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2018/2/27 阿簡生物筆記: 以ImageJ測量葉面積 http://a-chien.blogspot.tw/2007/09/imagej_2149.html 1/4 2007 9 1 以前我們在植物葉面積測量時會先準備一張方格紙，先剪下一小方格以電子天平秤重，然後把葉子描在方格紙 上，然後沿線剪下秤重。 真實葉的面積/ 單方格的面積= 方格葉子的重量 / 單方格的重量 假設 單方格的面積是1平方公分，重量是0.02克。 方格葉子的重量是10克 依此計算就可以知道真實葉面積是50平方公分。 而以上需要電子天平、剪刀、方格紙。 不過如果用電腦處理 我們就需要尺、數位相機(或掃描器)、電腦、ImageJ 以下我會用ImageJ附的範例圖檔來計算一片葉子的綠色面積 ************************************************** 開啟ImageJ 開啟範例圖檔 File-->Open Samples-->Leaf 將影像改為8-bit的影像 Image-->Type-->8-bit 以ImageJ測量葉面積 與我聯絡 搜尋 本 著作 係採用 創用 CC 姓名標示- 非商業性-相同方式分享 2.5 台灣 授 權條款授權. CC ► 2018 (9) ► 2017 (139) ► 2016 (270) ► 2015 (154) ► 2014 (171) ► 2013 (147) ► 2012 (368) ► 2011 (301) ► 2010 (147) ► 2009 (199) ► 2008 (252) ▼ 2007 (241) ► 12 (36) ► 11 (38) ► 10 (24) ▼ 09 (27) 觀察淡水浮游生物 本氏液檢驗澱粉和唾液 的反應-精簡版 本氏液做糖的檢定-精簡 版 亂畫的虎克顯微鏡 啥！？透明蛙 蛇骨標本製作-下集-麻 將牌的蛇骨 用心智圖想科展題目 氣泡玻片解決氣泡問題 以Imagej合成全對焦影 像 桌上阿蝦支持模組(生態 球啦) 更多 下一個網誌» 建立網誌 登入
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2018/2/27 阿簡生物筆記: 以ImageJ測量葉面積
http://a-chien.blogspot.tw/2007/09/imagej_2149.html 1/4
2007年9月1日
以前我們在植物葉面積測量時會先準備一張方格紙，先剪下一小方格以電子天平秤重，然後把葉子描在方格紙
上，然後沿線剪下秤重。 真實葉的面積/ 單方格的面積= 方格葉子的重量 / 單方格的重量
假設 單方格的面積是1平方公分，重量是0.02克。 方格葉子的重量是10克
依此計算就可以知道真實葉面積是50平方公分。 而以上需要電子天平、剪刀、方格紙。
不過如果用電腦處理 我們就需要尺、數位相機(或掃描器)、電腦、ImageJ
以下我會用ImageJ附的範例圖檔來計算一片葉子的綠色面積 **************************************************
開啟ImageJ
開啟範例圖檔
File-->Open Samples-->Leaf
將影像改為8-bit的影像
Image-->Type-->8-bit
以ImageJ測量葉面積
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2018/2/27 阿簡生物筆記: 以ImageJ測量葉面積
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設定影像比例尺：先以上方工具列的第5項的直線工具，在拍攝的尺上畫線，我是從5公分畫到10公分，然後設定
比例
Analyze-->Set Scale
Distance in Pixels：是你剛剛畫的那條線的長度，不用改。 Know Distance:已知的長度，這裡我畫的是5公分，不過底下的單位我用mm，所以我這裡填50。 Pixel Aspect Ratio:不用改，除非你的影像被拉長過或是壓扁過才需要改。 Unit of Length：長度的單位 Global：如果之後處理的影像都是相同比例尺，這裡打勾，之後就不用再到這邊設比例尺。
把尺的圖案刪掉，選擇工具列的第一個方形工具，把葉子框起來，然後選擇
Image-->Crop
設定閾值範圍
Image-->Adjus-->Threshold
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2018/2/27 阿簡生物筆記: 以ImageJ測量葉面積
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調整Threshold的上下兩列的捲軸，使紅色的面積剛好覆蓋在葉子的綠色部份。
計算綠色面積
Analyze-->Analyze Particles
Size (mm^2)：設定的是要計算的範圍，先不用管。或者直接打0，代表0以上的都要計算。
因為目的是計算面積，所以至少Display Results或Summarize要打勾。這樣才知道結果。
經過快速的運算之後，會出現很多視窗。在運算過程中，之前被框成紅色的部份有些是分離的，就會被計算成分
離的區塊。Results視窗就有這些區塊的資料，而Summary視窗就是統計這些結果，Count代表有11個區塊，
Total Area就是綠色的面積1995.754(平方公釐)。
但是光知道葉子的綠色面積還不夠，我們還想知道這片葉子的總面積是多少，這樣才知道綠色面積的比例。
所以我們再取一次閾值，設定範圍
Image--->Adjust--->Threshold
也可以改用快速鍵Ctrl+Shift+T，讓紅色範圍把全部葉子蓋住。
然後再計算一次
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Analyze-->Analyze Particles
那些Summary或是Result可以選擇要不要把之前的資料留下來，我沒把計算綠色面積的部份刪掉，所以在
Summary視窗裡就會有兩筆資料。
葉片總面積是2475.965 (mm^2) 綠色面積是1995.754(mm^2) 比例大約是80.6%
Summary或是Result的這些資料都可以剪貼到其他文書處理的軟體中
標籤： 開放原始碼, 資訊融入, ImageJ
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