Учреждение Российской академии наук Институт общей...

30
Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН Индуцированный мутагенез (количественные аспекты) А.В. Рубанович rubanovich@vigg .ru

description

Индуцированный мутагенез (количественные аспекты). А.В. Рубанович. Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН. [email protected]. XIX век – Август Вейсман: - PowerPoint PPT Presentation

Transcript of Учреждение Российской академии наук Институт общей...

Page 1: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Учреждение Российской академии наукИнститут общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Индуцированный мутагенез (количественные аспекты)

А.В. Рубанович

[email protected]

Page 2: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

История

1925 – Г. А. Надсон (и его сотрудник Г. С. Филиппов) - Ленинградский Институт рентгенологии и радиологии: после воздействия рентгеновых лучей вырастали колонии дрожжей, отличавшиеся величиной, формой и окраской.

XIX век – Август Вейсман: безуспешные попытки изменить наследственность используя температуру, влажность и механические воздействия.

1927 - Герман Джозеф Меллер - V Международный генетический конгресс в Берлине: первые удачные опыты по искусственному вызыванию рецессивных мутаций с помощью рентгеновых лучей у дрозофилы.

1927 - Л. Стадлер: искусственные мутации у ячменя и кукурузы после воздействия рентгеновых лучей.

Нобелевская премия - 1946

Расстрелян - 1939

Page 3: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Биологическое действии радиации осознали значительно раньше!

1936 - Обелиск в Гамбурге: имена 115 исследователей, погибших в результате действия радиации

1901 - Первый описанный случай радиационного ожога кожи

1906 - Первый летальный исход (США)

1911 - Первый описанный случай радиационно- индуцированной лейкемии

1946 – Первое описание «клинического синдрома обусловленного атомной бомбардировкой»

Page 4: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Радиобиологический парадокс: ничтожная энергия вызывает драматический

биологический эффект!

1920 - Фридрих Дессауер – «теория точечной теплоты»: радиация отдает энергию порциями, вызывая нагревание отдельных точек до очень высокой температуры. Далее локальное свертывание белков, что к ведет биологическому поражению.

Полулетальная доза для человека = 4 Гр = 270 Дж = 67 кал

=

1 чайная ложка горячего кофе

=

2 секунды на пляжегибель в 50% случаев

По энергетическим затратам:

Page 5: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Теория мишеней и принцип попадания (1946-1947)

Ионизирующие излучения переносят энергию в дискретном виде

Акты взаимодействия (попадания) не зависят друг от друга и подчиняются пуассоновскому распределению

Исследуемый эффект наступает, если число попаданий в некоторую чувствительную область (мишень), равно определенному числу раз

Карл Циммером (Гемания)

Николай Владимирович Тимофеев-Ресовский (Россия)

Дуглас Ли (Великобритания) Откуда взялись эти положения?

В основном из характера дозовых зависимостей…

Page 6: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Зависимость «доза-эффект» в радиобиологии

Частота, %

Время гибели

100

50

Среднее время гибели

Выживаемость, %

Время воздействия, концентрация

100

50

Токсические воздействия:

Выживаемость, %

Доза облучения

100

50

Радиация:

S(D)=e-D

Экспонента - порога нет!

Порог

Кривая выживания – это функция распределения дозы (времени воздействия), вызывающей гибель

Частота, %

Доза, вызывающая

гибель

100

50

Средняя убивающая

доза

Плотности распределений

Page 7: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Забудем на время о дозах – будем говорить о распределениях продолжительности жизни

Выживаемость, %

Возраст

100

50

75

ЧеловекВыживаемость, %

Возраст

100

50

Некоторые насекомые

Экспоненциальная продолжительность жизни - это распределение «без памяти о прошлом»

Вероятность умереть в следующемгоду не зависит от возраста

Вероятность умереть в следующемгоду увеличивается с возрастом

4000

Распределение продолжительности жизни

для бессмертных! Единственная причина смерти – попадание под

колеса автомобиля. Средняя продолжительность

жизни 4000 лет

Page 8: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Вернемся к зависимостям «доза-эффект»

Выживаемость, %

Доза облучения

100

50

Экспоненциальная зависимость:вероятность наступления эффекта при

следующей порции облучения не зависит от предыдущей дозы

Ионизирующие излучения переносят энергию в дискретном виде

Акты взаимодействия (попадания) не зависят друг от друга и подчиняются пуассоновскому распределению

Исследуемый эффект наступает, если число попаданий в некоторую чувствительную область (мишень), равно определенному числу раз

Положения теории попаданий в мишени

Не только дозовые зависимости! Многое проясняет физика

взаимодействия излучений с веществом

Page 9: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

-частиы

-лучи

X-лучи(рентгеновское излучение)

-частицы-Рентгеновское излучение

не связано с радиоактивностью

Виды ионизирующих излученийт.е. способных производить ионизации атомов (выбивать электроны с орбит )

Ядро атома

-

-

-

--

-

-

-

Вильгельм Конрад Рентген и рука его жены (1895)

Page 10: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Эрнест Резерфорд (1899)

Природа ионизирующих излучений

-частицы:

-частицы:

-лучи:

Pb +

-

Источник – радиоактиный изотоп, у которого ядра атомов

нестабильны за счет избытка нейтронов

Число протонов

Чи

сло

нейт

роно

в

Излучение, тип радиации Масса Заряд Защита

Ядра гелия 4 +2 Бумага, одежда

Электрон 1/1836 -1 Пластик, стекло

ЭМ-волны 0 0 Свинец, бетон

n Частица 1 0 Вода, парафин

Источник – радиоактиный изотоп, у которого ядра атомов

нестабильны за счет избытка (или дефицита) нейтронов

++

-

4Не

е-

2

Фотон

Частота, Гц

-лучи X-лучи УФ

Длина волны, м

Ионизирующая способность

Page 11: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Ионизации и линейная передача энергии (ЛПЭ)

Низкая ЛПЭ < 7 кэв/мкм(-лучи, X-лучи, -частицы)

Высокая ЛПЭ > 20 кэв/мкм (- частицы, протоны, нейтроны)

ЛПЭ = потери энергии ионизирующей частицы на единицу пути в веществе (E/s)

Ионизированный атом-

-

-

--

-

Ионизирующее излучение

Page 12: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Бумага Бетон

-частицы

-частицы

Прохождение излучений через вещество

Источники опасны только при

поступлении в организм

-лучи

Пробег в ткани 0.1 – 3 мкм

Page 13: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Единицы измерения доз Поглощенная доза – энергия, выделенная в 1 кг вещества: 1 Грей (Гр) =1 Дж/1 кг

Экспозиционная доза – мера ионизации (только для - и X-лучей) - заряд (одного знака), образующийся в 1 см3 воздуха

1 Рентген (Р) = 0,0088 Гр

Эффективная или эквивалентная доза – доза с учетом ОБЭ и радиочувствительности пораженного органа

1 зиверт (Зв) = 100 бэр

Только для личного пользования!1 Гр = 100 рад 100 Р 100 бэр 1 Зв

Единицы измерения радоактивности

Cкорость распада атамов: 1 беккерль (Бк) = 1 распад/сек 1 Кюри (Кю) = 3,71010 Бк

Дозиметры меряют не дозу, а мощность дозы, т.е. поглощенную дозу в единицу времени (Гр/c)

Рентген, грей, бэр, рад, зиверт, рем…?

0.1 1 10 100 1000

1

2

3

4

ЛПЭ, кэвмкм-1 ткани

ОБ

Э

Относительная биологическая эффективность излучения (ОБЭ)

- p+

Page 14: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Положения теории попаданий в мишени

Ионизирующие излучения переносят энергию в дискретном виде

Акты взаимодействия (попадания) не зависят друг от друга и подчиняются пуассоновскому распределению

Исследуемый эффект наступает, если число попаданий в некоторую чувствительную область (мишень), равно определенному числу раз

Что является «мишенью»?

Page 15: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Идентификация мишени: ядро, хромосомы, ДНК Микропучки -частиц с пробегом 40 мкм (210Ро):

избирательное облучение ядра Микроразрезы: перенос необлученного ядра в облученную цитоплазму

Уридин (РНК, цитоплазма) и тимин (ДНК, ядро), помеченные тритием 3Н

(-излучатель, пробег 1-2 мкм) Сенсибилизация клеток 5-бромдезоксиуридином

(BUdR подобен, но не идентичен тимину) Радиочувствительность содержание ДНК в клетках:

растения, насекомые, амфибии (объем интерфазных хромосом)

Ядро в 100 раз более чувствительно, чем цитоплазма

Облучение хромосом в 200-300 эффективней, чем облучение цитоплазмы

Page 16: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Прямое и непрямое действие радиации

Непрямое действие - радиолиз воды и возникновение свободных радикалов при прохождении излучения через цитоплазму:

- наиболее активен радикал OH (75% повреждений ДНК) - преобладает при низких ЛПЭ (- и X-лучи)

Прямое действие - непосредственная ионизация атомов ДНК - преобладает при высоких ЛПЭ (-частицы, нейтроны)

Свободный радикал OHэлектрически нейтрален, но имеет

неспаренный электрон на внешней орбите - высокая реакционная способность

(время жизни 10-10 с)

В любом случае речь идет о попадании в ДНК-мишень

2 мкм

Page 17: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Действие ионизирующих излучений

«Интерфазная гибель» - мгновенное прекращение метаболизма и разрушение клетки: большие дозы (> 20 Гр) «Репродуктивная гибель» - потеря способности к неограниченному делению: низкие дозы (< 10 Гр):

Однонитевые разрывы ДНК (низкое ЛПЭ) Двунитевые разрывы ДНК (высокое ЛПЭ) Повреждение оснований (особенно пиримидиновых).

На хромосомы:

На клетку:

Репарация Хромосомные аберрации, мутации генов в половых и соматических клетках (рак)

Дальнейшие события:

Page 18: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Попадания в мишени: распределение Пуассона

- среднее число попаданий при дозе D

Распределение «редких событий»:- число рыбок, пойманных за «время» D- число изюминок в кексе «объема» D- число голосов за Жириновского в квартале с D жителями

…………

Вероятность отсутствия поражений, т.е. выживаемость при

«одноударном» механизме гибели

объем мишени

Page 19: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Модель гибели «одна одноударная мишень»

Доза облучения

Выживаемость, %

100

50S(D)=e-D

Доза облучения

Выживаемость, %

1

0.1

0.01

Удобен «полулогарифмический» масштаб:

- доза, вызывающая 63% гибели:

1-2 Гр для клеток млекопитающих500 Гр - вирусы

По оси ординат ln S(D)=-D

D37

0.37

Первые правильные оценки размера генов в хромосомах.

Задолго до «двойной спирали»!

Page 20: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Модель гибели «несколько одноударных мишеней»

S(D)=1 – (1-e-D)m

0.01

Доза облучения

Выживаемость, %

1

0.1

Пусть для инактивации клетки небходимо попадание в m

мишеней, например при m=2 :

Вероятность попасть в одну мишень (хотя бы раз!)

m«Плечо»

Жива Жива Погибла

Оценка «числа мишеней»!

Page 21: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Численные оценки радиочувствительности

Выживаемость, %

D

100

50

- средняя доза, вызывающая

гибель

_D

=

Процедура нахождения площади более устойчива к разбросу точек, по сравнению с алгоритмами вычисления D50 или D37

Выживаемость, %

D

100

D50 D37

3750

D

Выживаемость, %

100

50

_D

D37 - в радиобиологии

D50 - в токсикологии

D - в теории вероятностей_

D = Площадь под кривой выживания в линейном масштабе

_

Page 22: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Одноударные и многоударные эффекты

………… и т.д. – распределение Пуассона

Одноударный эффект

Двухударный эффект

Доза облучения

Эффект (мутации, аберрации)

1 удар2 удара

Page 23: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Радиационно-специфические аберрации хромосом

Центрические кольца + фрагменты (2 разрыва в одной хромосоме)

Дицентрики + фрагменты (2 разрыва в разных хромосомах)

Page 24: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Одноударные и многоударные эффекты

2 4 60

0.4

0.8

1.2

1.6

Доза, Гр

Чис

ло д

ицен

трик

ов

на к

летк

у

2 разрыва за 1 удар

D

2 разрыва за 2 удара

D2

При увеличении ЛПЭ кривая становится

одноударной

Доза, Гр

Час

тота

ди

цент

рико

в

50

1.5

Xn

Выход дицентриков D+ D2

Page 25: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Биодозиметрия

0

0,1

0,2

0,3

0,4

0,5

0,6

0,7

0 0,5 1 1,5 2 2,5 3

Доза, Гр

Час

тота

ди

цен

три

ков

и

цет

ри

чес

ки

х к

олец

на

кл

етк

у

Калибровочная регрессия зависимости частоты дицентриков и центрических колец на дозу -облучения (облучение лимфоцитов in vitro)

y = 0,001 + 0,015 D + 0,063 D2y = 0,001 + 0,015 D + 0,063 D2

Доза, полученная пациентом

Частота аберраций у

пациента

Минимальная доза, которую можно выявить при анализе лимфоцитов составляет 0.1 – 0.2 Гр

Обнаружение хромосомных аберраций в лимфоцитах крови – доказательство недавнего облучения организма

Возможны более точные оценки индивидуальной дозы по данным, полученным при облучении лимфоцитов in vitro

В.А. Шевченко, 2002

Page 26: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Репарация

Повреждения ДНК Частота на Гр Доля летальных

Изменение оснований 500/Гр 0.01

Однонитевые разрывы 1000/Гр 0.01

Сшивки ДНК-белок 150/Гр ?

Двунитевые разрывы 50/Гр 0.95

Влияние мощности дозы на частоту микроядер

0

1

2

3

4

5

Контроль 10 cГр(острое)

10 cГр/2 ч 10 cГр/24 ч 10 cГр /48 ч

Час

тота

мик

рояд

ер/1

00 к

лето

к

de Toledo et al. 2006

При уменьшении мощности дозы

Ацентрические фрагменты хромосом исключенные из клеточных ядер в момент

деления клеток

Page 27: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Репарация – зависимость выживаемости от мощности дозы

X-лучи: 0,01 Гр/мин

2 4 6 8 100

10-3

10-4

10-2

10-1

1

X-лучи: 1 Гр/мин

Доза, ГрНейтроны: 0.01 Гр/мин

Нейтроны: 1 Гр/мин

При увеличении мощности дозы и ЛПЭ излучения

Репарации обнаруживается по изменению наклона кривых «доза-эффект»:

при изменении мощности дозы

при фракционированном облучении

Page 28: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Репарация – зависимость выхода дицентриков от мощности дозы

D.C. Lloyd (1981)

X-лучи: 1Гр/мин

X-лучи: 0,003 Гр/мин

543210

0.5

1.0

1.5

2.0

Доза, Гр

Час

тота

диц

ентр

иков

на

клет

ку

При увеличении мощности дозы и ЛПЭ излучения

Нейтроны, энергия 0.714.7 Мэв

Выход Х-сцепленных рецессивных леталей у дрозофилы не зависит от мощности дозы

в диапазоне 0.03 - 100 Гр/час

Принцип «беспороговости» и «кумулятивности» мутационного процесса

Page 29: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Проект «MegaMouse» супругов L. B. Russell & W. L. Russell (1955-1965)

Пять главных выводов

Выход различных мутаций на 1 Гр различается в 30 раз.

Эффект мощности дозы существенен. Хроническое облучение вызывает меньше мутаций, чем острое (в отличии от Drosophila)

Самцы более радиочувствительны, чем самки.

Генетические эффекты существенно уменьшаются, если увеличивается время между облучением и спариванием.

Удваивающая доза для частоты мутаций равна 1 Gy.

Индукция морфологических мутаций в потомстве облученных родителей

7 морфологических мутаций7 миллионов мышей!

1 Гр

The frequency of radiation-induced mutations is not, as the classical view holds, independent of dose rate. W. L. Russell, L. B. Russell. Science, 19, 1958

Page 30: Учреждение Российской академии наук Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН

Копию презентации можно скачать на сайте ИОГен: www.vigg.ru

Всем спасибо, и еще раз напомню:

Экспоненциальная зависимость выживаемости от дозы означает гибель от случайных и независимых актов поражения

Квадратичная зависимость от дозы указывает на двухударный механизм формирования эффекта

Для млекопитающих доза, удваивающая частоту мутаций в потомстве 1 Гр

1 Гр 100 рентген, хотя это разные вещи

Биологические эффекты ионизирующих излучений в основном связаны с воздействием на ядерное ДНК

Зависимость кривой «доза-эффект» от мощности дозы указывает на присутствие репарации