Cda 02-tipos de datos

Curso introductorio a CDA

Tema 2Tipos de datos

01/05/2023 2Tema 2. Tipos de datos

Contenido

1. Objetivos del tema2. Concepto de tipo de datos3. Tipos de datos en CDA4. Representación en XML5. Tipos de datos más importantes


1. Objetivos del tema

• Describir el concepto de tipo de datos• Introducir los diversos tipos de datos

utilizados en CDA• Describir brevemente y proporcionar

ejemplos de los tipos de datos más comunes


2. Concepto de tipo de datos

• Todos los elementos de información tienen un tipo de datos

• Un tipo de dato define la estructura y significado de los valores que pueden ser asignados a un elemento de información

• Por tanto: definen los elementos básicos a partir de los cuales se construye el resto de estructuras hasta llegar al documento


2. Concepto de tipo de datos

• Un aspecto importante en CDA es que los tipos de datos no tienen identidad (es decir sus instancias no tiene identificador) sino que solamente importa su valor

• La especificación de los tipos de datos en HL7 es independiente de la representación, es decir independiente de la tecnología


3. Tipos de datos en CDA

• CDA utiliza un conjunto amplio de tipos de datos con diversa complejidad. Algunos ejemplos son los enteros, lógicos (sí/no) o más complejos como PQ (physical Quantity) que permite representar medidas físicas (incluye la magnitud y la unidad de medida)

• A continuación veremos algunos de los más importantes. Para el listado completo consultar la sección “Data Types – Abstract Specification” del estándar


3. Tipos de datos en CDA (algunos de los más importantes)


4. Representación en XML

• Dada la importancia de XML, el estándar proporciona una representación en XML por medio de un conjunto de XML Schemas

• En esta representación los elementos constitutivos de los tipos de datos se representan como atributos en XML

• Los esquemas de los tipos de datos se encuentra en: datatypes.xsd y datatypes-base.xsd

Atributo valor

Valor 30

Unidad mg

<xs:elemento valor="30" unidad=“mg"/>


5. Tipos de datos más importantes

• A continuación describiremos y daremos ejemplos de algunos de los tipos de datos más comunes


Tipo ANY

• Es el tipo raíz, es decir todos los tipos de datos son subtipos de ANY. Por tanto, los atributos comunes a todos los tipos de datos aparecen en este tipo

• Es abstracto. Esto significa que en los datos no pueden aparecer instancias de ANY, sino instancias de alguno de sus subtipos no abstractos

• Sin embargo, sí que se gasta en la especificación ya que hay ocasiones donde múltiples tipos de datos son admisibles, por ejemplo en el atributo “value” de una observación (puede ser un número, un texto, valor codificado, fecha, etc.)

<xs:element name="value" type="ANY" minOccurs="0" maxOccurs="unbounded"/>


NULL FLAVOR

• En CDA el tipo de dato “ANY” tiene un atributo: nullFlavor de tipo NullFlavor

• Permite especificar el porqué de un valor faltante (desconocido, no se preguntó, sin información, etc.). El estándar define 11 “razones”

• La siguiente tabla recoge estas 11 razones o “flavor” de nulo. Las 4 en negrita son las más comunes


Null FlavorValor Explicación

NI Sin información, es decir el valor no está y no sabemos nada más

OTH El valor no está en el domino previsto para la variable. Se aplica principalmente a valores codificados

NINF Infinito negativo

PINF Infinito positivo

UNK Desconocido

ASKU A pesar de que se preguntó es desconocido

NASK No se preguntó

NAV Temporalmente desconocido. Puede saberse en el futuro

TRC Valor mayor que cero, pero no puede cuantificarse

MSK La información existe pero no puede facilitarse por razones de seguridad, privacidad o del negocio

NA No aplicable, por ejemplo fecha de la última menstruación en hombres


BL-Booleano

• Puede tomar dos valores: verdadero (true) o falso (false)

• En el siguiente ejemplo utilizamos un booleano para dar valor al atributo “value” de una observación. Nótese que en la representación en XML tenemos que indicar explícitamente el tipo ya que “value” es de tipo “ANY”

<value xsi:type=‘BL’ value=‘false’>


INT-Entero

• Número entero (por tanto sin decimales) • Puede incluir signo al principio• Ejemplos:

<versionNumber value="2"/><value xsi:type="INT" value="-100"/>


REAL

• Número con decimales• Puede contener signo al principio• Ejemplo:

<value xsi:type="REAL" value="12.32"/>


PQ – Cantidad Física

• Una cantidad con unidades de medida estandarizadas

• Por defecto se considera que las unidades siguen el formato estándar UCUM (http://unitsofmeasure.org/ucum.html), por ejemplo: Ej. 182 mmHG

• Puede incluir una representación alternativa en un sistema de medición diferente

• Ejemplo:<value xsi:type=“PQ” value=“300” unit=“mg”/>


ST-Cadena de caracteres

• Cadena de texto plano sin compresión• Permite especificar el idioma (atributo

language)• Ejemplos:<value xsi:type=“ST” language=“es/ES”>esto es una cadena de texto</value><value xsi:type=”ST” nullFlavour=“UNK”>


ED-Datos encapsulados

• Permite representar datos en formatos no definidos por HL7 como imágenes, video, audio, secuencias de genes, etc

• Los datos pueden estar referenciados, por ejemplo por medio de una URL o incluidos directamente en el documento CDA

• Incluyo diversos atributos como el tipo de multimedia (media type), compresión, idioma, etc


Tipos de datos codificados

• Este conjunto de tipos de datos (CS, CV, CE, CD) tiene como propósito representar conceptos de un sistema de codificación

• Permite representar desde sólo el código (CS) hasta codificar utilizando distintos sistemas de codificación y calificadores (CD)



• Atributos:– Code: identificador del concepto representado.

Es de tipo ST– DisplayName: descripción textual del concepto

codificado, por ejemplo “diabetes tipo II”– codeSystem: identificación del sistema de

codificación utilizado. Es de tipo OID– codeSystemName: nombre del sistema de

codificación, por ejemplo “Snomed-CT”



• Atributos (continuación):– codeSystemVersion: versión del sistema de codificación– originalText: texto original que fue codificado. Es de tipo ED– Qualifier: permite representar expresiones

postcoordinadasEjemplo: 22298006 : 363698007=73050001

<code code='22298006‘ displayName='myocardial infarction‘ codeSystem='2.16.840.1.113883.6.96‘ codeSystemName='SNOMED CT'>

<qualifier><name code='363698007' displayName='finding site' codeSystem='2.16.840.1.113883.6.96'/><value code='73050001‘ displayName='anterolateral region' codeSystem='2.16.840.1.113883.6.96'/>

</qualifier></code>



• Atributos (continuación):– Translation: permite representar la traducción

del concepto codificado a otros sistemas de codificación

Ejemplo:<code code='410.9' displayName='myocardial infarction' codeSystem='2.16.840.1.113883.6.103‘ codeSystemName='ICD-9-CM'>

<translation code='22298006‘ codeSystem='2.16.840.1.113883.6.96' codeSystemName='SNOMED CT'/>

</code>



• Cada tipo de dato codificado incluye diferentes combinaciones de los atributos anteriores

atributo CD CE CV CS

Code displayName codeSystem codeSystemName codeSystemVersion originalText Translation Qualifier


II-Identificador de Instancia

• Utilizado para identificar únicamente una ocurrencia, cosa u objeto. Compuesto por:– un dominio (root) obligatorio. Es un

identificador de tipo OID o UUID que garantiza la unicidad global del identificador. En algunas ocasiones es suficiente para identificar a la instancia

– identificador (extension) opcional. Identifica una instancia dentro del alcance del root


II-Identificador de instancia

• Ejemplos: – “root” es suficiente para identificar la

instancia, en este caso un hospital:<representedOrganization>

<id root="2.16.840.1.113883.2.35.2"/></representedOrganization>

– Necesitamos la extensión, en este caso identificamos un médico “4001” dentro del hospital anterior

<id root="2.16.840.1.113883.2.35.2“ extension="4001"/>


Tipos de datos temporales

• Los tipos de datos temporales de CDA se basan en el estándar ISO 8601

• Permite representar desde horas a sucesos que se repiten cada cierto tiempo durante un periodo

• Se sigue el criterio de especificar en primer lugar los períodos de tiempo más largos y posteriormente los más cortos (por ejemplo: año, mes, día)


TS-marca de tiempo

• Representa un instante en el tiempo. Puede contener la hora o la fecha y hora (incluyendo milisegundos y franja horaria)

• Al contrario que ISO 8601 en CDA no se incluye caracteres de separación entre la fecha y la hora– Ejemplo: 20160720175020.035-0500Representa el 20/07/2016 a las 17:50:20 y 35 milisegundos en la zona horaria +5 GMT.


PIVL_TS : intervalo periódico de tiempo

• Permite representar eventos que se repiten periódicamente. Por ejemplo 10 minutos cada 12 horas.

• Tiene dos atributos (entre otros):– period: cantidad de tiempo entre dos eventos

(en el ejemplo anterior 12 horas)– Phase: duración del evento que se repite (el

estándar ofrece hasta de 8 maneras diferentes de representación). En el ejemplo 10 minutos.


PIVL_TS : intervalo periódico de tiempo

• Ejemplos– Cada 12 horas:

<effectiveTime xsi:type=“PIVL_TS”> <period value='12' unit='h' /></effectiveTime>

– Cada 12 horas, durante 10 minutos<effectiveTime xsi:type=“PIVL_TS”> <period value='12' unit='h' /> <phase> <width value='10‘ unit='min'/> </phase></effectiveTime>


Material desarrollado por:

• José Alberto Maldonado Segura (HL7 CDA especialista certificado)• David Moner Cano (HL7 CDA especialista certificado)

http://www.veratech.es

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