5. Copy of Struktur Virus

31
1 SIFAT SIFAT VIRUS SIFAT SIFAT VIRUS

description

AAA

Transcript of 5. Copy of Struktur Virus

Page 1: 5. Copy of Struktur Virus

1

SIFAT SIFAT VIRUSSIFAT SIFAT VIRUS

Page 2: 5. Copy of Struktur Virus

Definisi virusDefinisi virus• Virus adalah mo penyebab infeksi yang dapat melalui ultrafilter, Virus adalah mo penyebab infeksi yang dapat melalui ultrafilter,

bersifat intercellulair obligate parasit.bersifat intercellulair obligate parasit.• Merupakan parasit sub-mikroskopik yang mutlak memerlukan sel Merupakan parasit sub-mikroskopik yang mutlak memerlukan sel

hidup.hidup.• Ukuran virus 20-400 nm. Berbentuk batang, sferik atau Ukuran virus 20-400 nm. Berbentuk batang, sferik atau

pleomorfik.pleomorfik.• Hanya dapat tumbuh dalam sel hidup. Hanya dapat tumbuh dalam sel hidup. • Tidak mempunyai informasi genetik untuk menyandi apparatu Tidak mempunyai informasi genetik untuk menyandi apparatu

untuk membentuk energi metabolik yang diperlukan sintesis untuk membentuk energi metabolik yang diperlukan sintesis protein.protein.

Page 3: 5. Copy of Struktur Virus

Virus dibedakan mikrorganisme lain OK :Virus dibedakan mikrorganisme lain OK :

1.1. Mengandung hanya 1 jenis asam nukleat sebagai genom Mengandung hanya 1 jenis asam nukleat sebagai genom 2.2. Genom hanya 1 macam asam nukleat , DNA atau RNA, beruntai Genom hanya 1 macam asam nukleat , DNA atau RNA, beruntai

satu atau dua (SS atau DS)satu atau dua (SS atau DS)3.3. Tidak mempunyai aktifitas metabolisme, tidak mp sist enzim dan Tidak mempunyai aktifitas metabolisme, tidak mp sist enzim dan

unsur pokok unt hidup bebas dan berk,biakunsur pokok unt hidup bebas dan berk,biak4.4. Tidak mempunyai ribosomTidak mempunyai ribosom5.5. Tidak tumbuh melalui pembelahan tapi , berk.biak dg unsur Tidak tumbuh melalui pembelahan tapi , berk.biak dg unsur

genetis pd asam nukleat dg cara biosintesisgenetis pd asam nukleat dg cara biosintesis6.6. Tidak mp metabolisme, shg tidak peka antibiotikTidak mp metabolisme, shg tidak peka antibiotik7.7. Sebagian besar virus peka interferonSebagian besar virus peka interferon8.8. Beberapa virus dapat menyebakan infeksi latenBeberapa virus dapat menyebakan infeksi laten

Page 4: 5. Copy of Struktur Virus

4

SIFAT-SIFAT VIRUSSIFAT-SIFAT VIRUS

• Agen infeksius yang berukuran sangat kecil• Mempunyai susunan yang sederhana.• Hanya dapat bereplikasi dalam sel hidup dapat bereplikasi dalam sel hidup

(manusia, hewan, tanaman dan bakteri). (manusia, hewan, tanaman dan bakteri). • Tidak bermetabolisme di luar sel inangTidak bermetabolisme di luar sel inang• memperbanyak diri dengan mengandalkan memperbanyak diri dengan mengandalkan

proses metabolisme dari sel inang. proses metabolisme dari sel inang. • Penyakit akibat infeksi virus terjadi karena Penyakit akibat infeksi virus terjadi karena

interaksi antara virus sel inanginteraksi antara virus sel inang

Page 5: 5. Copy of Struktur Virus

5

Struktur VirusStruktur Virus

• Partikel virus (virion) terdiri Partikel virus (virion) terdiri atas atas asam nukleat dan protein asam nukleat dan protein (kapsid)(kapsid)

• Beberapa virus dilengkapi Beberapa virus dilengkapi dengan envelope (membran dengan envelope (membran glikoprotein ) e.g. vesicular glikoprotein ) e.g. vesicular stomatitisstomatitis

Page 6: 5. Copy of Struktur Virus

6

KapsidKapsid

capsomerescapsomeres

Nucleocapsid(nukelokapsid tanpa genomadalah kapsid))

envelopedvirus

envelope

a virion

Page 7: 5. Copy of Struktur Virus

7

Simetri virusSimetri virus• IcosahedralIcosahedral

Constructed of 20 equilateral Constructed of 20 equilateral triangular faces triangular faces e.g. foot-and e.g. foot-and mouth disease virusmouth disease virus

• Helical Helical – Tubular construction with the Tubular construction with the

subunits arranged around the subunits arranged around the nucleic acid in a coilnucleic acid in a coile.g. rabies viruse.g. rabies virus

– See page 12 to 15 Veterinary Virology 3 See page 12 to 15 Veterinary Virology 3 for more detailfor more detail

Page 8: 5. Copy of Struktur Virus

8

Page 9: 5. Copy of Struktur Virus

9

Simetri virusSimetri virus• IcosahedralIcosahedral

Tersusun atas 20 permukaan segitiga Tersusun atas 20 permukaan segitiga sama sisisama sisi

Contoh : virus mulut dan kukuContoh : virus mulut dan kuku

• Helical Helical – Tabung yang tersusun atas berbagai Tabung yang tersusun atas berbagai

subunit yang tersusun berbentuk kil subunit yang tersusun berbentuk kil menutupi asam nukleatmenutupi asam nukleat

– Contoh : virus rabiesContoh : virus rabies

Page 10: 5. Copy of Struktur Virus

10

• KompleksKompleksBelum sepenuhnya Belum sepenuhnya

diketahuidiketahui e.g. smallpox viruse.g. smallpox virus

• Filamen pleomorficFilamen pleomorfice.g. ebolaviruse.g. ebolavirus

Page 11: 5. Copy of Struktur Virus

11

Asam inti (genom)Asam inti (genom)

Asam Inti

DNA

RNA

Serat Ganda (Double Stranded)

Positive

Negative

RNA DNA

serat tunggal (Single Stranded)

Serat ganda (Double Stranded)

(serat tunggal) Single Stranded

Page 12: 5. Copy of Struktur Virus

12

Struktur Kimia genomStruktur Kimia genom

Semua virus DNA Semua virus DNA mempunyai serat mempunyai serat beruntai ganda kecualiberuntai ganda kecuali

circoviruses and circoviruses and parvovirusesparvoviruses

• Semua virus DNA Semua virus DNA mempunyai 1 molekul mempunyai 1 molekul asam nukleat (tidak asam nukleat (tidak bersegmenbersegmen

Page 13: 5. Copy of Struktur Virus

13

• Virus RNA dapat mempunyai asam nukleat Virus RNA dapat mempunyai asam nukleat berserat tunggal atau ganda dan juga dapat berserat tunggal atau ganda dan juga dapat bersegmen atau berupa satu molekul, polarisasi bersegmen atau berupa satu molekul, polarisasi positif atau negatifpositif atau negatif

Page 14: 5. Copy of Struktur Virus

14

Struktur kimia kapsid (Protein)Struktur kimia kapsid (Protein)• Protein strukturalProtein struktural

– Menjaga kesetabilan virus Menjaga kesetabilan virus dan berperan dalam dan berperan dalam perlekatan virus ke sel perlekatan virus ke sel inanginang

• Protein non-strukturalProtein non-struktural– Enzim yang diperlukan Enzim yang diperlukan

dalam replikasi virusdalam replikasi virus– Antibodi biasanya terbetuk Antibodi biasanya terbetuk

terhadap protein struktural. terhadap protein struktural.

Page 15: 5. Copy of Struktur Virus

15

Fungsi protein struktural Fungsi protein struktural

• Melindungi asam nukleatMelindungi asam nukleat• Melekatkan virus pada reseptor sel inangMelekatkan virus pada reseptor sel inang• Menembus membran sel inangMenembus membran sel inang• Replikasi asam nukleat virus (beberapa Replikasi asam nukleat virus (beberapa

virus)virus)• Memodifikasi sel inangMemodifikasi sel inang

Page 16: 5. Copy of Struktur Virus

16

Sifat-sifatSifat-sifat Virus yang berhubungan dengan Virus yang berhubungan dengan disinfeksidisinfeksi

• Sensitivitas terhadap pemanasanSensitivitas terhadap pemanasan– Virus yang mempunyai amplop relatif lebih Virus yang mempunyai amplop relatif lebih

sensitif terhadap pemasanansensitif terhadap pemasanan

• Sensitivitas terhadap pHSensitivitas terhadap pH– pH yang ekstim dapat merusak viruspH yang ekstim dapat merusak virus

• Palarut lemakPalarut lemak– Virus yang mempunyai amplop umumnya lebih Virus yang mempunyai amplop umumnya lebih

sensitifsensitif

• Zat kimiaZat kimia– Bereaksi dengan asam amino dari protein Bereaksi dengan asam amino dari protein

beberapa di antaranya menginaktifkan DNA beberapa di antaranya menginaktifkan DNA atau RNAatau RNA

• Radiasi dan sinar ultravioletRadiasi dan sinar ultraviolet

Page 17: 5. Copy of Struktur Virus

17

Sifat-sifat virus yang berhubungan dengan Sifat-sifat virus yang berhubungan dengan diagnosisdiagnosis

• Virus dapat dilihat dengan Virus dapat dilihat dengan mikroskop elektronmikroskop elektron

• Virus dapat diisolasi Virus dapat diisolasi dalam sel hidupdalam sel hidup

• DNA atau RNA dapat DNA atau RNA dapat dilacak dengan dilacak dengan Polymerase chain reaction Polymerase chain reaction (PCR)(PCR)

• Antibodi khas virus dapat Antibodi khas virus dapat dilacak pada hewan yang dilacak pada hewan yang terinfeksi virusterinfeksi virus

Page 18: 5. Copy of Struktur Virus

18

Klasifikasi VirusKlasifikasi Virus

Didasarkan padaDidasarkan pada• Genom (RNA, DNA, SS, DS etc)Genom (RNA, DNA, SS, DS etc)• Morfologi virion, envelopeMorfologi virion, envelope• Cara ReplikasiCara Replikasi• Hubungan serologis (Hubungan serologis (SerotipeSerotipe))

International Committee onInternational Committee onTaxonomy of VirusesTaxonomy of Viruses

Page 19: 5. Copy of Struktur Virus

19

Dasar-dasar penamaan virusDasar-dasar penamaan virus

• Ordo ( - Ordo ( - viralesvirales))• Familia ( - Familia ( - viridaeviridae))• Sub-familia ( -Sub-familia ( -virinaevirinae))• Genera ( - Genera ( - virusvirus))• Nama umumNama umum

Page 20: 5. Copy of Struktur Virus

20

Perbandingan bentuk Perbandingan bentuk dan ukuran virus dari dan ukuran virus dari berbagai Familiaberbagai Familia

Page 21: 5. Copy of Struktur Virus

21

Perbandingan Perbandingan bentuk virus bentuk virus dari berbagai dari berbagai Familia dengan Familia dengan pewarnaan pewarnaan negative pada negative pada mikroskop mikroskop elektronelektron

A: PoxA: PoxB: PapillomaB: PapillomaC: FiloC: FiloD: ReoD: ReoE: HerpesE: HerpesF: RhabdoF: RhabdoG: CaliciG: CaliciH: BunyaH: BunyaI: OrthomyxoI: Orthomyxo

Page 22: 5. Copy of Struktur Virus

22Sistem Taksonomi Universal agen penyakit pada hewan dan manusiaSistem Taksonomi Universal agen penyakit pada hewan dan manusia

  Poxviridae Chordopoxvirinae

Orthopoxvirus vaccinia virus

      Parapoxvirus orf virus

      Avipoxvirus fowlpox virus

      Capripoxvirus sheeppox virus

      Leporipoxvirus myxoma virus

      Suipoxvirus swinepox virus

      Molluscipoxvirus Molluscum contagiosum virus

      Yatapoxvirus Yaba monkey tumor virus

    Entomopoxvirinae

Entomopoxvirus genera A, B,C

(Insect viruses, but likely also pathogens of fish)

  Family (Order)

Subfamily Genus Type Species

THE DNA VIRUSES

The Double-Stranded DNA Viruses

Etc, etc

Page 23: 5. Copy of Struktur Virus

23

Virus dengan genom DNA serat gandaVirus dengan genom DNA serat ganda

Poxviridae

Asfaviridae

Herpesviridae

Adenoviridae

Papovaviridaepapillomaviruses

adenoviruses

bovine herpesvirus-1,2

porcine cytomegalovirus

equine herpesviruses -1,4

african swine fever virus

poxviruses

Page 24: 5. Copy of Struktur Virus

24

Viruses with ss DNA genomesViruses with ss DNA genomes

Circoviridae

Parvoviridae

porcine circovirus

canine parvovirus-2

feline panleukopenia virus

porcine parvovirus (SMEDI)

Page 25: 5. Copy of Struktur Virus

25

Viruses with ds RNA genomesViruses with ds RNA genomes

Reoviridae

Birnaviridae

rotaviruses

bluetongue virus

african horse sickness

infectious bursal disease (chickens)

infectious pancreatic necrosis (salmonid fish)

Page 26: 5. Copy of Struktur Virus

26

Viruses with +ve RNA genomesViruses with +ve RNA genomes

PicornaviridaeCaliciviridae

CoronaviridaeArteriviridaeFlaviviridaeTogaviridae

foot and mouth disease virus

porcine enteroviruses

feline calicivirus

equine arterivirus

pestiviruses (BVD)

coronaviruses

equine encephalitis viruses

Page 27: 5. Copy of Struktur Virus

27

Viruses with -ve RNA genomesViruses with -ve RNA genomes

Paramyxoviridae

Rhabdoviridae

Orthomyxoviridae

Filoviridae

Bunyaviridae

parainfluenza viruscanine distemper virus

respiratory syncytial virus

rabies virus

vesicular stomatitis virus

influenzaviruses

Ebola virus

Haantan virus

Page 28: 5. Copy of Struktur Virus

28

Viruses with reverse transcriptaseViruses with reverse transcriptase

Retroviridae

Hepadnaviridae

feline leukemia virus

feline, bovine immunodeficiency

viruses

bovine, avian leukosis viruses

caprine arthritis-encephalitis virus

Page 29: 5. Copy of Struktur Virus

29

Grup, tipe, strain dan isolatGrup, tipe, strain dan isolat

Grup (e.g. Virus blue tongue)

Tipe 1 …..sampai 24

Group specific antigen

Type 1 specificantigen

Type 2 specificantigen

•Strain merupakan virus yang Strain merupakan virus yang dikarakterisasi dengan baik. Strain virus dikarakterisasi dengan baik. Strain virus yang berbeda mempunyai karakteristik yang berbeda mempunyai karakteristik yang berbeda seperti virulensiyang berbeda seperti virulensi•Isolat menunjukkan virus yang diisolasi Isolat menunjukkan virus yang diisolasi dari inang atau lokasi tertentudari inang atau lokasi tertentu•Tipe umumnya berarti kekebalan tidak Tipe umumnya berarti kekebalan tidak conferred oleh pemamaparan conferred oleh pemamaparan sebelumnyaoleh tipe eg Foot-and-mouth sebelumnyaoleh tipe eg Foot-and-mouth diseasedisease

Page 30: 5. Copy of Struktur Virus

30

Pengelompokkan virus berdasarkan Pengelompokkan virus berdasarkan kriteria epidemiologikriteria epidemiologi

• Selain cara di atas virus juga dapat dikelompokan Selain cara di atas virus juga dapat dikelompokan berdasarkan kriteria epidemiologi seperti berdasarkan kriteria epidemiologi seperti Tropisme jaringan dan cara penularanTropisme jaringan dan cara penularan

• Enteric virusesEnteric viruses (penularan fecal-oral) and (penularan fecal-oral) and replicate primarily in the intestinal tract. Enteric replicate primarily in the intestinal tract. Enteric viruses are included in the families viruses are included in the families PicornaviridaePicornaviridae (genus (genus EnterovirusEnterovirus), ), Caliciviridae, Astroviridae, Caliciviridae, Astroviridae, Coronaviridae,Coronaviridae, ReoviridaeReoviridae (genera (genera RotavirusRotavirus and and ReovirusReovirus), ), Parvoviridae,Parvoviridae, and and AdenoviridaeAdenoviridae..

Page 31: 5. Copy of Struktur Virus

Postulat Koch’sPostulat Koch’s1.1. Agen penyakit harus ditemukan pada setiap kasus Agen penyakit harus ditemukan pada setiap kasus

penyakitpenyakit2.2. Agen penyakit harus dapat diisolasi dari inang dan Agen penyakit harus dapat diisolasi dari inang dan

ditumbuhkan in vitroditumbuhkan in vitro3.3. Penyakit harus muncul kembali bila agen yang Penyakit harus muncul kembali bila agen yang

diisolasi diinfeksikan kembali pada inang yang diisolasi diinfeksikan kembali pada inang yang rentanrentan

4.4. Agen penyakit yang sama harus dapat diisolasi Agen penyakit yang sama harus dapat diisolasi kembali dari inang yang diinfeksikembali dari inang yang diinfeksi