Aprendiendo a usar epi info
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Universidad Nacional Autónoma de NicaraguaFacultad de Ciencias Médicas – LeónEscuela de Postgrado en Epidemiología y Salud
Universidad Nacional Autónoma de NicaraguaFacultad de Ciencias Médicas – LeónEscuela de Postgrado en Epidemiología y Salud
Desarrollando las habilidades para el análisis de datos estadístico en
Epidemiología
Dr. Juan R. Almendárez P.
23/03/2006.
JRAP
IntroducciónIntroducción• El programa Epi-Info en su versión 3.3.2 para Windows es la configuración
de un conjunto de programas que ha desarrollado el Centro para el Control de las Enfermedades (CDC) de Atlanta, Estados Unidos y la Oficina de la Organización Mundial de la Salud en Geneva, Suiza.
• Igual que otros programas estadísticos trata de facilitar el análisis de los datos producidos por la investigación y la vigilancia epidemiológica, pero se diferencia en que a pesar de que es considerado una potente herramienta, su distribución es gratuita.
• Vamos a utilizar este programa para desarrollar un ejercicio de entrenamiento en estadística, mediante un proceso de aprendizaje activo.
• Esperando que este esfuerzo sea de mucha utilidad en su aprendizaje,
Dr. Juan Almendárez ………
JRAP
ObjetivosObjetivos
1. Diseñar un cuestionario en “Crear Vistas” 1. Diseñar un cuestionario en “Crear Vistas”
2. Introducir datos al cuestionario en “Grabar datos” 2. Introducir datos al cuestionario en “Grabar datos”
3. Procesar los datos en “Analizar datos Diapositiva 243. Procesar los datos en “Analizar datos Diapositiva 24
4. Desarrollar diferentes análisis estadísticos 4. Desarrollar diferentes análisis estadísticos
JRAP
PresentaciónPresentación• Estamos contando con información proporcionada por una base de datos de
la Encuesta Nacional de Salud Sexual y Reproductiva realizada en el año 2,000 en Nicaragua. En ese momento se realizaron 13060 encuestas a nivel nacional mediante un muestreo mediante procedimientos probabilísticos estratificados y multietápico (Estratificación por regiones geográficas, por departamento, por municipios, por lugar de residencia).
• De esa base de datos se han seleccionado solamente algunas variables, todas ellas definidas o codificadas en valores numéricos: Edad, escolaridad, años de estudio, procedencia, lugar de residencia, la presencia de recursos en el hogar como radio, teléfono, televisor, refrigeradora, bicicleta, moto y vehículo a motor; además de información sobre el acceso a la información, datos reproductivos, el conocimiento y uso de los métodos de planificación familiar.
• Los pasos para el análisis se definen de la siguiente manera: Conocer los datos, para ello se deben revisar el cuestionario y en análisis realizar frecuencias simples de todas las variables, procesamiento o manipulación de las variables y análisis propiamente dicho.
JRAP
Permite diseñar una base de datos o ver y modificar una ya existente.
JRAP
Este botón permite diseñar el
cuestionario donde se van a introducir los
datos
Si hacemos “Click en este botón ….
JRAP
Aparecerá esta nueva página de trabajo.
¡Importante!Ponga
atención.
¡Importante!Ponga
atención.
¡Este es el menú
¡Este es el menú
JRAP
JRAP
Si va a abrir un archivo ya existente
como en nuestro caso, Marque aquí.
Si va a abrir un archivo ya existente
como en nuestro caso, Marque aquí.
JRAP
Al seleccionar “Abrir” el programa nos muestra esta ventana por defecto. O sea que busca en el disco “C” en la carpeta “Epi-Info”.
Podemos cambiar la dirección marcando aquí
Podemos cambiar la dirección marcando aquí
Ó aquíÓ aquí
JRAP
Si marcamos aquí
Si marcamos aquí
Aparece esta ventana
Así podemos buscar nuestros archivos por el Sistema
JRAP
Al seleccionar el archivo “Ejercicio” nos pregunta por el nombre de la vista. En nuestro caso se llama “Endesa”. Al seleccionarlo aparece esta página.
Y, hay otras páginas másY, hay otras páginas más
Es bueno revisarla para saber qué significan los
números que aparecen en los datos
Es bueno revisarla para saber qué significan los
números que aparecen en los datos
JRAP
JRAP
Si vamos a crear un archivo nuevo,
Marque aquí
Si vamos a crear un archivo nuevo,
Marque aquí
Seleccionar la opción “Nuevo” para hacer un cuestionario.
JRAP
El programa le pedirá que le ponga un nombre al archivo que va a crear y después oprime en el botón “Abrir” del lado derecho del nombre que ha escrito.
Encuesta
JRAP
El programa le pedirá que le ponga un nombre a la “Vista” o base de datos específica. El programa Epi-Info tiene como plataforma al programa de Office “Access”. En este programa se pueden hacer varias bases de datos relacionadas. En un archivo de Epi-Info se pueden hacer varias bases de datos relacionadas también. Después aprima “Aceptar”
Datos
JRAP
El programa muestra una página de trabajo y la especificación “Haga Click en el ratón derecho para crear un campo.
Recuerde el ratón tiene dos teclas una izquierda con el que se ejecutan las ordenes y uno derecho que genera opciones. Para crear campos se oprime la tecla derecha.
JRAP
Al presionar la tecla derecha del ratón aparece esta ventana.
Aquí se escribe la pregunta.
Se puede modificar la fuente de la
pregunta
Se define el tipo de variableSe define el
número de caracteres de
la variable
El programa define un nombre para la variable,
se puede modificar al inicio
JRAP
Otras opciones.
Aquí se escribe la pregunta.
Se pueden crear valores
legales
Se establecen algunos criterios
Al final se oprime en “Aceptar”
JRAP
Aquí se ingresa para introducir los datos en el cuestionario
diseñado en “Crear Vistas”
JRAP
Una vez que se ingresa a “Grabar datos” se abre en el menú la opción “Archivos” y se selecciona la opción “Abrir”.
JRAP
Igual que en hacer vista nos aparece las opciones de archivos en la carpeta de Epi-Info. Si el archivo esta en otra carpeta se busca siguiendo las opciones.
JRAP
Aparece la encuesta diseñada en vistas pero listo a introducir datos. Se procede a introducir los datos según información de las encuestas o registros de información.
Aparece la encuesta diseñada en vistas pero listo a introducir datos. Se procede a introducir los datos según información de las encuestas o registros de información.
Número de registro
Número de páginas
JRAP
JRAP
Procesar y analizar los datos
almacenado
JRAP
Características de análisisCaracterísticas de análisis
• El programa está conformado por tres pantallas:– Pantalla de comandos: Se encuentran
definidas todas las órdenes que el programa puede ejecutar.
– Pantalla de Salida: Se registran los resultados de las órdenes que se definan.
– Pantalla de órdenes: Se registran las ordenes que se definieron. Si se graba puede ser un programa ejecutable siempre en análisis.
JRAP
Pantalla de salida de resultados
Pantalla de Órdenes
Pantalla de “Comandos” o de listado de órdenes
Pantalla de “Comandos” o de listado de órdenes
JRAP
Pantalla de salida
Pantalla de Órdenes
Se inicia toda sesión abriendo o leyendo una
base de datos.Para ello haga click en “Abrir (Leer)/Importar”
Se inicia toda sesión abriendo o leyendo una
base de datos.Para ello haga click en “Abrir (Leer)/Importar”
JRAP
Aparece esta pantalla. Ella te permite buscar tu archivo de trabajo. Vamos a trabajar con el archivo “Ejercicio”. Está en esta versión del Epi-Info.
Aparece esta pantalla. Ella te permite buscar tu archivo de trabajo. Vamos a trabajar con el archivo “Ejercicio”. Está en esta versión del Epi-Info.
Hacer Click Aquí para buscar el
archivo
Hacer Click Aquí para buscar el
archivo
JRAP
Eso te lleva al menú de búsqueda. Puede elegir donde buscar tu archivo. Posiblemente tu archivo esté en un CD. Hay que buscarlo.
Eso te lleva al menú de búsqueda. Puede elegir donde buscar tu archivo. Posiblemente tu archivo esté en un CD. Hay que buscarlo.
Modifica la dirección de tu
archivo haciendo “Click” en Mi PC
JRAP
• Una vez que has abierto tu archivo el programa te da alguna información importante:– Te dice del nombre de tu archivo y la
dirección que tiene en tu PC– Te dice del número de registros que has
ingresado o que tiene– Te muestra la orden que ejecutaste para que
apareciera lo que hiciste.
JRAP
Orden ejecutadaOrden ejecutada
Información sobre la base de datos
Información sobre la base de datos
Orden ejecutadaOrden ejecutada
JRAP
¡ Ya podemos comenzar a trabajar !¡ Ya podemos comenzar a trabajar !
• Conocer los datos.
• Corregir los datos
• Procesar o manipular los datos.
• Realizar el análisis.
JRAP
• Conocer los datos es saber que datos se han introducido en las variables del estudio.
• Saber si están completos los datos en cada una de las variables.
• Si faltan datos, conocer si es razonable que falten datos o si es necesario investigar para complementar los datos.
• Detectar errores en la introducción de los datos.
• Corregir los datos errados para su posterior utilización (Limpieza de la base de datos).
JRAP
Podemos iniciar calculando frecuencia a todas sus
variables para conocer la información que tiene y como
se distribuyen los datos
Podemos iniciar calculando frecuencia a todas sus
variables para conocer la información que tiene y como
se distribuyen los datos
JRAP
Una vez que oprimiste la orden Frecuencia aparece una ventana donde se encuentra el listado de variables. Se alcanza presionando la pestaña en “Frecuencia de:”. Posteriormente se oprime el botón “Aceptar”. Si oprimes el asterisco “*” el programa calculará la frecuencia de todas las variables.
Así podrás ver como están los datos introducidos en el programa.
Una vez que oprimiste la orden Frecuencia aparece una ventana donde se encuentra el listado de variables. Se alcanza presionando la pestaña en “Frecuencia de:”. Posteriormente se oprime el botón “Aceptar”. Si oprimes el asterisco “*” el programa calculará la frecuencia de todas las variables.
Así podrás ver como están los datos introducidos en el programa.
a
JRAP
Si establecimos calcular la frecuencia de “todo”. EL Programa nos da primero un listado de los resultados por cada variable:Si presionamos una de las variables el programa nos envía a ver el resultado de esa frecuencia en esa variable.
JRAP
Cada número tiene un significado, revisar en vistas los significados.
JRAP
También podemos hacer gráficos para comprender mejor la distribución de los
datos
También podemos hacer gráficos para comprender mejor la distribución de los
datos
JRAP
Al marcar gráfico nos aparece esta ventana y elegimos el tipo de gráfico, las variables que queremos graficar, su título.
JRAP
Este es un ejemplo de gráfico:
Tipo de gráfico: Histograma.
Variable: Edad:
JRAP
• Algunas veces los datos no concuerdan porque durante la recolección o la digitación de los datos en el programa “ENTER” se cometieron errores.
• Se pueden hacer correcciones en la base de datos desde “ANALISIS” con la orden: “Listar”
Corregir datosCorregir datos
JRAP
Seleccionar las variables a corregir
Ejecutar listar
Permitir actualizaciones
Y aceptar
JRAP
Este es el número de registro o
número de la ficha
Al finalizar las correcciones se cierra esta ventana
Al finalizar las correcciones se cierra esta ventana
JRAP
En la base de datos “Ejercicio” de la Vista “Endesa”:
En la base de datos “Ejercicio” de la Vista “Endesa”:
• Todos los datos son numéricos.
• Muchos tienen más de dos categorías
• Unos como la edad son realmente numérico, pero se debería agrupar.
• Otros datos son categóricos, pero están codificados en varias opciones numéricas.
JRAP
JRAP
• Una condición para calcular Riesgo Relativo u Odds Ratio es agrupar la exposición y el efecto en dos categorías cada una
E
X
P
O
S
I
C
I
Ó
n
Efecto
Si No Total
Si a b a+b
No c d c+d
Total a+c b+d N
• a = Personas con el efecto y expuestas.
• b = Personas sin el efecto pero expuestas.
• c = Personas con el efecto pero no expuestas.
• d = Personas sin el efecto y no expuestas.
• a+b = Todos los expuestos.
• c+d = Todos los no expuestos
• A+c = Todos los que tienen el efecto.
• B+d = Todos los que no tienen el efecto
• a = Personas con el efecto y expuestas.
• b = Personas sin el efecto pero expuestas.
• c = Personas con el efecto pero no expuestas.
• d = Personas sin el efecto y no expuestas.
• a+b = Todos los expuestos.
• c+d = Todos los no expuestos
• A+c = Todos los que tienen el efecto.
• B+d = Todos los que no tienen el efecto
JRAP
• Puede que sea necesario agrupar TODAS O ALGUNAS de las variables en dos categorías o escalas:
• Exposición: “Si/No”• Efecto: “Si/No”
• Entonces, hay que manipular las variables.
JRAP
Procesar o manipular variablesProcesar o manipular variables
• Se requieren dos pasos:
– Definir una variable nueva, con su propio nombre pero de nombre parecido a la variable que ya existe: Si vamos a procesar la variable EDAD; el nombre de la variable a crear podría ser: EXAD2.
– El segundo paso es a partir de los datos existentes en la variable existente (EDAD), agregar datos recodificados en la variable nueva (EDAD2).
JRAP
Al presionar: DEFINIR Aparece esta
ventana
Aquí agregamos el nombre de la nueva
variable: EDAD2.
JRAP
Si presionamos en recodificar
Aparece esta ventana
Aquí ponemos el nombre de la
variable inicial: EDAD
Aquí ponemos el nombre de la
variable destino: EDAD2
Aquí establecemos los valores de las
escalas.
Aquí ponemos el valor en la
nueva variable
JRAP
ComprobaciónComprobación
• Una vez que hemos realizado el procedimiento de recodificación se procede a comprobar si el procedimiento fue el correcto. Para ello:
– Se saca frecuencia de la variable Edad2– Se compara que exista igual número de
registros que en la variable EDAD.
JRAP
Los datos concuerdan
JRAP
• Ya tenemos una variable de exposición: Edad organizada en dos grupos: – Expuestas= Adolescentes; – No expuestas= Adultas.
• Nos falta definir la variable efecto. En esta base de datos hay una variable que se llama: “USAMETOD” Que significa si usa algún método anticonceptivo. El programa tiene 4 opciones: – 0=No usa; – 1=Usa método folklórico; – 2=Usa método tradicional y – 3=Usa método moderno.
• Debemos agrupar esta variable en dos categorías: Usa/No usa.
JRAP
Creamos una nueva variable: “Planifica”Creamos una nueva variable: “Planifica”
JRAP
Recodificamos la nueva variable: Planifica” en dos categorías: USA/NO USA, a partir de las 4 opciones de la vieja variable: “ USAMETOD que tenía 4 categorías.
Recodificamos la nueva variable: Planifica” en dos categorías: USA/NO USA, a partir de las 4 opciones de la vieja variable: “ USAMETOD que tenía 4 categorías.
JRAP
• Ahora podemos hacer un análisis bivariado o cruce de variables mediante la tabla 2X2. y usar la estadística que genera este tipo de análisis.
JRAP
Es importante que la variable exposición y la variable resultados esté bien definida en cada una de sus ventanas correspondientes.
Es importante que la variable exposición y la variable resultados esté bien definida en cada una de sus ventanas correspondientes.
JRAP
Vemos la distribución absoluta y relativa en porcentajes que puede ser interpretada como tasas de prevalencia.
Vemos la distribución absoluta y relativa en porcentajes que puede ser interpretada como tasas de prevalencia.
JRAP
Vemos el resultado del análisis simple de la tabla. Con su Odds Ratio y su intervalo de confianza. Además de otras estadísticas.
Vemos el resultado del análisis simple de la tabla. Con su Odds Ratio y su intervalo de confianza. Además de otras estadísticas.
JRAP
• En este caso al cruzar la edad en dos categorías: – Adolescentes– Adultas,
Contra: • planificación en sus dos categorías:
– No usa– Usa
• Encontramos que las adolescentes tienen 11 veces más probabilidades de no planificar que las mujeres adultas. (Dato tomado del OR=11) Y la asociación se dice significativa porque el intervalo de confianza no contiene al “1”
JRAP
¡Cuidado!¡Cuidado!
• Recordemos que de todas las mujeres encuestadas algunas (667) estaban ya embarazadas por lo tanto no es correcto que se tomen en cuenta en este análisis.
• Sería un error.
JRAP
Marcamos “Seleccionar”Marcamos
“Seleccionar”
Y definimos que a la variable “Embarazada” tomar en cuenta la opción “0” que son las que no están embarazadas y deberían planificar. La embarazada no debería planificar.
Y definimos que a la variable “Embarazada” tomar en cuenta la opción “0” que son las que no están embarazadas y deberían planificar. La embarazada no debería planificar.
JRAP
El programa solo va a tomar en cuenta 12393 mujeres no las 13060 que inicialmente estaban, porque una parte estaba embarazada al momento de aplicar la encuesta.
El programa solo va a tomar en cuenta 12393 mujeres no las 13060 que inicialmente estaban, porque una parte estaba embarazada al momento de aplicar la encuesta.
JRAP
Los resultados han cambiado, han cambiado poco pero han cambiado. El OR no es de 11 es de 12.2 y siempre es estadísticamente significativa porque el intervalo de confianza no contiene el “1”.
JRAP
Otros análisisOtros análisis
• Podemos hacer otros como regresión lineal y regresión logística.
• El programa tiene esa opción.
• Para la primera podemos cruzar la variable edad con la variable hijos. (Ambas son cuantitativas, condición para este tipo de análisis).
JRAP
Nos da un coeficiente de regresión de 0.35 que nos indica una pequeña asociación a incrementar el número de hijos cuando aumenta la edad.
Nos da un coeficiente de regresión de 0.35 que nos indica una pequeña asociación a incrementar el número de hijos cuando aumenta la edad.
JRAP
Graficada esta asociación se miraría así:Graficada esta asociación se miraría así:
Con una tendencia a aumentar el número de hijos a medida que aumenta la edad.
Con una tendencia a aumentar el número de hijos a medida que aumenta la edad.
JRAP
Para hacer una regresión logística y tomar en cuenta el peso de varias variables en el efecto de otra. En este caso el uso de métodos anticonceptivos. Se selecciona regresión logística y se seleccionan las variables en sus respectivas casillas: Resultados y Otras variables.
Para hacer una regresión logística y tomar en cuenta el peso de varias variables en el efecto de otra. En este caso el uso de métodos anticonceptivos. Se selecciona regresión logística y se seleccionan las variables en sus respectivas casillas: Resultados y Otras variables.
JRAP
Encontramos como peso el odds ratio de cada una de las variables. Siendo las variables de mayor peso en la causa del no uso de métodos anticonceptivos el no conocimiento de los métodos y el menor número de hijos vivos.
Encontramos como peso el odds ratio de cada una de las variables. Siendo las variables de mayor peso en la causa del no uso de métodos anticonceptivos el no conocimiento de los métodos y el menor número de hijos vivos.
JRAP
A practicarA practicar
• Bueno ahora solo les toca practicar e innovar las ideas para usar el programa como una herramienta poderosa para la estadística, la investigación y la vigilancia epidemiológica.
• Saludos
Dr. Juan Almendárez