Post on 08-Jan-2016
description
Strukturen af transkriptionsaktivatorer1) DNA bindende domæne
2) Transkriptionsaktiverende domæne
3) Eventuelt et dimeriseringsdomæne
DNA bindende domæner1) Zink indeholdende faktorer
2) Homeodomæner
3) basiske leucin zippers
4) basiske helix-loop-helix
Transkriptionsaktiverende domæne1) Sure aminosyrer
2) Glutamin rigt domæne
3) Prolin rigt domæne
Zink finger struktur
-helix-loop--strand
to histidiner i -helix
to cysteiner i -sheet
aminosyrer i -helix kontakter DNA i major groove
Gal4p eksempel på en zink holdig transkriptionsfaktor uden fingerstruktur
zink koordineres af 6 cysteiner
kort helix genkender DNA target
binder i major groove
Kernereceptorer har zinkioner, der er koordineret af fire cysteiner
Homeodomæner indeholder helix-turn-helix strukturer
Homeobox domæner
helix turn helix
Den ene helix genkender major groove i DNAet
bZIP, basisk leucin zipper
dimeriserer via leucin resterne og binde DNA i major groove via basiske aminosyrer
Basisk helix-loop-helix protein
Rekrutering af RNA polymerase holoenzymet til promotoren
Eukaryote transkriptionsfaktorer stimulerer binding af generelle transkriptionsfaktorer og RNA polymerasen til promotorer. Hvordan ?
Hvilke dele af det generelle transkriptionsapparat der interagerer med en transkriptionsaktivator kan bestemmes ved et pull-down eksperiment
eller 2-hybrid analyse
Assay til bestemmelse af generelle transkriptionsfaktorer, der interagerer med det sure transkriptionsaktiverende domæne af GAL4