Post on 21-Dec-2021
Jeudi 24 Juin 2021
Webinaire LOINC
laquo Emettre et recevoir des comptes rendus de biologie en LOINC raquo
Animateur
Sylvie CORMONT ndash APHP amp SFIL
Bruno GAUTHIER ndash SFIL amp Inovie
Bonnes pratiques pour suivre ce webinaire
2
Les slides seront envoyeacutees par mail aux participants
Communiquer via le tchat vos adresses mail et coordonneacutees pour pouvoir ecirctre
recontacteacutes
Couper votre micro pendant les interventions
Utilisez la fonction laquo lever la main raquo si jamais vous voulez prendre la parole
Le tchat est ouvert pendant la session pour dialoguer si besoin
Introduction
Vous ecirctes hellip
Biologiste Informaticien Acteur reacutegional Autre
Vous avez des attentes particuliegraveres pour ce webinairehellip
Nrsquoheacutesitez pas agrave les partager dans le chat afin que lrsquoon srsquoassure drsquoy reacutepondre
Eacutediteur de logiciel
exploitant le CR-Bio
4
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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20rsquo
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5rsquo
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Dans quel contexte Le deacutecret sur la biologie ndeg2016-46 du 26 janvier 2016
5
Deacutecret
2016-
46
Le CR-BIO doit ecirctre structureacute
conformeacutement au reacutefeacuterentiel
drsquointeropeacuterabiliteacute deacutenommeacute ldquovolet
compte rendu drsquoexamens de biologie
meacutedicalerdquo Cela srsquoapplique aux
examens biologiques pour un patient
aux examens pour un patient associeacute agrave
un eacutechantillon biologique non humain
La Terminologie LOINC
Le compte rendu des examens
de biologie meacutedicale est
communiqueacute au prescripteur
par voie eacutelectronique leacutechange
se fait en utilisant une
messagerie eacutelectronique
seacutecuriseacutee de santeacute
Pour en savoir plus acceacutedez
au module deacutedieacute
httpsesante-
formationfrcourseindexphpcat
egoryid=9
Le compte rendu des
examens de biologie meacutedicale
est inseacutereacute dans le dossier
meacutedical partageacute degraves lors
qursquoil contribue agrave la
coordination des soins
Lrsquoalimentation du DMP
Lrsquoeacutechange via une
messagerie seacutecuriseacutee
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Dans quel contexte Le flux drsquoeacutechange du compte rendu drsquoexamen de biologie ndash CR-Bio
Prescripteur de villeLGC
Laboratoire de ville
Leacutegende
Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre en structureacute
(CDAR2 N3) et en MSSanteacute
Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre structureacutes en HL7
ou CDA
Etablissement de Santeacute
SIL du
laboratoireSIH
Autre laboratoire hospitalier
SIL
SIL
Autre laboratoire de ville
SIL
Prescripteur
7
Le Seacutegur Numeacuterique srsquoinscrit dans le cadre de reacutefeacuterence de la strateacutegie e-santeacute avec lrsquoobjectif drsquoagir
comme un acceacuteleacuterateur
En particulier sur la biologie meacutedicale 3 cas drsquousage ont eacuteteacute
prioriseacutes
Lrsquoenvoi systeacutematique des
comptes-rendus structureacutes
(+PDF) de biologie meacutedicale aux meacutedecins correspondants et aux
patients par MSSanteacute
Lrsquoalimentation systeacutematique du
dossier meacutedical partageacute avec
ces mecircmes comptes-rendus
La consultation possible du
dossier meacutedical partageacute par le biologiste meacutedical pour
parcourir un historique de santeacute
2
1
3
Le programme Seacutegur numeacuterique permet drsquoacceacuteleacuterer la feuille de route du virage numeacuterique en santeacute
Dans quel contexte Le Seacutegur du Numeacuterique
8
2 Mds euro drsquoinvestissements seront ainsi consacreacutes
pour les toutes prochaines anneacuteeshellip
Source Seacutegur de la Santeacute ndash Dossier de Presse Juillet 2020
Piliers et 33 mesures
composent le Seacutegur de la
santeacute4
Mds euro drsquoinvestissements
nouveaux preacutevus par la
mesure ndeg919
Mds euro drsquoinvestissements
destineacutes au rattrapage du
retard sur le numeacuterique
en santeacute
2
Source de valeur pour lrsquoacceacuteleacuteration du deacuteploiement
du numeacuterique en santeacute
2Action lsquomise en place drsquoun
financement agrave lrsquousage du
numeacuteriquersquo
1Action lsquofinancement de
lrsquoeacutequipement numeacuteriquersquo
et eacutevolution des services
socles
9
Calendrier preacutevisionnel de lrsquoaction financement de lrsquoeacutequipement
numeacuterique
10
Financement de lrsquoeacutequipement numeacuterique vague 1
specifications adopteacutees
DSL lsquoSGLrsquo (incluant exigences variables selon qursquoil srsquoagit drsquoun SGL en ville ou en
eacutetablissement et inteacutegrant la possibiliteacute de candidater avec un lsquoconnecteurrsquo tiers)
DSL lsquoTranscodage LOINCrsquo
Logiciels concerneacutes
par les dossiers de
speacutecifications (DSL)
CR Bio CI-SIS (CDA R2 N3)
ET pour les cas deacutegradeacutes
PDF lsquonursquo (pour MSS) et en CDA R2 N1
(pour le DMP)
Donneacutees exporteacutees
(DMP et MSS)
- Consultation du DMP (palier 1) avec lrsquoappel contextuel (contexte INS patient) vers le Web PS DMP (qui inteacutegrera Pro Santeacute Connect ndash PSC
Web comme modaliteacute drsquoidentification eacutelectronique au S1 2022)
- Inteacutegration de PSC pour tous les SGL
- Identiteacute Nationale de Santeacute (INS) avec reacutefeacuterentiel INS guide dimpleacutementation INS et reacutefeacuterentiel national didentitovigilance (RNIV)
Pour les SGL en ES gestion de lrsquoidentiteacute entrante depuis le reacutefeacuterentiel des identiteacutes
Pour les SGL en ville (+ dans certains cas activiteacute externe agrave lrsquohocircpital) appel du teacuteleacuteservice INSi selon le guide drsquointeacutegration via CPx et CL-ORG
- [Systeacutematiquement par le SGL] Geacuteneacuteration (+ visualisation de controcircle) du CR-Bio conforme au format CI-SIS (CDA R2 N3) (incluant INS
codification LOINC des analyses avec des veacuterifications type Gazel lecture du XML et quelques exigences particuliegraveres (gestion commentaires
etc) ainsi qursquoen PDF (avec Datamatrix INS)
- Reacuteception et visualisation du CDA R2 N3 + PDF en provenant drsquoun laboratoire sous-traitant avec recommandation de savoir geacuterer une
fusion (insertion des analyses structureacutees dans le CDA R2 N3 du LBM1) ou agrave minima de savoir inseacuterer lrsquoimage le pdf du sous-traitant
- [SGL ou EAI etou DPI] Envoi systeacutematique et automatiseacute au DMP (version patient + professionnel en CDA R2 N3 + PDF en CDA R2 N1) et
par MSS aux correspondants (version professionnel en CDA R2 N3 + PDF nu) et aux patients (version patient en PDF nu et en CDA R2 N3)
degraves la validation biologique avec possibiliteacute de modification retrait ulteacuterieur
- Pour le contexte hospitalier la capaciteacute de transmettre au DPI les CDA R2 N3 via un flux normeacute HL7 ORU (avec donneacutees de masquage)
- Capaciteacute ergonomique dexport reacuteimport des analyses locales pour proceacuteder au transcodage LOINC
- Veacuterification systeacutematique au RPPS (annuaire santeacute) avec une gestion de multiples correspondants de santeacute
Speacutecifications
reacutefeacuterentiels
Seacutejour hospitalier
Tous les CR Bio (voir section
suivante)
CR Bio Patient Pro
DMP X X
MSS
patientX
MSS
proX
httpsinteropesantegouvfrEVSClient
detailedResultseamtype=CDAampoid=
1361411255911363114810
Publieacute Mi-juin
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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20rsquo
10rsquo
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Le CDA R2
Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document
Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)
Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante
Deacutefinitions
LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un
codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
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La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo
Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale
Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique
Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)
Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs
Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays
Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal
2 rue du pontParis 75001
Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal
De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
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1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM
Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par
une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du
CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)
bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)
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Format Hprim structureacute (V3)
Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur
Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame
Veacutehicule peu drsquoinformations
- En-tecircte 12 lignes
- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement
- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo
Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes
- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis
- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
16
16
Respect des obligations reacuteglementaires
CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3
Obligations Hprim CDAR2 N3
nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO
OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK
La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK
CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99
CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
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Respect des obligations normatives
Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS
REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX
Une meilleure identification du patient
et des professionnels de santeacute dans le
compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des
reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de
Santeacute INShellip)
TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE
Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des
groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie
baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne
contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par
groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)
TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE
Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute
drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement
lrsquoauteur
FORMAT STANDARD INTERNATIONAL
Un format de compte rendu baseacute sur le standard international
Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30
nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS
Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un
professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats
eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale
Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la
visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse
preacutecise
Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP
MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS
Beacuteneacutefices pour les biologistes
Beacuteneacutefices pour les prescripteurs
Beacuteneacutefices pour les patients
CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale
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Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
19
20
Programme de la formation
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
10rsquo
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20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
Crsquoest quoi
LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques
Ccedila sert agrave quoi
Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux
Comment
Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute
Qui doit inteacutegrer cette terminologie
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM
codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21
22
Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute
Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)
Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)
Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H
Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses
Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)
Technique (type of method)
Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee
Exemple
53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL
AnalyteCode LOINC Grandeur
Temporaliteacute
Milieu Eacutechelle Technique
5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
23
Ensembles drsquoobservations regroupeacutees
par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip
par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA
par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
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2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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26
En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
29
bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
39
40
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
42
POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
45
Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
46
Merci de votre participation
Bonnes pratiques pour suivre ce webinaire
2
Les slides seront envoyeacutees par mail aux participants
Communiquer via le tchat vos adresses mail et coordonneacutees pour pouvoir ecirctre
recontacteacutes
Couper votre micro pendant les interventions
Utilisez la fonction laquo lever la main raquo si jamais vous voulez prendre la parole
Le tchat est ouvert pendant la session pour dialoguer si besoin
Introduction
Vous ecirctes hellip
Biologiste Informaticien Acteur reacutegional Autre
Vous avez des attentes particuliegraveres pour ce webinairehellip
Nrsquoheacutesitez pas agrave les partager dans le chat afin que lrsquoon srsquoassure drsquoy reacutepondre
Eacutediteur de logiciel
exploitant le CR-Bio
4
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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10rsquo
5rsquo
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Dans quel contexte Le deacutecret sur la biologie ndeg2016-46 du 26 janvier 2016
5
Deacutecret
2016-
46
Le CR-BIO doit ecirctre structureacute
conformeacutement au reacutefeacuterentiel
drsquointeropeacuterabiliteacute deacutenommeacute ldquovolet
compte rendu drsquoexamens de biologie
meacutedicalerdquo Cela srsquoapplique aux
examens biologiques pour un patient
aux examens pour un patient associeacute agrave
un eacutechantillon biologique non humain
La Terminologie LOINC
Le compte rendu des examens
de biologie meacutedicale est
communiqueacute au prescripteur
par voie eacutelectronique leacutechange
se fait en utilisant une
messagerie eacutelectronique
seacutecuriseacutee de santeacute
Pour en savoir plus acceacutedez
au module deacutedieacute
httpsesante-
formationfrcourseindexphpcat
egoryid=9
Le compte rendu des
examens de biologie meacutedicale
est inseacutereacute dans le dossier
meacutedical partageacute degraves lors
qursquoil contribue agrave la
coordination des soins
Lrsquoalimentation du DMP
Lrsquoeacutechange via une
messagerie seacutecuriseacutee
6
Dans quel contexte Le flux drsquoeacutechange du compte rendu drsquoexamen de biologie ndash CR-Bio
Prescripteur de villeLGC
Laboratoire de ville
Leacutegende
Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre en structureacute
(CDAR2 N3) et en MSSanteacute
Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre structureacutes en HL7
ou CDA
Etablissement de Santeacute
SIL du
laboratoireSIH
Autre laboratoire hospitalier
SIL
SIL
Autre laboratoire de ville
SIL
Prescripteur
7
Le Seacutegur Numeacuterique srsquoinscrit dans le cadre de reacutefeacuterence de la strateacutegie e-santeacute avec lrsquoobjectif drsquoagir
comme un acceacuteleacuterateur
En particulier sur la biologie meacutedicale 3 cas drsquousage ont eacuteteacute
prioriseacutes
Lrsquoenvoi systeacutematique des
comptes-rendus structureacutes
(+PDF) de biologie meacutedicale aux meacutedecins correspondants et aux
patients par MSSanteacute
Lrsquoalimentation systeacutematique du
dossier meacutedical partageacute avec
ces mecircmes comptes-rendus
La consultation possible du
dossier meacutedical partageacute par le biologiste meacutedical pour
parcourir un historique de santeacute
2
1
3
Le programme Seacutegur numeacuterique permet drsquoacceacuteleacuterer la feuille de route du virage numeacuterique en santeacute
Dans quel contexte Le Seacutegur du Numeacuterique
8
2 Mds euro drsquoinvestissements seront ainsi consacreacutes
pour les toutes prochaines anneacuteeshellip
Source Seacutegur de la Santeacute ndash Dossier de Presse Juillet 2020
Piliers et 33 mesures
composent le Seacutegur de la
santeacute4
Mds euro drsquoinvestissements
nouveaux preacutevus par la
mesure ndeg919
Mds euro drsquoinvestissements
destineacutes au rattrapage du
retard sur le numeacuterique
en santeacute
2
Source de valeur pour lrsquoacceacuteleacuteration du deacuteploiement
du numeacuterique en santeacute
2Action lsquomise en place drsquoun
financement agrave lrsquousage du
numeacuteriquersquo
1Action lsquofinancement de
lrsquoeacutequipement numeacuteriquersquo
et eacutevolution des services
socles
9
Calendrier preacutevisionnel de lrsquoaction financement de lrsquoeacutequipement
numeacuterique
10
Financement de lrsquoeacutequipement numeacuterique vague 1
specifications adopteacutees
DSL lsquoSGLrsquo (incluant exigences variables selon qursquoil srsquoagit drsquoun SGL en ville ou en
eacutetablissement et inteacutegrant la possibiliteacute de candidater avec un lsquoconnecteurrsquo tiers)
DSL lsquoTranscodage LOINCrsquo
Logiciels concerneacutes
par les dossiers de
speacutecifications (DSL)
CR Bio CI-SIS (CDA R2 N3)
ET pour les cas deacutegradeacutes
PDF lsquonursquo (pour MSS) et en CDA R2 N1
(pour le DMP)
Donneacutees exporteacutees
(DMP et MSS)
- Consultation du DMP (palier 1) avec lrsquoappel contextuel (contexte INS patient) vers le Web PS DMP (qui inteacutegrera Pro Santeacute Connect ndash PSC
Web comme modaliteacute drsquoidentification eacutelectronique au S1 2022)
- Inteacutegration de PSC pour tous les SGL
- Identiteacute Nationale de Santeacute (INS) avec reacutefeacuterentiel INS guide dimpleacutementation INS et reacutefeacuterentiel national didentitovigilance (RNIV)
Pour les SGL en ES gestion de lrsquoidentiteacute entrante depuis le reacutefeacuterentiel des identiteacutes
Pour les SGL en ville (+ dans certains cas activiteacute externe agrave lrsquohocircpital) appel du teacuteleacuteservice INSi selon le guide drsquointeacutegration via CPx et CL-ORG
- [Systeacutematiquement par le SGL] Geacuteneacuteration (+ visualisation de controcircle) du CR-Bio conforme au format CI-SIS (CDA R2 N3) (incluant INS
codification LOINC des analyses avec des veacuterifications type Gazel lecture du XML et quelques exigences particuliegraveres (gestion commentaires
etc) ainsi qursquoen PDF (avec Datamatrix INS)
- Reacuteception et visualisation du CDA R2 N3 + PDF en provenant drsquoun laboratoire sous-traitant avec recommandation de savoir geacuterer une
fusion (insertion des analyses structureacutees dans le CDA R2 N3 du LBM1) ou agrave minima de savoir inseacuterer lrsquoimage le pdf du sous-traitant
- [SGL ou EAI etou DPI] Envoi systeacutematique et automatiseacute au DMP (version patient + professionnel en CDA R2 N3 + PDF en CDA R2 N1) et
par MSS aux correspondants (version professionnel en CDA R2 N3 + PDF nu) et aux patients (version patient en PDF nu et en CDA R2 N3)
degraves la validation biologique avec possibiliteacute de modification retrait ulteacuterieur
- Pour le contexte hospitalier la capaciteacute de transmettre au DPI les CDA R2 N3 via un flux normeacute HL7 ORU (avec donneacutees de masquage)
- Capaciteacute ergonomique dexport reacuteimport des analyses locales pour proceacuteder au transcodage LOINC
- Veacuterification systeacutematique au RPPS (annuaire santeacute) avec une gestion de multiples correspondants de santeacute
Speacutecifications
reacutefeacuterentiels
Seacutejour hospitalier
Tous les CR Bio (voir section
suivante)
CR Bio Patient Pro
DMP X X
MSS
patientX
MSS
proX
httpsinteropesantegouvfrEVSClient
detailedResultseamtype=CDAampoid=
1361411255911363114810
Publieacute Mi-juin
11
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
12
Le CDA R2
Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document
Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)
Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante
Deacutefinitions
LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un
codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
13
La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo
Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale
Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique
Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)
Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs
Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays
Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal
2 rue du pontParis 75001
Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal
De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
14
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM
Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par
une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du
CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)
bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)
15
Format Hprim structureacute (V3)
Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur
Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame
Veacutehicule peu drsquoinformations
- En-tecircte 12 lignes
- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement
- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo
Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes
- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis
- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
16
16
Respect des obligations reacuteglementaires
CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3
Obligations Hprim CDAR2 N3
nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO
OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK
La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK
CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99
CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
17
Respect des obligations normatives
Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS
REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX
Une meilleure identification du patient
et des professionnels de santeacute dans le
compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des
reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de
Santeacute INShellip)
TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE
Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des
groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie
baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne
contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par
groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)
TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE
Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute
drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement
lrsquoauteur
FORMAT STANDARD INTERNATIONAL
Un format de compte rendu baseacute sur le standard international
Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30
nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS
Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un
professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats
eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale
Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la
visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse
preacutecise
Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP
MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS
Beacuteneacutefices pour les biologistes
Beacuteneacutefices pour les prescripteurs
Beacuteneacutefices pour les patients
CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale
18
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
19
20
Programme de la formation
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
Crsquoest quoi
LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques
Ccedila sert agrave quoi
Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux
Comment
Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute
Qui doit inteacutegrer cette terminologie
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM
codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21
22
Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute
Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)
Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)
Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H
Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses
Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)
Technique (type of method)
Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee
Exemple
53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL
AnalyteCode LOINC Grandeur
Temporaliteacute
Milieu Eacutechelle Technique
5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
23
Ensembles drsquoobservations regroupeacutees
par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip
par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA
par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
24
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
25
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
26
En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
29
bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
32
33
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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15rsquo
34
La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
39
40
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
42
POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
45
Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
46
Merci de votre participation
Introduction
Vous ecirctes hellip
Biologiste Informaticien Acteur reacutegional Autre
Vous avez des attentes particuliegraveres pour ce webinairehellip
Nrsquoheacutesitez pas agrave les partager dans le chat afin que lrsquoon srsquoassure drsquoy reacutepondre
Eacutediteur de logiciel
exploitant le CR-Bio
4
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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Dans quel contexte Le deacutecret sur la biologie ndeg2016-46 du 26 janvier 2016
5
Deacutecret
2016-
46
Le CR-BIO doit ecirctre structureacute
conformeacutement au reacutefeacuterentiel
drsquointeropeacuterabiliteacute deacutenommeacute ldquovolet
compte rendu drsquoexamens de biologie
meacutedicalerdquo Cela srsquoapplique aux
examens biologiques pour un patient
aux examens pour un patient associeacute agrave
un eacutechantillon biologique non humain
La Terminologie LOINC
Le compte rendu des examens
de biologie meacutedicale est
communiqueacute au prescripteur
par voie eacutelectronique leacutechange
se fait en utilisant une
messagerie eacutelectronique
seacutecuriseacutee de santeacute
Pour en savoir plus acceacutedez
au module deacutedieacute
httpsesante-
formationfrcourseindexphpcat
egoryid=9
Le compte rendu des
examens de biologie meacutedicale
est inseacutereacute dans le dossier
meacutedical partageacute degraves lors
qursquoil contribue agrave la
coordination des soins
Lrsquoalimentation du DMP
Lrsquoeacutechange via une
messagerie seacutecuriseacutee
6
Dans quel contexte Le flux drsquoeacutechange du compte rendu drsquoexamen de biologie ndash CR-Bio
Prescripteur de villeLGC
Laboratoire de ville
Leacutegende
Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre en structureacute
(CDAR2 N3) et en MSSanteacute
Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre structureacutes en HL7
ou CDA
Etablissement de Santeacute
SIL du
laboratoireSIH
Autre laboratoire hospitalier
SIL
SIL
Autre laboratoire de ville
SIL
Prescripteur
7
Le Seacutegur Numeacuterique srsquoinscrit dans le cadre de reacutefeacuterence de la strateacutegie e-santeacute avec lrsquoobjectif drsquoagir
comme un acceacuteleacuterateur
En particulier sur la biologie meacutedicale 3 cas drsquousage ont eacuteteacute
prioriseacutes
Lrsquoenvoi systeacutematique des
comptes-rendus structureacutes
(+PDF) de biologie meacutedicale aux meacutedecins correspondants et aux
patients par MSSanteacute
Lrsquoalimentation systeacutematique du
dossier meacutedical partageacute avec
ces mecircmes comptes-rendus
La consultation possible du
dossier meacutedical partageacute par le biologiste meacutedical pour
parcourir un historique de santeacute
2
1
3
Le programme Seacutegur numeacuterique permet drsquoacceacuteleacuterer la feuille de route du virage numeacuterique en santeacute
Dans quel contexte Le Seacutegur du Numeacuterique
8
2 Mds euro drsquoinvestissements seront ainsi consacreacutes
pour les toutes prochaines anneacuteeshellip
Source Seacutegur de la Santeacute ndash Dossier de Presse Juillet 2020
Piliers et 33 mesures
composent le Seacutegur de la
santeacute4
Mds euro drsquoinvestissements
nouveaux preacutevus par la
mesure ndeg919
Mds euro drsquoinvestissements
destineacutes au rattrapage du
retard sur le numeacuterique
en santeacute
2
Source de valeur pour lrsquoacceacuteleacuteration du deacuteploiement
du numeacuterique en santeacute
2Action lsquomise en place drsquoun
financement agrave lrsquousage du
numeacuteriquersquo
1Action lsquofinancement de
lrsquoeacutequipement numeacuteriquersquo
et eacutevolution des services
socles
9
Calendrier preacutevisionnel de lrsquoaction financement de lrsquoeacutequipement
numeacuterique
10
Financement de lrsquoeacutequipement numeacuterique vague 1
specifications adopteacutees
DSL lsquoSGLrsquo (incluant exigences variables selon qursquoil srsquoagit drsquoun SGL en ville ou en
eacutetablissement et inteacutegrant la possibiliteacute de candidater avec un lsquoconnecteurrsquo tiers)
DSL lsquoTranscodage LOINCrsquo
Logiciels concerneacutes
par les dossiers de
speacutecifications (DSL)
CR Bio CI-SIS (CDA R2 N3)
ET pour les cas deacutegradeacutes
PDF lsquonursquo (pour MSS) et en CDA R2 N1
(pour le DMP)
Donneacutees exporteacutees
(DMP et MSS)
- Consultation du DMP (palier 1) avec lrsquoappel contextuel (contexte INS patient) vers le Web PS DMP (qui inteacutegrera Pro Santeacute Connect ndash PSC
Web comme modaliteacute drsquoidentification eacutelectronique au S1 2022)
- Inteacutegration de PSC pour tous les SGL
- Identiteacute Nationale de Santeacute (INS) avec reacutefeacuterentiel INS guide dimpleacutementation INS et reacutefeacuterentiel national didentitovigilance (RNIV)
Pour les SGL en ES gestion de lrsquoidentiteacute entrante depuis le reacutefeacuterentiel des identiteacutes
Pour les SGL en ville (+ dans certains cas activiteacute externe agrave lrsquohocircpital) appel du teacuteleacuteservice INSi selon le guide drsquointeacutegration via CPx et CL-ORG
- [Systeacutematiquement par le SGL] Geacuteneacuteration (+ visualisation de controcircle) du CR-Bio conforme au format CI-SIS (CDA R2 N3) (incluant INS
codification LOINC des analyses avec des veacuterifications type Gazel lecture du XML et quelques exigences particuliegraveres (gestion commentaires
etc) ainsi qursquoen PDF (avec Datamatrix INS)
- Reacuteception et visualisation du CDA R2 N3 + PDF en provenant drsquoun laboratoire sous-traitant avec recommandation de savoir geacuterer une
fusion (insertion des analyses structureacutees dans le CDA R2 N3 du LBM1) ou agrave minima de savoir inseacuterer lrsquoimage le pdf du sous-traitant
- [SGL ou EAI etou DPI] Envoi systeacutematique et automatiseacute au DMP (version patient + professionnel en CDA R2 N3 + PDF en CDA R2 N1) et
par MSS aux correspondants (version professionnel en CDA R2 N3 + PDF nu) et aux patients (version patient en PDF nu et en CDA R2 N3)
degraves la validation biologique avec possibiliteacute de modification retrait ulteacuterieur
- Pour le contexte hospitalier la capaciteacute de transmettre au DPI les CDA R2 N3 via un flux normeacute HL7 ORU (avec donneacutees de masquage)
- Capaciteacute ergonomique dexport reacuteimport des analyses locales pour proceacuteder au transcodage LOINC
- Veacuterification systeacutematique au RPPS (annuaire santeacute) avec une gestion de multiples correspondants de santeacute
Speacutecifications
reacutefeacuterentiels
Seacutejour hospitalier
Tous les CR Bio (voir section
suivante)
CR Bio Patient Pro
DMP X X
MSS
patientX
MSS
proX
httpsinteropesantegouvfrEVSClient
detailedResultseamtype=CDAampoid=
1361411255911363114810
Publieacute Mi-juin
11
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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15rsquo
20rsquo
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12
Le CDA R2
Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document
Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)
Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante
Deacutefinitions
LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un
codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
13
La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo
Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale
Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique
Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)
Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs
Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays
Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal
2 rue du pontParis 75001
Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal
De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
14
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM
Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par
une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du
CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)
bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)
15
Format Hprim structureacute (V3)
Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur
Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame
Veacutehicule peu drsquoinformations
- En-tecircte 12 lignes
- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement
- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo
Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes
- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis
- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
16
16
Respect des obligations reacuteglementaires
CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3
Obligations Hprim CDAR2 N3
nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO
OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK
La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK
CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99
CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
17
Respect des obligations normatives
Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS
REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX
Une meilleure identification du patient
et des professionnels de santeacute dans le
compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des
reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de
Santeacute INShellip)
TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE
Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des
groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie
baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne
contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par
groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)
TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE
Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute
drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement
lrsquoauteur
FORMAT STANDARD INTERNATIONAL
Un format de compte rendu baseacute sur le standard international
Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30
nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS
Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un
professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats
eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale
Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la
visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse
preacutecise
Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP
MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS
Beacuteneacutefices pour les biologistes
Beacuteneacutefices pour les prescripteurs
Beacuteneacutefices pour les patients
CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale
18
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
19
20
Programme de la formation
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
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10rsquo
5rsquo
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2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
Crsquoest quoi
LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques
Ccedila sert agrave quoi
Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux
Comment
Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute
Qui doit inteacutegrer cette terminologie
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM
codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21
22
Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute
Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)
Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)
Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H
Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses
Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)
Technique (type of method)
Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee
Exemple
53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL
AnalyteCode LOINC Grandeur
Temporaliteacute
Milieu Eacutechelle Technique
5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
23
Ensembles drsquoobservations regroupeacutees
par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip
par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA
par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
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2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
25
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
29
bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
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Posez-nous vos questions
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33
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
39
40
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
42
POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
45
Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
46
Merci de votre participation
4
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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Dans quel contexte Le deacutecret sur la biologie ndeg2016-46 du 26 janvier 2016
5
Deacutecret
2016-
46
Le CR-BIO doit ecirctre structureacute
conformeacutement au reacutefeacuterentiel
drsquointeropeacuterabiliteacute deacutenommeacute ldquovolet
compte rendu drsquoexamens de biologie
meacutedicalerdquo Cela srsquoapplique aux
examens biologiques pour un patient
aux examens pour un patient associeacute agrave
un eacutechantillon biologique non humain
La Terminologie LOINC
Le compte rendu des examens
de biologie meacutedicale est
communiqueacute au prescripteur
par voie eacutelectronique leacutechange
se fait en utilisant une
messagerie eacutelectronique
seacutecuriseacutee de santeacute
Pour en savoir plus acceacutedez
au module deacutedieacute
httpsesante-
formationfrcourseindexphpcat
egoryid=9
Le compte rendu des
examens de biologie meacutedicale
est inseacutereacute dans le dossier
meacutedical partageacute degraves lors
qursquoil contribue agrave la
coordination des soins
Lrsquoalimentation du DMP
Lrsquoeacutechange via une
messagerie seacutecuriseacutee
6
Dans quel contexte Le flux drsquoeacutechange du compte rendu drsquoexamen de biologie ndash CR-Bio
Prescripteur de villeLGC
Laboratoire de ville
Leacutegende
Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre en structureacute
(CDAR2 N3) et en MSSanteacute
Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre structureacutes en HL7
ou CDA
Etablissement de Santeacute
SIL du
laboratoireSIH
Autre laboratoire hospitalier
SIL
SIL
Autre laboratoire de ville
SIL
Prescripteur
7
Le Seacutegur Numeacuterique srsquoinscrit dans le cadre de reacutefeacuterence de la strateacutegie e-santeacute avec lrsquoobjectif drsquoagir
comme un acceacuteleacuterateur
En particulier sur la biologie meacutedicale 3 cas drsquousage ont eacuteteacute
prioriseacutes
Lrsquoenvoi systeacutematique des
comptes-rendus structureacutes
(+PDF) de biologie meacutedicale aux meacutedecins correspondants et aux
patients par MSSanteacute
Lrsquoalimentation systeacutematique du
dossier meacutedical partageacute avec
ces mecircmes comptes-rendus
La consultation possible du
dossier meacutedical partageacute par le biologiste meacutedical pour
parcourir un historique de santeacute
2
1
3
Le programme Seacutegur numeacuterique permet drsquoacceacuteleacuterer la feuille de route du virage numeacuterique en santeacute
Dans quel contexte Le Seacutegur du Numeacuterique
8
2 Mds euro drsquoinvestissements seront ainsi consacreacutes
pour les toutes prochaines anneacuteeshellip
Source Seacutegur de la Santeacute ndash Dossier de Presse Juillet 2020
Piliers et 33 mesures
composent le Seacutegur de la
santeacute4
Mds euro drsquoinvestissements
nouveaux preacutevus par la
mesure ndeg919
Mds euro drsquoinvestissements
destineacutes au rattrapage du
retard sur le numeacuterique
en santeacute
2
Source de valeur pour lrsquoacceacuteleacuteration du deacuteploiement
du numeacuterique en santeacute
2Action lsquomise en place drsquoun
financement agrave lrsquousage du
numeacuteriquersquo
1Action lsquofinancement de
lrsquoeacutequipement numeacuteriquersquo
et eacutevolution des services
socles
9
Calendrier preacutevisionnel de lrsquoaction financement de lrsquoeacutequipement
numeacuterique
10
Financement de lrsquoeacutequipement numeacuterique vague 1
specifications adopteacutees
DSL lsquoSGLrsquo (incluant exigences variables selon qursquoil srsquoagit drsquoun SGL en ville ou en
eacutetablissement et inteacutegrant la possibiliteacute de candidater avec un lsquoconnecteurrsquo tiers)
DSL lsquoTranscodage LOINCrsquo
Logiciels concerneacutes
par les dossiers de
speacutecifications (DSL)
CR Bio CI-SIS (CDA R2 N3)
ET pour les cas deacutegradeacutes
PDF lsquonursquo (pour MSS) et en CDA R2 N1
(pour le DMP)
Donneacutees exporteacutees
(DMP et MSS)
- Consultation du DMP (palier 1) avec lrsquoappel contextuel (contexte INS patient) vers le Web PS DMP (qui inteacutegrera Pro Santeacute Connect ndash PSC
Web comme modaliteacute drsquoidentification eacutelectronique au S1 2022)
- Inteacutegration de PSC pour tous les SGL
- Identiteacute Nationale de Santeacute (INS) avec reacutefeacuterentiel INS guide dimpleacutementation INS et reacutefeacuterentiel national didentitovigilance (RNIV)
Pour les SGL en ES gestion de lrsquoidentiteacute entrante depuis le reacutefeacuterentiel des identiteacutes
Pour les SGL en ville (+ dans certains cas activiteacute externe agrave lrsquohocircpital) appel du teacuteleacuteservice INSi selon le guide drsquointeacutegration via CPx et CL-ORG
- [Systeacutematiquement par le SGL] Geacuteneacuteration (+ visualisation de controcircle) du CR-Bio conforme au format CI-SIS (CDA R2 N3) (incluant INS
codification LOINC des analyses avec des veacuterifications type Gazel lecture du XML et quelques exigences particuliegraveres (gestion commentaires
etc) ainsi qursquoen PDF (avec Datamatrix INS)
- Reacuteception et visualisation du CDA R2 N3 + PDF en provenant drsquoun laboratoire sous-traitant avec recommandation de savoir geacuterer une
fusion (insertion des analyses structureacutees dans le CDA R2 N3 du LBM1) ou agrave minima de savoir inseacuterer lrsquoimage le pdf du sous-traitant
- [SGL ou EAI etou DPI] Envoi systeacutematique et automatiseacute au DMP (version patient + professionnel en CDA R2 N3 + PDF en CDA R2 N1) et
par MSS aux correspondants (version professionnel en CDA R2 N3 + PDF nu) et aux patients (version patient en PDF nu et en CDA R2 N3)
degraves la validation biologique avec possibiliteacute de modification retrait ulteacuterieur
- Pour le contexte hospitalier la capaciteacute de transmettre au DPI les CDA R2 N3 via un flux normeacute HL7 ORU (avec donneacutees de masquage)
- Capaciteacute ergonomique dexport reacuteimport des analyses locales pour proceacuteder au transcodage LOINC
- Veacuterification systeacutematique au RPPS (annuaire santeacute) avec une gestion de multiples correspondants de santeacute
Speacutecifications
reacutefeacuterentiels
Seacutejour hospitalier
Tous les CR Bio (voir section
suivante)
CR Bio Patient Pro
DMP X X
MSS
patientX
MSS
proX
httpsinteropesantegouvfrEVSClient
detailedResultseamtype=CDAampoid=
1361411255911363114810
Publieacute Mi-juin
11
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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Le CDA R2
Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document
Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)
Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante
Deacutefinitions
LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un
codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
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La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo
Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale
Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique
Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)
Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs
Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays
Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal
2 rue du pontParis 75001
Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal
De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
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1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM
Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par
une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du
CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)
bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)
15
Format Hprim structureacute (V3)
Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur
Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame
Veacutehicule peu drsquoinformations
- En-tecircte 12 lignes
- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement
- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo
Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes
- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis
- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
16
16
Respect des obligations reacuteglementaires
CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3
Obligations Hprim CDAR2 N3
nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO
OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK
La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK
CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99
CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
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Respect des obligations normatives
Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS
REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX
Une meilleure identification du patient
et des professionnels de santeacute dans le
compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des
reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de
Santeacute INShellip)
TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE
Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des
groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie
baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne
contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par
groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)
TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE
Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute
drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement
lrsquoauteur
FORMAT STANDARD INTERNATIONAL
Un format de compte rendu baseacute sur le standard international
Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30
nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS
Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un
professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats
eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale
Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la
visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse
preacutecise
Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP
MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS
Beacuteneacutefices pour les biologistes
Beacuteneacutefices pour les prescripteurs
Beacuteneacutefices pour les patients
CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale
18
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
19
20
Programme de la formation
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
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2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
Crsquoest quoi
LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques
Ccedila sert agrave quoi
Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux
Comment
Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute
Qui doit inteacutegrer cette terminologie
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM
codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21
22
Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute
Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)
Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)
Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H
Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses
Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)
Technique (type of method)
Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee
Exemple
53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL
AnalyteCode LOINC Grandeur
Temporaliteacute
Milieu Eacutechelle Technique
5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
23
Ensembles drsquoobservations regroupeacutees
par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip
par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA
par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
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2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
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3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
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bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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SIDEP
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Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
42
POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
45
Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
46
Merci de votre participation
Dans quel contexte Le deacutecret sur la biologie ndeg2016-46 du 26 janvier 2016
5
Deacutecret
2016-
46
Le CR-BIO doit ecirctre structureacute
conformeacutement au reacutefeacuterentiel
drsquointeropeacuterabiliteacute deacutenommeacute ldquovolet
compte rendu drsquoexamens de biologie
meacutedicalerdquo Cela srsquoapplique aux
examens biologiques pour un patient
aux examens pour un patient associeacute agrave
un eacutechantillon biologique non humain
La Terminologie LOINC
Le compte rendu des examens
de biologie meacutedicale est
communiqueacute au prescripteur
par voie eacutelectronique leacutechange
se fait en utilisant une
messagerie eacutelectronique
seacutecuriseacutee de santeacute
Pour en savoir plus acceacutedez
au module deacutedieacute
httpsesante-
formationfrcourseindexphpcat
egoryid=9
Le compte rendu des
examens de biologie meacutedicale
est inseacutereacute dans le dossier
meacutedical partageacute degraves lors
qursquoil contribue agrave la
coordination des soins
Lrsquoalimentation du DMP
Lrsquoeacutechange via une
messagerie seacutecuriseacutee
6
Dans quel contexte Le flux drsquoeacutechange du compte rendu drsquoexamen de biologie ndash CR-Bio
Prescripteur de villeLGC
Laboratoire de ville
Leacutegende
Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre en structureacute
(CDAR2 N3) et en MSSanteacute
Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre structureacutes en HL7
ou CDA
Etablissement de Santeacute
SIL du
laboratoireSIH
Autre laboratoire hospitalier
SIL
SIL
Autre laboratoire de ville
SIL
Prescripteur
7
Le Seacutegur Numeacuterique srsquoinscrit dans le cadre de reacutefeacuterence de la strateacutegie e-santeacute avec lrsquoobjectif drsquoagir
comme un acceacuteleacuterateur
En particulier sur la biologie meacutedicale 3 cas drsquousage ont eacuteteacute
prioriseacutes
Lrsquoenvoi systeacutematique des
comptes-rendus structureacutes
(+PDF) de biologie meacutedicale aux meacutedecins correspondants et aux
patients par MSSanteacute
Lrsquoalimentation systeacutematique du
dossier meacutedical partageacute avec
ces mecircmes comptes-rendus
La consultation possible du
dossier meacutedical partageacute par le biologiste meacutedical pour
parcourir un historique de santeacute
2
1
3
Le programme Seacutegur numeacuterique permet drsquoacceacuteleacuterer la feuille de route du virage numeacuterique en santeacute
Dans quel contexte Le Seacutegur du Numeacuterique
8
2 Mds euro drsquoinvestissements seront ainsi consacreacutes
pour les toutes prochaines anneacuteeshellip
Source Seacutegur de la Santeacute ndash Dossier de Presse Juillet 2020
Piliers et 33 mesures
composent le Seacutegur de la
santeacute4
Mds euro drsquoinvestissements
nouveaux preacutevus par la
mesure ndeg919
Mds euro drsquoinvestissements
destineacutes au rattrapage du
retard sur le numeacuterique
en santeacute
2
Source de valeur pour lrsquoacceacuteleacuteration du deacuteploiement
du numeacuterique en santeacute
2Action lsquomise en place drsquoun
financement agrave lrsquousage du
numeacuteriquersquo
1Action lsquofinancement de
lrsquoeacutequipement numeacuteriquersquo
et eacutevolution des services
socles
9
Calendrier preacutevisionnel de lrsquoaction financement de lrsquoeacutequipement
numeacuterique
10
Financement de lrsquoeacutequipement numeacuterique vague 1
specifications adopteacutees
DSL lsquoSGLrsquo (incluant exigences variables selon qursquoil srsquoagit drsquoun SGL en ville ou en
eacutetablissement et inteacutegrant la possibiliteacute de candidater avec un lsquoconnecteurrsquo tiers)
DSL lsquoTranscodage LOINCrsquo
Logiciels concerneacutes
par les dossiers de
speacutecifications (DSL)
CR Bio CI-SIS (CDA R2 N3)
ET pour les cas deacutegradeacutes
PDF lsquonursquo (pour MSS) et en CDA R2 N1
(pour le DMP)
Donneacutees exporteacutees
(DMP et MSS)
- Consultation du DMP (palier 1) avec lrsquoappel contextuel (contexte INS patient) vers le Web PS DMP (qui inteacutegrera Pro Santeacute Connect ndash PSC
Web comme modaliteacute drsquoidentification eacutelectronique au S1 2022)
- Inteacutegration de PSC pour tous les SGL
- Identiteacute Nationale de Santeacute (INS) avec reacutefeacuterentiel INS guide dimpleacutementation INS et reacutefeacuterentiel national didentitovigilance (RNIV)
Pour les SGL en ES gestion de lrsquoidentiteacute entrante depuis le reacutefeacuterentiel des identiteacutes
Pour les SGL en ville (+ dans certains cas activiteacute externe agrave lrsquohocircpital) appel du teacuteleacuteservice INSi selon le guide drsquointeacutegration via CPx et CL-ORG
- [Systeacutematiquement par le SGL] Geacuteneacuteration (+ visualisation de controcircle) du CR-Bio conforme au format CI-SIS (CDA R2 N3) (incluant INS
codification LOINC des analyses avec des veacuterifications type Gazel lecture du XML et quelques exigences particuliegraveres (gestion commentaires
etc) ainsi qursquoen PDF (avec Datamatrix INS)
- Reacuteception et visualisation du CDA R2 N3 + PDF en provenant drsquoun laboratoire sous-traitant avec recommandation de savoir geacuterer une
fusion (insertion des analyses structureacutees dans le CDA R2 N3 du LBM1) ou agrave minima de savoir inseacuterer lrsquoimage le pdf du sous-traitant
- [SGL ou EAI etou DPI] Envoi systeacutematique et automatiseacute au DMP (version patient + professionnel en CDA R2 N3 + PDF en CDA R2 N1) et
par MSS aux correspondants (version professionnel en CDA R2 N3 + PDF nu) et aux patients (version patient en PDF nu et en CDA R2 N3)
degraves la validation biologique avec possibiliteacute de modification retrait ulteacuterieur
- Pour le contexte hospitalier la capaciteacute de transmettre au DPI les CDA R2 N3 via un flux normeacute HL7 ORU (avec donneacutees de masquage)
- Capaciteacute ergonomique dexport reacuteimport des analyses locales pour proceacuteder au transcodage LOINC
- Veacuterification systeacutematique au RPPS (annuaire santeacute) avec une gestion de multiples correspondants de santeacute
Speacutecifications
reacutefeacuterentiels
Seacutejour hospitalier
Tous les CR Bio (voir section
suivante)
CR Bio Patient Pro
DMP X X
MSS
patientX
MSS
proX
httpsinteropesantegouvfrEVSClient
detailedResultseamtype=CDAampoid=
1361411255911363114810
Publieacute Mi-juin
11
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
12
Le CDA R2
Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document
Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)
Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante
Deacutefinitions
LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un
codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
13
La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo
Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale
Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique
Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)
Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs
Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays
Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal
2 rue du pontParis 75001
Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal
De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
14
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM
Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par
une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du
CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)
bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)
15
Format Hprim structureacute (V3)
Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur
Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame
Veacutehicule peu drsquoinformations
- En-tecircte 12 lignes
- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement
- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo
Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes
- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis
- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
16
16
Respect des obligations reacuteglementaires
CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3
Obligations Hprim CDAR2 N3
nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO
OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK
La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK
CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99
CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
17
Respect des obligations normatives
Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS
REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX
Une meilleure identification du patient
et des professionnels de santeacute dans le
compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des
reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de
Santeacute INShellip)
TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE
Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des
groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie
baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne
contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par
groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)
TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE
Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute
drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement
lrsquoauteur
FORMAT STANDARD INTERNATIONAL
Un format de compte rendu baseacute sur le standard international
Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30
nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS
Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un
professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats
eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale
Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la
visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse
preacutecise
Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP
MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS
Beacuteneacutefices pour les biologistes
Beacuteneacutefices pour les prescripteurs
Beacuteneacutefices pour les patients
CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale
18
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
19
20
Programme de la formation
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
Crsquoest quoi
LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques
Ccedila sert agrave quoi
Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux
Comment
Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute
Qui doit inteacutegrer cette terminologie
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM
codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21
22
Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute
Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)
Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)
Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H
Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses
Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)
Technique (type of method)
Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee
Exemple
53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL
AnalyteCode LOINC Grandeur
Temporaliteacute
Milieu Eacutechelle Technique
5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
23
Ensembles drsquoobservations regroupeacutees
par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip
par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA
par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
24
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
25
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
26
En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
29
bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
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drsquoeacutechange
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
39
40
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
42
POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
45
Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
46
Merci de votre participation
6
Dans quel contexte Le flux drsquoeacutechange du compte rendu drsquoexamen de biologie ndash CR-Bio
Prescripteur de villeLGC
Laboratoire de ville
Leacutegende
Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre en structureacute
(CDAR2 N3) et en MSSanteacute
Echanges des laboratoires qui peuvent ecirctre structureacutes en HL7
ou CDA
Etablissement de Santeacute
SIL du
laboratoireSIH
Autre laboratoire hospitalier
SIL
SIL
Autre laboratoire de ville
SIL
Prescripteur
7
Le Seacutegur Numeacuterique srsquoinscrit dans le cadre de reacutefeacuterence de la strateacutegie e-santeacute avec lrsquoobjectif drsquoagir
comme un acceacuteleacuterateur
En particulier sur la biologie meacutedicale 3 cas drsquousage ont eacuteteacute
prioriseacutes
Lrsquoenvoi systeacutematique des
comptes-rendus structureacutes
(+PDF) de biologie meacutedicale aux meacutedecins correspondants et aux
patients par MSSanteacute
Lrsquoalimentation systeacutematique du
dossier meacutedical partageacute avec
ces mecircmes comptes-rendus
La consultation possible du
dossier meacutedical partageacute par le biologiste meacutedical pour
parcourir un historique de santeacute
2
1
3
Le programme Seacutegur numeacuterique permet drsquoacceacuteleacuterer la feuille de route du virage numeacuterique en santeacute
Dans quel contexte Le Seacutegur du Numeacuterique
8
2 Mds euro drsquoinvestissements seront ainsi consacreacutes
pour les toutes prochaines anneacuteeshellip
Source Seacutegur de la Santeacute ndash Dossier de Presse Juillet 2020
Piliers et 33 mesures
composent le Seacutegur de la
santeacute4
Mds euro drsquoinvestissements
nouveaux preacutevus par la
mesure ndeg919
Mds euro drsquoinvestissements
destineacutes au rattrapage du
retard sur le numeacuterique
en santeacute
2
Source de valeur pour lrsquoacceacuteleacuteration du deacuteploiement
du numeacuterique en santeacute
2Action lsquomise en place drsquoun
financement agrave lrsquousage du
numeacuteriquersquo
1Action lsquofinancement de
lrsquoeacutequipement numeacuteriquersquo
et eacutevolution des services
socles
9
Calendrier preacutevisionnel de lrsquoaction financement de lrsquoeacutequipement
numeacuterique
10
Financement de lrsquoeacutequipement numeacuterique vague 1
specifications adopteacutees
DSL lsquoSGLrsquo (incluant exigences variables selon qursquoil srsquoagit drsquoun SGL en ville ou en
eacutetablissement et inteacutegrant la possibiliteacute de candidater avec un lsquoconnecteurrsquo tiers)
DSL lsquoTranscodage LOINCrsquo
Logiciels concerneacutes
par les dossiers de
speacutecifications (DSL)
CR Bio CI-SIS (CDA R2 N3)
ET pour les cas deacutegradeacutes
PDF lsquonursquo (pour MSS) et en CDA R2 N1
(pour le DMP)
Donneacutees exporteacutees
(DMP et MSS)
- Consultation du DMP (palier 1) avec lrsquoappel contextuel (contexte INS patient) vers le Web PS DMP (qui inteacutegrera Pro Santeacute Connect ndash PSC
Web comme modaliteacute drsquoidentification eacutelectronique au S1 2022)
- Inteacutegration de PSC pour tous les SGL
- Identiteacute Nationale de Santeacute (INS) avec reacutefeacuterentiel INS guide dimpleacutementation INS et reacutefeacuterentiel national didentitovigilance (RNIV)
Pour les SGL en ES gestion de lrsquoidentiteacute entrante depuis le reacutefeacuterentiel des identiteacutes
Pour les SGL en ville (+ dans certains cas activiteacute externe agrave lrsquohocircpital) appel du teacuteleacuteservice INSi selon le guide drsquointeacutegration via CPx et CL-ORG
- [Systeacutematiquement par le SGL] Geacuteneacuteration (+ visualisation de controcircle) du CR-Bio conforme au format CI-SIS (CDA R2 N3) (incluant INS
codification LOINC des analyses avec des veacuterifications type Gazel lecture du XML et quelques exigences particuliegraveres (gestion commentaires
etc) ainsi qursquoen PDF (avec Datamatrix INS)
- Reacuteception et visualisation du CDA R2 N3 + PDF en provenant drsquoun laboratoire sous-traitant avec recommandation de savoir geacuterer une
fusion (insertion des analyses structureacutees dans le CDA R2 N3 du LBM1) ou agrave minima de savoir inseacuterer lrsquoimage le pdf du sous-traitant
- [SGL ou EAI etou DPI] Envoi systeacutematique et automatiseacute au DMP (version patient + professionnel en CDA R2 N3 + PDF en CDA R2 N1) et
par MSS aux correspondants (version professionnel en CDA R2 N3 + PDF nu) et aux patients (version patient en PDF nu et en CDA R2 N3)
degraves la validation biologique avec possibiliteacute de modification retrait ulteacuterieur
- Pour le contexte hospitalier la capaciteacute de transmettre au DPI les CDA R2 N3 via un flux normeacute HL7 ORU (avec donneacutees de masquage)
- Capaciteacute ergonomique dexport reacuteimport des analyses locales pour proceacuteder au transcodage LOINC
- Veacuterification systeacutematique au RPPS (annuaire santeacute) avec une gestion de multiples correspondants de santeacute
Speacutecifications
reacutefeacuterentiels
Seacutejour hospitalier
Tous les CR Bio (voir section
suivante)
CR Bio Patient Pro
DMP X X
MSS
patientX
MSS
proX
httpsinteropesantegouvfrEVSClient
detailedResultseamtype=CDAampoid=
1361411255911363114810
Publieacute Mi-juin
11
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
12
Le CDA R2
Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document
Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)
Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante
Deacutefinitions
LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un
codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
13
La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo
Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale
Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique
Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)
Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs
Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays
Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal
2 rue du pontParis 75001
Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal
De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
14
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM
Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par
une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du
CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)
bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)
15
Format Hprim structureacute (V3)
Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur
Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame
Veacutehicule peu drsquoinformations
- En-tecircte 12 lignes
- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement
- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo
Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes
- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis
- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
16
16
Respect des obligations reacuteglementaires
CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3
Obligations Hprim CDAR2 N3
nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO
OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK
La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK
CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99
CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
17
Respect des obligations normatives
Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS
REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX
Une meilleure identification du patient
et des professionnels de santeacute dans le
compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des
reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de
Santeacute INShellip)
TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE
Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des
groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie
baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne
contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par
groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)
TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE
Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute
drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement
lrsquoauteur
FORMAT STANDARD INTERNATIONAL
Un format de compte rendu baseacute sur le standard international
Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30
nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS
Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un
professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats
eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale
Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la
visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse
preacutecise
Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP
MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS
Beacuteneacutefices pour les biologistes
Beacuteneacutefices pour les prescripteurs
Beacuteneacutefices pour les patients
CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale
18
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
19
20
Programme de la formation
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
Crsquoest quoi
LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques
Ccedila sert agrave quoi
Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux
Comment
Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute
Qui doit inteacutegrer cette terminologie
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM
codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21
22
Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute
Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)
Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)
Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H
Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses
Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)
Technique (type of method)
Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee
Exemple
53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL
AnalyteCode LOINC Grandeur
Temporaliteacute
Milieu Eacutechelle Technique
5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
23
Ensembles drsquoobservations regroupeacutees
par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip
par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA
par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
24
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
25
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
26
En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
29
bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
32
33
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
34
La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
39
40
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
42
POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
45
Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
46
Merci de votre participation
7
Le Seacutegur Numeacuterique srsquoinscrit dans le cadre de reacutefeacuterence de la strateacutegie e-santeacute avec lrsquoobjectif drsquoagir
comme un acceacuteleacuterateur
En particulier sur la biologie meacutedicale 3 cas drsquousage ont eacuteteacute
prioriseacutes
Lrsquoenvoi systeacutematique des
comptes-rendus structureacutes
(+PDF) de biologie meacutedicale aux meacutedecins correspondants et aux
patients par MSSanteacute
Lrsquoalimentation systeacutematique du
dossier meacutedical partageacute avec
ces mecircmes comptes-rendus
La consultation possible du
dossier meacutedical partageacute par le biologiste meacutedical pour
parcourir un historique de santeacute
2
1
3
Le programme Seacutegur numeacuterique permet drsquoacceacuteleacuterer la feuille de route du virage numeacuterique en santeacute
Dans quel contexte Le Seacutegur du Numeacuterique
8
2 Mds euro drsquoinvestissements seront ainsi consacreacutes
pour les toutes prochaines anneacuteeshellip
Source Seacutegur de la Santeacute ndash Dossier de Presse Juillet 2020
Piliers et 33 mesures
composent le Seacutegur de la
santeacute4
Mds euro drsquoinvestissements
nouveaux preacutevus par la
mesure ndeg919
Mds euro drsquoinvestissements
destineacutes au rattrapage du
retard sur le numeacuterique
en santeacute
2
Source de valeur pour lrsquoacceacuteleacuteration du deacuteploiement
du numeacuterique en santeacute
2Action lsquomise en place drsquoun
financement agrave lrsquousage du
numeacuteriquersquo
1Action lsquofinancement de
lrsquoeacutequipement numeacuteriquersquo
et eacutevolution des services
socles
9
Calendrier preacutevisionnel de lrsquoaction financement de lrsquoeacutequipement
numeacuterique
10
Financement de lrsquoeacutequipement numeacuterique vague 1
specifications adopteacutees
DSL lsquoSGLrsquo (incluant exigences variables selon qursquoil srsquoagit drsquoun SGL en ville ou en
eacutetablissement et inteacutegrant la possibiliteacute de candidater avec un lsquoconnecteurrsquo tiers)
DSL lsquoTranscodage LOINCrsquo
Logiciels concerneacutes
par les dossiers de
speacutecifications (DSL)
CR Bio CI-SIS (CDA R2 N3)
ET pour les cas deacutegradeacutes
PDF lsquonursquo (pour MSS) et en CDA R2 N1
(pour le DMP)
Donneacutees exporteacutees
(DMP et MSS)
- Consultation du DMP (palier 1) avec lrsquoappel contextuel (contexte INS patient) vers le Web PS DMP (qui inteacutegrera Pro Santeacute Connect ndash PSC
Web comme modaliteacute drsquoidentification eacutelectronique au S1 2022)
- Inteacutegration de PSC pour tous les SGL
- Identiteacute Nationale de Santeacute (INS) avec reacutefeacuterentiel INS guide dimpleacutementation INS et reacutefeacuterentiel national didentitovigilance (RNIV)
Pour les SGL en ES gestion de lrsquoidentiteacute entrante depuis le reacutefeacuterentiel des identiteacutes
Pour les SGL en ville (+ dans certains cas activiteacute externe agrave lrsquohocircpital) appel du teacuteleacuteservice INSi selon le guide drsquointeacutegration via CPx et CL-ORG
- [Systeacutematiquement par le SGL] Geacuteneacuteration (+ visualisation de controcircle) du CR-Bio conforme au format CI-SIS (CDA R2 N3) (incluant INS
codification LOINC des analyses avec des veacuterifications type Gazel lecture du XML et quelques exigences particuliegraveres (gestion commentaires
etc) ainsi qursquoen PDF (avec Datamatrix INS)
- Reacuteception et visualisation du CDA R2 N3 + PDF en provenant drsquoun laboratoire sous-traitant avec recommandation de savoir geacuterer une
fusion (insertion des analyses structureacutees dans le CDA R2 N3 du LBM1) ou agrave minima de savoir inseacuterer lrsquoimage le pdf du sous-traitant
- [SGL ou EAI etou DPI] Envoi systeacutematique et automatiseacute au DMP (version patient + professionnel en CDA R2 N3 + PDF en CDA R2 N1) et
par MSS aux correspondants (version professionnel en CDA R2 N3 + PDF nu) et aux patients (version patient en PDF nu et en CDA R2 N3)
degraves la validation biologique avec possibiliteacute de modification retrait ulteacuterieur
- Pour le contexte hospitalier la capaciteacute de transmettre au DPI les CDA R2 N3 via un flux normeacute HL7 ORU (avec donneacutees de masquage)
- Capaciteacute ergonomique dexport reacuteimport des analyses locales pour proceacuteder au transcodage LOINC
- Veacuterification systeacutematique au RPPS (annuaire santeacute) avec une gestion de multiples correspondants de santeacute
Speacutecifications
reacutefeacuterentiels
Seacutejour hospitalier
Tous les CR Bio (voir section
suivante)
CR Bio Patient Pro
DMP X X
MSS
patientX
MSS
proX
httpsinteropesantegouvfrEVSClient
detailedResultseamtype=CDAampoid=
1361411255911363114810
Publieacute Mi-juin
11
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
12
Le CDA R2
Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document
Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)
Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante
Deacutefinitions
LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un
codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
13
La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo
Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale
Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique
Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)
Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs
Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays
Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal
2 rue du pontParis 75001
Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal
De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
14
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM
Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par
une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du
CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)
bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)
15
Format Hprim structureacute (V3)
Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur
Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame
Veacutehicule peu drsquoinformations
- En-tecircte 12 lignes
- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement
- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo
Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes
- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis
- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
16
16
Respect des obligations reacuteglementaires
CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3
Obligations Hprim CDAR2 N3
nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO
OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK
La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK
CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99
CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
17
Respect des obligations normatives
Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS
REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX
Une meilleure identification du patient
et des professionnels de santeacute dans le
compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des
reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de
Santeacute INShellip)
TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE
Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des
groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie
baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne
contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par
groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)
TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE
Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute
drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement
lrsquoauteur
FORMAT STANDARD INTERNATIONAL
Un format de compte rendu baseacute sur le standard international
Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30
nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS
Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un
professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats
eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale
Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la
visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse
preacutecise
Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP
MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS
Beacuteneacutefices pour les biologistes
Beacuteneacutefices pour les prescripteurs
Beacuteneacutefices pour les patients
CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale
18
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
19
20
Programme de la formation
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
Crsquoest quoi
LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques
Ccedila sert agrave quoi
Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux
Comment
Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute
Qui doit inteacutegrer cette terminologie
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM
codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21
22
Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute
Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)
Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)
Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H
Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses
Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)
Technique (type of method)
Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee
Exemple
53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL
AnalyteCode LOINC Grandeur
Temporaliteacute
Milieu Eacutechelle Technique
5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
23
Ensembles drsquoobservations regroupeacutees
par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip
par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA
par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
24
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
25
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
26
En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
29
bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
32
33
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
34
La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
39
40
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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5rsquo
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SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
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POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
45
Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
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Merci de votre participation
8
2 Mds euro drsquoinvestissements seront ainsi consacreacutes
pour les toutes prochaines anneacuteeshellip
Source Seacutegur de la Santeacute ndash Dossier de Presse Juillet 2020
Piliers et 33 mesures
composent le Seacutegur de la
santeacute4
Mds euro drsquoinvestissements
nouveaux preacutevus par la
mesure ndeg919
Mds euro drsquoinvestissements
destineacutes au rattrapage du
retard sur le numeacuterique
en santeacute
2
Source de valeur pour lrsquoacceacuteleacuteration du deacuteploiement
du numeacuterique en santeacute
2Action lsquomise en place drsquoun
financement agrave lrsquousage du
numeacuteriquersquo
1Action lsquofinancement de
lrsquoeacutequipement numeacuteriquersquo
et eacutevolution des services
socles
9
Calendrier preacutevisionnel de lrsquoaction financement de lrsquoeacutequipement
numeacuterique
10
Financement de lrsquoeacutequipement numeacuterique vague 1
specifications adopteacutees
DSL lsquoSGLrsquo (incluant exigences variables selon qursquoil srsquoagit drsquoun SGL en ville ou en
eacutetablissement et inteacutegrant la possibiliteacute de candidater avec un lsquoconnecteurrsquo tiers)
DSL lsquoTranscodage LOINCrsquo
Logiciels concerneacutes
par les dossiers de
speacutecifications (DSL)
CR Bio CI-SIS (CDA R2 N3)
ET pour les cas deacutegradeacutes
PDF lsquonursquo (pour MSS) et en CDA R2 N1
(pour le DMP)
Donneacutees exporteacutees
(DMP et MSS)
- Consultation du DMP (palier 1) avec lrsquoappel contextuel (contexte INS patient) vers le Web PS DMP (qui inteacutegrera Pro Santeacute Connect ndash PSC
Web comme modaliteacute drsquoidentification eacutelectronique au S1 2022)
- Inteacutegration de PSC pour tous les SGL
- Identiteacute Nationale de Santeacute (INS) avec reacutefeacuterentiel INS guide dimpleacutementation INS et reacutefeacuterentiel national didentitovigilance (RNIV)
Pour les SGL en ES gestion de lrsquoidentiteacute entrante depuis le reacutefeacuterentiel des identiteacutes
Pour les SGL en ville (+ dans certains cas activiteacute externe agrave lrsquohocircpital) appel du teacuteleacuteservice INSi selon le guide drsquointeacutegration via CPx et CL-ORG
- [Systeacutematiquement par le SGL] Geacuteneacuteration (+ visualisation de controcircle) du CR-Bio conforme au format CI-SIS (CDA R2 N3) (incluant INS
codification LOINC des analyses avec des veacuterifications type Gazel lecture du XML et quelques exigences particuliegraveres (gestion commentaires
etc) ainsi qursquoen PDF (avec Datamatrix INS)
- Reacuteception et visualisation du CDA R2 N3 + PDF en provenant drsquoun laboratoire sous-traitant avec recommandation de savoir geacuterer une
fusion (insertion des analyses structureacutees dans le CDA R2 N3 du LBM1) ou agrave minima de savoir inseacuterer lrsquoimage le pdf du sous-traitant
- [SGL ou EAI etou DPI] Envoi systeacutematique et automatiseacute au DMP (version patient + professionnel en CDA R2 N3 + PDF en CDA R2 N1) et
par MSS aux correspondants (version professionnel en CDA R2 N3 + PDF nu) et aux patients (version patient en PDF nu et en CDA R2 N3)
degraves la validation biologique avec possibiliteacute de modification retrait ulteacuterieur
- Pour le contexte hospitalier la capaciteacute de transmettre au DPI les CDA R2 N3 via un flux normeacute HL7 ORU (avec donneacutees de masquage)
- Capaciteacute ergonomique dexport reacuteimport des analyses locales pour proceacuteder au transcodage LOINC
- Veacuterification systeacutematique au RPPS (annuaire santeacute) avec une gestion de multiples correspondants de santeacute
Speacutecifications
reacutefeacuterentiels
Seacutejour hospitalier
Tous les CR Bio (voir section
suivante)
CR Bio Patient Pro
DMP X X
MSS
patientX
MSS
proX
httpsinteropesantegouvfrEVSClient
detailedResultseamtype=CDAampoid=
1361411255911363114810
Publieacute Mi-juin
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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Le CDA R2
Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document
Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)
Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante
Deacutefinitions
LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un
codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
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La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo
Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale
Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique
Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)
Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs
Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays
Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal
2 rue du pontParis 75001
Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal
De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
14
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM
Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par
une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du
CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)
bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)
15
Format Hprim structureacute (V3)
Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur
Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame
Veacutehicule peu drsquoinformations
- En-tecircte 12 lignes
- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement
- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo
Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes
- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis
- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
16
16
Respect des obligations reacuteglementaires
CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3
Obligations Hprim CDAR2 N3
nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO
OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK
La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK
CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99
CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
17
Respect des obligations normatives
Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS
REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX
Une meilleure identification du patient
et des professionnels de santeacute dans le
compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des
reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de
Santeacute INShellip)
TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE
Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des
groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie
baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne
contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par
groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)
TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE
Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute
drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement
lrsquoauteur
FORMAT STANDARD INTERNATIONAL
Un format de compte rendu baseacute sur le standard international
Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30
nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS
Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un
professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats
eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale
Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la
visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse
preacutecise
Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP
MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS
Beacuteneacutefices pour les biologistes
Beacuteneacutefices pour les prescripteurs
Beacuteneacutefices pour les patients
CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale
18
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
19
20
Programme de la formation
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
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10rsquo
5rsquo
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2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
Crsquoest quoi
LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques
Ccedila sert agrave quoi
Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux
Comment
Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute
Qui doit inteacutegrer cette terminologie
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM
codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21
22
Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute
Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)
Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)
Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H
Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses
Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)
Technique (type of method)
Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee
Exemple
53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL
AnalyteCode LOINC Grandeur
Temporaliteacute
Milieu Eacutechelle Technique
5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
23
Ensembles drsquoobservations regroupeacutees
par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip
par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA
par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
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2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
25
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
29
bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
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40
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
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POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
45
Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
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Merci de votre participation
9
Calendrier preacutevisionnel de lrsquoaction financement de lrsquoeacutequipement
numeacuterique
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Financement de lrsquoeacutequipement numeacuterique vague 1
specifications adopteacutees
DSL lsquoSGLrsquo (incluant exigences variables selon qursquoil srsquoagit drsquoun SGL en ville ou en
eacutetablissement et inteacutegrant la possibiliteacute de candidater avec un lsquoconnecteurrsquo tiers)
DSL lsquoTranscodage LOINCrsquo
Logiciels concerneacutes
par les dossiers de
speacutecifications (DSL)
CR Bio CI-SIS (CDA R2 N3)
ET pour les cas deacutegradeacutes
PDF lsquonursquo (pour MSS) et en CDA R2 N1
(pour le DMP)
Donneacutees exporteacutees
(DMP et MSS)
- Consultation du DMP (palier 1) avec lrsquoappel contextuel (contexte INS patient) vers le Web PS DMP (qui inteacutegrera Pro Santeacute Connect ndash PSC
Web comme modaliteacute drsquoidentification eacutelectronique au S1 2022)
- Inteacutegration de PSC pour tous les SGL
- Identiteacute Nationale de Santeacute (INS) avec reacutefeacuterentiel INS guide dimpleacutementation INS et reacutefeacuterentiel national didentitovigilance (RNIV)
Pour les SGL en ES gestion de lrsquoidentiteacute entrante depuis le reacutefeacuterentiel des identiteacutes
Pour les SGL en ville (+ dans certains cas activiteacute externe agrave lrsquohocircpital) appel du teacuteleacuteservice INSi selon le guide drsquointeacutegration via CPx et CL-ORG
- [Systeacutematiquement par le SGL] Geacuteneacuteration (+ visualisation de controcircle) du CR-Bio conforme au format CI-SIS (CDA R2 N3) (incluant INS
codification LOINC des analyses avec des veacuterifications type Gazel lecture du XML et quelques exigences particuliegraveres (gestion commentaires
etc) ainsi qursquoen PDF (avec Datamatrix INS)
- Reacuteception et visualisation du CDA R2 N3 + PDF en provenant drsquoun laboratoire sous-traitant avec recommandation de savoir geacuterer une
fusion (insertion des analyses structureacutees dans le CDA R2 N3 du LBM1) ou agrave minima de savoir inseacuterer lrsquoimage le pdf du sous-traitant
- [SGL ou EAI etou DPI] Envoi systeacutematique et automatiseacute au DMP (version patient + professionnel en CDA R2 N3 + PDF en CDA R2 N1) et
par MSS aux correspondants (version professionnel en CDA R2 N3 + PDF nu) et aux patients (version patient en PDF nu et en CDA R2 N3)
degraves la validation biologique avec possibiliteacute de modification retrait ulteacuterieur
- Pour le contexte hospitalier la capaciteacute de transmettre au DPI les CDA R2 N3 via un flux normeacute HL7 ORU (avec donneacutees de masquage)
- Capaciteacute ergonomique dexport reacuteimport des analyses locales pour proceacuteder au transcodage LOINC
- Veacuterification systeacutematique au RPPS (annuaire santeacute) avec une gestion de multiples correspondants de santeacute
Speacutecifications
reacutefeacuterentiels
Seacutejour hospitalier
Tous les CR Bio (voir section
suivante)
CR Bio Patient Pro
DMP X X
MSS
patientX
MSS
proX
httpsinteropesantegouvfrEVSClient
detailedResultseamtype=CDAampoid=
1361411255911363114810
Publieacute Mi-juin
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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Le CDA R2
Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document
Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)
Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante
Deacutefinitions
LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un
codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
13
La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo
Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale
Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique
Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)
Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs
Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays
Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal
2 rue du pontParis 75001
Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal
De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
14
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM
Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par
une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du
CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)
bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)
15
Format Hprim structureacute (V3)
Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur
Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame
Veacutehicule peu drsquoinformations
- En-tecircte 12 lignes
- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement
- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo
Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes
- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis
- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
16
16
Respect des obligations reacuteglementaires
CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3
Obligations Hprim CDAR2 N3
nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO
OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK
La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK
CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99
CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
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Respect des obligations normatives
Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS
REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX
Une meilleure identification du patient
et des professionnels de santeacute dans le
compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des
reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de
Santeacute INShellip)
TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE
Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des
groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie
baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne
contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par
groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)
TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE
Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute
drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement
lrsquoauteur
FORMAT STANDARD INTERNATIONAL
Un format de compte rendu baseacute sur le standard international
Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30
nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS
Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un
professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats
eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale
Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la
visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse
preacutecise
Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP
MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS
Beacuteneacutefices pour les biologistes
Beacuteneacutefices pour les prescripteurs
Beacuteneacutefices pour les patients
CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale
18
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
19
20
Programme de la formation
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
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10rsquo
5rsquo
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2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
Crsquoest quoi
LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques
Ccedila sert agrave quoi
Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux
Comment
Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute
Qui doit inteacutegrer cette terminologie
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM
codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21
22
Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute
Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)
Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)
Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H
Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses
Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)
Technique (type of method)
Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee
Exemple
53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL
AnalyteCode LOINC Grandeur
Temporaliteacute
Milieu Eacutechelle Technique
5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
23
Ensembles drsquoobservations regroupeacutees
par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip
par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA
par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
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2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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10rsquo
5rsquo
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En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
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bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
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33
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
39
40
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
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15rsquo
SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
42
POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
45
Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
46
Merci de votre participation
10
Financement de lrsquoeacutequipement numeacuterique vague 1
specifications adopteacutees
DSL lsquoSGLrsquo (incluant exigences variables selon qursquoil srsquoagit drsquoun SGL en ville ou en
eacutetablissement et inteacutegrant la possibiliteacute de candidater avec un lsquoconnecteurrsquo tiers)
DSL lsquoTranscodage LOINCrsquo
Logiciels concerneacutes
par les dossiers de
speacutecifications (DSL)
CR Bio CI-SIS (CDA R2 N3)
ET pour les cas deacutegradeacutes
PDF lsquonursquo (pour MSS) et en CDA R2 N1
(pour le DMP)
Donneacutees exporteacutees
(DMP et MSS)
- Consultation du DMP (palier 1) avec lrsquoappel contextuel (contexte INS patient) vers le Web PS DMP (qui inteacutegrera Pro Santeacute Connect ndash PSC
Web comme modaliteacute drsquoidentification eacutelectronique au S1 2022)
- Inteacutegration de PSC pour tous les SGL
- Identiteacute Nationale de Santeacute (INS) avec reacutefeacuterentiel INS guide dimpleacutementation INS et reacutefeacuterentiel national didentitovigilance (RNIV)
Pour les SGL en ES gestion de lrsquoidentiteacute entrante depuis le reacutefeacuterentiel des identiteacutes
Pour les SGL en ville (+ dans certains cas activiteacute externe agrave lrsquohocircpital) appel du teacuteleacuteservice INSi selon le guide drsquointeacutegration via CPx et CL-ORG
- [Systeacutematiquement par le SGL] Geacuteneacuteration (+ visualisation de controcircle) du CR-Bio conforme au format CI-SIS (CDA R2 N3) (incluant INS
codification LOINC des analyses avec des veacuterifications type Gazel lecture du XML et quelques exigences particuliegraveres (gestion commentaires
etc) ainsi qursquoen PDF (avec Datamatrix INS)
- Reacuteception et visualisation du CDA R2 N3 + PDF en provenant drsquoun laboratoire sous-traitant avec recommandation de savoir geacuterer une
fusion (insertion des analyses structureacutees dans le CDA R2 N3 du LBM1) ou agrave minima de savoir inseacuterer lrsquoimage le pdf du sous-traitant
- [SGL ou EAI etou DPI] Envoi systeacutematique et automatiseacute au DMP (version patient + professionnel en CDA R2 N3 + PDF en CDA R2 N1) et
par MSS aux correspondants (version professionnel en CDA R2 N3 + PDF nu) et aux patients (version patient en PDF nu et en CDA R2 N3)
degraves la validation biologique avec possibiliteacute de modification retrait ulteacuterieur
- Pour le contexte hospitalier la capaciteacute de transmettre au DPI les CDA R2 N3 via un flux normeacute HL7 ORU (avec donneacutees de masquage)
- Capaciteacute ergonomique dexport reacuteimport des analyses locales pour proceacuteder au transcodage LOINC
- Veacuterification systeacutematique au RPPS (annuaire santeacute) avec une gestion de multiples correspondants de santeacute
Speacutecifications
reacutefeacuterentiels
Seacutejour hospitalier
Tous les CR Bio (voir section
suivante)
CR Bio Patient Pro
DMP X X
MSS
patientX
MSS
proX
httpsinteropesantegouvfrEVSClient
detailedResultseamtype=CDAampoid=
1361411255911363114810
Publieacute Mi-juin
11
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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10rsquo
5rsquo
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Le CDA R2
Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document
Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)
Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante
Deacutefinitions
LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un
codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
13
La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo
Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale
Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique
Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)
Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs
Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays
Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal
2 rue du pontParis 75001
Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal
De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
14
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM
Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par
une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du
CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)
bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)
15
Format Hprim structureacute (V3)
Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur
Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame
Veacutehicule peu drsquoinformations
- En-tecircte 12 lignes
- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement
- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo
Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes
- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis
- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
16
16
Respect des obligations reacuteglementaires
CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3
Obligations Hprim CDAR2 N3
nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO
OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK
La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK
CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99
CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
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Respect des obligations normatives
Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS
REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX
Une meilleure identification du patient
et des professionnels de santeacute dans le
compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des
reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de
Santeacute INShellip)
TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE
Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des
groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie
baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne
contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par
groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)
TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE
Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute
drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement
lrsquoauteur
FORMAT STANDARD INTERNATIONAL
Un format de compte rendu baseacute sur le standard international
Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30
nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS
Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un
professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats
eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale
Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la
visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse
preacutecise
Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP
MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS
Beacuteneacutefices pour les biologistes
Beacuteneacutefices pour les prescripteurs
Beacuteneacutefices pour les patients
CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale
18
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
19
20
Programme de la formation
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
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20rsquo
10rsquo
5rsquo
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2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
Crsquoest quoi
LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques
Ccedila sert agrave quoi
Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux
Comment
Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute
Qui doit inteacutegrer cette terminologie
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM
codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21
22
Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute
Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)
Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)
Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H
Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses
Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)
Technique (type of method)
Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee
Exemple
53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL
AnalyteCode LOINC Grandeur
Temporaliteacute
Milieu Eacutechelle Technique
5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
23
Ensembles drsquoobservations regroupeacutees
par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip
par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA
par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
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2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
25
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
29
bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
39
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
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POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
45
Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
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Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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Le CDA R2
Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document
Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)
Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante
Deacutefinitions
LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un
codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
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La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo
Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale
Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique
Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)
Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs
Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays
Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal
2 rue du pontParis 75001
Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal
De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
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1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM
Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par
une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du
CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)
bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)
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Format Hprim structureacute (V3)
Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur
Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame
Veacutehicule peu drsquoinformations
- En-tecircte 12 lignes
- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement
- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo
Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes
- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis
- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
16
16
Respect des obligations reacuteglementaires
CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3
Obligations Hprim CDAR2 N3
nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO
OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK
La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK
CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99
CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
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Respect des obligations normatives
Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS
REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX
Une meilleure identification du patient
et des professionnels de santeacute dans le
compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des
reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de
Santeacute INShellip)
TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE
Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des
groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie
baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne
contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par
groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)
TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE
Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute
drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement
lrsquoauteur
FORMAT STANDARD INTERNATIONAL
Un format de compte rendu baseacute sur le standard international
Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30
nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS
Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un
professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats
eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale
Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la
visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse
preacutecise
Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP
MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS
Beacuteneacutefices pour les biologistes
Beacuteneacutefices pour les prescripteurs
Beacuteneacutefices pour les patients
CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale
18
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
19
20
Programme de la formation
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
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2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
Crsquoest quoi
LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques
Ccedila sert agrave quoi
Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux
Comment
Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute
Qui doit inteacutegrer cette terminologie
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM
codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21
22
Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute
Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)
Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)
Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H
Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses
Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)
Technique (type of method)
Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee
Exemple
53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL
AnalyteCode LOINC Grandeur
Temporaliteacute
Milieu Eacutechelle Technique
5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
23
Ensembles drsquoobservations regroupeacutees
par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip
par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA
par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
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2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
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bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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SIDEP
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Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
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POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
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Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
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Le CDA R2
Interopeacuterabiliteacute syntaxique standardformatinternational Clinical Document Architecture (CDARelease 2) de transmission des documentsmeacutedicaux permettant notamment une inteacutegrationautomatique dans le logiciel meacutetier concerneacute desinformations contenues dans un document
Il existe 3 niveaux de structuration (N1-en-tecircteN2 N3)
Le CDA R2 N3 doit remplacer le HPRIM meacutedecin30 qui nrsquoest plus maintenu par InteroprsquoSante
Deacutefinitions
LOINC (Logical Observation Identifiers Names and Codes) Inteacuteropeacuterabiliteacute seacutemantique Un
codage des examens de biologie baseacutee sur une nomenclature internationale commune aux biologistes et auxprescripteurs
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
13
La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo
Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale
Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique
Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)
Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs
Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays
Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal
2 rue du pontParis 75001
Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal
De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
14
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM
Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par
une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du
CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)
bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)
15
Format Hprim structureacute (V3)
Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur
Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame
Veacutehicule peu drsquoinformations
- En-tecircte 12 lignes
- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement
- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo
Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes
- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis
- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
16
16
Respect des obligations reacuteglementaires
CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3
Obligations Hprim CDAR2 N3
nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO
OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK
La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK
CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99
CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
17
Respect des obligations normatives
Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS
REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX
Une meilleure identification du patient
et des professionnels de santeacute dans le
compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des
reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de
Santeacute INShellip)
TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE
Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des
groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie
baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne
contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par
groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)
TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE
Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute
drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement
lrsquoauteur
FORMAT STANDARD INTERNATIONAL
Un format de compte rendu baseacute sur le standard international
Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30
nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS
Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un
professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats
eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale
Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la
visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse
preacutecise
Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP
MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS
Beacuteneacutefices pour les biologistes
Beacuteneacutefices pour les prescripteurs
Beacuteneacutefices pour les patients
CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale
18
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
19
20
Programme de la formation
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
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10rsquo
5rsquo
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2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
Crsquoest quoi
LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques
Ccedila sert agrave quoi
Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux
Comment
Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute
Qui doit inteacutegrer cette terminologie
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM
codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21
22
Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute
Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)
Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)
Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H
Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses
Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)
Technique (type of method)
Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee
Exemple
53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL
AnalyteCode LOINC Grandeur
Temporaliteacute
Milieu Eacutechelle Technique
5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
23
Ensembles drsquoobservations regroupeacutees
par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip
par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA
par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
24
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
25
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
29
bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
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33
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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SIDEP
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Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
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POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
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Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
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4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
46
Merci de votre participation
13
La syntaxe est le langage informatique utiliseacute pour structurer un document laquo informatique raquo
Meacutetaphoriquement parlant ont pourrait repreacutesenter le CDAR2 par une adresse geacuteo postale
Pour alimenter cette adresse et permettre agrave lrsquoinformation drsquoecirctre comprise du plus grand nombre on utilise la couche seacutemantique
Dans notre cas il srsquoagit des terminologies et nomenclatures de santeacute (CIM LOINC ICHI HGNC OMIM hellip)
Pour continuer sur lrsquoexemple ci-dessus il srsquoagirait des eacuteleacutements seacutemantiques neacutecessaires agrave lrsquoalimentation des champs
Ici la syntaxe deacutefinie un format de preacutesentation de lrsquoinformation qui est commune agrave tous les pays
Ndeg de rue avenue boulevardVille Code postal
2 rue du pontParis 75001
Ici la seacutemantique fournit lrsquoinformation neacutecessaire au bon traitement du courrier par nrsquoimporte quel service postal
De ce fait on comprend aiseacutement que la syntaxe et la seacutemantique sont deux eacuteleacutements indissociables quand il srsquoagit de transmettre des informations de santeacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCDA amp LOINC interopeacuterabiliteacute syntaxique et seacutemantique
14
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM
Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par
une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du
CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)
bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)
15
Format Hprim structureacute (V3)
Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur
Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame
Veacutehicule peu drsquoinformations
- En-tecircte 12 lignes
- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement
- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo
Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes
- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis
- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
16
16
Respect des obligations reacuteglementaires
CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3
Obligations Hprim CDAR2 N3
nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO
OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK
La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK
CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99
CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
17
Respect des obligations normatives
Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS
REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX
Une meilleure identification du patient
et des professionnels de santeacute dans le
compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des
reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de
Santeacute INShellip)
TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE
Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des
groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie
baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne
contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par
groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)
TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE
Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute
drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement
lrsquoauteur
FORMAT STANDARD INTERNATIONAL
Un format de compte rendu baseacute sur le standard international
Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30
nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS
Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un
professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats
eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale
Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la
visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse
preacutecise
Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP
MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS
Beacuteneacutefices pour les biologistes
Beacuteneacutefices pour les prescripteurs
Beacuteneacutefices pour les patients
CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale
18
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
19
20
Programme de la formation
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
Crsquoest quoi
LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques
Ccedila sert agrave quoi
Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux
Comment
Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute
Qui doit inteacutegrer cette terminologie
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM
codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21
22
Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute
Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)
Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)
Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H
Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses
Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)
Technique (type of method)
Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee
Exemple
53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL
AnalyteCode LOINC Grandeur
Temporaliteacute
Milieu Eacutechelle Technique
5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
23
Ensembles drsquoobservations regroupeacutees
par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip
par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA
par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
24
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
25
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
26
En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
29
bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
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33
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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15rsquo
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10rsquo
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34
La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
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40
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
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10rsquo
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SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
42
POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
45
Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
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10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
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sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
46
Merci de votre participation
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1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesCadre drsquointeropeacuterabiliteacute et volet de contenu CRBM
Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au Cadre drsquointeropeacuterabiliteacute des systegravemes drsquoinformation de santeacute (CI-SIS)
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS comprend o une preacutesentation des reacutesultats drsquoanalyse lisibles par un humaino une preacutesentation codeacutee en LOINC (notamment) des analyses porteuses de reacutesultats drsquoexamen exploitables laquo par
une machine raquo o les speacutecifications du volet laquo compte rendu drsquoexamen de biologie raquo sont disponibles dans lrsquoespace de publication du
CI-SIS sur le site de lrsquoANS httpsesantegouvfrinteroperabiliteci-sisespace-publication
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoapplique o aux examens biologiques pour un patiento aux examens pour un patient associeacute agrave un eacutechantillon biologique non humain
bull Le compte rendu drsquoexamen de biologie conforme au CI-SIS srsquoappuie sur le standard HL7V3 - CDA R2 et le profil XD-LAB(Sharing Report) du domaine IHE International ndash Pathology and Laboratory Medecine Technical Framework (PALM)
bull En eacutetablissement de santeacute pour les eacutechanges intra-hospitaliers les reacutesultats drsquoexamens de biologie sont eacutechangeacutesconformeacutement au standard HL7V2 (hors CI-SIS)
15
Format Hprim structureacute (V3)
Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur
Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame
Veacutehicule peu drsquoinformations
- En-tecircte 12 lignes
- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement
- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo
Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes
- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis
- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
16
16
Respect des obligations reacuteglementaires
CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3
Obligations Hprim CDAR2 N3
nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO
OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK
La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK
CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99
CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
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Respect des obligations normatives
Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS
REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX
Une meilleure identification du patient
et des professionnels de santeacute dans le
compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des
reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de
Santeacute INShellip)
TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE
Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des
groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie
baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne
contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par
groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)
TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE
Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute
drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement
lrsquoauteur
FORMAT STANDARD INTERNATIONAL
Un format de compte rendu baseacute sur le standard international
Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30
nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS
Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un
professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats
eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale
Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la
visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse
preacutecise
Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP
MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS
Beacuteneacutefices pour les biologistes
Beacuteneacutefices pour les prescripteurs
Beacuteneacutefices pour les patients
CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale
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Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
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20
Programme de la formation
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
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5rsquo
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2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
Crsquoest quoi
LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques
Ccedila sert agrave quoi
Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux
Comment
Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute
Qui doit inteacutegrer cette terminologie
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM
codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21
22
Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute
Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)
Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)
Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H
Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses
Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)
Technique (type of method)
Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee
Exemple
53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL
AnalyteCode LOINC Grandeur
Temporaliteacute
Milieu Eacutechelle Technique
5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
23
Ensembles drsquoobservations regroupeacutees
par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip
par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA
par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
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2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
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bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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SIDEP
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Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
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POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
45
Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
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10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
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Merci de votre participation
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Format Hprim structureacute (V3)
Trame simple contenant des donneacutees seacuteparateur
Les donneacutees sont deacutefinies par leur place dans la trame
Veacutehicule peu drsquoinformations
- En-tecircte 12 lignes
- Corps 14 donneacutees par eacuteleacutement
- Impossibiliteacute de coder les laquo eacuteleacutement-fils raquo
Les dictionnaires des laboratoires sont heacuteteacuterogegravenes
- par exemple les codes examens transmis ne sont pas deacutefinis
- =gt Point drsquoachoppement agrave lrsquoInteropeacuterabiliteacute
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
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Respect des obligations reacuteglementaires
CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3
Obligations Hprim CDAR2 N3
nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO
OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK
La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK
CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99
CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
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Respect des obligations normatives
Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS
REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX
Une meilleure identification du patient
et des professionnels de santeacute dans le
compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des
reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de
Santeacute INShellip)
TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE
Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des
groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie
baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne
contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par
groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)
TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE
Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute
drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement
lrsquoauteur
FORMAT STANDARD INTERNATIONAL
Un format de compte rendu baseacute sur le standard international
Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30
nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS
Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un
professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats
eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale
Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la
visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse
preacutecise
Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP
MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS
Beacuteneacutefices pour les biologistes
Beacuteneacutefices pour les prescripteurs
Beacuteneacutefices pour les patients
CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale
18
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
19
20
Programme de la formation
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
10rsquo
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20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
Crsquoest quoi
LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques
Ccedila sert agrave quoi
Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux
Comment
Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute
Qui doit inteacutegrer cette terminologie
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM
codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21
22
Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute
Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)
Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)
Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H
Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses
Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)
Technique (type of method)
Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee
Exemple
53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL
AnalyteCode LOINC Grandeur
Temporaliteacute
Milieu Eacutechelle Technique
5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
23
Ensembles drsquoobservations regroupeacutees
par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip
par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA
par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
24
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
25
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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10rsquo
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26
En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
29
bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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34
La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
39
40
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
42
POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
45
Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
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Merci de votre participation
16
16
Respect des obligations reacuteglementaires
CSP art R 6222-3 CSP art D 6211-3
Obligations Hprim CDAR2 N3
nom ou la raison sociale du LBM et sa forme drsquoexploitation KO OKLe nom du biologiste responsable du LBM et le cas eacutecheacuteant le nom des biologistes coresponsables KO OKLe numeacutero drsquoaccreacuteditation degraves qursquoune accreacuteditation totale est deacutelivreacutee KO OKLrsquoadresse du ou des sites concerneacutes par la reacutealisation de lrsquoexamen KO OKLa signature du Biologiste KO OKNotion de compte-rendu partiel ou complet KO OKLrsquoidentification du professionnel preacuteleveur nom de famille preacutenom qualiteacute numeacutero drsquoidentification professionnelle KO OKLa nature du ou des eacutechantillons KO OKles valeurs de reacutefeacuterences OK OKla meacutethode drsquoanalyse etou les reacuteactifs utiliseacutes doivent ecirctre mentionneacutes KO OKConsolidation des comptes rendus des laboratoires sous-traitant KO OKLrsquoinformation des patients des destinataires des comptes rendus32113 information Recipientndash Destinataires en copie du compte rendu KO
OKLrsquoajout drsquoexamens compleacutementaires hors prescription (A mettre en commentaires par analyse ou par chapitre quand lrsquoexamen compleacutementaire agrave reacutealiser fait suite agrave un reacutesultat drsquoanalyse) KO OK
La geacuteneacuteration drsquoun compte rendu agrave part en cas drsquoincoheacuterence deacutetecteacute sur les appareils drsquoautomesure KO KOOK1 OK 13 OK
CSP art D 6211-3 CSP art D 6211-2 GBEA 26 Nov 99
CSP art L 6211-19 RGPD art 5-1-a) RGPD art 13-1-e) convention des laboratories CSP art L 6211-12
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
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Respect des obligations normatives
Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS
REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX
Une meilleure identification du patient
et des professionnels de santeacute dans le
compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des
reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de
Santeacute INShellip)
TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE
Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des
groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie
baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne
contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par
groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)
TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE
Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute
drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement
lrsquoauteur
FORMAT STANDARD INTERNATIONAL
Un format de compte rendu baseacute sur le standard international
Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30
nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS
Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un
professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats
eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale
Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la
visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse
preacutecise
Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP
MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS
Beacuteneacutefices pour les biologistes
Beacuteneacutefices pour les prescripteurs
Beacuteneacutefices pour les patients
CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale
18
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
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Programme de la formation
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
10rsquo
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10rsquo
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2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
Crsquoest quoi
LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques
Ccedila sert agrave quoi
Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux
Comment
Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute
Qui doit inteacutegrer cette terminologie
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM
codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21
22
Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute
Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)
Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)
Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H
Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses
Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)
Technique (type of method)
Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee
Exemple
53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL
AnalyteCode LOINC Grandeur
Temporaliteacute
Milieu Eacutechelle Technique
5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
23
Ensembles drsquoobservations regroupeacutees
par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip
par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA
par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
24
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
25
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
26
En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
29
bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
32
33
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
34
La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
39
40
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
42
POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
45
Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
46
Merci de votre participation
17
Respect des obligations normatives
Au total le CDAR2 N3 comptabilise 1922 items conformes aux obligations normatives et reacuteglementaires contre seulement 322 pour le HPRIM
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesComparaison entre le HPRIM Meacutedecin 30 et le CDAR2 N3
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS
REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX
Une meilleure identification du patient
et des professionnels de santeacute dans le
compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des
reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de
Santeacute INShellip)
TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE
Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des
groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie
baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne
contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par
groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)
TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE
Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute
drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement
lrsquoauteur
FORMAT STANDARD INTERNATIONAL
Un format de compte rendu baseacute sur le standard international
Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30
nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS
Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un
professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats
eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale
Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la
visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse
preacutecise
Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP
MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS
Beacuteneacutefices pour les biologistes
Beacuteneacutefices pour les prescripteurs
Beacuteneacutefices pour les patients
CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale
18
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
19
20
Programme de la formation
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
Crsquoest quoi
LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques
Ccedila sert agrave quoi
Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux
Comment
Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute
Qui doit inteacutegrer cette terminologie
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM
codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21
22
Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute
Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)
Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)
Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H
Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses
Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)
Technique (type of method)
Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee
Exemple
53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL
AnalyteCode LOINC Grandeur
Temporaliteacute
Milieu Eacutechelle Technique
5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
23
Ensembles drsquoobservations regroupeacutees
par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip
par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA
par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
24
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
25
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
26
En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
29
bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
32
33
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
34
La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
39
40
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
42
POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
45
Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
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Merci de votre participation
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacuteesLes beacuteneacutefices utilisateurs du CRBM structureacute conformeacutement au CI-SIS
REacuteFEacuteRENTIELS NATIONAUX
Une meilleure identification du patient
et des professionnels de santeacute dans le
compte rendu gracircce agrave lrsquoutilisation des
reacutefeacuterentiels nationaux(Reacutepertoire National des Professionnels de
Santeacute INShellip)
TERMINOLOGIE INTERNATIONALE COMMUNE
Un langage commun entre tous les LBM qui facilite un pilotage de lrsquoactiviteacute des
groupes (comparaison en interne des SELAS par exemple) Un codage des examens de biologie
baseacutee sur une terminologie internationale commune aux biologistes et aux prescripteursUne
contribution au big data dans le secteur de la biologie meacutedicale (consolidation de donneacutees par
groupe de laboratoire sur la base drsquoune terminologie pivot LOINC pour les examens)
TRACcedilABILITEacute PLUS PREacuteCISE
Une traccedilabiliteacute plus preacutecise des reacutesultats drsquoexamens possibiliteacute
drsquoindiquer au niveau de chaque reacutesultat drsquoexamen le preacutelegravevement
lrsquoauteur
FORMAT STANDARD INTERNATIONAL
Un format de compte rendu baseacute sur le standard international
Clinical Document Architecture (CDA) HPRIM meacutedecin 30
nrsquoest plus maintenuMEILLLEURE COORDINATION DES SOINS
Lrsquoutilisation de ce format donne la possibiliteacute pour un
professionnel de santeacute de comparer les reacutesultats
eacutemanant de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale
Lrsquoaffichage sous forme de graphiques permet la
visualisation de lrsquohistorique patient sur une analyse
preacutecise
Anticiper la e-prescription et alimenter le DMP
MEILLLEURE PRISE EN CHARGE DES PATIENTS
Beacuteneacutefices pour les biologistes
Beacuteneacutefices pour les prescripteurs
Beacuteneacutefices pour les patients
CRBM = Compte Rendu de Biologie Meacutedicale
18
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
19
20
Programme de la formation
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
Crsquoest quoi
LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques
Ccedila sert agrave quoi
Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux
Comment
Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute
Qui doit inteacutegrer cette terminologie
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM
codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21
22
Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute
Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)
Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)
Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H
Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses
Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)
Technique (type of method)
Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee
Exemple
53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL
AnalyteCode LOINC Grandeur
Temporaliteacute
Milieu Eacutechelle Technique
5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
23
Ensembles drsquoobservations regroupeacutees
par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip
par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA
par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
24
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
25
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
26
En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
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bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
32
33
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
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La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
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4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
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Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
39
40
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
42
POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
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Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
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sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
46
Merci de votre participation
Temps
drsquoeacutechange
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19
20
Programme de la formation
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
Crsquoest quoi
LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques
Ccedila sert agrave quoi
Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux
Comment
Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute
Qui doit inteacutegrer cette terminologie
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM
codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21
22
Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute
Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)
Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)
Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H
Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses
Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)
Technique (type of method)
Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee
Exemple
53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL
AnalyteCode LOINC Grandeur
Temporaliteacute
Milieu Eacutechelle Technique
5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
23
Ensembles drsquoobservations regroupeacutees
par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip
par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA
par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
24
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
25
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
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20rsquo
10rsquo
5rsquo
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En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
29
bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
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20rsquo
10rsquo
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La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
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Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
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5rsquo
15rsquo
SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
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94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
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Questionnaire de satisfaction
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2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
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MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
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Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
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Ressources disponibles
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du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
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Programme de la formation
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
10rsquo
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2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
Crsquoest quoi
LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques
Ccedila sert agrave quoi
Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux
Comment
Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute
Qui doit inteacutegrer cette terminologie
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM
codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21
22
Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute
Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)
Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)
Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H
Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses
Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)
Technique (type of method)
Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee
Exemple
53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL
AnalyteCode LOINC Grandeur
Temporaliteacute
Milieu Eacutechelle Technique
5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
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Ensembles drsquoobservations regroupeacutees
par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip
par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA
par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
24
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
25
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
26
En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
29
bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
32
33
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
34
La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
39
40
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
42
POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
45
Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
46
Merci de votre participation
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
Crsquoest quoi
LOINC (Logical Observation Names and Codes) est la terminologie de santeacute internationale et commune utiliseacuteepour coder les analyses de biologieCrsquoest donc un langage qui a pour vocation drsquoecirctre compris par tous les systegravemes informatiques
Ccedila sert agrave quoi
Faciliter les eacutechanges de reacutesultats de biologie (interopeacuterabiliteacute) Permettre la demande drsquoexamens de biologie agrave partir de mecircmes codes Permettre la structuration des dossiers meacutedicaux
Comment
Les codes LOINC sont veacutehiculeacutes dans le corps drsquoun compte rendu de biologie meacutedicale seulement au formatCDAR2 N3 (Clinical Document Architecture) Le CDAR2 N3 remplace le format HPRIM meacutedecin 30 qui nrsquoest plusmaintenu par InteroprsquoSanteacute
Qui doit inteacutegrer cette terminologie
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes par les biologistes dans leurs logiciels (SIL) Les codes LOINC doivent eacutegalement ecirctre impleacutementeacutes dans les LGC pour permettre la compreacutehension des CRBM
codeacutes avec LOINCCette terminologie est maintenue par le Regenstrief Institute et est disponible sur le site httpsloincorg Unenouvelle version est publieacutee tous les six mois21
22
Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute
Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)
Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)
Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H
Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses
Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)
Technique (type of method)
Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee
Exemple
53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL
AnalyteCode LOINC Grandeur
Temporaliteacute
Milieu Eacutechelle Technique
5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
23
Ensembles drsquoobservations regroupeacutees
par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip
par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA
par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
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2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
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20rsquo
10rsquo
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En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
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bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
29
bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
32
33
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
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La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
39
40
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
42
POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
45
Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
46
Merci de votre participation
22
Un libelleacute complet correspondant agrave la concateacutenation de six axes pour deacutecrire ce qui est mesureacute
Analyte et paramegravetre (component) Ce qui est mesureacute eacutevalueacute ou observeacute (calcium ioniseacute ajusteacute pH 74)
Grandeur (kind of property) Caracteacuteristiques de ce qui est mesureacute (masse substance nombre)
Temporaliteacute (time aspect) Moment ou intervalle de temps de lrsquoobservation ou de la mesure PT (ponctuel) 24H
Milieu (system) Milieu drsquoexeacutecution des analyses
Echelle (type of scale) Echelle de mesure QN (quantitative) ORD (ordinale)
Technique (type of method)
Remarque lrsquouniteacute nrsquoest pas preacuteciseacutee
Exemple
53531-0Albumine [MasseVolume] Urine Numeacuterique Limite de deacutetectionlt=10mgL
AnalyteCode LOINC Grandeur
Temporaliteacute
Milieu Eacutechelle Technique
5 chiffres (seacutequentiel) + 1 caractegravere controcircle
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
23
Ensembles drsquoobservations regroupeacutees
par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip
par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA
par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
24
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
25
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
26
En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
29
bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
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33
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
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20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
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La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
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4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
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Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
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4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
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SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
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94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
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MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
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Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
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Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
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Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
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esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
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Ensembles drsquoobservations regroupeacutees
par chapitresAntibiogramme allergie Biochimie Heacutematologiecytologie Radiologie Cardiologie pneumologieQuestionnaires documents administratifshellip
par panelsPanels servant agrave la prescription panels servant agrave regrouper des reacutesultats drsquoanalyses dossier patientstructureacute CDA
par groupesRegroupement de codes LOINC en vue de la structuration des donneacutees pour un entrepocirct de donneacuteesde santeacute agrave des fins eacutepideacutemiologiques
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
24
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
25
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
26
En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
29
bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
32
33
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
34
La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
39
40
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
42
POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
45
Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
46
Merci de votre participation
1 Le LOINC international
2 Le jeu de valeurs LOINC biologie Franccedilais
3 Le jeu de valeurs ldquoCircuit de la biologierdquo
Terminologie maintenue par le Regenstrief Institute La version actuelle est la V269 Elle contient 91 177 codes actifs
Il correspond agrave la traduction franccedilaise drsquoune seacutelection de la terminologie LOINC (chapitrescorrespondant aux examens de biologie pour lexpression des reacutesultats dans un contenu meacutedicaldeacutemateacuterialiseacute en France)
La version actuelle est la V215 pour la version 269 (LOINC international) Elle contient 55 192 codes dont 53 133 codes actifs Alignement LOINC - Nomenclature des actes de Biologie meacutedicale (NABM) 783 codes
NABM ont un alignement avec LOINC
Crsquoest le jeu de valeurs de reacutefeacuterence agrave utiliser par les biologistes Il est composeacute des codes pour lesanalyses les plus freacutequences en France correspondant agrave 80 90 de lrsquoactiviteacute de biologie meacutedicalede ville (des codes pour les laquo demandes raquo les plus freacutequentes et des codes pour les laquo reacutesultats raquo les plusfreacutequents)
La version actuelle de ce jeu de valeurs est la V1115 Elle contient 1510 codes demandes et 5526 codes reacutesultats
91 177 codes
55 192
codes
5526
codes
24
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationaleLOINC en France
25
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
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20rsquo
10rsquo
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En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
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bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
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bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
32
33
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
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La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
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4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
39
40
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
42
POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
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Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
46
Merci de votre participation
25
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
26
En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
drsquoexamens donneacutee parmi les codes LOINC du jeu de valeurs de reacutefeacuterence- agrave la description des informations cliniques indispensables pour certains examens de biologie
meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
29
bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
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33
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
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La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
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Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
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5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
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POUR ALLER
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des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
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En compleacutement du jeu de valeurs LOINC de reacutefeacuterence lrsquoANS met agrave disposition des eacutediteurs de SGL de LGC des LBMet des prescripteurs le jeu de valeurs circuit de biologie
Les objectifs de ce jeu de valeurs sont de
bull Coder de maniegravere homogegravene et interopeacuterable les demandes et reacutesultats drsquoexamens de biologie gracircce - au choix du ou des codes LOINC des codes de reacutesultats les plus pertinents pour une demande
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meacutedicale- agrave la preacuteconisation drsquoune uniteacute du Systegraveme International comme uniteacute principal pour chaque reacutesultat- agrave la deacutefinition de regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats drsquoexamen de biologie agrave suivre par un
prescripteur lorsque les reacutesultats proviennent de diffeacuterents laboratoires de biologie meacutedicale baseacuteessur le code LOINC et le code technique drsquoanalyse
- agrave la preacuteconisation de libelleacute drsquoeacutedition pour un code de reacutesultats drsquoexamen donneacute
bull Anticiper la deacutemateacuterialisation de la prescription (codification en LOINC de la prescription nature depreacutelegravevementhellip)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo A quoi sert le jeu de valeurs
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bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
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Niveau
minimum
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Techniqu
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ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
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29
bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
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20rsquo
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15rsquo
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La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
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Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
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Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
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Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
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4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
39
40
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
42
POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
45
Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
46
Merci de votre participation
27
bull Le jeu de valeurs est diviseacute en 3 parties
1 NABMRIHN (Codes NABMRIHN adapteacutes aux reacutesultats)
2 Prescription (libelleacutes de prescription synonymes Codes LOINC de prescription nature de preacutelegravevement renseignementscliniques (liste de choix proposeacutee) Serait une base de deacutepart pour les travaux sur la e-prescription
3 Reacutesultats (Chapitre Codes LOINC de reacutesultats drsquoexamens Libelleacutes drsquoeacutedition Uniteacute recommandeacutee)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Structure du jeu de valeurs
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
29
bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
32
33
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
34
La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
39
40
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
42
POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
45
Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
46
Merci de votre participation
28
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo La gestion du jeu de valeurs
bull Une version tous les 6 mois Date de validation + VP accompagneacutee drsquoune note de version explicative agrave chaque publication
bull Gestion des modifications mineures (libelleacute drsquoeacutedition uniteacutes) Version de lrsquoitem corrigeacute
bull Gestion des modifications de code LOINC (fermeture LOINC ou ANS) Version de lrsquoitem corrigeacute + Date de retrait ANS + remplaceacute par Ajout drsquoune ligne suppleacutementaire avec le nouveau code LOINC
LOINC Libelleacutes franccedilais de reacutefeacuterenceLibelleacutes
deacutedition
Niveau
minimum
de
comparab
iliteacute
Techniqu
e
discrimin
ante ON
Uniteacute
recommand
eacutee
Uniteacute
UCUM
Preacutesenc
e
systeacutema
CR
ON
Date de
validatio
n
Version
VP
Statu
t
Versio
n de
litem
corrigeacute
Date de
retrait
ASIP
Remplac
eacute par
60474-
4
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique Comptage
automate
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N
150720
17 V115
Inact
if
ASIP
V111
0
15012
019 14196-0
14196-
0
Reacuteticulocytes
[NombreVolume] Sang
Numeacuterique
Reacuteticulocyt
es1 N 109L 109L N 150120
19 V1110 Actif
29
bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
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33
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
34
La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
39
40
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
42
POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
45
Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
46
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29
bull Que propose LOINC 2 codes pour 2 grandeurs bull Ex massevolume et quantiteacute de matiegravere () volume ( uniteacute SI associeacutee mole)
14749-6 Glucose [MolesVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (mmolL) (UI)
2345-7 Glucose [MasseVolume] SeacuterumPlasma Numeacuterique (gL)
bull Que permet le compte-rendu CI-SIS bull 1 code LOINC pour lrsquouniteacute principale associeacutee agrave une uniteacute secondaire
bull Que contient le JDV laquo Circuit de biologie raquo bull Les codes LOINC ayant pour grandeur la correspondance agrave lrsquouniteacute internationale uniteacute principale du compte
rendu de biologie conforme au CI-SISbull Recommandations eacutemises sur les uniteacutes agrave utiliser pour le code LOINC proposeacute eacuteviter les diffeacuterences de
deacutecimalesbull Exception pour la Pharmacologie consensus national en masseVolumebull Exception pour quelques paramegravetres (Glucose cholesteacuterolhellip) 2 codes LOINC sont proposeacutes pour tenir
compte des pratiques actuellesbull Des regravegles de comparabiliteacute des reacutesultats avec un niveau minimum de comparabiliteacute (au code LOINC = 1
Code LOINC insuffisant = 2 technique deacutependante) (oui non)
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Uniteacutes principales et uniteacutes secondaires Comparabiliteacute
30
Navigation dans les concepts
du jeu de valeurs
Teacuteleacutechargement
en format XLS
Le portail bioloincfr permet de teacuteleacutecharger le jeu de valeurs
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
1 Srsquoidentifier sur le portail bioloincfr
2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
Proposer31
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquoAide meacutetier et fonctionnel au transcodage LOINC
Srsquoabonner agrave la newsletter (+-)
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
32
33
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
34
La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
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Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
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1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
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20rsquo
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Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
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0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
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1
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3
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MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
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biologie
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8
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du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
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du jeu de valeurs
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3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo Comment acceacuteder aux jeux de valeurs
Le site permet de soumettre des questions des demandes agrave propos de la LOINC du jeu de valeurshellip
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2 Seacutelectionner le jeu de valeurs LOINC ou le jeu
de valeurs circuit de biologie et cliquer sur
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1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
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La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
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4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
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Alors je lrsquoimpleacutemente dans
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Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
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1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
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Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
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Web
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1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
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Programme de la formation
10rsquo
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Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
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POUR ALLER
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Questionnaire de satisfaction
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1
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2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
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lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
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8
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sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
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Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
permettent cette gestion
httpsmssantefrlbmsil
Le biologiste doit reacutealiser le
transcodage entre ses codes
drsquoanalyses internes et la nomenclature
LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
39
40
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
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0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
42
POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
45
Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
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1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
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Le SIL doit assurer la gestion de
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LOINC
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biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
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LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
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fait par un
industriel
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biologiste
21
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LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
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biologiste
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de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
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trouveacute
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Bonne pratique
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interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
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Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
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1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
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Programme de la formation
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La mise en œuvre de la terminologie LOINC repose sur 3 preacuterequis
Le SIL doit assurer la gestion de
plusieurs catalogues drsquoexamens et la
correspondance sur ces catalogues
Pour en savoir plus sur les SIL qui
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Le biologiste doit reacutealiser le
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LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
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Tacircche approximativement de 4 jours en
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Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
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manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
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laboratoire
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Transcodage
manuel par le
biologiste
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Code
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Alors je lrsquoimpleacutemente dans
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Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
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1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
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1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
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LOINC
Le jeu de valeurs laquo circuit de la
biologie raquo permet drsquoaller agrave lrsquoessentiel
Gestion et mise agrave jour du jeu de valeurs
et de son alignement avec le catalogue
degraves la sortie drsquoune nouvelle version
Tacircche approximativement de 4 jours en
temps plein pour un biologiste (REX)
Des regravegles de gestion de la
comparabiliteacute doivent ecirctre deacutefinies
Choix des codes LOINC avec ou
sans technique renseigneacutee
Choix drsquoutiliser un mecircme code
LOINC pour plusieurs techniques
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCPreacuterequis agrave la mise en œuvre du LOINC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCComment reacutealiser le transcodage LOINC
Transcodage
fait par un
industriel
Transcodage
manuel par le
biologiste
21
Description de la meacutethode
Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
eacutediteur de SIL qui propose des solutions semi-automatiques de
transcodage des catalogues drsquoanalyses internes en LOINC
Comment la mettre en œuvre
Faire appel agrave un des industriels connus
Description de la meacutethode
Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
de seacutelection de chapitres LOINC
transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
(page suivante)
35
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCTranscodage manuel fait par le biologiste ndash Mode opeacuteratoire
1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
3
4
4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
augmenteacute
Web httpsmedicusail
pagescolingua
Contact
francemedicusai
Opeacuterateur
drsquointeropeacuterabiliteacute
Web httpwwwphastf
rciolab
Conseil en
biologie meacutedicale
Contact
philippechatrongmail
com
C2Bio
Intelligence
Artificielle (IA)
Web
httpsonaoscomsolutions
Contact
Guilhemmayoralonaosc
om
namratapatelonaoscom
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
39
40
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
94
50
0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
42
POUR ALLER
PLUS LOINhellip
Ressources disponibles
Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
Merci drsquoavance pour vos retours
45
Ressources disponibles
1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
questionssfilassofr
4Pour mieux connaitre les offres techniques
MSSanteacute httpsmssantefretsoffres
5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
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Transcodage
fait par un
industriel
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biologiste
21
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Le laboratoire peut faire appel agrave un industriel autre que son
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Faire appel agrave un des industriels connus
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Le biologiste reacutealise manuellement lui-mecircme le transcodage en
LOINC de son catalogue interne drsquoanalyses
2 faccedilons de proceacuteder
transcodage par chapitre LOINC transcodage suivant un ordre
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transcodage par identification des examens les plus freacutequents
transcodage par examens les plus freacutequents reacutealiseacutes dans le
laboratoire
Comment la mettre en œuvre
Mode opeacuteratoire agrave suivre commun aux 2 possibiliteacutes
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1
Transcodage
manuel par le
biologiste
Reacutecupeacuteration de la derniegravere
version du jeu de valeurs
laquo circuit de la biologie raquo sur le
site Bioloincfr
Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je demande lrsquoajout du code
sur le site Bioloincfr36
1
2
3
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4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
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Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
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drsquointeropeacuterabiliteacute
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Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
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Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
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15rsquo
SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
50
0-6
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0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
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POUR ALLER
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Questionnaire de satisfaction
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des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
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biologiste
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Je cherche mon code dans le jeu
de valeurs en veacuterifiant bien
lrsquouniteacute
Code
trouveacute
Alors je lrsquoimpleacutemente dans
mon systegraveme
Code Interne lt=gt Code Loinc
Je recherche mon code dans
un plus grand JDV le
laquo LOINC Franccedilais raquo
Code
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Code Interne lt=gt Code Loinc
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1
2
3
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4
JDV = Jeu de valeurs
Bonne pratique
Une regravegle est agrave respecter le code LOINC identifieacute doit ecirctre coheacuterent avec le code
interne en termes drsquoanalyte de grandeur de temporaliteacute milieu eacutechelle et de
technique
Oui
Non
Oui
Non
37
Les codes LOINC doivent ecirctre impleacutementeacutes agrave la fois dans les SIL pour produire des CRBM en LOINC mais eacutegalementdans les LGC afin de pourvoir
Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
Reconnaissance des codes LOINCidentiques
Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
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meacutedicale ndash IA
Web
httpsbiologbookfrtran
scodification-loinc
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drsquointeropeacuterabiliteacute
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biologie meacutedicale
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Intelligence
Artificielle (IA)
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Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
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1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
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5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
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Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
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0-6
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0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
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42
POUR ALLER
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o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
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Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
3
Pour en savoir plus sur la SFIL httpswwwsfilassofr
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4Pour mieux connaitre les offres techniques
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5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
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7
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8
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Interpreacuteter les donneacutees des CRBM reccedilus en LOINC
Reacutealiser des prescriptions de biologie avec les codes LOINC
Comparabiliteacute des reacutesultats Un reacutesultat porteacute par un mecircme code LOINC nrsquoest pas forceacutement comparable agrave lui-mecircme si la techniquede dosage est diffeacuterente
Le flux de reacutesultat est porteur drsquoun code LOINC associeacute agrave un libelleacute des uniteacutes une technique et des valeurs de reacutefeacuterence
Arriveacutee du reacutesultatAvec des codes LOINC
Possibiliteacute 1
Preacute-transcodage Associer un code ouplusieurs codes LOINC agrave chaque libelleacute dudictionnaire de LGC Si plusieurs codespossibles (deux uniteacutes deux techniques)donner la possibiliteacute de recevoir un deces codes
Possibiliteacute 2
Arriveacutee du flux
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Post-transcodage Inteacutegrer le codeLOINC Associer le libelleacute entrant aulibelleacute du LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCMeacutethode de transcodage pour les LGC
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
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3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
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Programme de la formation
10rsquo
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15rsquo
SIDEP
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Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
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94762-294762-2
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POUR ALLER
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5Pour tout savoir sur LOINC httpsbioloincfrbioloincKB 6
Pour se former aux enjeux de
lrsquointeropeacuterabiliteacute
Outils de tests compte rendu drsquoexamen de
biologie
httpsesantegouvfrannexe-outil-de-verification-des-
documents-cda
7
Pour nous contacter ans-mssantelaboratoiresesantegouvfr
8
Pour tout savoir sur le programme HOPrsquoEN httpssolidarites-santegouvfrsysteme-de-sante-et-medico-sociale-
santesihhopen
Pour tout savoir sur lrsquoAvenant 10 sur la biologie
preacutevoyant un financement inheacuterent au DMP httpswwwlegifrancegouvfraffichTextedocidTexte=JORFTEXT000038935
163ampcategorieLien=id
9
10
Ressources disponibles
esantegouvfrLe portail pour acceacuteder agrave lrsquoensemble
des services et produits de lrsquoagence
du numeacuterique en santeacute et srsquoinformer
sur lrsquoactualiteacute de la e-santeacute
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4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINCLes prestations drsquoaide au transcodage
5 prestations industrielles connues agrave ce jour bull Elles proposent une solution de transcodage pour les laboratoires gracircce agrave des algorithmes apprenantsbull Les industriels utilisent le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
Des formations GRATUITES sont organiseacutees par la SFIL et lrsquoANS bull Orienteacutees sur lrsquoapplication sur le terrain elles incluent des deacutemonstrations drsquoaide au transcodage LOINC bull Inscriptions et informations compleacutementaires httpssfilassofrformations
38
Aide agrave la deacutecision
meacutedicale ndash IA
Web
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Contact
contactbiologbookfr
Compte rendu
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Web httpsmedicusail
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biologie meacutedicale
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Intelligence
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4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
Le transcodage en pratique deacutemonstration dans Odancio
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40
Dans quel contexte
1 Interopeacuterabiliteacute et structuration des donneacutees
2 LOINC une terminologie de reacutefeacuterence internationale
3 Le jeu de valeurs laquo circuit de la biologie raquo
4 Transcodage dudes catalogue(s) interne(s) en LOINC
5 Exemple drsquoapplication
Programme de la formation
10rsquo
15rsquo
20rsquo
10rsquo
5rsquo
15rsquo
SIDEP
41
Remonteacutee des reacutesultats de tests de deacutepistage du SARS-CoV-2 des laboratoires de biologie meacutedicale vers le systegraveme drsquoinformation de deacutepistage (SIDEP) de Santeacute publique France exemples de codes drsquoanalyse LOINC utiliseacutes dans SI-DEP (liste complegravete sur le site bioloincfr)
Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
94
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0-6
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0-6
94762-294762-2
5 Exemple drsquoapplicationCas drsquousage Projet SI-DEP
Temps
drsquoeacutechange
Posez-nous vos questions
42
POUR ALLER
PLUS LOINhellip
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Questionnaire de satisfaction
Afin de continuellement ameacuteliorer nos formations pouvez-vous prendre quelques minutes pour reacutepondre agrave notre questionnaire de satisfaction srsquoil vous plait
o Le lien vers le questionnaire vient drsquoecirctre ajouteacute dans la conversation
o httpsformsgleg8tWgVQFvstKvZby9
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1
Pour en savoir plus sur lrsquoANS httpsesantegouvfr
Pour en savoir plus sur MSSanteacute httpsmssantefrhome
2 Pour acceacuteder agrave lrsquoannuaire MSSanteacute httpsannuairesantefr
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Utilisation des mecircmes codes par tous
Deacutepistage SARS COV-2 par RT-PCR Deacutetection de lrsquoADN 94500-6
Deacutepistage seacuterologiqueAnticorps Totaux 94762-2IgG 94563-4IgM 94564-2
P = positif N = neacutegatif I = indeacutetermineacute
X = preacutelegravevement non conforme
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