- Basic of plant gene expression - Fundamental of plant signal transduction
description
Transcript of - Basic of plant gene expression - Fundamental of plant signal transduction
- Basic of plant gene
expression
- Fundamental of plant
signal transduction
- Phytochrome and blue-
light responses in plants
Gene expression and signal transduction (4 hr)
http://5e.plantphys.net/
Gene expression คื�ออะไร
genes
“DNA sequence that encode protein & RNA”
gene expression
“turning gene on”
อะไรบ้�างที่� มี�ผลให้�ยี�นแสดงออก
turning “flowering genes” on
turning “heat shock protein genes” on
turning “growth & development genes” on
ภาวะปกติ�
Growth & development
ภาวะผ�ดปกติ�
Environmental change
ร�ปแบ้บ้การแสดงออกของยี�น
Constitutive expression
Regulated expression
มี�การแสดงออกอยี างถาวรและเห้มี�อนก#นที่$กเซลล& (ได�แก housekeeping genes)
มี�การแสดงออกเมี� อได�ร#บ้ส#ญญาณกระติ$�น(internal / external signals)
พื�ชมี�ระบ้บ้ร#บ้ร��ป,จจ#ยีส� งแวดล�อมีการร#บ้ส#ญญาณ
(signal perception)
การถ ายีที่อดส#ญญาณ (signal
transduction)การติอบ้สนองติ างๆ(gene expression,
responses)
“chemical communication
”
เวลา
การตอบสนองต อส�ญญาณจะเก�ดขึ้��นร�ปแบบใดน��น ขึ้��นก�บระด�บ (dose, level)
ประสบการณ�
ติ#วอยี าง: Temperature-dependent
extracellular pH change of cells
level of stress sensed by plant cellsphysiological : 25°Cnon-physiological : >45°C
(Chaidee and Pfeiffer 2006)
threshold
Sung et al. 2003
signal
receptor
signaltransduction
responses
Basic of plant gene expression
1. Transcription: การส#งเคืราะห้& mRNA (transcript)
2. Translation: การส#งเคืราะห้&โปรติ�น
Gene expression in eukaryotes
Gene expression in eukaryotes
ร�ป 14.4 Gene expression in eukaryotes1 .อ านคื0าอธิ�บ้ายีภาพืและเข�ยีนอธิ�บ้ายีด�วยี
ภาษาติ#วเอง2 .ข�อด�ของการเติ�มี poly-A tail มี�
อะไรบ้�าง
Transcription factors
DNA-binding motifs
การคืวบ้คื$มี gene expression
การคืวบ้คื$มีที่� ข#3น transcriptionเพื� อให้�ได� mRNA ที่� ถ�กติ�อง
1. mRNA processing เพื� อให้�ส งออกไปที่� ไซโที่พืลาซ4มีได�[5′ capping, addition of poly-A tail, excision of introns, splicing together of exons]
2. Posttranscriptional regulation[mRNA degradation (turnover)]
3. Binding to cis-acting regulatory sequences[transcription factor]
การคืวบ้คื$มีข#3น posttranscription
คืวบ้คื$มีปร�มีาณ mRNA และ translatability
mRNA turnover ratemRNA foldingcodon usagecellular location