biohemija-6b_enzimi

36
Regulacija enzimske katali

description

Enzimi

Transcript of biohemija-6b_enzimi

  • Regulacija enzimske katalize

  • Enzimska aktivnost je regulisana i odrazava fiziolosko stanje organizmabrzina enzimski katalisane reakcije zavisi od koncentracije supstratamatematicki se predstavlja Michaelis-Menten-ovom jednacinom

  • Ostali mehanizmi za regulaciju enzimske aktivnostiMehanizam povratne sprege (feedback)Najcesce prve reakcije metabolickog putaKovalentna modifikacija aminokiselinskih ostataka proteinaInterakcija sa modulator proteinimaVezuju se za enzimMenjaju konformaciju enzima i tako njegovu aktivnost

  • Regulacija koncentracijom supstrata i produkta k1 k3E + S ES P k2

    Brzina (kolicina stvaranja produkta u jedinici vremena) svih enzima zavisi od koncentracije supstrata

  • Izrazava se

    Michaelis-Menten jednacinomLineweaver-Burk (reciprocne vrednosti)

    Km = (k2 + k3)/k1

  • [S] > KmVo = Vmax[S] < KmVo = Vmax [S] /Km[S] = KmVo = Vmax / 2

  • izoenzimi heksokinazeheksokinaza I Km 0.05 mMu eritrocitima (zavisni iskljucivo od glukoze)glukokinaza (jetra i pankreas) 5.0 6.0 mMjetra preuzima visak iz krvi glikogen

  • Regulacija enzimske aktivnosti inhibicijominhibitori supstance koje se vezuju za enzim i smanjuju brzinu katalizereverzibilna inhibicijainhibitor se vezuje za enzim nekovalentnolako se odvaja od enzima

  • Reverzibilni inhibitori (cesto sami produkti reakcije)prema odnosu supstrata i inhibitorakompetititivna inhibicijanekompetitivna inhibicijaakompetitivna inhibicija

  • kompetitivna inhibiticijainhibitor slican pravom supstratuinhibitor se takmici sa pravim supstratom za aktivno mestopovecava se Km, a Vmax ostaje istapovecanjem supstrata lako se prevazilazi ova inhibicija

  • nekompetitivna inhibicijasa nekompetitivnim inhibitorominhibitor se ne vezuje za mesto gde i supstrat menja se Vmax, Km ostaje istosa akompetitivnim inhibitorminhibitor se vezuje za kompleks enzim-supstrat menja se i Vmax i Km

  • Nekompetativna inhibicija

  • Regulacija enzimske aktivnosti konformacionim promenama (brza regulacija)alosterna aktivacija i inhibicijakovalentne modifikacije (fosforilacija)protein-protein interakcija (izmedju regulatorne i kataliticke subjedinice)proteoliticko razlaganje

  • alosterni aktivatori ili inhibitori se vezuju za enzim na neko drugo mestonastale konformacione promene uticu na kataliticko mestona taj nacin regulisu enzimsku aktivnost

  • Alosterna aktivacija i inhibicijaenzim obicno ima dve ili vise subjedinicaSubjedinice vezivanje supstrata za jednu subjedinicu menja konformaciju ostalih-kooperativno vezivanje supstrata primer Hb

  • alosterni efektorialosterni inhibitori imaju jaci uticaj od ostalih (kompetitivni, nekompetitivni, akomepetitivni) inhibitorane zauzimaju kataliticko mesto mogu delovati kao aktivatoriefekat alosternog efektora brz

  • Kovalentne modifikacijefosforilacijomsa protein kinazama ili protein fosfatazamau fosforilaciji ucestvuje ATP i -OH grupe Ser, Thr i Tyr

  • Protein-protein interakcijereceptor (protein) G proteinG protein adenilat ciklaza

  • Proteoliticko razlaganjeproenzimi (zimogeni)za aktivaciju neophodno proteoliticko razlaganje (ireverzibilno)himotripsinogen (tripsinom se konvertuje u himotripsin)kod koagulacije krvi (odrzavanje hemostaze -konstantne zapremine krvi)fibrinogen prelazi u fibrin delovanjem trombina (serin proteaza)aktivacija trombina koagulaciona kaskada

  • Hemoglobin kao alosterni proteinglobularni protein (4 subjedinice, 2alfa, 2 beta) u eritrocitimaprenosi kiseonik iz pluca u tkiva CO2 i H+ iz tkiva u plucanosi i otpusta NO (vazodilator)

  • HbA1, 2 (141 a.k.) i 2 (146 a.k.), 98%HbA2, 2 , 2 HbF, 2, 2

  • konformacione promene u tercijalnoj strukturi nakon vezivanja kiseonikaT stanje (mali afinitet za O2) i R stanje (visoki afinitet za O2)pozitivna kooperativnost prvog vezanog O2 (olaksava konformacione promene u drugim subjedinicama)

  • Agensi koji uticu na vezivanje kiseonikavodonikovi joni2,3-bisfosfogliceratkovalentno vezivanje CO2

  • vezivanje H+ smanjuje afinitet Hb za O2 (Borov efekat)

  • 2,3-bisfosfoglicerat (u eritrocitima) otezava formiranje stanja za vezivanje O2 i tako smanjuje afinitet Hb za O2eritrociti promenom koncentracije 2,3-bisfosfoglicerata moduliraju vezivanje O2

  • CO2 se do pluca uglavnom transportuje kao bikarbonatdeo se vezuje za Hbu tkivima za deoksi konformaciju (stabilizuje je)preko amino grupa (karbamat)u plucima se vezuje O2 i oslobadja CO2