20160418 Auftaktveranstaltung BT v03...Fakultät III Prozesswissenschaften Fachgebiet für...
Transcript of 20160418 Auftaktveranstaltung BT v03...Fakultät III Prozesswissenschaften Fachgebiet für...
Tag der Biotechnologie
Der Tag der Biotechnologie findet am 14.7.2015 von 13.00‐20.00 Uhr in der Peter‐Behrens‐Halle, Gustav‐Meyer‐Allee 25, 13355 Berlin statt.
Programm:13.00‐14.30 Uhr: Bachelor‐Kolloquium14.30‐16.00 Uhr: Festvortrag 16.00‐19.00 Uhr: Postershow der PromovendenAb 19.00 Uhr: Geselliger Abend mit Grillen und Getränken
Anmeldung über die Webseite:https://www.biotech.tu‐berlin.de/menue/tag_der_biotechnologie/
Wahlpflichtliste A – BVT VeranstaltungenVL/SE Betriebswirtschaftliche Projektplanung biotechnischer Prozesse (6LP)
Blockveranstaltung vom 26.4.16 bis 18.5.16, Schriftliche Prüfung, 26.‐28.4. 10‐16, 9.5.‐12.5. 10‐13, 13.5.‐18.5. 10‐16Ackerstr. 76, Z20Anmeldung bis 25.4.2016 per e‐mail an stefan.junne@tu‐berlin.de UND auf ISIS2 und Quispos
ODER
PR Projektierung biotechnologischer Prozesse (9LP)Voraussetzung ist gleichzeitige Teilnahme am obigen Modul „Betriebswirtschaftliche Projektplanung biotechnischer Prozesse“Blockveranstaltung vom 26.4.16 bis 18.5.16, Projektierungs / Businessplanprojektarbeit während des SS in Gruppen,Abschlußpräsentation (nach Vereinbarung), Anmeldung bis 25.4.2016 per e‐mail an stefan.junne@tu‐berlin.de UND auf ISIS2 und Quispos
Wahlpflichtliste A – BVT Veranstaltungen
Unifying Concepts of Biomolecular Synthesis (6LP)Zeit: 21.4. bis 23.6.16 jeweils Donnerstags 13‐17 Uhr, 27.6. bis 30.6.16 9‐17 UhrOrt: Ackerstr. 76, ACK Z20Anmeldung: Quispos und auf ISIS2
Day Date Time Subject LecturerThursday 21.4. 13‐15 L1 Concepts of Biocatalysis Neubauer
15‐17 S1 Introductory seminar to projects
Thursday 28.4. 13‐16 L2 The microbial use of sugars: a complex physiology of of simple biochemical reactions Neubauer
16‐17 S2 Project seminar
Thursday 12.5. 13‐16 L3 Stress responses in bioreactors Neubauer16‐17 S3 Project seminar
Thursday 19.5. 13‐16 L4 Algae and DHA production Andri Hutari / Peter Neubauer16‐17 S4 Project seminar
Thursday 26.5. 13‐16 L5 Biocatalysis of modified Nucleosides as bioactive compounds and drugs Sarah Kamel
16‐17 S5 Project seminar
Thursday 2.6. 13‐16 L6 Synthesis and production of bioactive peptides Neubauer /Elvis Legala
16‐17 S6 Project seminar
Thursday 9.6. 13‐16 L7 Continuous bioprocessing ‐ from evolution in bioreactors to continuous processes Peter Neubauer /Christian Schipp
16‐17 S7 Project seminar
Thursday 16.6. 13‐17 L8 Biokatalytische Prozesse und Wertstoffrückgewinnung Thomas Grimm16‐17 S8 Project seminar
Thursday 23.6. 13‐17 L9 Biocatalysis of modified Nucleosides as bioactive compounds and drugs Heba Yehia / Maryke Fehlau16‐17 S9 Project seminar
Monday 27.6. 10‐14 L10 in silico screening approaches for identificationof biocatalysts with desired properties (e.g., substrate specificity)
Prof. Matthias Höhne, Univ. Greifswald
14‐17 S10 Project seminar
Tuesday 28.6. 9‐12 L11 Industrial scale production of peptide pharamceuticals and antibiotics Dr. Burghard König (Sandoz)
13‐17 L12 Synthetic biology and genome editing Johannes Kabisch
Wednesday 10‐13 L13 Anaerobic biocatalysis of halogen compoundsPhD students of Prof. Lorenz Adrian (UfZ Leipzig)
14‐17Anaerobic biocatalysis of halogen compounds
PhD students of Prof. Lorenz Adrian (UfZ Leipzig) and Peter Neubauer
Thursday 9‐12 P1 Group presentationsThursday 13‐17 P2 Group presentations Friday 1.7. 10‐12 E
29.6.
30.6.
Einführung in die Bioelektronik – SoSe 2016 (Birkholz)
Wie funktionieren Biosensoren?
Was haben Leben und IT gemeinsam?
Wie intelligent können Mikrotiterplatten und Lab‐on‐Chip Systeme noch werden?
Was steht zwischen Dir und dem Einsatz der Bioelektronik?Wie sind Mikrochips für die eigenen Versuche zu nutzen?
Was sind ISFETs und was machen
sie in DNA‐Sequenzierern?
Antworten in der ILV Bioelektronikdonnerstags am FGBVT, Z 20, 17h c. t. Einführung am 21.4. 2016; Details unter ISIS.
Wahlpflichtliste A – BVT Veranstaltungen
Systembiotechnologie
Zeit: Mittwochs, 17 ct – 19 Uhr, Start 27.4.2016Ort: Ackerstr. 76, Seminarraum ACK268Anmeldung und weitere Information: Prof. Dr. Peter Götz (goetz@beuth‐hochschule.de)
IngenieurwissenschaftlicheMethoden zur quantitativenBeschreibung biologischerSysteme
Wahlpflichtliste A – BVT Veranstaltungen
Wahlpflichtliste A – BVT VeranstaltungenIndustrielle anaerobe Bioprozesse – Bioenergie, Biogas, Biosolvents (6LP)Zeit: 29.8. bis 2.9.2016 jeweils 10.00 bis 16.00 UhrOrt: Ackerstr. 76, ACK Z20Anmeldung: Quispos und auf ISIS2 (bis 30.6.2016) Mindestteilnehmerzahl 10Weitere Information: Dr. Ing. Stefan Junne (stefan.junne@tu‐berlin.de)
Fakultät III Prozesswissenschaften Fachgebiet für Mess‐ und Regelungstechnik
Regelungstechnisches Praktikum BiotechnologieProf. R. King / F. Neddermeyer ([email protected])
• 3 LP (7 Tage am Fachgebiet)
• Portfolioprüfung (Protokoll, Aussprache)
• Voraussetzung: Grundlagen der Regelungstechnik für BT und Chemieing. oder GMRT (6 LP ?)
• Freitag 29.4.2016 um 16:00 im ER 103 Vorbesprechung zur Terminfindung
This image cannot currently be displayed.
This image cannot currently be displayed.This image cannot currently be
displayed.
VorlesungRegulation der Genexpression
Veranstaltungsnummer: 0335 L 123
Block 05.09.-16.09.2016, HS TIB 21c, 12-16h Dozent: Dr. Henry Fechner
Informationen auf ISIS2
INHALTE
• Genexpression und Regulation der Transkription• Prinzipien der Genregulation / Transkriptionsfaktoren• Chromatinstruktur und Transkriptionsregulation• Posttranskriptionale Regulation der Genexpression – RNA Interferenz• Transmembranrezeptoren• Transmembranrezeptoren mit Tyrosinspezifischer Proteinkinase-Aktivität• G-Protein gekoppelte Rezeptoren• Nukleäre Rezeptoren• Second Messenger• Regulation des Zellzyklus• Regulierbare Genexpressionssysteme
1. RNA Interferenz als molekulares Werkzeug Veranstaltungsnummer: 0335 L 120
Block 19.09.-23.09.2016, 9-18hPraktikumsraum 423, 325
2. Gentherapie und Genexpression Veranstaltungsnummer: 0335 L 122
Block 26.09.-30.09.2016, 9-18hPraktikumsraum 423, 325
Praktikumsinhalt:
‐ Zellkultur‐ Transfektion von Zellen mit Plasmiden‐ Anwenden von shRNA und amiRsgegen Phospholamban‐ Anwendung des Tet‐On Genexpressionssystems ‐ Luciferase‐Indikatorgenexpressionssysteme‐ Herstellung und Testung von Adeno‐Assoziierten Virus (AAV)‐Vektoren
PraktikumBetreuer: Dr. Henry Fechner
Ziel: Entwicklung einer Gentherapie für die Behandlung der Herzinsuffizienz
Einschreibung 01.07‐15.7.2015 auf ISIS 2; 16 Teilnehmer je Praktikum.
Prüfungsausschuss Master
• PA‐Vorsitzender: Jens Kurreck (Stellvertreter: Peter Neubauer)– Alle E‐mails an:
• [email protected]‐berlin.de
– Das Sekretariat ist derzeit nicht besetzt und das Fachgebiet hat zur Zeit nur einen Assistenten. Bitte planen Sie etwas Zeit für die Antworten ein.
• Sprechstunden: mittwochs 9.30 bis 10.00 Uhr– Keine Anmeldung– Sprechstunde am 23.4. fällt aus, weitere Abweichungen werden
durch Aushang am Sekretariat (TIB 17A, R. 322) bekanntgegeben
PR Zelldifferenzierung humaner Stammzellen
02.7. bis 07.07.
09.7. bis 14. 07.
SE Vertiefung Med. Biotechnologie
20.06. bis 01. 07.
10:00 bis 17:00
Moderne Techniken in der in in vitro Diagnostik
18.4. ‐ 11. 7. TIB 825
Montags 17‐18:30
PR 14.7. 9:30 ‐ 13:30
Forensische Genetik
15.7. 16:00 Vorbesprechung
18.7. bis 22. 7. 13:30 bis 18:30 in TIB 582
VL SE Membranproteine
DI. 18:00 bis 20:00
Thielalle 63
Prof. Dr.-Ing. Vera Meyer
IBioT, Department Applied and Molecular Microbiology
Applied and Molecular Microbiology
Courses for Master StudentsSoSe 2016
Lehre FG AMM SoSe 2016
VL Angewandte und Molekulare Mikrobiologie (0335 L 058)(2 SWS)
Block: 04.07. bis 08.07.2016
Zeit: 10.00 bis 16.00 Uhr
Ort: Seminarraum 401, (TIB; Geb. 17a)
Vorbesprechung: 27.06.2016 17.00 bis 18.00 TIB 401
Diese Lehrveranstaltung wird von Vera Meyer gehalten.
Lehre FG AMM SoSe 2016
VL Angewandte und Molekulare Mikrobiologie (0335 L 058)(2 SWS)
1) Systems biology in applied microbiology
-> an omics view on microbial fermentation (bacteria, yeast, fil. fungi)
-> genomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics
-> complexity of biological networks
-> databases and data evaluation
3,000,000 components
Weight : 560 tSpeed : 900 km/hPassengers : 850
Genes : 3002Proteins : ~ 3000 Metabolites: ~ 800 - 10007,000 components
Lehre FG AMM SoSe 2016
VL Angewandte und Molekulare Mikrobiologie (0335 L 058)(2 SWS)
2) Synthetic biology in applied microbiology
-> minimal genomes, synthetic life, ethical considerations
-> standardization, modularisation, designing biological systems
AND OR NOT
Standardized parts
Logic Gates
Computers
Integrated Circuits
Cells
Lehre FG AMM SoSe 2016
SE Systembiologie der Mikroorganismen (0335 L056)(2 SWS)
Block: 11.07. bis 22.07.2016
Zeit: 10.00 bis 15.00 Uhr
Ort: Seminarraum 401 (TIB, Geb. 17a)
Termin zur Vorbesprechung und Platzverteilung wird über ISIS/per Aushang bekannt gegeben!
Diese Lehrveranstaltung wird von Herrn Dipl.-Ing. Paul Schäpe gehalten.
Lehre FG AMM SoSe 2016
SE Systembiologie der Mikroorganismen (0335 L056)(2 SWS)
-> microbial genome databases
-> evaluation of transcriptomic data
-> gene co-expression networks
-> R, Bioconductor, Cytoscape
-> FetGOAT, TFBSF, …
-> focus: Aspergillus niger
Lehre FG AMM SoSe 2016
PR Praxis der angewandten und molekularen Mikrobiologie (0335L057)(3 SWS)
Block: 25.07. bis 29.07.2016
Zeit: 10.00 bis 17.00 Uhr
Ort: Praktikumsraum 494 (TIB, Geb. 17a)
Termin zur Vorbesprechung und Platzverteilung wird über ISIS/per Aushang bekannt gegeben!
Diese Lehrveranstaltung wird von Herrn Dr. Sascha Jung gehalten.
Lehre FG AMM SoSe 2016
PR Praxis der angewandten und molekularen Mikrobiologie (0335 L057)(3 SWS)
Functional studies
Deletion ofGOI
Overexpressionof GOI
GFP reporter to studylocalisation of GOI
-> topic: functional genomics of Aspergillus niger
-> methods:
-> Gibson cloning, PCR, Southern Blot
-> chemiluminescence detection, fluorescence microscopy
Lehre FG AMM SoSe 2016
Peer-to-Peer teaching in der Mikrobiologie (10 LP)
Wahlfach für Biotechnologen im Masterstudiengang bzw. Bachelorstudiengang (5./6. Semester).
Anmeldung via E-Mail bis spätestens 22.4.16: [email protected]
Peer-to-Peer teaching II in der Mikrobiologie (6 LP)
Wahlfach für Biotechnologen im Masterstudiengang bzw. Bachelorstudiengang (5./6. Semester).
Anmeldung via E-Mail bis spätestens 22.4.16 : [email protected]
Lehre FG AMM SoSe 2016
Genetik in der Biotechnologie (0335 L 044)(1 SWS, Wahlfach)
Zeit: Donnerstag: 17.00 bis 18.00 UhrOrt: Hörsaal TIB 21 004 Beginn: 28.04.2016
Diese Lehrveranstaltung wird von Frau Prof. Dr. Christine Lang gehalten.
Anmeldung via E-Mail [email protected]
Synthetic Biology, IGEM Prof. Ned Budisa (Fakultät II)
Other recommended courses
http://igem.biocat.tu-berlin.de/index.php
Astrobiologie (VL) Prof. Schulze-Makuch (Fakultät II)
Other recommended courses
Astrobiologie (VL) Prof. Schulze-Makuch (Fakultät II)
Other recommended courses
Last but not least: DTG Life-Science-Network
DTG: Deutsche Technion GesellschaftTechnion: Israel Institute of Technology Haifa
• Life Science Network of the DTG offers the possibility for Master or PhD
students to join one of the participating Institutes for a 4 – 6 weeks research stay.
• Each of the German universities accepts up to five Technion students per year,
while each German university can send up to five students to the Technion.
• Each student is supported by a grant of 1000 € by the DTG
German Life—Science Network: TUB, TU Hamburg-Harburg, TU München, TU Dresden, Uni Hanover
Contact TUB: Vera Meyer
DTGMarianne Krüger‐JungnickelTU Hochhaus TEL1515Ernst‐Reuter‐Platz 7D‐10587 [email protected]
FG Bioanalytik
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
FG Bioanalytik – Angebotene Module
Sommer Semester• Advanced Bioanalytics (max. 18 LP)
• Vorlesung + Seminar: 6 LP• Forschungsemester: 6 LP (ca. 120 h)• Forschungsemester: 12 LP (ca. 240 h)• in Planung: Praktikum NMR (B): 6 LP
Winter Semester• Modern Mass Spectrometry (6 LP)
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
WS
SS
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
Advanced Bioanalytics VorlesungSS
Analyse von Biomolekülen (insb. Proteine)
strukturell quantitativfunktionell
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
Advanced Bioanalytics VorlesungSS
Analyse von Biomolekülen (insb. Proteine)
• Massenspektrometrie• Biostatistik• Next‐Generation‐Sequencing• Kristallstrukturanalyse• Kernspinresonanzsprektroskopie• Elektronenmikroskopie
strukturell quantitativfunktionell
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
Advanced Bioanalytics VorlesungSS
Analyse von Biomolekülen (insb. Proteine)
• Massenspektrometrie• Biostatistik• Next‐Generation‐Sequencing• Kristallstrukturanalyse• Kernspinresonanzsprektroskopie• Elektronenmikroskopie
strukturell quantitativfunktionell
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
Advanced Bioanalytics SeminarSS
Seminar zur Datenanalyse• Big Data Handling• Graphische Darstellung• Statistik• Methodenspezifisches
t
Schw
ierig
keit/K
omplexitä
t
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
Advanced Bioanalytics SeminarSS
Seminar zur Datenanalyse• Big Data Handling• Graphische Darstellung• Statistik• Methodenspezifisches Laptop bitte
mitbringen!
t
Schw
ierig
keit/K
omplexitä
t
Advanced Bioanalytics VL + Se
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
SS
Mo Di Mi Do Fr08‐10 Uhr Vorlesung Seminar10‐12 Uhr12‐14 Uhr14‐16 Uhr16‐18 Uhr
Advanced Bioanalytics VL + Se
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
SS
Mo Di Mi Do Fr08‐10 Uhr Vorlesung Seminar10‐12 Uhr12‐14 Uhr14‐16 Uhr16‐18 Uhr
Ausnahme:1. Vorlesung am Do 21.04. ‐‐ 8.30 Uhr
Advanced Bioanalytics ‐ RegistrierungSS
Registrierung via ISISPasswort: HSA‐BS3
Wichtig:Fragebogen ausfüllen + Foto
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
Advanced Bioanalytics ‐ ForschungssemesterSS
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
• Mitarbeit in einem aktuellen Forschungsprojekt• kein Skript ‐‐> Versuchsplanung im Team• Leider nur sehr begrenzte Teilnehmerzahl
• Wir wollen:• Engagement und Zuverlässigkeit• Lust auf wissenschaftliches Arbeiten
Wir bieten:• Team‐ und Laborerfahrung• 6 LP (ca. 120 h)• 12 LP (ca. 240 h)
Advanced Bioanalytics ‐ ForschungssemesterSS
E. Coli E. Coli
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
Advanced Bioanalytics ‐ ForschungssemesterSS
E. Coli E. Coli
Zellaufschluss / Probenvorbereitung
other methods...
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
Advanced Bioanalytics ‐ ForschungssemesterSS
E. Coli E. Coli
Zellaufschluss / Probenvorbereitung
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
Advanced Bioanalytics ‐ ForschungssemesterSS
E. Coli E. Coli
Zellaufschluss / Probenvorbereitung
x 100
x 100
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
Advanced Bioanalytics ‐ ForschungssemesterSS
E. Coli E. Coli
Zellaufschluss / Probenvorbereitung
+ Maschinenlernenx 100
x 100
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
Advanced Bioanalytics ‐ ForschungssemesterSS
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
Modern Mass Spectrometry
• MMS will take place in WiSe• Advanced Bioanalytics required• Two blocks:
• soft skills• mass spectrometry
Our goal:• Give you practical skills that will prepare you for your thesis and beyond• Make you a (budding) expert in mass spectrometry
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
WS
Modern Mass Spectrometry
Soft skills:
Presentations:
• How to read a paper?• How to write a paper (thesis)?• How to give a talk?
• Each student needs to give a talk about a recently published paper from the mass spectrometry field
• prepare a written summary (extended abstract) of the paper
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
WS
Modern Mass Spectrometry
Topics for the mass spectrometry part:
• Peptide and protein identification• Quantitative proteomics ‐ disease vs. healthy proteomes• Advanced acquisition techniques:
• Selected reaction monitoring• Data independent acquisition
• 3D proteomics ‐ gain information about 3D structure of proteins• …. Many more!
TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)
WS
Functional Genomics in Environmental Biotechnology
Bakterien und Archaeenrelevant für die Umwelt- und GeomikrobiologieGenomik, Physiologie, Biochemie und Metabolismus
Themen• Umweltbiotechnologie (Bodensanierung, Plastik,
Chemikalienabschätzung, Methanbildung, …)• Geomikrobiologie (Biomining, Aquifere, Böden,
Meeressedimente)• Evolution
Methoden• Bioinformatische Tools & Datenbanken• Sequenzierung und Annotation mikrobieller Genome• Proteomik• Verwendung stabiler Isotope (13C, 15N, 2H)• Single-Cell Methoden
Functional Genomics in Environmental Biotechnology
Vorlesung mit SeminarFachlicher Ergänzungsbereich - 0335 L 146 (freie Wahl)
Dozent: PD Dr. Lorenz AdrianKontakt: [email protected]
Termine: ab 25.04.2016Montags 8:15 – 9:45 Uhr (n.V.)
Raum: Gustav-Meyer-Allee, TIB21-004Abschluss: Portfolioprüfung; Vortrag eines eigenen ProjektesLPs: 3, Liste AInfo: ISIS2 (ohne Passwort einschreiben)
Kurs unter Fachgebiet Angewandte Biochemie