Post on 12-Dec-2015
description
ENZIMEnzim adalah katalisator biologis (biokatalisator) : mempercepat reaksi kimia dalam sel hidup tanpa ikut bereaksiEnzim = Protein– Enzim adalah protein aktif. – Terdiri atas 100 – 2500 asam amino.– Sifat-sifat enzim = sifat-sifat protein
Enzim merupakan holoenzim, terdiri atas :– Apoenzim : bagian protein dari enzim yang
tidak aktif– Kofaktor : komponen non-protein untuk
aktivitas enzim. Macam :1. Koenzim : molekul organik2. Ion logam
Komponen Enzim
Enzim adalah Protein Polipetida-polipeptida saja : Chymotrypsin,
Pankreatik ribonuklease Protein + non Protein : Sebagia besar enzim
Molekul organik (Koenzim) Protein inaktif + Kofaktor (Apoenzim)
Ion logam
ENZIM Protein aktif (Holoenzim)
CONTOH Zn SEBAGAI ION LOGAM
Zn
Sisi aktif enzim
Sisi aktif mengandung ion logam seperti Zn, Fe, dan Cu, serta koenzim
STRUKTUR 3-DIMENSI ENZIM
E.C. Nymber: 3.2.1.21
Oligomerik Unit Octamer
No of residues 448
Contoh Lysozyme
Senyawa yang dapat mempercepat reaksi kimia Biokatalisator
ENZIM : E + S ES E + P
Tetap tidak berubah diakhir reaksi Sangat efektif dalam jumlah sedikit Tidak dapat merubah produk akhir Tidak merubah posisi kesetimbangan Dipengaruhi pH, inhibitor, aktivator Mengalami denaturasi pada suhu tinggi Sangat Spesifik
Sifat Reaksi Enzim:
SPESIFISITAS ENZIM
Enzim bekerja secara spesifik
Substrat dan Enzim harus cocok
HIPOTESIS “LOCK and KEY”
RG: Reacting group; BG: Binding group; BS: Binding site; CS: Catalytic site
Substrat Enzim Kompleks ES
SPESIFISITAS ENZIM
HIPOTESIS “INDUCED-FIT”
RG: Reacting group; BG: Binding group; BS: Binding site; CS: Catalytic site
Substrat Enzim Kompleks ES
SPESIFISITAS ENZIM
HIPOTESIS “INDUCED-FIT”
RG: Reacting group; BG: Binding group; BS: Binding site; CS: Catalytic site
Mirip substrat
Non-productive interaction
Cara lama (nama trivial) :• Akhiran “in”
substrat atau asal enzim diberi akhiran in misal : pepsin, papain, tripsin, dll
• Akhiran “ase”substrat atau macam reaksi diberi akhiran asemisal :– laktase (mengkatalisa laktosa menjadi glukosa dan
galaktosa); – fumarase (mengkatalisa fumarat dan air menjadi
malat)– laktat dehidrogenase (mengkatalisa dehidrogenasi
laktat menjadi piruvat)
Cara Baru (nama sistimatik) :• Tahun 1955 dalam International Union of
Biochemistry, komosi enzim menyusun penamaan enzim, setiap enzim diberi nomer E.C. (Enzyme Commission)
• Misal laktat dehidrogenase (nama trivial)atau L-laktat:NAD+ oksidoreduktase EC. 1.1.1.27– Nomor I : Kelompok enzim/ tipe reaksi– Nomor II : Sub- kelompok enzim, substrat atau
ikatan yang dipotong, misal donor elektron (u/ enzim oksidoreduktase)
– Nomor III : Sub-sub-kelompok enzim, jenis reaksi yang lebih detil, koenzim yang diperlukan, substrat, misal aseptor elektron (u/ enzim oksidoreduktase)
– Nomor IV : nomor seri dalam sub-kelompok enzim
Kelompok enzim: 6 kelompok besar :1. Oksido-reduktase : mengkatalisa reaksi oksido-
reduktasi 2. Transferase : mengkatalisa reaksi transfer
gugus3. Hidolase : mengkatalisa reaksi hidrolitik4. Liase : mengkatalisa reaksi penghilangan gugus
sehingga terbentuk ikatan rangkap5. Isomerase, mengkatalisa reaksi isomerasi6. Ligase (sintetase), mengkatalisa reaksi
penggabungan 2 molekul dengan melibatkan sumber energi (biasanya ATP)
• Kelompok I : OKSIDOREDUKTASEmisal : laktat dehidrogenase (E.C 1.1.1.27)nama lengkap : L-laktat-NAD oksidoreduktase– Laktat berfungsi sebagai donor elektron– NAD berfungsi sebagai aseptor elektron– Reaksi : laktat + NAD piruvat + NADH
• Kelompok II : TRANSFERASEmisal : heksokinase (E.C 2.7.1.1)nama lengkap : D-heksosa 6-phosphat transferase– ATP sebagai donor phosphat– D-heksosa sebagai aseptor phosphat dan
ditransfer ke atom C no-6 dari heksosa– Reaksi : ATP + D-heksosa ADP + D-heksosa 6-P
• Kelompok III : HIDROLASEmisal : adenosin triphosphatase (E.C 3.6.1.3)nama lengkap : ATP phospho-hidrolase– ATP sebagai substrat, dihidrolisa sehingga
melepaskan ortho-phosphate– Reaksi : ATP + H2O ADP + orhtophosphat
• Kelompok IV : LIASEmisal : fruktosa-biphosphat aldolase (E.C 4.1.2.13)nama lengkap : D-fruktosa 1,6 biphosphat D-gliseraldehid 3-phosphat liase– D-fruktosa 1,6 biphosphat sebagai substrat– D-gliseraldehid 3-P sebagai produk– Reaksi : D-Fruktosa 1,6 di-P
D-gliseraldehid 3-P + dihidroksiaseton-P
• Kelompok V : ISOMERASEmisal : triose-phosphat isomerase (E.C 5.3.1.1)nama lengkap : D-gliseraldehid 3-phospho ketol-isomerase– D-gliseraldehid 3-P (aldosa) diisomerasi menjadi
ketosa (dihidroksiaseton-phosphat)– Reaksi : D-gliseraldehid 3-P dihidroksiaseton-P
• Kelompok VI : LIGASEmisal : isoleusil-t-RNA-seintetase (E.C 6.1.1.5)nama lengkap : L-isoleusin : t-RNA ligase– L-isoleusin berikatan dengan aseptor spesifik t-
RNA, pada proses ini ATP terurai menjadi AMP dan piro-phosphat
– Reaksi : ATP + L-isoleusin + t-RNA AMP + pirophosphat + L-isoleusil-t-RNA