaim of competitive scientific analyses
n Überlebensanalyse
n Prädiktion des Therapieansprechens
n Prädiktion der Lebensqualität
n Mindset: Try a „full take“
![Page 26: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/26.jpg)
Utilization Registry Data to improve healthcare
Improve healthcare / Standard of Care
Selection of patients forClincial trialsDesign of clinical Trials
![Page 27: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/27.jpg)
Beispiel 1
![Page 28: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/28.jpg)
Workflow eines next generation Tests
RegisterPatientand transfer Dataand Biomaterialsto DataandBiomaterialCenter
Whole GenomeSequencing andProteomics
BigDataMiningforTreatmentandstudy options
ReturnReporttoparticipating site
Integrationof wholegenomics and data analysisintumor board atstudy site
Biomaterials CentralBiobank CentralDataServer PatientReported Outcomes
Whole Genome SequencingBioinformaticsClinicalGenome Analysis PatientDataAnalysis BigDataAnalysis
GenomicResults Proteomics Summaryand detail Reports Treatmentand StudySuggestions
TumorBOard Results Dissemination PatientIntegration
StandardTreatment
CompassionateCare
PhaseIIIStudy
up to 10PhaseIIStudies
Determine IndividualTreatment
![Page 29: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/29.jpg)
Wissenschaftlicher Fortschritt
Von der DNA
zur RNA
zum Protein
zur Funktion.
Tumor-DNA
Tumor-RNA
Protein
BiologischeFunktion
Ein Test, eine Interpretation.
Splicing Organ
Phosphory-lisierung
Glykosy-lierung
TherapieprädiktionDetektion Prognose
Keimbahn-DNA
![Page 30: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/30.jpg)
Kontinuierliches update der Interpretation durch“Supercomputer” (maschnielles Lernen)
Akademia• Kliniken/Medizin• Informatik/Bioinformatik• KünstlicheIntelligenz• Rechenzentren
BigPharma• Google• Microsoft• SAP• SIEMENS• NantWorks
Regierung
Health CareSystems• BlueCrossShield• Anthem• Providence• UCLA• ….
![Page 31: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/31.jpg)
Testresultat in verständlicher Form (GPS Cancer)
Zusammenfassung
Studienvorschläge
Mutationsliste
Anderemolkulare Tests
![Page 32: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/32.jpg)
Realität von Heute – Erfahrung mit 60 Patientinnen (SABCS 2015)
![Page 33: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/33.jpg)
Beispiel 2
![Page 34: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/34.jpg)
Example Patient selection for PARP Inhibitor Trial
n Inclusion Criteria:§ No more than 2 prior chemotherapy-inclusive regimens for locally
advanced and/or metastatic disease§ Prior treatment with a taxane and/or anthracycline in the adjuvant
or metastatic setting§ ECOG performance status ≤ 1
n Exclusion Criteria:§ Prior platinum treatment for metastatic disease. Subjects who
have received platinum in the adjuvant or neoadjuvant setting are eligible
§ CNS metastasis § Prior malignancy except for prior BRCA-associated cancer § Known to be HIV positive, active hepatitis C virus, or active
hepatitis B virus
![Page 35: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/35.jpg)
Comparison Computer Algorithm vs. Human Gold Standard
n Assessement of 320 patients health records by twoindependent trained investigators of this PARP Study -> 120 patients eligible
n Assessment of these patients by computeralgorithm (simple SQL statements) -> 129 patientseligible
n Sensitivity >90%n Specificity >90%
![Page 36: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/36.jpg)
PRAEGANT Distribution (Basket in and basket out)
„PerFect“Pertuzumab
„Seraphina“Nab-Pclitaxel Weitere Studien
Regular BC Patients
„EMBRACA“PARP-I
„ABRAZO“PARP-I
![Page 37: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/37.jpg)
German Registry Programs
Organ NameBreast PRAEGNANTOvarian, Endometrial, Vulvar, Cervix
G20 (Genomics andGynecologic Oncology
Bladder PlannedRenal Planned
![Page 38: Die PRAEGNANT Studie – eine lebenslange, klinische und ... · • SAP • SIEMENS • ... hepatitis B virus. ComparisonComputer Algorithm vs. Human Gold Standard n Assessement of](https://reader030.fdocument.pub/reader030/viewer/2022040711/5e130f69e459f02ff71aa71b/html5/thumbnails/38.jpg)
GPS Cancer Pro(?)