BIOPEN MANAGERFERRAMENTA COMPUTACIONAL PARA COLETA E ANÁLISE DE DADOS

LABORATORIAIS DE ENTEROPATÓGENOS

Alan de Camargo IgnácioLuiz Antonio Pereira NevesRodrigo Albuquerque da RochaRodrigo ResendeTerumi Paula Bonfim KamadaVinicius Ferreira Correia

VI e-Science

XXXII Congresso da Sociedade Brasileira de Computação (CSBC)

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SUMÁRIO

INTRODUÇÃO

• INTRODUÇÃO• VISÃO GERAL DO PROJETO• METODOLOGIA• VALIDAÇÃO• INSTALAÇÃO• CONCLUSÃO• AGRADECIMENTOS

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INTRODUÇÃO

BIOLOGICAL PROTOCOL ELETRONIC FOR ENTEROPATHOGENS

BIOPEN

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INTRODUÇÃO

O BIOPEN MANAGER é o conjunto de ferramentas (4 módulos) com o propósito de

gerenciar dados de Enteropatógenos bacterianos obtidos através de análises

laboratoriais efetuadas no Laboratório de Bacteriologia da UFPR

BIOPEN MANAGER

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Escherichia coli visualizada em microscópio eletrônico

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INTRODUÇÃO

Principais Contribuições:

• Melhorias nos processos de coleta, armazenamento e recuperação de dados

• Possibilidade de utilização de recursos informatizados para pesquisa e

desenvolvimento científico

BIOPEN MANAGER

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VISÃO GERAL DO PROJETO

INTRODUÇÃO• VISÃO GERAL DO PROJETO• METODOLOGIA• VALIDAÇÃO• INSTALAÇÃO• CONCLUSÃO• AGRADECIMENTOS

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VISÃO GERAL DO PROJETO

OBJETIVO PRINCIPAL

• Integração de 4 módulos independentes

• A arquitetura de integração dos módulos é orientada a serviço

• Comunicação entre os módulos, usando XML (Extensible Markup Language)

DESCRIÇÃO DO PRODUTO DO PROJETO

Desenvolver uma ferramenta computacional que proporcione ao Laboratório de Bacteriologia Clínica da UFPR armazenar e gerenciar os dados coletados em seus exames laboratoriais

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VISÃO GERAL DO PROJETO

BIOPEN MANAGER - MÓDULOS

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VISÃO GERAL DO PROJETO

Módulo responsável pelo cadastro e gerenciamento de usuários

Principais Funcionalidades:

• Controle de acesso ao BIOPEN MANAGER

• Liberação de acesso completo ou parcial aos módulos do sistema

• Serviço de autenticação aos módulos de forma independente

Biopen - SSO

BIOPEN MANAGER - MÓDULOS

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VISÃO GERAL DO PROJETO

Finalidades:

Armazenar dados coletados nos exames laboratoriais com segurança, permitindo futuras consultas aos exames e estudos prospectivos

Pode ser entendido como formulário inteligente para armazenamento dos dados coletados nos exames

Biopen - Lab

BIOPEN MANAGER - MÓDULOS

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VISÃO GERAL DO PROJETO

Módulo para o compartilhamento de informações entre os usuários através de uma interface de blog

Principais finalidades:• Auxílio na integração entre os pesquisadores.• Canal de comunicação entre professor e pesquisadores.

Biopen - Blog

BIOPEN MANAGER - MÓDULOS

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VISÃO GERAL DO PROJETO

Disponibiliza relatórios estatísticos que são gerados a partir da análise dos dados coletados no Biopen-Lab

O uso dos relatórios:• Amplia a experiência do usuário• Identifica surtos e organismos mais comuns em determinadas regiões• Auxilia no planejamento de ações para controle sanitário

Biopen - Report

BIOPEN MANAGER - MÓDULOS

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METODOLOGIA

INTRODUÇÃO REVISÃO DA LITERATURA VISÃO GERAL DO PROJETO• METODOLOGIA• VALIDAÇÃO• INSTALAÇÃO• CONCLUSÃO• AGRADECIMENTOS

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Linguagens Utilizadas:• HTML• PHP• JavaScript• SQL• XML

Ferramentas Utilizadas:• Office (Word, PowerPoint, Visio)• XAMPP (PHP, MySQL)• Astah Community• Google Chrome• Notepad ++• DbDesigner• Tortoise Svn• Assembla Subversion• Acrobat Reader X• Gantt Project

METODOLOGIA

AMBIENTE DE SOFTWARE

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METODOLOGIA

O modelo de gerenciamento de projeto adotada no desenvolvimento do sistema foi o Modelo Espiral

(BOEHM, 1988)

Etapas do Desenvolvimento:

1. Definição da modelagem do sistema2. Construção da modelagem do banco de dados3. Implementação da modelagem proposta4. Avaliação do sistema

A modelagem adotada:• UML (Unified Modeling Language), que facilita a concepção da ferramenta através

de diagramas

METODOLOGIAS DO DESENVOLVIMENTO

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DIAGRAMAS DE CASOS DE USO

METODOLOGIA

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DIAGRAMAS DE CASOS DE USO

METODOLOGIA

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DIAGRAMA DE TELAS

METODOLOGIA

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METODOLOGIA

PRINCIPAIS TELAS

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PRINCIPAIS TELAS

METODOLOGIA

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METODOLOGIA

PRINCIPAIS TELAS

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VALIDAÇÃO

INTRODUÇÃO REVISÃO DA LITERATURA VISÃO GERAL DO PROJETO METODOLOGIA• VALIDAÇÃO• INSTALAÇÃO• CONCLUSÃO• AGRADECIMENTOS

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• Desenvolvimento de uma ferramenta computacional para gerenciar a seção de exames do Laboratório de Bacteriologia Clínica da UFPR

• Armazenamento de dados de forma consistente e segura

• Análise dos dados armazenados e geração de relatórios prospectivos para auxiliar ações de controle sanitário

• Disponibilidade de um blog, integrando os usuários do sistema e incentivando o compartilhamento do conhecimento

OBJETIVOS ATINGIDOS

CONCLUSÃO

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• Além do cunho acadêmico, este software será utilizado dentro do Laboratório de Bacteriologia da UFPR

• BIOPEN MANGER tem facilidade de atualizações ou manutenções

• A ferramenta proposta apresenta alta escalabilidade (evolutibilidade) de acordo com a evolução e necessidades do laboratório

RELEVÂNCIAS

CONCLUSÃO

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• Inclusão de técnicas de mineração de dados para uma análise mais complexa das informações obtidas dos exames laboratoriais

• Inclusão de novos módulos ao software, podendo assim, disponibilizar a mesma plataforma para a informatização de outros setores da UFPR

• Uso de tecnologias móveis como IOS, Android, Windows Phone, entre outros para melhor mobilidade das informações

TRABALHOS FUTUROS

CONCLUSÃO

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AGRADECIMENTOS

INTRODUÇÃO REVISÃO DA LITERATURA VISÃO GERAL DO PROJETO METODOLOGIA VALIDAÇÃO INSTALAÇÃO CONCLUSÃO• AGRADECIMENTOS

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AGRADECIMENTOS

À todos os integrantes do

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