ALTERACIONES DEL GEN IKZF1 (IKAROS) EN LA LEUCEMIA LINFOBLÁSTICA AGUDA Inés Gómez Seguí Mayo...
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ALTERACIONES DEL GEN IKZF1
(IKAROS) EN LA LEUCEMIA
LINFOBLÁSTICA AGUDA
Inés Gómez Seguí
Mayo 2010
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HELIOS
IKZF1 Locus 7p12
Ikaros en LLA
FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN DE LA FAMILIA DE DEDOS DE
ZINC KRUPPLE-LIKE
IKAROS
AIOLOS
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IKZF1 (Ikaros Zinc Finger 1)
- Proteina de unión al ADN que actúa como factor de transcripción
Alteraciones genéticas en LLA
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Ikaros en LLA
-COOH
-COOH
NH2NH2 NH2 NH2
IKZF1 (Ikaros Zinc Finger 1)
- Estructura y dominios funcionales
SUBDOMINIO
HIDROFÓBICO
SUBDOMINIO
ACÍDICO
- Máxima actividad si coopera el subdominio hidrofóbico
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Isoformas largas
con capacidad de unión al
ADN
Isoformas cortas
o inhibidores dominantes negativos
Ikaros en LLA
IKZF1 (Ikaros Zinc Finger 1): Isoformas
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Ikaros en LLA
IKZF1 (Ikaros Zinc Finger 1)
- Regulación por homo y heterodimerización, además de splicing alternativo
HOMODÍMEROS HETERODÍMEROS
ISOFORMA ACTIVA (LARGA)
ISOFORMA ACTIVA (LARGA)
ISOFORMA INACTIVA (CORTA)
ISOFORMA ACTIVA (LARGA)
+ +
ACTIVIDAD TRANSCRIPCIONAL POTENCIADA
SIN ACTIVIDAD TRANSCRIPCIONAL
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Ikaros en LLAIkaros en LLA
IKZF1 (Ikaros Zinc Finger 1): Función
FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN
Ratón con infraexpresión
Bloqueo madurativo en el estadío linfoide pro-B
ONCOGENMutación
heterocigota dominante-negativa
Neoplasia T agresiva (ratón)
GEN SUPRESOR DE TUMORES
Infraexpresión de isoformas largas
leucemia
Kirstetter P et al. Eur J Immunol.2002;32: 720-730. Winandy S et al. Cell. 1995; 83: 289-299.
Tonnelle C et al. Blood 2001; 98: 2673-2680.
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Ikaros en LLA
Ikaros en neoplasias hematológicas
TABLA de Rebollo pag 173
Tomada de Rebollo et al. Immunol Cell Biol. 2003
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Ikaros en LLA
Ikaros en leucemia linfoblástica aguda
Mullighan et al. Nature 2008
Frequency of recurring DNA copy number abnormalities in ALL
DELECIONES DE IKZF1
- 84% de LLA-Phi+
- 11% LLA-B Phi-
- Expresión de Ik6 sólo en los casos con deleción de los exones 3 al 6.
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Ikaros en LLA
Ikaros en leucemia linfoblástica aguda
n Ik6 del IKZF1Iacobucci. Blood 2008 47 92%Iacobucci. Haematologica 2008 46 59%Iacobucci. JCO 2009 83 37% 63%Iacobucci. Blood 2009 106 42% 75%
- Estudios en LLA-B BCR-ABL+ del adulto
RT-PCR CNA
- Hipótesis inicial: splicing alternativo
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Ikaros en LLA
Deleciones: - completas: del locus 7p12 o monosomía 7.
- parciales: exones 3-6 (=Ik6) ~55%
exones 1-6 ~30%
otras ~15%
Ikaros en leucemia linfoblástica aguda
Ik6
Ik10
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Ikaros en LLA
Mullighan. NEJM 2009
Detección de CNA en todo el genoma de niños con LLA-B
Las deleciones más frecuentes: CDKN2A/B (46%), PAX5 (32%) e IKZF1 (29%)
n deleciones Ik6COHORTE ORIGINAL 16 completas LLA-B alto riesgo 47 parciales (excluyendo Phi+, hipodiploide y <1año) Total: 63 (29%)COHORTE DE VALIDACIÓN 258 riesgo estándar y alto riesgo
221 20
48 (19%)
Ikaros en leucemia linfoblástica aguda
IKAROS
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Ikaros en LLA
Mullighan. NEJM 2009
- Asociación con elevada EMR, recaída y evento adverso, en ambas cohortes
- Implicación pronóstica independientemente de BCR-ABL
- Elevado % de casos sin alteraciones recurrentes (39% cohorte original y 23% cohorte validación)
IKZF1 WT del IKZF1 p IKZF1 WT del IKZF1 pTasa de recaída (5 años) 25% 73% <0.001 26% 48% 0.004Tasa de evento adverso (5 años) 27% 74% <0.001 28% 61% <0.001EMR elevada (día +8 y +19) 43% 62% 0,04 9% 62% <0.001
cohorte de validacióncohorte original
Ikaros en leucemia linfoblástica aguda
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Ikaros en LLA
-Iacobucci. LAS DELECIONES DE IKZF1 SON INDEPENDIENTES
DEL REORDENAMIENTO BCR-ABL Y SE ASOCIAN CON UN
PERFIL DE EXPRESIÓN GÉNICA PARTICULAR Y UN PEOR
PRONÓSTICO EN PACIENTES ADULTOS CON LLA-B. 144 LLA
del adulto de novo (106 BCR-ABL+ y 38 BCR-ABL – sin otros
reordenamientos conocidos).
-Volejnikova. LA EXPRESIÓN RELATIVA DE ISOFORMAS DE
IKAROS TIENE VALOR PRONÓSTICO EN LA LLA-PHI
NEGATIVA DEL NIÑO. 94 niños con LLA. Ratio isoformas
cortas/funcionales relacionada con peor pronóstico.
Ikaros en leucemia linfoblástica aguda
Comunicaciones ASH 2009
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Ikaros en LLA
Kuiper. Leukemia 2010
Ikaros en leucemia linfoblástica aguda
LAS DELECIONES DE IKZF1 PREDICEN RECAÍDA EN
LAS LLA-B PEDIÁTRICAS UNIFORMEMENTE
TRATADAS
Estudian 34 muestras pareadas de diagnóstico/recaída.
Las deleciones de IKAROS están preservadas en la
recaída, a diferencia de PAX5, CDKN2A y EBF1.
Deleciones (n=13, 38%) relacionadas con menor SLR.
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Kuiper. Leukemia 2010
Ikaros en LLA
Ikaros en leucemia linfoblástica aguda
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Kuiper. Leukemia 2010
Validado en una cohorte de 131 niños tratados homogéneamente.
Pacientes de riesgo estándar (n=102) : RR de recaída x12.
Ikaros en LLA
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Ikaros en LLA
Hipótesis
- Las deleciones de IKZF1 son un evento frecuente en la
LLA-B.
- Un gran porcentaje de estos casos se correlaciona con
la expresión de la isoforma Ik6.
- Implicación pronóstica en el adulto y aplicación al
algoritmo diagnóstico y terapéutico.
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Ikaros en LLA
Muestra
- 65 muestras de RNA de adultos con LLA
(50-55 con muestra de DNA)
+ 10 -12 nuevos casos por año
- aproximadamente, 150 niños con LLA + 30 nuevos casos por año
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Ikaros en LLA
Metodología
- Expresión de isoformas cortas: RT-PCR con cebadores en exón 1 y 7
- Deleciones génicas: (MLPA®)
Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification
gen locus exonesIKZF1 7p12 1,2,3,4,5,6,7,8
CDKN2A/B 9p21.3 1,2,4PAX5 9p13.2. 1,2,5,6,8,10ETV6 12p13.2, 1,2,3,5,8
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Objetivos
- Determinar la frecuencia de Ik6 en nuestra serie
- Correlación con deleciones génicas de IKZF1
- Determinar su implicación pronóstica
Ikaros en LLA
Fondos
- Generalitat Valenciana
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B + - 1 2 3 4 MVI
Ikaros en LLA
Resultados
Ik6
Ik4
Ik2
Ik1
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Ikaros en LLA
Resultados
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Ikaros en neoplasias hematológicas
Marcais et al. Leukemia Research 2009
25 casos de LLA-T
Deleciones n=1
Mutaciones n=0
Proteína: localización citoplasmática
INACTIVACIÓN GÉNICA EN NEOPLASIAS B VS. INACTIVACIÓN FUNCIONAL EN NEOPLASIAS T.