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Bioinformática Básica Tutorial de acesso ao NCBI e Blast
Rafael Dias Mesquita
Laboratório de Bioinformática
Departamento de Bioquímica Instituto de Química - UFRJ
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NCBI
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NCBI
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NCBI - Exemplo
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NCBI - Exemplo
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NCBI - Exemplo
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NCBI - Exemplo
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NCBI - Exemplo
Que título é esse?
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NCBI - Exemplo
Não é BRCA1 sozinha, é uma região genômica contendo BRCA1
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NCBI - Recomeçando
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NCBI – escolhendo um dos variantes
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NCBI – baixando a proteína
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NCBI – indo para o CDS
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NCBI – baixando o CDS
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NCBI – Voltando para o registro da proteína
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NCBI – Entrando no registro do gene
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NCBI – indo para a região genomica
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NCBI – baixando a região genômica
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NCBI –voltando para o gene e seguindo para os ESTs
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NCBI – baixando os ESTs
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NCBI – Voltando para a proteína, escolhendo BLAST
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NCBI – Rodando Blast
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NCBI – Resultado do BLAST
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NCBI – Resultado do BLAST
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NCBI – Resultado do BLAST
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NCBI – Resultado do BLAST
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NCBI – Resultado do BLAST
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NCBI – Resultado Taxonômico do BLAST
Escolher a melhor sequência dos 5 organismos mais próximos taxonomicamente e baixar PTN, cDNA, região genômica, ESTs de todas.