Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή...
description
Transcript of Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή...
![Page 1: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/1.jpg)
Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση
Δρ Α. Μεντής, Διευθυντής Ερευνών Ιατρός Βιοπαθολόγος, Κλινικός Μικροβιολόγος Εθνικό Εργαστήριο Αναφοράς Γρίπης Ν. Ελλάδος
Ελληνικό Iνστιτούτο Pasteur
![Page 2: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/2.jpg)
![Page 3: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/3.jpg)
Ιοί γρίπης Α
![Page 4: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/4.jpg)
Ιοί γρίπης Α
![Page 5: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/5.jpg)
Ιοί γρίπης Α Ιοί γρίπης Α
![Page 6: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/6.jpg)
![Page 7: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/7.jpg)
Πολλαπλασιασμός του ιού ΗΑ
ΝΑ
![Page 8: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/8.jpg)
Αντιγονική παρέκκλιση και μεταβολή
Αντιγονική παρέκλιση (drift) Σε ιούς γρίπης Α και Β Σημειακές μεταλλάξεις στα γονίδια Η και Ν Υπεύθυνη για εποχική γρίπη
Αντιγονική μεταβολή (shift) Σε ιούς γρίπης Α μόνο Μεγάλη μεταβολή στη δομή Η και Ν Νέος ιός με νέο αντιγονικό προφίλ Δυνητικά πανδημία
![Page 9: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/9.jpg)
Αντιγονική παρέκκλιση Α/Panama/H3N2
![Page 10: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/10.jpg)
Αντιγονική παρέκκλιση Α/Panama/H3N2 Α/Fujian/H3N2
![Page 11: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/11.jpg)
Αντιγονική παρέκκλιση και μεταβολή
Αντιγονική παρέκλιση (drift)
Αντιγονική μεταβολή (shift) Σε ιούς γρίπης Α μόνο Μεγάλη μεταβολή στη δομή Η και Ν Νέος ιός με νέο αντιγονικό προφίλ Δυνητικά πανδημία
![Page 12: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/12.jpg)
Aντιγονική μεταβολή – ανασυγκρότηση
![Page 13: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/13.jpg)
Aντιγονική μεταβολή – ανασυγκρότηση
![Page 14: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/14.jpg)
![Page 15: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/15.jpg)
Triple rassortant virus
![Page 16: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/16.jpg)
Triple rassortant virus
![Page 17: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/17.jpg)
Triple rassortant virus
![Page 18: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/18.jpg)
PB2-North American Avian
PB1-Human H3N2
PA-North American avian
H1-Classical swine
NP-Classical swine
N1-Eurasian avian-like swine
M-Eurasian avian-like swine
NS-Classical swine
Triple rassortant virus
Neumann, Nature, 2009
![Page 19: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/19.jpg)
Διαφορές στην αιμοσυγκολλητίνη του H1N1v και Η1Ν1 εποχικής
Gallacher G, 2009
![Page 20: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/20.jpg)
Gatherer D, 2009
Διαφορές ιών γρίπης στην αμινοξική αλληλουχία
![Page 21: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/21.jpg)
![Page 22: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/22.jpg)
MMWR, 58,2009
Ηλικιακή ομάδα (έτη)
Ποσοστό παρουσίας διασταυρούμενων αντισωμάτων για H1N1v (ΜΝ, τίτλος > 160)
18 – 40 6%
18 - 64 9%
> 60 33%
... Εμβολιαμός με εμβόλια εποχιακής γρίπης δεν είναι πιθανό να παρέχει προστασία έναντι του ιού Η1Ν1v…
![Page 23: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/23.jpg)
Hanckock K, NEJM, 2009
Neutralizing antibodies according to birth decade.
![Page 24: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/24.jpg)
![Page 25: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/25.jpg)
250 260 270 280 290 300 310 320 ....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|A/California/05/2009(H1N1) VMTDGPSNGQASYKIFRIEKGKIVKSVEMNAPNYHYEECSCYPDSSEITCVCRDNWHGSNRPWVSFNQNLEYQIGYICSG A/Washington/28/2009(H1N1) ..................................Y............................................. A/Athens/3974/2009(H1N1) .......D........................................................................ A/Athens/3975/2009(H1N1) .......D........................................................................ A/Crete/4008/2009(H1N1) .......D........................................................................ A/Crete/4057/2009(H1N1) .......D........................................................................ A/ Tripoli/4081/2009(H1N1) .......D........................................................................ A/Zakynthos /3802/2009(H1N .......D........................................................................ A/Crete/3809/2009(H1N1) .......D........................................................................ A/Aigio/3893/2009(H1N1) ................................................................................ 330 340 350 360 370 380 390 400 ....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|A/California/05/2009(H1N1) IFGDNPRPNDKTGSCGPVSSNGANGVKGFSFKYGNGVWIGRTKSISSRNGFEMIWDPNGWTGTDNNFSIKQDIVGINEWS A/Washington/28/2009(H1N1) ................................................................................ A/Athens/3974/2009(H1N1) ....................................................................~~~~~~~~~~~~ A/Athens/3975/2009(H1N1) ....................................................................~~~~~~~~~~~~ A/Crete/4008/2009(H1N1) ....................................................................~~~~~~~~~~~~ A/Crete/4057/2009(H1N1) ....................................................................~~~~~~~~~~~~ A/ Tripoli/4081/2009(H1N1) ....................................................................~~~~~~~~~~~~ A/Zakynthos /3802/2009(H1N ....................................................................~~~~~~~~~~~~ A/Crete/3809/2009(H1N1) ....................................................................~~~~~~~~~~~~ A/Aigio/3893/2009(H1N1) ....................................................................~~~~~~~~~~~~
NA
![Page 26: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/26.jpg)
90 100 110 120 130 140 150 160 ....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|A/California/05/2009(H1N1) NPECESLSTASSWSYIVETSSSDNGTCYPGDFIDYEELREQLSSVSSFERFEIFPKTSSWPNHDSNKGVTAACPHAGAKS A/Athens/728/2009(H1N1)) ................................................................................ A/Athens/893/2009 (H1N1) ................................................................................ A/Athens/919/2009(H1N1) ................................................................................ A/Athens/920/2009(H1N1) ................................................................................ A/Athens/924/2009(H1N1) ................................................................................ A/Athens/926/2009(H1N1) ................................................................................ A/Athens/939/2009(H1N1) ................................................................................ A/Athens/940/2009(H1N1) ................................................................................ A/Athens/943/2009(H1N1) ................................................................................ A/Athens/948/2009(H1N1) ................................................................................ A/Athens/3124/2009(H1N1) ................................................................................ A/Zakynthos/3802/2009(H1N1 ................................................................................ A/Crete/3809/2009(H1N1) Y............................................................................... A/Athens/3974/2009(H1N1) ................................................................................ A/Crete/4057/2009(H1N1) ................................................................................ A/ Tripoli/4081/2009(H1N1) ................................................................................ 170 180 190 200 210 220 230 240 ....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|/California/05/2009(H1N1) FYKNLIWLVKKGNSYPKLSKSYINDKGKEVLVLWGIHHPSTSADQQSLYQNADAYVFVGSSRYSKKFKPEIAIRPKVRDQ A/Athens/728/2009(H1N1)) ................................................................................ A/Athens/893/2009 (H1N1) ...........................................................T..................E. A/Athens/919/2009(H1N1) ...........................................................T.................... A/Athens/920/2009(H1N1) ...........................................................T.................... A/Athens/924/2009(H1N1) ...........................................................T.................... A/Athens/926/2009(H1N1) ...........................................................T.................... A/Athens/939/2009(H1N1) ...........................................................T.................... A/Athens/940/2009(H1N1) ...........................................................T.................... A/Athens/943/2009(H1N1) ...........................................................T.................... A/Athens/948/2009(H1N1) ...........................................................T.................... A/Athens/3124/2009(H1N1) ................................................................................ A/Zakynthos/3802/2009(H1N1 ...........................................................T.................... A/Crete/3809/2009(H1N1) ...........................................................T...................~ A/Athens/3974/2009(H1N1) ...........................................................T...................~ A/Crete/4057/2009(H1N1) ...........................................................T.................... A/ Tripoli/4081/2009(H1N1) ...........................................................T....................
HA
![Page 27: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/27.jpg)
Εργαστηριακή επιτήρηση γρίπης
Διάγνωση Μοριακή ανίχνευση ιών γρίπης Α και Β Ταχείες διαγνωστικές δοκιμασίες
Ορολογικές εξετάσεις
Ορολογική τυποποίηση
Καλλιέργεια σε κύτταρα MDCK-SIAT, αναστολή αιμοσυγκολλήσεως (IHA)
Γενετικός χαρακτηρισμός
Αλληλούχηση των γονιδίων Η, Μ και Ν απομονωθέντων στελεχών γρίπης και φυλογενετική ανάλυση
Ευαισθησία στα αντιικά φάρμακα
Εντοπισμό της μετάλλαξης στο γονίδιο της νευραμινιδάσηςΜε ενζυμική μέθοδο
![Page 28: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/28.jpg)
Κριτήρια λήψης δείγματος στη Φάση Προστασίας των Ασθενών
(ΚΕΕΛΠΝΟ, 24/07/09)
Ασθενείς με σοβαρές εκδηλώσεις γρίπης με εισαγωγή σε νοσοκομείο
Ασθενείς που κατέληξαν με αδιευκρίνιστη λοίμωξη του αναπνευστικού
Συρροές κρουσμάτων
Κατά την κρίση του θεράποντος (π.χ. αντοχή σε παράταση θεραπείας, σε νησιά και πόλεις σε περιπτώσεις που ο ιός δεν έχει ανιχνευθεί ακόμη)
![Page 29: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/29.jpg)
CDC kit
![Page 30: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/30.jpg)
CDC kit rRT-PCR για Η1Ν1v
Όνομα Γονίδιο Σχόλια
InfA Matrix A Ανίχνευση όλων των ιών γρίπης Α
SW InfA universal
NP Ανίχνευση όλων των ιών γρίπης Α των χοίρων
SW H1 Η Ειδική ανίχνευση Η1Ν1v
RnaseP RnaseP Για έλεγχο επάρκειας δείγματος
![Page 31: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/31.jpg)
CDC kit - ερμηνεία αποτελεσμάτων rtRT-PCR
InfA +
SW InfA universal +
SW H1 +
RnaseP +
![Page 32: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/32.jpg)
CDC kit - ερμηνεία αποτελεσμάτων rtRT-PCR
InfA + -
SW InfA universal + -
SW H1 + -
RnaseP + +
![Page 33: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/33.jpg)
CDC kit - ερμηνεία αποτελεσμάτων rtRT-PCR
InfA + - -
SW InfA universal + - -
SW H1 + - -
RnaseP + + -
![Page 34: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/34.jpg)
CDC kit - ερμηνεία αποτελεσμάτων rtRT-PCR
InfA + - - +
SW InfA universal + - - -
SW H1 + - - -
RnaseP + + - +
![Page 35: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/35.jpg)
CDC kit - ερμηνεία αποτελεσμάτων rtRT-PCR
InfA + - - +
SW InfA universal + - - -
SW H1 + - - -
RnaseP + + - +
H1 εποχιακής +/-
Η3 εποχιακής +/-
![Page 36: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/36.jpg)
CDC kit - ερμηνεία αποτελεσμάτων rtRT-PCR
Ψευδώς αρνητικά αποτελέσματα Δειγματοληψία όχι εντός 1-7 ημερών
από έναρξη συμπτωμάτων Μικρός αριθμός ιικών σωματίων στο
κλινικό δείγμα Ακατάλληλη συλλογή, μεταφορά και
χειρισμός των κλινικών δειγμάτων
Tι γίνεται μετά λήψη οσελταμιβίρης;
![Page 37: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/37.jpg)
Επίδραση αγωγής με οσελταμιβίρη στην ανίχνευση ιών εποχιακής γρίπης
J INFECT DIS 2009
![Page 38: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/38.jpg)
Ταχείες διαγνωστικές δοκιμές
Ανοσοφθορισμός Ανοσοχρωματικες μέθοδοι ανίχνευσης
αντιγόνου (νουκλεοπρωτείνης) σε 30 min Aνιχνεύουν και διαχωρίζουν Α και Β Ανιχνεύουν ιούς γρίπης (Α και Β) αλλά δεν
τους διαχωρίζουν Ανιχνεύουν μόνο Α Δεν διαχωρίζουν υπότυπους (Η1Ν1 – Η3Ν2)
Μεγαλύτερη ευαισθησία σε παιδιά από ότι σε ενήλικες
![Page 39: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/39.jpg)
Evaluation of Rapid Influenza Diagnostic Tests for Detection of Novel Influenza A (H1N1) Virus — United States, MMWR, 2009
![Page 40: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/40.jpg)
![Page 41: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/41.jpg)
Αρνητικό για γρίπη Α ή Β
Θετικό για γρίπη Α
Πιθανοί ιοί:
Νέας Γρίπη Η1Ν1v,
Εποχιακής Η1Ν1 ή Η3Ν2.
Θεραπεία αν απαιτείται
Έλεγχος ανάγκης για:
•Επιβεβαιωτικές δοκιμές
•Αντιβιοτική θεραπεία
Δεν μπορεί να αποκλεισθεί γρίπη (ευαισθησία 40-70%)
Θεραπεία σε όσους ενδείκνυται, παρά το αρνητικό αποτέλεσμα
Το αρνητικό αποτέλεσμα να μη χρησιμοποιείται για να στέλνονται συμπτωματικά παιδιά στο σχολείο, ή για αποκλεισμό παρουσίας γρίπης σε ιδρύματα
Έλεγχος ανάγκης για: •Επιβεβαιωτικές δοκιμές•Αντιβιοτική θεραπεία
WHO, 10 Aug 2009
![Page 42: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/42.jpg)
![Page 43: Ιός της Νέας Γρίπης Η1Ν1 Ιολογία - Εργαστηριακή διάγνωση](https://reader033.fdocument.pub/reader033/viewer/2022052510/56814029550346895dab8994/html5/thumbnails/43.jpg)