「診療録データの臨床研究利用のための仕組み」

　　　　内　容：１．「システムの概要」　　　　　　　　松村泰志　　　　　　　　２．「入力システムのデモ」　　　　　藤井歩美　　　　　　　　３．「データ抽出システムのデモ」　村田泰三　　　　　　　　　　　　大阪大学医学部附属病院医療情報部

　　　 MTE 世話人 : 松村泰志（大阪大学医学部附属病院）　　　 主　催 : 日本医療情報学会関西支部

データ抽出 データ変換

病院情報システム

処方 検査結果 入院歴

データ構造が分析に適さない

日常業務がストールする心配がある

分析に適したデータ構造

Data Warehouse (DW Ｈ )

データベースDWH

GW

DWH を利用した解析事例

糖尿病の疫学調査 降圧剤の変遷 シスプラチンの腎毒性の評価 アミノグリコシド系薬剤の腎毒性の評価 ワーファリンの薬剤相互作用の評価 糖尿病性腎症における ACE 、 ARB 投与

の実態と効果

臨床研究のテーマの例

食道癌におけるある化学療法の効果変形性膝関節症に対する人工関節置換術の効果拡張型心筋症に対するある薬剤の効果

癌症例におけるステージ分類、組織型化学療法実施時の副作用（嘔吐、脱毛、皮膚所見、筋肉痛）の出現整形外科的疾患での、関節可動域の測定結果心臓疾患における左室拡張末期径、 Ejection Fraction

必要な情報

入力テンプレートによるソリューション

入力テンプレート電子カルテシステムが提示した項目に、ユーザが値を入れていく方式の入力支援ツール（プログラム）

氏名：＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿

性：　○男性　　○女性

生年月日：＿＿　＿＿年＿＿月＿＿日

職業：　□医師　□看護婦（士）　□薬剤師　□検査技師　□事務　

例）

複雑な臨床データをテンプレート方式で入力できるのか？

ダイナミックテンプレートによるソリューション

階層構造を持つ　異常所見に対して更に詳細な記述が可能

登録データを自然言語変換して読みやすく表示　コンピュータは、厳密な木構造の表現が処理しやすい　 　 (machine processible)

　人間は、推測可能な言葉は省略される方が、重要は情報を認識しやす

い　　　 (human readable)

経過記録作成時のテンプレート呼び出し

ダイナミックテンプレート

テンプレートデータの自然言語変換

テンプレー

トで入力したデー

タ

フローシートへのテンプレート登録データの表示

表在リンパ節 腋窩リンパ節 右：腫大 小指頭大 硬い 表面凹凸不整 癒着あり 左：触知せず

テンプレートの例

GCS ： E4V5M5 COMA SCORE = 14

テンプレートの例

病院内の様々な文書

文書作成システム 退院時サマリ 検査レポート 栄養評価 院内がん登録　 etc

• Word ファイルからテンプレート呼び出し• 患者基本情報の自動表示

患者基本情報から取得

テンプレート入力

テンプレートマスタの具体例<ATOM-LIST><ATOM-STYLE /><ATOM><ATOM-TYPE CODE="A908100100" NAME=" 心音の I音 " CATEGORY="汎用項目 " FIRST="0" SEQUENCE="0" ADD="no"/><DISPLAY-STRING ITALIC="off" BOLD="off" LEVEL="0" TITLEWIDTH="5" RETURN="off" SHOWTITLE="yes" TITLERETURN="yes" TITLEITALIC="no" TITLEBOLD="no" xml:space="preserve">I音： </DISPLAY-STRING><DOCUMENT-STRING><DOC-BODY RETURN="on" xml:space="preserve"></DOC-BODY><DOC-PREFIX RETURN="off" xml:space="preserve"> I音： </DOC-PREFIX><DOC-CONJUNCTION RETURN="off" xml:space="preserve"></DOC-CONJUNCTION><DOC-SUFFIX RETURN="off" xml:space="preserve"></DOC-SUFFIX></DOCUMENT-STRING><VALUE-LIST><VALUE-STYLE TYPE="CheckBox" ITEMWIDTH="0" ITEMHEIGHT="0" SPECIAL="" CODE="" NUMBER="0 " RETURN="on" MANDATORY="no"/><VALUE SAMEABOBE="no"><VALUE-TYPE CODE="V908100101" NAME="純 " SELECTED="no" MAPPOINTER="" SEQUENCE="0" /><DISPLAY-STRING ITALIC="off" BOLD="off" LEVEL="0" TITLEWIDTH="2" RETURN="off" SHOWTITLE="yes" TITLERETURN="yes" TITLEITALIC="yes" TITLEBOLD="no" xml:space="preserve">純 </DISPLAY-STRING><DOCUMENT-STRING><DOC-BODY RETURN="off" xml:space="preserve">純 </DOC-BODY><DOC-PREFIX RETURN="off" xml:space="preserve"></DOC-PREFIX><DOC-CONJUNCTION RETURN="off" xml:space="preserve"></DOC-CONJUNCTION><DOC-SUFFIX RETURN="off" xml:space="preserve"></DOC-SUFFIX></DOCUMENT-STRING></VALUE><VALUE SAMEABOBE="no"><VALUE-TYPE CODE="V908100102" NAME="亢進 " SELECTED="no" MAPPOINTER="" SEQUENCE="1" /><DISPLAY-STRING ITALIC="off" BOLD="off" LEVEL="0" TITLEWIDTH="4" RETURN="off" SHOWTITLE="yes" TITLERETURN="yes" TITLEITALIC="yes" TITLEBOLD="no" xml:space="preserve">亢進 </DISPLAY-STRING><DOCUMENT-STRING><DOC-BODY RETURN="off" xml:space="preserve">亢進 </DOC-BODY><DOC-PREFIX RETURN="off" xml:space="preserve"></DOC-PREFIX><DOC-CONJUNCTION RETURN="off" xml:space="preserve"></DOC-CONJUNCTION><DOC-SUFFIX RETURN="off" xml:space="preserve"></DOC-SUFFIX></DOCUMENT-STRING></VALUE><VALUE SAMEABOBE="no"><VALUE-TYPE CODE="V908100103" NAME="減弱 " SELECTED="no" MAPPOINTER="" SEQUENCE="2" /><DISPLAY-STRING ITALIC="off" BOLD="off" LEVEL="0" TITLEWIDTH="4" RETURN="off" SHOWTITLE="yes" TITLERETURN="yes" TITLEITALIC="yes" TITLEBOLD="no" xml:space="preserve">減弱 </DISPLAY-STRING><DOCUMENT-STRING><DOC-BODY RETURN="off" xml:space="preserve">減弱 </DOC-BODY><DOC-PREFIX RETURN="off" xml:space="preserve"></DOC-PREFIX><DOC-CONJUNCTION RETURN="off" xml:space="preserve"></DOC-CONJUNCTION><DOC-SUFFIX RETURN="off" xml:space="preserve"></DOC-SUFFIX></DOCUMENT-STRING></VALUE></ATOM>

患者データベース

データウェアハウス

HIS端末

入力テンプレート呼び出し

Templateデータベース

患者ID

date Template+ 患者データXML

自然言語表現

1001 10/12

BP=120/60

1002 10/12

HR=60/min

Template＋患者データ

Template＋患者データ

データ登録

Template

コード

TemplateXML

T001Template

Template

Template＋患者データ

データ分析

データウェアハウス

患者 ID date Template ｘ Path 親項目 親値 項目 値

1001 10/12 心音 \心雑音 root 心雑音 収縮期雑音

1001 10/12 心音 \心雑音 \収縮期雑音 \大きさ

心雑音 収縮期雑音

大きさ III度

1001 10/12 心音 \心雑音 \収縮期雑音 \最強点

心雑音 収縮期雑音

最強点 心尖部

心雑音

大きさ 最強点

III 心尖部

収縮期雑音

心音

1 value 1 record のデータベースファイル

臨床研究で求められる要件

患者 ID date 血圧 脈拍 心雑音 WBC RBC

1001 10/12 120/84 64/min 収縮期雑音 6800 432

1001 10/13 154/96 84/min なし 11200 486

• プロジェクトで収集したデータ群を一つのファイルで欲しい　　　　　　

• １ケースが１レコードとなるデータ構造が望ましい

統計解析ソフトで解析

AAA: BBB: ○XX, ○YYY, ○ZZZCCC: □PP 、□ QQDD ：　　　　

GG: ○XX, ○YYY, ○ZZZHHH: □PP 、□ QQIII ：　　　　JJJ ：○ RR, ○SSS, ○TT

KKK: ○NN, ○OOO, HHH: □PP 、□ QQLLL ：　　　　MMM ：○ UUU, ○VV, ○WWW

入力テンプレート データベースファイル

テンプレート１

テンプレート２

テンプレート３

テンプレート１用 DB

テンプレート２用 DB

テンプレート３用 DB

一般的な方法

入力テンプレート毎にデータベースファイルを定義

テンプレートの個数分データベースファイルが必要

運用の途中でテンプレートの変更が難しい

一般記述に適応しにくい

AAA: BBB: ○XX, ○YYY, ○ZZZCCC: □PP 、□ QQDD ：　　　　

GG: ○XX, ○YYY, ○ZZZHHH: □PP 、□ QQIII ：　　　　JJJ ：○ RR, ○SSS, ○TT

KKK: ○NN, ○OOO, HHH: □PP 、□ QQLLL ：　　　　MMM ：○ UUU, ○VV, ○WWW

入力テンプレート臨床研究用

データベースファイル無構造データベース

臨床研究１

臨床研究２

臨床研究３

テンプレート１

テンプレート２

テンプレート３

• テンプレートがデータベース構造に非依存→ テンプレートの新規作成・修正が簡単• 必要なデータを後付けで収集することができる

• 複数のテンプレートのデータを１つのデータベースファイルに格納できる• １つのテンプレートのデータを複数のデータベースファイルに格納できる

患者 ID date Template ｘ Path 親項目 親値 項目 値

1001 10/12 心音 \心雑音 root 心雑音 収縮期雑音

1001 10/12 心音 \心雑音 \収縮期雑音 \大きさ

心雑音 収縮期雑音

大きさ III度

1001 10/12 心音 \心雑音 \収縮期雑音 \最強点

心雑音 収縮期雑音

最強点 心尖部

データウェアハウス

特定領域の臨床研究データベースファイル

患者 ID date 血圧 脈拍 心雑音 WBC RBC

1001 10/12 120/84 64/min 収縮期雑音 6800 432

1001 10/13 154/96 84/min なし 11200 486

1 value 1 record 　→　 1 case 1 record 　に変換

操作用 PC

データ登録

データ抽出

データ閲覧・集計

各プロジェクト別臨床研究用データベース　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　へのデータ移行

各プロジェクト別臨床研究用

データベースGW２

GW１

電子カルテサーバ

XMLパース

1 value1 record

データウェアハウス

1 case1 record

操作用 PC