Elurikkuse informaatika ja arusaam liikidest 200 aastat pärast Darwini sündi

Charles Darwin

Urmas KõljalgTartu Ülikool

27 veebruar 2009

Nature 2009

Transmutation Notebook (juuli 1837 - märts 1838) esimene teadaolev evolutsoonipuu ülesjoonistus kus näidatakse organismirühmade vahelist sugulust.

Elurikkuse informaatika

- EI tegeleb üksikindiviidi, populatsiooni, taksoni ja nendevaheliste suhete kohta käiva informatsiooni kogumise, talletamise, toimetamise, otsimise ning analüüsiga.;

Elurikkuse informaatika

- EI hõlmab erinevates uurimisvaldkondades loodud informatsiooni: (molekulaarne) süstemaatika, evolutsioonibioloogia, populatsioonibioloogia, käitumisteadused, sünökoloogia jm.;

Elurikkuse informaatika

- EI on osa bioloogilisest informaatikast, mis asetseb keskkonnainformaatika ja bioinformaatika (genoomika ja proteoomika) vahel ning kattub nendega osaliselt. EI moodustab bioloogiateaduste üldise infosüsteemi skeleti.

Nature 2009

DNA triipkood: uus metoodika, mis kasutab kokkulepitud nn. standardgeeni lühikest DNA järjestust liikide molekulaarseks määramiseks.

DNA triipkood (DNA barcoding)

Liikide määramiseks mõeldud uus globaalne standard.

DNA triipkood

The Consortium for the Barcode of Life (CBOL) - rahvusvaheline initsiatiiv liikide määramiseks mõeldud globaalse standardi arendamiseks.

http://www.barcoding.si.edu/

DNA triipkood

The European Consortium for the Barcode of Life (ECBOL) - rahvusvaheline initsiatiiv liikide määramiseks mõeldud globaalse standardi arendamiseks.

http://www.ecbol.org/

DNA triipkood

Hydnum rufescens

Tomentella coerulea

1 cm

Tomentella botryoides

1 cm

ECM

Tomentella lilacinogrisea

ECM

Tomentellopsis submollis

Soovide nimekiri

Kõik andmed andmebaasisKõik andmed ja anlüüsid veebipõhisel töölaual

Origin of Species

“No one definition has as yet satisfied all naturalists; yet every naturalist knows vaguely what he means when he speaks of a species.”

tänusõnad

kessylehotriinirjasergeimohammad

iTOL

charles