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BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Dall’esperienza della Rete Regionale BIONET
verso la nuova programmazione
Presentazione dei risultati e prospettive
Veneto Agricoltura - Corte Benedettina - Legnaro (PD)
martedì 25 novembre 2014
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Martino Cassandro (Università degli Studi di Padova)
Biodiversità delle Specie e Razze Animali
Veneto Agricoltura - Corte Benedettina - Legnaro (PD)
martedì 25 novembre 2014
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Martino Cassandro (Università degli Studi di Padova)
Specie Razze-Popolazioni
1 1
1 4
5 20 (13)
7 25 (18)
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Martino Cassandro (Università degli Studi di Padova)
7 Partners
1
2
3
4
5
6
7
53 Persone
6
16
16
2
8
3
2
Veneto Agricoltura Az. “Sasse
Rami” Ceregnano e Villiago
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Martino Cassandro (Università degli Studi di Padova)
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Flaviana Gottardo (Università degli Studi di Padova)
Totale
+46%
+27%
+66%
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Martino Cassandro et al. (Università degli Studi di Padova)
Un totale di 399 individui campionati, ed analizzati con un BeadChip (Illumina)
da 26K di SNPs. Presso i laboratori di GENESEEK. St. Lincoln, Nebraska (USA)
L’editing ha ridotto il dataset da circa 26,000 SNPs a circa 15,000 SNPs
Call freq <0.95; Minor freq <0.05; HWE Chi-Test <0.095
Ne = 65,1 = 4*(382*17)/(399)
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caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Martino Cassandro et al. (Università degli Studi di Padova)
Burlina VI-TV
Burlina TV-VI
Frisona
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
• Conservazione di un nucleo bovino
• di razza Burlina
• Conservazione e diffusione della razza
• sul territorio tramite Az. Agr. satelliti
• Divulgazione della razza
• (visite didattiche, manifestazioni)
• Raccolta di materiale genetico
Marco Parise e Angelo Padovan (Amm. Provinciale di Vicenza - Montecchio Precalcino)
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Marco Parise e Angelo Padovan (Amm. Provinciale di Vicenza - Montecchio Precalcino)
Valerio Bondesan (Veneto Agricoltura)
• Conservazione di
• bovini di razza Burlina presso il Centro di conservazione di Montecchio Precalcino
• e 9 giovani torelli al Centro di Bassano
• Al Centro tori di BASSANO.
• Sono stati acquistati 9 vitelli nell’autunno 2013, provenienti da 7 allevamenti (3 situati in provincia di Treviso e 4 in quella di Vicenza) e sono figli di padri diversi. Sui soggetti idonei si procederà alla raccolta del seme.
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Calogero Stelletta
(Università di Padova)
Attività di selezione donatrici di oociti per salvataggio genetico
Reperti ecografici in vacche Burlina ipofertili
Degenerazione cistica
ovarica
Idrosalpinge monolaterale o
bilaterale Diagnosi di gravidanza
Aspirazione trans-
vaginale ecoguidata
VACCHE BURLINA visitate: 30 in 18 mesi
Vacche selezionate: 8
Numero di oociti vitrificati: 16 di 6 donatrici
differenti in 3 settimane
Valutazione, processazione e vitrificazione degli oociti selezionati
Degenerazione cistica
ovarica
Aspirazione trans-
vaginale ecoguidata
Video
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Antonio Barberio, Brnuella dall’Ava, e Giulia Rosa
negativo
53% S. aureus +
S.agalactiae
4%
S. aureus
37%
S.agalactiae
6%
% capi positivi
6,3
23,5 26,6
5,0
14,2
0
20
40
60
80
100
Leptospira Febbre Q Ab
(ELISA)
Clamidia Ab
(FdC)
PARATBC Neospora
%
ricerca di patogeni infettivi che causano problemi riproduttivi e mastiti contagiose controlli sierologici e coprologici su 405 capi presenti in 16 allevamenti
Linee guida
sanitarie
ricerca agenti di mastiti contagiose nel latte in 172 bovine
Linee guida
sanitarie
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Martino Cassandro (Università degli Studi di Padova)
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Giovanni Bittante (Università degli Studi di Padova)
Progettazione, rilievo dati, elaborazione statistica e impiego a supporto della selezione dei riproduttori: di un profilo morfometrico (misure biometriche e indici somatici); di una scheda di valutazione morfologica lineare; di un panel di SNPs; Supporto alla gestione riproduttiva: Raccolta, valutazione e conservazione di seme congelato dei montoni; Ecografia delle pecore dei centri di conservazione; Caratterizzazione delle capacità produttive: Valore nutraceutico della carne e del latte, specie tramite il profilo acidico dettagliato; Proprietà tecnologiche e reologiche della carne e del latte;
Principali attività svolte
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Esempi di caratterizzazione
fenotipica delle pecore
autoctone venete
Clusterizzazione in base a rilievi e indici
biometrici
Profilo biometrico delle razze ovine
venete
Profilo lattodinamografico delle razze ovine venete
Giovanni Bittante (Università degli Studi di Padova)
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Valerio Bondesan (Veneto Agricoltura)
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Valerio Bondesan (Veneto Agricoltura)
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Valerio Bondesan (Veneto Agricoltura)
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Calogero Stelletta (Università di Padova)
Attività
Vitalità fetale
Sessaggio fetale
Conteggio fetale
Stima dell’età gestazionale per la gestione del gregge
(DBP = diametro biparietale)
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
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Calogero Stelletta (Università di Padova)
N. Individui N. Paillette
Valutazione ecografica testicolare
Valutazione andrologica di 22 arieti
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Franco Mutinelli, Eliana Schiavon, Anna Granato
Determinazione della suscettibilità alla scrapie mediante analisi dei polimorfismi ai codoni 136, 141, 154 e 171 del gene che codifica per la proteina prionica ovina
% Totale per Razza Classe Genotipo
Alpagota
Brogna
Vicentina
Lamon % Totale per
genotipo
1 ARR/ARR 6,85 4,08 1,33 3,00 3,76
2
ARR/AHQ 2,74 0,00 1,33 2,00 1,44
ARR/ARQ 26,02 23,47 18,67 20,0 21,97
ARR/ARH 1,37 0,00 1,33 3,00 1,44
ARR/ARK 0,00 0,00 2,67 0,00 0,58
3
AHQ/ARH 0,00 0,00 0,00 3,00 0,87
AHQ/AHQ 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00
ARQ/AHQ 2,74 0,00 2,67 1,00 1,44
ARH/ARH 0,00 0,00 1,33 0,00 0,29
ARQ/ARK 0,00 0,00 9,33 0,00 2,02
ARQ/ARH 0,00 3,06 6,67 4,00 3,47
ARQ/ARQ 54,79 38,78 53,33 24,00 41,04
4 ARR/VRQ 1,37 4,08 0,00 11,00 4,33
5
AHQ/VRQ 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00
ARH/VRQ 0,00 0,00 0,00 3,00 0,87
ARQ/VRQ 4,11 21,43 1,33 18,00 12,43
VRQ/VRQ 0,00 5,10 0,00 8,00 3,77
Genotipi rilevati e percentuali di attribuzione per Classe e Razza Alleli rilevati e relative frequenze (%) nella razze
% per Razza
Allele Alpagota
Brogna
Vicentina
Lamon
ARR 22,6 17,86 13,33 21
ARQ 71,23 62,76 72,67 45,5
ARH 0,68 1,53 5,33 6,5
AHQ 2,74 - 2 3
ARK - - 6 -
VRQ 2,74 17,86 0,67 24
Verifica dello stato sanitario dei centri di conservazione per la razze ovine autoctone
Monitoraggio delle patologie negli allevamenti satelliti e centri di conservazione
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Serena Turrin (IIS di Feltre)
Valerio Bondesan (Veneto Agricoltura)
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Martino Cassandro (Università degli Studi di Padova)
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Martino Cassandro et al. (Università degli Studi di Padova)
5 Specie Avicole analizzate (Anatra, Oca, Faraona, Pollo, Tacchino), 15 razze/popolazioni considerate
per un totale di 1229 campioni raccolti di singoli individui
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
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Martino Cassandro et al. (Università degli Studi di Padova)
POLLI
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Martino Cassandro et al. (Università degli Studi di Padova)
TACCHINI
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Martino Cassandro et al. (Università degli Studi di Padova)
FARAONA ANATRA
OCA
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Istituti Tecnici Agrari di Padova, Feltre e Castelfranco
13.172 Uova Incubate, di 5 Specie Avicole, appartenenti a 14 razze/popolazioni conservate
7.871 pulcini nati (60% pulcini nati su uova incubate)
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Chiara Rizzi (Università degli Studi di Padova)
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Marco Parise (Amm. Provinciale di Vicenza - Montecchio Precalcino)
Maristella Baruchello (Veneto Agricoltura)
Istituti Tecnici Agrari di Padova, Feltre e Castelfranco
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
OBIETTIVI: •Valutazione stato sanitario dei gruppi
avicoli
•Definizione programmi di
contenimento e di risanamento delle
problematiche sanitarie evidenziate
•Misure di contenimento
dell’eventuale introduzione di nuovi
patogeni
ATTIVITA’ •Sopralluoghi in allevamento: visite
cliniche, prelievi di sangue, tamponi
tracheali, cloacali e raccolta delle feci
•Diagnostica di malattie infettive
(esami autoptici su carcassa, uova
scarto schiusa, altre matrici, ulteriori
sopralluoghi/approfondimenti, piani di
controllo)
•Consulenza sanitaria
IZSVe Ente sanitario di Diritto pubblico- prevenzione,
controllo, ricerca, sicurezza alimentare tutela
ambientale
PROGETTO
BIONET - WP4: Diagnostica aviare, Micoplasmi, Anticorpi monoclonali
(Struttura Complessa Territoriale 3 – Padova e Rovigo)
Salvatore Catania et al.
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Salvatore Catania et al.
METODO ACCERTAMENTO Totale N°Positivi Totale N°Positivi Totale N°Positivi Totale N°Positivi Totale N°Positivi
LEUCOSI A-B 542 34 ND ND ND ND ND ND ND ND
LEUCOSI J 542 37 ND ND ND ND ND ND ND ND
M. GALLISEPTICUM 557 118 164 4 49 0 ND ND ND ND
M. SYNOVIAE 557 96 164 9 49 0 ND ND ND ND
M. MELEAGRIDIS ND ND 164 32 49 0 ND ND ND ND
M. GALLISEPTICUM 542 141 79 2 49 0 ND ND ND ND
M. SYNOVIAE 538 142 79 9 49 3 ND ND ND ND
PULLUROSI (S. PULLORUM E GALLINARUM) 542 0 80 0 49 0 121 0 16 0
M. GALLISEPTICUM 59 12 8 0 5 0 ND ND ND ND
M. SYNOVIAE 59 11 8 1 5 0 ND ND ND ND
COLORIMETRIA ACIDO URICO 95 / ND ND ND ND ND ND ND ND
CARCASSA 1223 / 152 / 151 / 95 / 0 /
UOVA SCARTO SCHIUSA 1287 / 95 / 154 / 286 / 0 /
MICROSCOPIA OTTICA 390 153 86 74 98 78 33 2 0 0
FLOTTAZIONE P.S. 1300 45 37 6 6 5 5 9 8 2 0
IMPRONTE 18 2 4 1 3 0 2 0 0 /
ESAME COLTURALE PER MYCOPLASMA SPP. 358 70 137 22 63 1 116 3 6 2
ESAME BATTERIOLOGICO 252 / 67 / 25 / 29 / 0 /
RICERCA INIBENTI 44 / 11 / 6 / 4 / 0 /
ANTIBIOGRAMMI KIRBY-BAUER 51 / 11 / 5 / 10 / 0 /
RICERCA SALMONELLA SPP. 96 1 9 0 5 0 21 1 2 0
ESAME ISTOLOGICO E-E 48 / 5 / 4 / 1 / 0 /
ESAME VIROLOGICO 24 / 5 1 5 0 1 / 0 /
DGGE 131 110 33 23 14 1 20 8 2 2
ALTRE PCR 35 / 5 0 / / 2 / 1 /
ALTRO 26 / 2 / 2 / 2 / / /
8061 964 1374 184 844 88 752 22 29 4
ANATRA OCA
ESAMI MICROBIOLOGICI
ESAME AUTOPTICO
SAR
ELISA
PCR
PARASSITOLOGICO
ALTRO
TOTALE
POLLO TACCHINO FARAONA
PROSPETTIVE
FUTURE • Mantenimento e
miglioramento dello
status sanitario delle
popolazioni avicole
• Contenimento delle
patologie a trasmissione
verticale con
conseguente
miglioramento
performances
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Daniele Carnio (ISISS “Sartor” Castelfranco)
RISULTATI CONSEGUITI:
DIFFUSIONE DELLE RAZZE SUL TERRITORIO.
E’ stata monitorata la diffusione delle razze sul territorio
mediante la cessione ad allevatori di uova da cova, pulcini e
riproduttori a fine carriera (DATI 2014 – termini
NUMERICI e PERCENTUALI).
0% 10% 20% 30% 40% 50% 60% 70% 80% 90%
100%
Diffusione (%) - 2014
Pollo
Tacchino
Faraona 0
10
20
30
40
50
60
70
Diffuzione (numero) - 2014
Pollo
Tacchino
Farona
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Daniele Carnio (ISISS “Sartor” Castelfranco)
RISULTATI CONSEGUITI:
DIFFUSIONE DELLE RAZZE SUL TERRITORIO.
0%
55%
20%
7%
0,8%
0%
6%
4% 8%
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Gabriele Baldan (I.I.S. “Duca degli Abruzzi” Padova)
Descrittori di interesse sull’attività di conservazione della razza Padovana
• Padova – percorsi didattici
• Grisignano di Z. – specialità Colli berici ed Euganei Territorio
• DAFNAE e MAPS (PD) ricerca e tirocinio di studenti
• CIMeC (TN): studio comportamento pulcini razze diverse.
Studio e ricerca
• Fondaz. Slow Food x Biodiversità – Progetto Presidi Società civile
• Ass. Ristorantori padovani (ASCOM) – accordo per fornitura esclusiva in provincia Mercato
• Rete veneta, Marco Polo TV, Rivista Touring Club Italiano, Rivista La Casana - Banca Carige. Media
• EXPO’ 2015 (CCIAA Pd – Ecce Veneto; Ass. Fidapa) Eventi
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
Gabriele Baldan (I.I.S. “Duca degli Abruzzi” Padova)
1 - Allevamento Conservazione
• PAN – soci 14, di cui: allevatori 5, agriturismi 2
2 - Lavorazione
• Macelli (2 ) Distributore (1)
3 - Vendita 2009-14
• Pollerie (5)
• Pastifici (3)
• Ristorazione (44)
• Vendita diretta
4 - Mercato 2009-14
Pezzi 6654
Consumatori 46.000
Futuro = Ricerca di giovani
allevatori e nuova imprenditoria
Dati di filiera per un futuro della Padovana
(carne)
Induzione di
nuova
domanda
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
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RICADUTA SULLA DIDATTICA:
gli studenti partecipando alle
attività apprendono e comprendono
l’importanza del progetto.
CONSERVAZIONE: alla fine del biennio di
progetto sono state conservate in purezza tutte e
sette le razze avicole venete. Al momento attuale
è stata completata l’attività di selezione dei
riproduttori e sono stati creati i nuclei di
selezione dai quali l’anno prossimo si otterranno,
per ciascuna razza, i nuovi soggetti.
Daniele Carnio (ISISS “Sartor” Castelfranco)
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
CARATTERIZZAZIONE:
1. Raccolta dati di allevamento: deposizione uova,
incubazione, anagrafe, selezione.
2. Raccolta dati di accrescimento e di consumo mangime:
su Tacchino Comune Bronzato e Tacchino Ermellinato
di Rovigo.
Daniele Carnio (ISISS “Sartor” Castelfranco)
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
BIONET (Rete regionale per la conservazione e la
caratterizzazione della biodiversità di interesse agrario)
CONCLUSIONI GENERALI
o Un progetto nato dall’esperienza dei progetti COVA ,
DIVGEN,OVINI VENETI, BIADF (CO.VAgri) per le
specie e razze animali con una storia rurale nel Veneto
o Una rete di Enti e Partners Regionali che hanno lavorato in sinergia e trovato accordi e soluzioni
o Un team di oltre 50 docenti, ricercatori e tecnici specializzati che hanno lavorato assieme
o Un patrimonio di biodiversità animale conservata, caratterizzata, approfondita, e divulgata nel territorio
o Un modello di lavoro e di conoscenze da valorizzare che può essere ulteriormente migliorato