APP/PS1 小鼠基因型的简捷方法研究 · 2018. 5. 10. · 编号:QC2015-59)。...

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ISSN1672-4305 CN12-1352 / N LABORATORY SCIENCE 21 2018 Vol 21 No 2 Apr 2018 一种鉴定 APP / PS1 双转基因 小鼠基因型的简捷方法研究 闫清伟 西藏民族大学 体育学院陕西 咸阳 712082APP / PS1 双转基因小鼠是体育科学领域研究运动改善 AD 分子机制的一种常用模型针对该模型小鼠的基因鉴定业内常用的办法较为繁琐实验操作过程中容易出错且实验过 程中采用的小剂量 DNA 抽提试剂盒增加了实验成本为克服这些弊端详细报道了一种简便高效低成本的基因鉴定方案并重点介绍了小鼠剪趾标记法方案,“ 一步法” DNA 抽提方案APP / PS1 小鼠基因型的鉴定提供了一种简捷高效的方法参考关键词基因型鉴定; APP / PS1 双转基因小鼠剪趾标记法; DNA 抽提 中图分类号G804 文献标识码doi10.3969 / j.issn.1672-4305.2018.02.003 Research of a simplified method for identification of APP / PS1 double transgenic mice YAN Qing-wei (College of Physical Education, Xizang Minzu University, Xianyang 712082, China) Abstract : APP / PS1 double transgenic mice is a commonly model for studying the mechanism of exer⁃ cise anti AD in sports science. The commonly method for gene identification of APP / PS1 transgenic mice is more cumbersome and error prone during the operating process of the experiment. And the small doses of DNA extraction kit increases the experiment cost. In order to overcome these disadvanta⁃ ges. This paper reports a simple, efficient and low cost strategy for gene identification in detail. It focu⁃ ses on the mice toe clipping labeling scheme and “one-step” DNA extraction scheme, this paper pro⁃ vides a simple and efficient method for genotypes identification of the APP / PS1 mice. Key words: genotype identification; APP / PS1 transgenic mice; toe clipping labeling scheme; DNA extraction 基金项目西藏自治区高校青年教师创新之处计划项目 编号:QC2015-59)。 阿尔茨海默病( Alzheimer’ s disease, AD) 是一 种中枢神经系统的进行性神经退行性疾病主要表 现有学习记忆能力减退或丧失大脑 Aβ 沉积老年 斑块增多,tau 蛋白过度磷酸化脑萎缩脑糖代谢下 降及蛋白质降解等特征 [1-3] 目前临床医学对 AD 仍无有效的治疗办法近年来体育科学领域的研 究显示合理规律的运动可明显延缓 AD 的病理进 [ 4 - 5] 但其内在机制尚不清楚仍需要开展广泛深 入的研究。 APP / PS1 双转基因小鼠是关于 AD 病理 研究的一种常用动物模型该模型小鼠价格昂贵在研究过程中可在购买种鼠后实验室自行繁殖由于繁殖时使用 APP / PS1 杂合子雄鼠与野生型雌 鼠交配繁殖根据孟德尔遗传定律可知子代小鼠中 1/2 概率的小鼠为野生型因此需对子代小鼠进 APP / PS1 基因型鉴定本研究系统介绍了一种 快速高效低成本的基因鉴定方案具体如下材料与器材 1.1 实验动物 本实验所用种鼠为 C57BL / 6 品系 APP / PS1 基因雄性小鼠及野生雌性小鼠均购自南京大学模 式动物研究所(1) 动物饲养条件 温度:25±1℃,湿度:45%,光照条件:12h 光照 12h 黑暗自由摄食与饮水

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 ISSN1672-4305CN12-1352 N

实    验    室    科    学

LABORATORY  SCIENCE第 21 卷  第 2 期  2018 年 4 月

Vol1049008 21  No1049008 2   Apr1049008 2018

一种鉴定 APP PS1 双转基因小鼠基因型的简捷方法研究

闫清伟(西藏民族大学 体育学院 陕西 咸阳  712082)

摘  要 APP PS1 双转基因小鼠是体育科学领域研究运动改善 AD 分子机制的一种常用模型针对该模型小鼠的基因鉴定 业内常用的办法较为繁琐 实验操作过程中容易出错 且实验过

程中采用的小剂量 DNA 抽提试剂盒增加了实验成本 为克服这些弊端 详细报道了一种简便高效 低成本的基因鉴定方案 并重点介绍了小鼠剪趾标记法方案 ldquo一步法rdquo DNA 抽提方案为 APP PS1小鼠基因型的鉴定提供了一种简捷高效的方法参考关键词 基因型鉴定 APP PS1 双转基因小鼠 剪趾标记法 DNA 抽提

中图分类号G804    文献标识码A    doi103969 jissn1672-4305201802003

Research of a simplified method for identificationof APP PS1 double transgenic mice

YAN Qing-wei(College of Physical Education Xizang Minzu University Xianyang 712082 China)

Abstract APP PS1 double transgenic mice is a commonly model for studying the mechanism of exercise anti AD in sports science The commonly method for gene identification of APP PS1 transgenicmice is more cumbersome and error prone during the operating process of the experiment And thesmall doses of DNA extraction kit increases the experiment cost In order to overcome these disadvantages This paper reports a simple efficient and low cost strategy for gene identification in detail It focuses on the mice toe clipping labeling scheme and ldquoone-steprdquo DNA extraction scheme this paper provides a simple and efficient method for genotypes identification of the APP PS1 miceKey words genotype identification APP PS1 transgenic mice toe clipping labeling scheme DNA extraction

                                              

 

                        

 

基金项目西藏自治区高校青年教师创新之处计划(项目

编号QC2015-59)

    阿尔茨海默病(Alzheimerrsquo s disease AD)是一

种中枢神经系统的进行性神经退行性疾病 主要表

现有学习记忆能力减退或丧失大脑 Aβ 沉积老年

斑块增多tau 蛋白过度磷酸化脑萎缩脑糖代谢下

降及蛋白质降解等特征[1-3] 目前临床医学对 AD仍无有效的治疗办法 近年来体育科学领域的研

究显示合理规律的运动可明显延缓 AD 的病理进

程[4 - 5]但其内在机制尚不清楚仍需要开展广泛深

入的研究 APP PS1 双转基因小鼠是关于 AD 病理

研究的一种常用动物模型 该模型小鼠价格昂贵在研究过程中可在购买种鼠后实验室自行繁殖

由于繁殖时使用 APP PS1 杂合子雄鼠与野生型雌

鼠交配繁殖根据孟德尔遗传定律可知子代小鼠中

有 1 2 概率的小鼠为野生型因此需对子代小鼠进

行 APP PS1 基因型鉴定 本研究系统介绍了一种

快速高效低成本的基因鉴定方案具体如下

1  材料与器材

11  实验动物

本实验所用种鼠为 C57BL 6 品系 APP PS1 转

基因雄性小鼠及野生雌性小鼠均购自南京大学模

式动物研究所(1)动物饲养条件

温度25plusmn1湿度45光照条件12h 光照 12h 黑暗自由摄食与饮水

闫清伟一种鉴定 APP PS1 双转基因小鼠基因型的简捷方法研究

(2)繁殖方法

1 只雄性 APP PS1 转基因小鼠与 3 只野生雌

性小鼠同笼饲养交配后约 20 天产仔 本实验共鉴

定 4 周龄新生小鼠 31 只鉴定的 APP PS1 双转基

因小鼠均为杂合子12  试剂与耗材

50mmol L NaOH 溶液 (实验室自配) pH8 0TrisHCl(实验室自配)2timesTaq Master Mix(Gene Solution)PS1 引物(上海生工生物工程技术服务有限

公司以下简称上海生工)50timesTAE(上海生工)琼脂糖(上海生工)核酸燃料 Gold view(上海浩然

生物)DNA Ladder(上海碧云天生物技术有限公

司以下简称碧云天)6times上样缓冲液(碧云天)15mL 离心管(碧云天)移液枪头(碧云天)PCR用八联管(碧云天)13  仪器

移液枪水浴锅低温高速离心机低速微型离

心机PCR 仪精密电子秤微波炉水平电泳仪凝胶成像系统

2  基因鉴定方法

21  剪趾标记

小鼠采用剪脚趾法进行序号标记 即小鼠前肢

每只 4 个脚趾前脚趾号码由左到右分别定义为

2030405060708090后肢每只有 5 个脚趾后脚趾号码由左到右分别定义为 12345678910如图 1 所示 这样前后组合一次最多标记

100 只小鼠 如 4 号鼠的标记法为剪左侧后肢第 4号脚趾16 号鼠标记方法为剪右侧后肢第 6 号脚

趾和第 10 号脚趾30 号鼠的标记法为剪左侧前肢

第 30 号脚趾99 号鼠的标记法为剪右侧前肢第 90号脚趾和右侧后肢第 9 号脚趾100 号鼠的标记方

法为剪右侧前肢第 90 号脚趾和右侧后肢第 10 号

脚趾其余以此类推

图 1  小鼠脚趾号码定义

22  DNA 抽提

本实验小鼠 DNA 抽提方法采用简捷的ldquo一步

法rdquo抽提方案 具体方法为

(1)将小鼠标记时剪掉的脚趾或剪尾巴 02 ~01049008 5cm 放入事前标好的 15mL 离心管中

(2)然后每管中加入 100μL 50mmol L 的 NaOH溶液放入 100水浴锅中水浴裂解 30min

(3)取出后每管加入 20μL pH= 80 的 TrisHCl中和涡轮混匀

(4)置于高速低温离心机 12000rpm 离心 5min所得离心管中的上清液即为抽提出的小鼠

DNA 混合溶液可用于后续 DNA 扩增反应23  DNA 扩增

231  引物

本实验所用 APP PS1 双转基因小鼠在原始构建

时其 APP 基因和 PS1 基因载体共用 PrP 启动子所以这两个基因为连锁表达表现为ldquo全或无rdquo的表达状

态即有 PS1 基因表达时则 APP 基因也同时表达为简化鉴定程序本实验只鉴定 PS1 基因其碱基数

为 608bp PS1 基因上游引物为5-AAT AGA GAACGG CAG GAG CA-3下游引物为5 -GCC ATGAGG GCA CTA ATC AT-3 由于鉴定基因型属定性

实验为简化实验程序本实验不设置内参232  20μL PCR 反应体系配置

本实验采用 20μL PCR 反应体系扩增小鼠 PS1基因反应体系配置方案见表 1 所示 每只小鼠对

应的扩增体系配置于事先标记好的 PCR 八联管中盖上八联盖震荡混匀微型离心机离心 15s用于

后续 DNA 扩增

表 1  20μL DNA 扩增反应体系

试剂 体积(μL) 规格

2 times MasterMix

10

50units mLTaq DNA Polymerase 2 times PCR Buffer ( pH8 5)4mM MgCL2 2 times Loading dyedATP dCTP dGTP dTTP01049008 4mM each

上游引物 004 100μM L

下游引物 004 100Μm L

DNA 模板 2

ddH2O 792

233  PCR 扩增

将上述装有配制好的 20μL 小鼠 DNA 扩增体

系的八联管置于 PCR 扩增以上扩增设置扩增程

序 基本程序为(1)95预变性 5min(共 1 个循环)(2)95变性 30s58退火 35s72延伸 45s

(共 40 个循环)(3)72充分延伸 3min(共 1 个循环)(4)扩增完毕 4保持(循环数infin )如图 2 所

示 总扩增时间大约需要 2h

图 2  PS1 基因 PCR 反应程序

24  琼脂糖凝胶电泳

241  1琼脂糖凝胶配制

用精密电子秤称取 1g 琼脂糖导入 300mL 锥

形瓶中 再用量筒量取 100mL 1timesTAE 溶液倒入上

述锥形瓶中微波加热溶解 待琼脂糖完全溶解后

取出室温放置 5 ~ 10min 后用移液枪吸取核酸染

料 Gold view 10μL 加入该锥形瓶中充分混匀后倒

入事先准备好的插有梳子的制胶槽中室温冷却凝

固大约需要 30min 待胶凝固后拔出梳子然后将

胶放入事先准备好的水平电泳槽中倒入适量(使TAE 溶液高于胶面)1timesTAE 溶液待用242  电泳及成像

点样法使 10μL DNA 扩增产物与 6 times Loadingbuffer 2μL 充分混合每孔上样量为 10μL凝胶两端

胶孔中各加入 5μL DNA Ladder上样完毕后110V电压电泳 30min电泳结束后将凝胶置于凝胶成像

系统中观察并拍照

3  结果

凝胶成像显示本实验所鉴定的 31 只子代小鼠

中有 13 只为 APP PS1 双转基因小鼠 本次扩增

的 PS1 基因 DNA 链长为 608bp因此在 500bp 和

1000bp 之间显示条带的孔道均有 PS1 基因条带该孔对应的小鼠为 APP PS1 双转基因小鼠 本实

验鉴定出的 APP PS1 双转基因小鼠对应的泳道分

别是 14512131618192324252729见图

3 所示

图 3  小鼠 PS1 基因凝胶系统成像

4  讨论

APP PS1 双转基因小鼠是目前体育科学领域

研究运动干预阿尔茨海默病分子机制的一种较为常

用的转基因动物模型其主要是给 C57BL 6 小鼠转

入 APP 和 PS1 两个基因使小鼠过表达淀粉样前体

蛋白进而在低月龄时即可表现出 Aβ 堆积的 AD 症

状[6 - 7] 目前对于运动干预阿尔茨海默病的病理机

制研究中采用的 APP PS1 双转基因模型在进行选

择实验动物之前不可避免要对动物的基因型进行

鉴定因此合理高效的基因鉴定方案是提高实验效

率的关键 本实验采用的基因鉴定方案其优点主

要在于 DNA 的ldquo一步法rdquo抽提方案该方案可有效

降低鉴定成本缩短鉴定时耗对于 APP PS1 基因的鉴定以往的研究多采用

专用的小剂量 DNA 抽提试剂盒进行 DNA 抽

提[8-10] 小剂量 DNA 抽提试剂盒在抽提 DNA 时虽有抽提纯度高的优点但其整个抽提耗时较长通常在第一步裂解时即需要 6 ~ 8h整个鉴定过程需

12h 以上且中间程序繁琐操作时容易出错 由于

对 APP PS1 基因鉴定仅为定性研究无需定量因此可采用粗略的ldquo一步法rdquo抽提方案且后续 PCR 扩

增时无需对内参基因进行扩增 ldquo一步法rdquo抽提方

案中间过程操作简捷不易出错其可在 40min 内完

成对 DNA 的抽提且抽提试剂为一般实验室常用试

剂实验室可自行配制因而大大节约了时间成本和

经济成本对于一般的 APP PS1 基因及其他基因的

鉴定3h 左右即可得出结果 因此本实验所采用

的基因鉴定方案有准确高效操作简便等优点极大地降低了实验的难度和成本是一种值得借鉴和

推广的基因鉴定方案

5  结语

ldquo一步法rdquo基因鉴定方法为基因型鉴定提供了

一种快速高效的方法参考其关键在于对 DNA 抽提

过程的方法改进该方法显著提高了对转基因小鼠

的鉴定与分选效率有利于后续科学研究的快速高

效开展

参考文献(References)

[1]   Cacabelos RTorrellas CLoacutepez-Muntildeoz FEpigenomics of Alzheimers Disease[ J] Journal of Experimental Clinical Medicine20146(3)75-82

[2]   Collins JMKing A EWoodhouse Aet alThe effect of focal braininjury on beta-amyloid plaque deposition inflammation and synapses in the APP PS1 mouse model of Alzheimer s disease[ J] Experimental Neurology2015267219-229

(下转第 14 页)

01                    

(d)颜色熵检索结果

图 2  花草检索结果

(a)灰度共生矩阵的检索结果

(b)Gabor 小波检索的结果

图 3  纹理图像检索结果

经过多次实验选用不同的图像和不同的方法比

较分析可知在颜色特征方面颜色直方图描述了各

个颜色出现的频率适用于颜色信息种类较多的图

像累积直方图与颜色直方图检索结果大致相似但是计算精度有所提高因此可用于检索图像质量不好

的图像能有效提高检索结果的精确度颜色矩利用

其前三阶矩来表达颜色的分布信息区分能力较弱所以适用于图像间差异大的图像库颜色熵可用于检

索形状相同颜色却不一样的相关物体 在纹理特征

方面灰度共生矩阵的纹理特征适用于描述大而疏的

图像对于细密的图像检索效果较差Gabor 小波变换

方法比灰度共生矩阵检索效果好不仅可以获得较好

的频域信息同时还能反映图像像素的空间信息并且对图像的尺寸变化不敏感适合进行多尺度分析

3  结语

根据视频处理与分析的过程并结合教学需求

设计多个实验本文选取运动目标跟踪和图像检索

作为示例进行说明 首先介绍了视频处理与分析的

重要性以及实验设计的必要性然后是对实验课程

设计的介绍包括实验目的实验环境实验方法和

结果分析 实验的设计不仅使课堂教学与实践教学

相统一便于学生理解抽象的图像特征而且提高学

生的动手和创新实践能力激发学生兴趣

参考文献(References)

[1]   陈汗青数字图像处理技术研究进展[ J] 工业控制计算机201326(1)72-74

[2]   田晨旭蔡绪福杨昌跃等ldquo实验教学+rdquo的设计策略与实现

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子与信息学报201032(5)1111-1115[5]   谢红原博解武等LK 光流法和三帧差分法的运动目标检测

算法[J] 应用科技201643(3)23-27[6]   李国杨国庆张心珂等一种基于尺度不变特征点的运动目

标检测算法[J] 信息与控制200837(3)280-283[7]   王莲基于内容的图像检索研究进展[ J] 现代情报200525

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201239(11)243-245[9]   李友峰基于颜色和纹理特征的图像检索相关算法的研究

[D]成都电子科技大学2009[10]   王晓东纹理图像分类系统及其关键技术研究[D]南京南

京邮电大学2013[11]   贾婧王忠芝基于共生矩阵的图像检索系统的研究[ J] 微计

算机信息201026(29)202-203

收稿日期2017-08-02修改日期2017-09-27作者简介刘永康(1991-)男山东寿光人研究生主要研

究方向数字图像处理模式识别

10509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979(上接第 10 页)[3]   Zerbi VKleinnijenhuis MFang Xet alGray and white matter de

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的繁殖及基因型鉴定[J]实用中西医结合临床2015(10)4-6[10]   宋敏唐军李达兵等 PS1 APP 双转基因阿尔茨海默病模

型传代小鼠的基因型鉴定及其组织学分析[ J] 第三军医大

学学报2006(14)1453-1456

收稿日期2017-08-02修改日期2017-08-31作者简介闫清伟(1982-)男河南新乡人博士讲师主

要研究方向为体育学习与身心健康

41                    

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闫清伟一种鉴定 APP PS1 双转基因小鼠基因型的简捷方法研究

(2)繁殖方法

1 只雄性 APP PS1 转基因小鼠与 3 只野生雌

性小鼠同笼饲养交配后约 20 天产仔 本实验共鉴

定 4 周龄新生小鼠 31 只鉴定的 APP PS1 双转基

因小鼠均为杂合子12  试剂与耗材

50mmol L NaOH 溶液 (实验室自配) pH8 0TrisHCl(实验室自配)2timesTaq Master Mix(Gene Solution)PS1 引物(上海生工生物工程技术服务有限

公司以下简称上海生工)50timesTAE(上海生工)琼脂糖(上海生工)核酸燃料 Gold view(上海浩然

生物)DNA Ladder(上海碧云天生物技术有限公

司以下简称碧云天)6times上样缓冲液(碧云天)15mL 离心管(碧云天)移液枪头(碧云天)PCR用八联管(碧云天)13  仪器

移液枪水浴锅低温高速离心机低速微型离

心机PCR 仪精密电子秤微波炉水平电泳仪凝胶成像系统

2  基因鉴定方法

21  剪趾标记

小鼠采用剪脚趾法进行序号标记 即小鼠前肢

每只 4 个脚趾前脚趾号码由左到右分别定义为

2030405060708090后肢每只有 5 个脚趾后脚趾号码由左到右分别定义为 12345678910如图 1 所示 这样前后组合一次最多标记

100 只小鼠 如 4 号鼠的标记法为剪左侧后肢第 4号脚趾16 号鼠标记方法为剪右侧后肢第 6 号脚

趾和第 10 号脚趾30 号鼠的标记法为剪左侧前肢

第 30 号脚趾99 号鼠的标记法为剪右侧前肢第 90号脚趾和右侧后肢第 9 号脚趾100 号鼠的标记方

法为剪右侧前肢第 90 号脚趾和右侧后肢第 10 号

脚趾其余以此类推

图 1  小鼠脚趾号码定义

22  DNA 抽提

本实验小鼠 DNA 抽提方法采用简捷的ldquo一步

法rdquo抽提方案 具体方法为

(1)将小鼠标记时剪掉的脚趾或剪尾巴 02 ~01049008 5cm 放入事前标好的 15mL 离心管中

(2)然后每管中加入 100μL 50mmol L 的 NaOH溶液放入 100水浴锅中水浴裂解 30min

(3)取出后每管加入 20μL pH= 80 的 TrisHCl中和涡轮混匀

(4)置于高速低温离心机 12000rpm 离心 5min所得离心管中的上清液即为抽提出的小鼠

DNA 混合溶液可用于后续 DNA 扩增反应23  DNA 扩增

231  引物

本实验所用 APP PS1 双转基因小鼠在原始构建

时其 APP 基因和 PS1 基因载体共用 PrP 启动子所以这两个基因为连锁表达表现为ldquo全或无rdquo的表达状

态即有 PS1 基因表达时则 APP 基因也同时表达为简化鉴定程序本实验只鉴定 PS1 基因其碱基数

为 608bp PS1 基因上游引物为5-AAT AGA GAACGG CAG GAG CA-3下游引物为5 -GCC ATGAGG GCA CTA ATC AT-3 由于鉴定基因型属定性

实验为简化实验程序本实验不设置内参232  20μL PCR 反应体系配置

本实验采用 20μL PCR 反应体系扩增小鼠 PS1基因反应体系配置方案见表 1 所示 每只小鼠对

应的扩增体系配置于事先标记好的 PCR 八联管中盖上八联盖震荡混匀微型离心机离心 15s用于

后续 DNA 扩增

表 1  20μL DNA 扩增反应体系

试剂 体积(μL) 规格

2 times MasterMix

10

50units mLTaq DNA Polymerase 2 times PCR Buffer ( pH8 5)4mM MgCL2 2 times Loading dyedATP dCTP dGTP dTTP01049008 4mM each

上游引物 004 100μM L

下游引物 004 100Μm L

DNA 模板 2

ddH2O 792

233  PCR 扩增

将上述装有配制好的 20μL 小鼠 DNA 扩增体

系的八联管置于 PCR 扩增以上扩增设置扩增程

序 基本程序为(1)95预变性 5min(共 1 个循环)(2)95变性 30s58退火 35s72延伸 45s

(共 40 个循环)(3)72充分延伸 3min(共 1 个循环)(4)扩增完毕 4保持(循环数infin )如图 2 所

示 总扩增时间大约需要 2h

图 2  PS1 基因 PCR 反应程序

24  琼脂糖凝胶电泳

241  1琼脂糖凝胶配制

用精密电子秤称取 1g 琼脂糖导入 300mL 锥

形瓶中 再用量筒量取 100mL 1timesTAE 溶液倒入上

述锥形瓶中微波加热溶解 待琼脂糖完全溶解后

取出室温放置 5 ~ 10min 后用移液枪吸取核酸染

料 Gold view 10μL 加入该锥形瓶中充分混匀后倒

入事先准备好的插有梳子的制胶槽中室温冷却凝

固大约需要 30min 待胶凝固后拔出梳子然后将

胶放入事先准备好的水平电泳槽中倒入适量(使TAE 溶液高于胶面)1timesTAE 溶液待用242  电泳及成像

点样法使 10μL DNA 扩增产物与 6 times Loadingbuffer 2μL 充分混合每孔上样量为 10μL凝胶两端

胶孔中各加入 5μL DNA Ladder上样完毕后110V电压电泳 30min电泳结束后将凝胶置于凝胶成像

系统中观察并拍照

3  结果

凝胶成像显示本实验所鉴定的 31 只子代小鼠

中有 13 只为 APP PS1 双转基因小鼠 本次扩增

的 PS1 基因 DNA 链长为 608bp因此在 500bp 和

1000bp 之间显示条带的孔道均有 PS1 基因条带该孔对应的小鼠为 APP PS1 双转基因小鼠 本实

验鉴定出的 APP PS1 双转基因小鼠对应的泳道分

别是 14512131618192324252729见图

3 所示

图 3  小鼠 PS1 基因凝胶系统成像

4  讨论

APP PS1 双转基因小鼠是目前体育科学领域

研究运动干预阿尔茨海默病分子机制的一种较为常

用的转基因动物模型其主要是给 C57BL 6 小鼠转

入 APP 和 PS1 两个基因使小鼠过表达淀粉样前体

蛋白进而在低月龄时即可表现出 Aβ 堆积的 AD 症

状[6 - 7] 目前对于运动干预阿尔茨海默病的病理机

制研究中采用的 APP PS1 双转基因模型在进行选

择实验动物之前不可避免要对动物的基因型进行

鉴定因此合理高效的基因鉴定方案是提高实验效

率的关键 本实验采用的基因鉴定方案其优点主

要在于 DNA 的ldquo一步法rdquo抽提方案该方案可有效

降低鉴定成本缩短鉴定时耗对于 APP PS1 基因的鉴定以往的研究多采用

专用的小剂量 DNA 抽提试剂盒进行 DNA 抽

提[8-10] 小剂量 DNA 抽提试剂盒在抽提 DNA 时虽有抽提纯度高的优点但其整个抽提耗时较长通常在第一步裂解时即需要 6 ~ 8h整个鉴定过程需

12h 以上且中间程序繁琐操作时容易出错 由于

对 APP PS1 基因鉴定仅为定性研究无需定量因此可采用粗略的ldquo一步法rdquo抽提方案且后续 PCR 扩

增时无需对内参基因进行扩增 ldquo一步法rdquo抽提方

案中间过程操作简捷不易出错其可在 40min 内完

成对 DNA 的抽提且抽提试剂为一般实验室常用试

剂实验室可自行配制因而大大节约了时间成本和

经济成本对于一般的 APP PS1 基因及其他基因的

鉴定3h 左右即可得出结果 因此本实验所采用

的基因鉴定方案有准确高效操作简便等优点极大地降低了实验的难度和成本是一种值得借鉴和

推广的基因鉴定方案

5  结语

ldquo一步法rdquo基因鉴定方法为基因型鉴定提供了

一种快速高效的方法参考其关键在于对 DNA 抽提

过程的方法改进该方法显著提高了对转基因小鼠

的鉴定与分选效率有利于后续科学研究的快速高

效开展

参考文献(References)

[1]   Cacabelos RTorrellas CLoacutepez-Muntildeoz FEpigenomics of Alzheimers Disease[ J] Journal of Experimental Clinical Medicine20146(3)75-82

[2]   Collins JMKing A EWoodhouse Aet alThe effect of focal braininjury on beta-amyloid plaque deposition inflammation and synapses in the APP PS1 mouse model of Alzheimer s disease[ J] Experimental Neurology2015267219-229

(下转第 14 页)

01                    

(d)颜色熵检索结果

图 2  花草检索结果

(a)灰度共生矩阵的检索结果

(b)Gabor 小波检索的结果

图 3  纹理图像检索结果

经过多次实验选用不同的图像和不同的方法比

较分析可知在颜色特征方面颜色直方图描述了各

个颜色出现的频率适用于颜色信息种类较多的图

像累积直方图与颜色直方图检索结果大致相似但是计算精度有所提高因此可用于检索图像质量不好

的图像能有效提高检索结果的精确度颜色矩利用

其前三阶矩来表达颜色的分布信息区分能力较弱所以适用于图像间差异大的图像库颜色熵可用于检

索形状相同颜色却不一样的相关物体 在纹理特征

方面灰度共生矩阵的纹理特征适用于描述大而疏的

图像对于细密的图像检索效果较差Gabor 小波变换

方法比灰度共生矩阵检索效果好不仅可以获得较好

的频域信息同时还能反映图像像素的空间信息并且对图像的尺寸变化不敏感适合进行多尺度分析

3  结语

根据视频处理与分析的过程并结合教学需求

设计多个实验本文选取运动目标跟踪和图像检索

作为示例进行说明 首先介绍了视频处理与分析的

重要性以及实验设计的必要性然后是对实验课程

设计的介绍包括实验目的实验环境实验方法和

结果分析 实验的设计不仅使课堂教学与实践教学

相统一便于学生理解抽象的图像特征而且提高学

生的动手和创新实践能力激发学生兴趣

参考文献(References)

[1]   陈汗青数字图像处理技术研究进展[ J] 工业控制计算机201326(1)72-74

[2]   田晨旭蔡绪福杨昌跃等ldquo实验教学+rdquo的设计策略与实现

方法[J] 实验科学与技术201715(1)131-133[3]   秦小文基于视频序列的运动目标检测与跟踪算法的研究

[D]太原中北大学2012[4]   高韬刘正光张军等基于特征点的多运动目标跟踪[ J] 电

子与信息学报201032(5)1111-1115[5]   谢红原博解武等LK 光流法和三帧差分法的运动目标检测

算法[J] 应用科技201643(3)23-27[6]   李国杨国庆张心珂等一种基于尺度不变特征点的运动目

标检测算法[J] 信息与控制200837(3)280-283[7]   王莲基于内容的图像检索研究进展[ J] 现代情报200525

(5)25-28[8]   张鑫基于颜色特征的图像检索方法研究[ J] 计算机科学

201239(11)243-245[9]   李友峰基于颜色和纹理特征的图像检索相关算法的研究

[D]成都电子科技大学2009[10]   王晓东纹理图像分类系统及其关键技术研究[D]南京南

京邮电大学2013[11]   贾婧王忠芝基于共生矩阵的图像检索系统的研究[ J] 微计

算机信息201026(29)202-203

收稿日期2017-08-02修改日期2017-09-27作者简介刘永康(1991-)男山东寿光人研究生主要研

究方向数字图像处理模式识别

10509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979(上接第 10 页)[3]   Zerbi VKleinnijenhuis MFang Xet alGray and white matter de

generation revealed by diffusion in an Alzheimer mouse model[J] Neurobiology of Aging 2013 34(5) 1440-1450

[4]   Liu H Zhao G Zhang H et al Long-term treadmill exercise inhibits the progression of Alzheimers disease-like neuropathologyin the hippocampus of APP PS1 transgenicmice[ J] BehaviouralBrain Research2013256261-272

[5]   LiuHZhao GCai Ket alTreadmill exercise prevents decline inspatial learning and memory in APP PS1 transgenic mice throughimprovement of hippocampal long - term potentiation [ J] Behavioural Brain Research2011218(2)308-314

[6]   ZhangYYin FLiu Jet alGeniposide attenuates insulin-deficiency-induced acceleration of β-amyloidosis in an APP PS1 transgenic model of Alzheimerrsquo s disease[ J] Neurochemistry International2015897-16

[7]   YaoZJing HWang Det al Valproic acid ameliorates olfactorydysfunction in APP PS1 transgenic mice of Alzheimers diseaseAmeliorations from the olfactory epithelium to the olfactory bulb[J] Pharmacology Biochemistry and Behavior201614453-59

[8]   武强李露斯范文辉等APP PS1 双转基因 AD 传代小鼠的基因

型鉴定及其行为学分析[J]卒中与神经疾病2009(5)293-296[9]   毛敬洁李钻芳林如辉等APP PSl 双转基因阿尔海默病小鼠

的繁殖及基因型鉴定[J]实用中西医结合临床2015(10)4-6[10]   宋敏唐军李达兵等 PS1 APP 双转基因阿尔茨海默病模

型传代小鼠的基因型鉴定及其组织学分析[ J] 第三军医大

学学报2006(14)1453-1456

收稿日期2017-08-02修改日期2017-08-31作者简介闫清伟(1982-)男河南新乡人博士讲师主

要研究方向为体育学习与身心健康

41                    

Page 3: APP/PS1 小鼠基因型的简捷方法研究 · 2018. 5. 10. · 编号:QC2015-59)。 阿尔茨海默病(Alzheimer’sdisease,AD)是一 种中枢神经系统的进行性神经退行性疾病。主要表

(共 40 个循环)(3)72充分延伸 3min(共 1 个循环)(4)扩增完毕 4保持(循环数infin )如图 2 所

示 总扩增时间大约需要 2h

图 2  PS1 基因 PCR 反应程序

24  琼脂糖凝胶电泳

241  1琼脂糖凝胶配制

用精密电子秤称取 1g 琼脂糖导入 300mL 锥

形瓶中 再用量筒量取 100mL 1timesTAE 溶液倒入上

述锥形瓶中微波加热溶解 待琼脂糖完全溶解后

取出室温放置 5 ~ 10min 后用移液枪吸取核酸染

料 Gold view 10μL 加入该锥形瓶中充分混匀后倒

入事先准备好的插有梳子的制胶槽中室温冷却凝

固大约需要 30min 待胶凝固后拔出梳子然后将

胶放入事先准备好的水平电泳槽中倒入适量(使TAE 溶液高于胶面)1timesTAE 溶液待用242  电泳及成像

点样法使 10μL DNA 扩增产物与 6 times Loadingbuffer 2μL 充分混合每孔上样量为 10μL凝胶两端

胶孔中各加入 5μL DNA Ladder上样完毕后110V电压电泳 30min电泳结束后将凝胶置于凝胶成像

系统中观察并拍照

3  结果

凝胶成像显示本实验所鉴定的 31 只子代小鼠

中有 13 只为 APP PS1 双转基因小鼠 本次扩增

的 PS1 基因 DNA 链长为 608bp因此在 500bp 和

1000bp 之间显示条带的孔道均有 PS1 基因条带该孔对应的小鼠为 APP PS1 双转基因小鼠 本实

验鉴定出的 APP PS1 双转基因小鼠对应的泳道分

别是 14512131618192324252729见图

3 所示

图 3  小鼠 PS1 基因凝胶系统成像

4  讨论

APP PS1 双转基因小鼠是目前体育科学领域

研究运动干预阿尔茨海默病分子机制的一种较为常

用的转基因动物模型其主要是给 C57BL 6 小鼠转

入 APP 和 PS1 两个基因使小鼠过表达淀粉样前体

蛋白进而在低月龄时即可表现出 Aβ 堆积的 AD 症

状[6 - 7] 目前对于运动干预阿尔茨海默病的病理机

制研究中采用的 APP PS1 双转基因模型在进行选

择实验动物之前不可避免要对动物的基因型进行

鉴定因此合理高效的基因鉴定方案是提高实验效

率的关键 本实验采用的基因鉴定方案其优点主

要在于 DNA 的ldquo一步法rdquo抽提方案该方案可有效

降低鉴定成本缩短鉴定时耗对于 APP PS1 基因的鉴定以往的研究多采用

专用的小剂量 DNA 抽提试剂盒进行 DNA 抽

提[8-10] 小剂量 DNA 抽提试剂盒在抽提 DNA 时虽有抽提纯度高的优点但其整个抽提耗时较长通常在第一步裂解时即需要 6 ~ 8h整个鉴定过程需

12h 以上且中间程序繁琐操作时容易出错 由于

对 APP PS1 基因鉴定仅为定性研究无需定量因此可采用粗略的ldquo一步法rdquo抽提方案且后续 PCR 扩

增时无需对内参基因进行扩增 ldquo一步法rdquo抽提方

案中间过程操作简捷不易出错其可在 40min 内完

成对 DNA 的抽提且抽提试剂为一般实验室常用试

剂实验室可自行配制因而大大节约了时间成本和

经济成本对于一般的 APP PS1 基因及其他基因的

鉴定3h 左右即可得出结果 因此本实验所采用

的基因鉴定方案有准确高效操作简便等优点极大地降低了实验的难度和成本是一种值得借鉴和

推广的基因鉴定方案

5  结语

ldquo一步法rdquo基因鉴定方法为基因型鉴定提供了

一种快速高效的方法参考其关键在于对 DNA 抽提

过程的方法改进该方法显著提高了对转基因小鼠

的鉴定与分选效率有利于后续科学研究的快速高

效开展

参考文献(References)

[1]   Cacabelos RTorrellas CLoacutepez-Muntildeoz FEpigenomics of Alzheimers Disease[ J] Journal of Experimental Clinical Medicine20146(3)75-82

[2]   Collins JMKing A EWoodhouse Aet alThe effect of focal braininjury on beta-amyloid plaque deposition inflammation and synapses in the APP PS1 mouse model of Alzheimer s disease[ J] Experimental Neurology2015267219-229

(下转第 14 页)

01                    

(d)颜色熵检索结果

图 2  花草检索结果

(a)灰度共生矩阵的检索结果

(b)Gabor 小波检索的结果

图 3  纹理图像检索结果

经过多次实验选用不同的图像和不同的方法比

较分析可知在颜色特征方面颜色直方图描述了各

个颜色出现的频率适用于颜色信息种类较多的图

像累积直方图与颜色直方图检索结果大致相似但是计算精度有所提高因此可用于检索图像质量不好

的图像能有效提高检索结果的精确度颜色矩利用

其前三阶矩来表达颜色的分布信息区分能力较弱所以适用于图像间差异大的图像库颜色熵可用于检

索形状相同颜色却不一样的相关物体 在纹理特征

方面灰度共生矩阵的纹理特征适用于描述大而疏的

图像对于细密的图像检索效果较差Gabor 小波变换

方法比灰度共生矩阵检索效果好不仅可以获得较好

的频域信息同时还能反映图像像素的空间信息并且对图像的尺寸变化不敏感适合进行多尺度分析

3  结语

根据视频处理与分析的过程并结合教学需求

设计多个实验本文选取运动目标跟踪和图像检索

作为示例进行说明 首先介绍了视频处理与分析的

重要性以及实验设计的必要性然后是对实验课程

设计的介绍包括实验目的实验环境实验方法和

结果分析 实验的设计不仅使课堂教学与实践教学

相统一便于学生理解抽象的图像特征而且提高学

生的动手和创新实践能力激发学生兴趣

参考文献(References)

[1]   陈汗青数字图像处理技术研究进展[ J] 工业控制计算机201326(1)72-74

[2]   田晨旭蔡绪福杨昌跃等ldquo实验教学+rdquo的设计策略与实现

方法[J] 实验科学与技术201715(1)131-133[3]   秦小文基于视频序列的运动目标检测与跟踪算法的研究

[D]太原中北大学2012[4]   高韬刘正光张军等基于特征点的多运动目标跟踪[ J] 电

子与信息学报201032(5)1111-1115[5]   谢红原博解武等LK 光流法和三帧差分法的运动目标检测

算法[J] 应用科技201643(3)23-27[6]   李国杨国庆张心珂等一种基于尺度不变特征点的运动目

标检测算法[J] 信息与控制200837(3)280-283[7]   王莲基于内容的图像检索研究进展[ J] 现代情报200525

(5)25-28[8]   张鑫基于颜色特征的图像检索方法研究[ J] 计算机科学

201239(11)243-245[9]   李友峰基于颜色和纹理特征的图像检索相关算法的研究

[D]成都电子科技大学2009[10]   王晓东纹理图像分类系统及其关键技术研究[D]南京南

京邮电大学2013[11]   贾婧王忠芝基于共生矩阵的图像检索系统的研究[ J] 微计

算机信息201026(29)202-203

收稿日期2017-08-02修改日期2017-09-27作者简介刘永康(1991-)男山东寿光人研究生主要研

究方向数字图像处理模式识别

10509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979(上接第 10 页)[3]   Zerbi VKleinnijenhuis MFang Xet alGray and white matter de

generation revealed by diffusion in an Alzheimer mouse model[J] Neurobiology of Aging 2013 34(5) 1440-1450

[4]   Liu H Zhao G Zhang H et al Long-term treadmill exercise inhibits the progression of Alzheimers disease-like neuropathologyin the hippocampus of APP PS1 transgenicmice[ J] BehaviouralBrain Research2013256261-272

[5]   LiuHZhao GCai Ket alTreadmill exercise prevents decline inspatial learning and memory in APP PS1 transgenic mice throughimprovement of hippocampal long - term potentiation [ J] Behavioural Brain Research2011218(2)308-314

[6]   ZhangYYin FLiu Jet alGeniposide attenuates insulin-deficiency-induced acceleration of β-amyloidosis in an APP PS1 transgenic model of Alzheimerrsquo s disease[ J] Neurochemistry International2015897-16

[7]   YaoZJing HWang Det al Valproic acid ameliorates olfactorydysfunction in APP PS1 transgenic mice of Alzheimers diseaseAmeliorations from the olfactory epithelium to the olfactory bulb[J] Pharmacology Biochemistry and Behavior201614453-59

[8]   武强李露斯范文辉等APP PS1 双转基因 AD 传代小鼠的基因

型鉴定及其行为学分析[J]卒中与神经疾病2009(5)293-296[9]   毛敬洁李钻芳林如辉等APP PSl 双转基因阿尔海默病小鼠

的繁殖及基因型鉴定[J]实用中西医结合临床2015(10)4-6[10]   宋敏唐军李达兵等 PS1 APP 双转基因阿尔茨海默病模

型传代小鼠的基因型鉴定及其组织学分析[ J] 第三军医大

学学报2006(14)1453-1456

收稿日期2017-08-02修改日期2017-08-31作者简介闫清伟(1982-)男河南新乡人博士讲师主

要研究方向为体育学习与身心健康

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Page 4: APP/PS1 小鼠基因型的简捷方法研究 · 2018. 5. 10. · 编号:QC2015-59)。 阿尔茨海默病(Alzheimer’sdisease,AD)是一 种中枢神经系统的进行性神经退行性疾病。主要表

(d)颜色熵检索结果

图 2  花草检索结果

(a)灰度共生矩阵的检索结果

(b)Gabor 小波检索的结果

图 3  纹理图像检索结果

经过多次实验选用不同的图像和不同的方法比

较分析可知在颜色特征方面颜色直方图描述了各

个颜色出现的频率适用于颜色信息种类较多的图

像累积直方图与颜色直方图检索结果大致相似但是计算精度有所提高因此可用于检索图像质量不好

的图像能有效提高检索结果的精确度颜色矩利用

其前三阶矩来表达颜色的分布信息区分能力较弱所以适用于图像间差异大的图像库颜色熵可用于检

索形状相同颜色却不一样的相关物体 在纹理特征

方面灰度共生矩阵的纹理特征适用于描述大而疏的

图像对于细密的图像检索效果较差Gabor 小波变换

方法比灰度共生矩阵检索效果好不仅可以获得较好

的频域信息同时还能反映图像像素的空间信息并且对图像的尺寸变化不敏感适合进行多尺度分析

3  结语

根据视频处理与分析的过程并结合教学需求

设计多个实验本文选取运动目标跟踪和图像检索

作为示例进行说明 首先介绍了视频处理与分析的

重要性以及实验设计的必要性然后是对实验课程

设计的介绍包括实验目的实验环境实验方法和

结果分析 实验的设计不仅使课堂教学与实践教学

相统一便于学生理解抽象的图像特征而且提高学

生的动手和创新实践能力激发学生兴趣

参考文献(References)

[1]   陈汗青数字图像处理技术研究进展[ J] 工业控制计算机201326(1)72-74

[2]   田晨旭蔡绪福杨昌跃等ldquo实验教学+rdquo的设计策略与实现

方法[J] 实验科学与技术201715(1)131-133[3]   秦小文基于视频序列的运动目标检测与跟踪算法的研究

[D]太原中北大学2012[4]   高韬刘正光张军等基于特征点的多运动目标跟踪[ J] 电

子与信息学报201032(5)1111-1115[5]   谢红原博解武等LK 光流法和三帧差分法的运动目标检测

算法[J] 应用科技201643(3)23-27[6]   李国杨国庆张心珂等一种基于尺度不变特征点的运动目

标检测算法[J] 信息与控制200837(3)280-283[7]   王莲基于内容的图像检索研究进展[ J] 现代情报200525

(5)25-28[8]   张鑫基于颜色特征的图像检索方法研究[ J] 计算机科学

201239(11)243-245[9]   李友峰基于颜色和纹理特征的图像检索相关算法的研究

[D]成都电子科技大学2009[10]   王晓东纹理图像分类系统及其关键技术研究[D]南京南

京邮电大学2013[11]   贾婧王忠芝基于共生矩阵的图像检索系统的研究[ J] 微计

算机信息201026(29)202-203

收稿日期2017-08-02修改日期2017-09-27作者简介刘永康(1991-)男山东寿光人研究生主要研

究方向数字图像处理模式识别

10509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979105097910509791050979(上接第 10 页)[3]   Zerbi VKleinnijenhuis MFang Xet alGray and white matter de

generation revealed by diffusion in an Alzheimer mouse model[J] Neurobiology of Aging 2013 34(5) 1440-1450

[4]   Liu H Zhao G Zhang H et al Long-term treadmill exercise inhibits the progression of Alzheimers disease-like neuropathologyin the hippocampus of APP PS1 transgenicmice[ J] BehaviouralBrain Research2013256261-272

[5]   LiuHZhao GCai Ket alTreadmill exercise prevents decline inspatial learning and memory in APP PS1 transgenic mice throughimprovement of hippocampal long - term potentiation [ J] Behavioural Brain Research2011218(2)308-314

[6]   ZhangYYin FLiu Jet alGeniposide attenuates insulin-deficiency-induced acceleration of β-amyloidosis in an APP PS1 transgenic model of Alzheimerrsquo s disease[ J] Neurochemistry International2015897-16

[7]   YaoZJing HWang Det al Valproic acid ameliorates olfactorydysfunction in APP PS1 transgenic mice of Alzheimers diseaseAmeliorations from the olfactory epithelium to the olfactory bulb[J] Pharmacology Biochemistry and Behavior201614453-59

[8]   武强李露斯范文辉等APP PS1 双转基因 AD 传代小鼠的基因

型鉴定及其行为学分析[J]卒中与神经疾病2009(5)293-296[9]   毛敬洁李钻芳林如辉等APP PSl 双转基因阿尔海默病小鼠

的繁殖及基因型鉴定[J]实用中西医结合临床2015(10)4-6[10]   宋敏唐军李达兵等 PS1 APP 双转基因阿尔茨海默病模

型传代小鼠的基因型鉴定及其组织学分析[ J] 第三军医大

学学报2006(14)1453-1456

收稿日期2017-08-02修改日期2017-08-31作者简介闫清伟(1982-)男河南新乡人博士讲师主

要研究方向为体育学习与身心健康

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