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・本パンフレットで紹介した製品はすべて研究用として販売しております。ヒト、動物への医療、臨床診断用には使用しないようご注意ください。また、食品、化粧品、家庭用品等として使用しないでください。・タカラバイオの承認を得ずに製品の再販・譲渡、再販・譲渡のための改変、商用製品の製造に使用することは禁止されています。 ・ライセンス情報については弊社ウェブサイトにてご確認ください。 ・本パンフレットに記載された社名および製品名は、特に記載がなくても各社の商標または登録商標です。 ・本パンフレット記載の価格は2019年7月1日現在の希望小売価格です。価格に消費税は含まれておりません。
2019年7月作成18K
東京支店 TEL 03-3271-8553 FAX 03-3271-7282関西支店 TEL 077-565-6969 FAX 077-565-6995
テクニカルサポートライン TEL 077-565-6999 FAX 077-565-6995Website http://www.takara-bio.co.jpFacebook http://www.facebook.com/takarabio.jp
取扱店
本パンフレットに掲載した製品はMACHEREY-NAGEL(マッハライ・ナーゲル)社の製品です。MN
DNA/RNA Clean-upガイド
PCR産物もゲルからのDNA抽出も単一のキットで精製
◆ スピンカラムで迅速精製 NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up / Midi / Maxi
ゲノムDNAもtotal RNAもシリカカラムで簡便に再精製
◆ 長鎖のDNAも簡便に精製 NucleoSpin® gDNA Clean-up / XS◆ フェノール抽出後、酵素処理後のRNAを簡単精製 NucleoSpin® RNA Clean-up / XS / Maxi
DNAのサイズ分画を容易に実現
◆ 磁性ビーズを用いたキットで多検体対応も容易 NucleoMag® NGS Clean-up and Size Select
スピンカラムによる迅速・確実なクリーンアップ
www.mn-net.comMACHEREY-NAGEL
| DNA/RNA Clean-upガイド -2--1- | DNA/RNA Clean-upガイド
pH indicatorによる溶解後のサンプル状態の確認
MACHEREY-NAGEL社 DNA/RNAクリーンアップキット選択ガイド
NucleoSpin® Gel and PCRClean-upの操作フロー
NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up
共通のバッファーでPCR産物の精製にもアガロースゲルからの回収にも対応
● 操作時間はわずか10分、最小溶出量は15 μl ● プライマーを効率よく除去、50 bp以上のDNA断片を回収● 主要な電気泳動用バッファー(TAE、TBEなど)に対応 ● pH indicatorにより、至適pHを色で確認可能● 精製DNAはクローニング、シーケンス、NGSに使用可能● 追加Bufferを使用することでssDNA、RNAの精製も可能
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別)
NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up 10回 50回250回150 ml100 ml
740609.10740609.50740609.250740595.150740654.100
¥5,300 ¥13,000 ¥47,500 ¥6,600¥7,500
Buffer NTBBuffer NTC
NucleoSpin Gel and PCR Clean-upのカラムは、pH5~6でもっともよくDNAを結合できる。PCR反応液またはゲルとBinding Buffer NTIを混合した溶液のpHがこの範囲から外れた場合は、回収量の低下が起こる可能性がある。Binding Buffer NTIにはpH indicatorが含まれているため、溶液の色によって至適pHかどうかをチェックできる。至適pHでない場合、溶液が黄色になるまでBuffer NTIまたは4M酢酸ナトリウム(NaAc, pH5.0)または少量のHClを加えることで、DNAのより確実な回収を行うことが可能である。
サンプルのpHが至適
サンプルのpHが少し高い
サンプルのpHが高い
pH調整が必要
結合
溶出
洗浄
PCR反応液 アガロースゲル
目的は? サンプルは? 手法・処理量
手法
処理量
お勧めはこれ!
NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up
NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up Maxi
NucleoTraP®CR
NucleoSpin® 8/96 PCR Clean-up
NucleoMag® 96 PCR
NucleoFast® 96 PCR
NucleoTrap®
NucleoMag® NGS Clean-up and Size Select
NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up Midiスピンカラム
HTP: 磁性ビーズ
HTP: 限外ろ過
シリカビーズ(バッチ)
磁性ビーズ
シリカビーズ(バッチ)
HTP: 吸引 or 遠心分離
・PCR反応液・アガロースゲル
NucleoSpin® RNA Clean-up
NucleoSpin® RNA Clean-up XS
NucleoSpin® RNA Clean-up Maxi
・PCR反応液
・アガロースゲル
・ライブラリー作製途中の反応液
NGSライブラリーの精製、サイズ分画
NucleoSEQ®ゲルろ過・シーケンス反応液ダイターミネーターの除去
PCRクリーンアップ
~200 μg RNA
~90 μg RNA
~35 mg RNA
・粗抽出RNA溶液・反応液
NucleoSpin® gDNA Clean-up XS
NucleoSpin® gDNA Clean-up
~2 μg DNA
~25 μg DNA
・粗抽出ゲノム DNA溶液
・反応液
ゲノムDNA精製クリーンアップ
RNAクリーンアップ
| DNA/RNA Clean-upガイド -2--1- | DNA/RNA Clean-upガイド
pH indicatorによる溶解後のサンプル状態の確認
MACHEREY-NAGEL社 DNA/RNAクリーンアップキット選択ガイド
NucleoSpin® Gel and PCRClean-upの操作フロー
NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up
共通のバッファーでPCR産物の精製にもアガロースゲルからの回収にも対応
● 操作時間はわずか10分、最小溶出量は15 μl ● プライマーを効率よく除去、50 bp以上のDNA断片を回収● 主要な電気泳動用バッファー(TAE、TBEなど)に対応 ● pH indicatorにより、至適pHを色で確認可能● 精製DNAはクローニング、シーケンス、NGSに使用可能● 追加Bufferを使用することでssDNA、RNAの精製も可能
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別)
NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up 10回 50回250回150 ml100 ml
740609.10740609.50740609.250740595.150740654.100
¥5,300 ¥13,000 ¥47,500 ¥6,600¥7,500
Buffer NTBBuffer NTC
NucleoSpin Gel and PCR Clean-upのカラムは、pH5~6でもっともよくDNAを結合できる。PCR反応液またはゲルとBinding Buffer NTIを混合した溶液のpHがこの範囲から外れた場合は、回収量の低下が起こる可能性がある。Binding Buffer NTIにはpH indicatorが含まれているため、溶液の色によって至適pHかどうかをチェックできる。至適pHでない場合、溶液が黄色になるまでBuffer NTIまたは4M酢酸ナトリウム(NaAc, pH5.0)または少量のHClを加えることで、DNAのより確実な回収を行うことが可能である。
サンプルのpHが至適
サンプルのpHが少し高い
サンプルのpHが高い
pH調整が必要
結合
溶出
洗浄
PCR反応液 アガロースゲル
目的は? サンプルは? 手法・処理量
手法
処理量
お勧めはこれ!
NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up
NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up Maxi
NucleoTraP®CR
NucleoSpin® 8/96 PCR Clean-up
NucleoMag® 96 PCR
NucleoFast® 96 PCR
NucleoTrap®
NucleoMag® NGS Clean-up and Size Select
NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up Midiスピンカラム
HTP: 磁性ビーズ
HTP: 限外ろ過
シリカビーズ(バッチ)
磁性ビーズ
シリカビーズ(バッチ)
HTP: 吸引 or 遠心分離
・PCR反応液・アガロースゲル
NucleoSpin® RNA Clean-up
NucleoSpin® RNA Clean-up XS
NucleoSpin® RNA Clean-up Maxi
・PCR反応液
・アガロースゲル
・ライブラリー作製途中の反応液
NGSライブラリーの精製、サイズ分画
NucleoSEQ®ゲルろ過・シーケンス反応液ダイターミネーターの除去
PCRクリーンアップ
~200 μg RNA
~90 μg RNA
~35 mg RNA
・粗抽出RNA溶液・反応液
NucleoSpin® gDNA Clean-up XS
NucleoSpin® gDNA Clean-up
~2 μg DNA
~25 μg DNA
・粗抽出ゲノム DNA溶液
・反応液
ゲノムDNA精製クリーンアップ
RNAクリーンアップ
原理、形状 シリカメンブレン法、ミニスピンカラム
サンプル量 <400 μl PCR反応液<400 mg TAE/TBEアガロースゲル
精製サイズ 50 bp~約20 kb
回収量 70~95%
A260/280 1.8~1.9
溶出液量 15~30 μl
精製時間 10分
結合容量 25 μg
注:SDSを含む試料からの精製にはBuff er NTBが必要です。ssDNA、アガロースゲルからのRNA精製にはBuff er NTCが必要です。
■製品仕様
http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100006678
| DNA/RNA Clean-upガイド -4--3- | DNA/RNA Clean-upガイド
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別)
バッチ法でのアガロースゲルからのDNA抽出
● カラムを用いないバッチ法でアガロースゲルから効率よくDNAを回収
● 非常に短いDNA(≧20 bp)に対しても高い結合能力● 長鎖DNA断片も切断や分解を起こしにくい精製法
大容量DNA断片を1カラム精製
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別)
NucleoTrap®10回
100回1 ml(100回)
740584.10740584740589
¥4,800¥20,000¥17,000
NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up Midi / Maxi NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up Midi / Maxi NucleoTrap®NucleoTrap®
NucleoTraP®CRNucleoTraP®CR
● 1種類のバッファーでPCR産物の精製にもアガロースゲルからの抽出にも対応● 大容量の反応液、アガロースゲルから1本のカラムでDNA精製● Binding BufferにpH indicatorを含む● 主要な電気泳動用バッファー(TAE、TBEなど)に対応● 一本鎖DNAやSDSを含むサンプルからも精製可能
NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up MidiによるPrimerの除去
252 bp、164 bp、100 bpおよび65 bpのPCR増幅DNAにプライマーを添加した後、NucleoSpin Gel and PCR Clean-up Midiで精製した。Elution Buffer 400 μl で溶出した後、精製前(レーン1)と精製後(レーン2)のサンプルを2%アガロースゲル電気泳動した。NucleoSpin Gel and PCR Clean-up Midiで精製することにより、プライマーが除去できていることがわかる。
NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up Midi / Maxiの操作フロー NucleoTrap® suspension
NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up MidiNucleoSpin® Gel and PCR Clean-up Maxi
20回20回
740986.20740610.20
¥32,000¥48,000
NucleoTrap®の操作フロー
NucleoTraP®CRの操作フロー
バッチ法でのPCR産物の精製
● シリカマトリックスによるPCR反応液からのDNA精製 ● ≧120 bpのDNA断片に対して高い回収率● プライマー、プライマーダイマーの除去
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別)
10回100回
740587.10740587
¥5,300¥30,000
NucleoTraP®CR
アガロースゲル
または
PCR反応液 結合 洗浄 溶出
Buffer NTI を加えた後、溶液が黄色の時はカラムへアプライ可能。緑や青色の時は、pH を調整した後アプライする。
結合(バッチ法)
洗浄
PCR反応液
溶出
結合(バッチ法)
洗浄
アガロースゲル
溶出
M
1 2
1 21 2
1 2
NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up Midi NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up Maxi原理 シリカメンブレン法、ミニスピンカラム
形状 Midiスピンカラム Maxiスピンカラム
サンプル量 <4 ml PCR反応液<4 g TAE/TBEアガロースゲル<10 ml PCR反応液
<10 g TAE/TBEアガロースゲル
精製サイズ 50 bp~約20 kb
回収量 70~95%
A260/280 1.75~1.85
溶出液量 200~400 μl 1,000 μl
精製時間 25分 30分
結合容量 75 μg 250 μg
■製品仕様
http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100009350
| DNA/RNA Clean-upガイド -4--3- | DNA/RNA Clean-upガイド
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別)
バッチ法でのアガロースゲルからのDNA抽出
● カラムを用いないバッチ法でアガロースゲルから効率よくDNAを回収
● 非常に短いDNA(≧20 bp)に対しても高い結合能力● 長鎖DNA断片も切断や分解を起こしにくい精製法
大容量DNA断片を1カラム精製
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別)
NucleoTrap®10回
100回1 ml(100回)
740584.10740584740589
¥4,800¥20,000¥17,000
NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up Midi / Maxi NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up Midi / Maxi NucleoTrap®NucleoTrap®
NucleoTraP®CRNucleoTraP®CR
● 1種類のバッファーでPCR産物の精製にもアガロースゲルからの抽出にも対応● 大容量の反応液、アガロースゲルから1本のカラムでDNA精製● Binding BufferにpH indicatorを含む● 主要な電気泳動用バッファー(TAE、TBEなど)に対応● 一本鎖DNAやSDSを含むサンプルからも精製可能
NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up MidiによるPrimerの除去
252 bp、164 bp、100 bpおよび65 bpのPCR増幅DNAにプライマーを添加した後、NucleoSpin Gel and PCR Clean-up Midiで精製した。Elution Buffer 400 μl で溶出した後、精製前(レーン1)と精製後(レーン2)のサンプルを2%アガロースゲル電気泳動した。NucleoSpin Gel and PCR Clean-up Midiで精製することにより、プライマーが除去できていることがわかる。
NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up Midi / Maxiの操作フロー NucleoTrap® suspension
NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up MidiNucleoSpin® Gel and PCR Clean-up Maxi
20回20回
740986.20740610.20
¥32,000¥48,000
NucleoTrap®の操作フロー
NucleoTraP®CRの操作フロー
バッチ法でのPCR産物の精製
● シリカマトリックスによるPCR反応液からのDNA精製 ● ≧120 bpのDNA断片に対して高い回収率● プライマー、プライマーダイマーの除去
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別)
10回100回
740587.10740587
¥5,300¥30,000
NucleoTraP®CR
アガロースゲル
または
PCR反応液 結合 洗浄 溶出
Buffer NTI を加えた後、溶液が黄色の時はカラムへアプライ可能。緑や青色の時は、pH を調整した後アプライする。
結合(バッチ法)
洗浄
PCR反応液
溶出
結合(バッチ法)
洗浄
アガロースゲル
溶出
M
1 2
1 21 2
1 2
原理、形状 シリカマトリックス法、シリカビーズ懸濁液
サンプル量 <200 mg アガロースゲル
精製サイズ 20 bp~50 kb
回収量 50~90%
A260/280 1.7~1.9
溶出液量 20~50 μl
精製時間 60分
結合容量 6 μg/10 μl 懸濁液
原理、形状 シリカマトリックス法、シリカビーズ懸濁液
サンプル量 20~400 μl PCR反応液
精製サイズ 100 bp~50 kb
回収量 70~80%
A260/280 1.7~1.9
溶出液量 20~50 μl
精製時間 45分
結合容量 6 μg/10 μl 懸濁液
■製品仕様
■製品仕様
http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100006683http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100006684
| DNA/RNA Clean-upガイド -6--5- | DNA/RNA Clean-upガイド
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別)
NucleoMag® NGS Clean-up and Size Select5 ml
50 ml500 ml
744970.5744970.50744970.500
¥15,000¥68,000
¥520,000
NucleoMag® NGS Clean-up and Size Selectを用いて作製したNGSライブラリー
断片化DNAのサイズ分画
大腸菌ゲノムDNAをサンプルに、TruSeq DNA PCR Free kit(Illumina社)を用いてNGS用ライブラリーを作製した。その際、DNA精製とサイズ分画は、A社磁性ビーズ(赤)、B社磁性ビーズ(青)、NucleoMag NGS Clean-up and Size Select(緑)を使用した。図Aは、精製前の断片化E. coli DNA
(1 μg)を示す。図Bは、ライブラリー調製後のDNA断片の分布を示す。作製されたライブラリーを用いて実際に塩基配列解析を行った。塩基配列解析はTruSeq Rapid SBS Kit(Illumina社)を用いて、HiSeq 2500で解析を行った。 得られた塩基配列を大腸菌ゲノムにマッピングを行い、各塩基の解析数(depth)を比較した(図C)。3種の磁性ビーズでグラフの形状はほぼ一致しており、ゲノム全体で解析結果に差は見られなかった。 (弊社取得データ)
マウスのゲノムDNAを断片化し、NucleoMag NGS Clean-up and Size Selectを用いて2つの条件でサイズ分画を行った。
緑:精製前の断片化DNA赤:混合比率0.6と0.4で2回のサイズ分画を行った結果(平均460 bp)青:混合比率0.8と0.55で2回のサイズ分画を行った結果(平均340 bp)
DNA断片のサイズ選択
試料と磁性ビーズ溶液の混合比を変化させることで、結合できるDNA断片の大きさが変わる。この混合比を調整することで、目的の大きさのDNA断片を精製できる。
NGSライブラリーの精製、サイズ分画に
NucleoMag® NGS Clean-up and Size SelectNucleoMag® NGS Clean-up and Size Select● 磁性ビーズの使用により、1本のチューブ内で精製可能 ● 150~800 bpのサイズ分画が可能● 少量(17.5 pg)サンプルから利用可能● 手動と自動化装置のどちらにも対応
限外ろ過法によるPCR産物のハイスループット精製
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別)
NucleoSEQ® 10回50回
250回
740523.10740523.50740523.250
¥5,300¥18,700¥78,000
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別)
NucleoFast® 96 PCR Plates
96 well×496 well×1096 well×50
743500.4743500.10743500.50
¥68,000¥76,000
¥300,000
NucleoFast® 96 PCRNucleoFast® 96 PCR● 丈夫な限外ろ過膜の使用によりDNAの回収が容易● ウェル間のコンタミネーションを低減 ● 精製DNAはシーケンスやマイクロアレイスポッティングに
利用可能● 手動または自動化装置による
ハイスループット精製
スピンカラムを用いたダイターミネーター除去
NucleoSEQ®NucleoSEQ®● エタノール沈殿操作なしで、ダイター
ミネーター(BigDye terminatorなど)を効果的に除去
● 便利なスピンカラムタイプ● 室温での長期保存が可能
NucleoSEQ®により精製した試料の塩基配列解析
NucleoSpin Plasmid (製品コード 740588.10)を用いて精製したプラスミドを、ABI PRISM BigDye Terminator Cycle Sequencing kitでシーケンス反応を行い、NucleoSEQで精製した。ABI 310 sequencerで解析したところ、良好な解析データが得られた。
NucleoFast® 96 PCR Clean-up Kit
NucleoFast® 96 PCRの操作フロー
A CB
吸引 or 遠心分離
吸引 or 遠心分離
フィルトレーション
回収
洗浄(オプション)
NucleoFast 96 PCR Plate
PCR反応液
0
10,000
20,000
30,000
0 200 400 600 800
Freq
uenc
y
Insert Size (bp)
35
300
250
200
150
100
50
0
100 200 300 400 500 700 2000 10380
Targetregion size
Higher cut-offLower cut-off
原理、形状 限外ろ過法、96ウェルプレート
操作 手動または自動化装置、吸引または遠心分離
サンプル量 20~300 μl PCR反応液
精製サイズ ≧150 bp
回収率 40~95%
A260/280 1.7~1.8
溶出液量 25~100 μl
精製時間 20分(PCR反応液 25 μlの場合)
原理、形状 ゲルろ過法、ミニスピンカラム
サンプル量 20 μl シーケンス反応液
精製時間 5分(ゲルの膨潤時間は含まない)
■製品仕様
■製品仕様
http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100006673http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100006675
| DNA/RNA Clean-upガイド -6--5- | DNA/RNA Clean-upガイド
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別)
NucleoMag® NGS Clean-up and Size Select5 ml
50 ml500 ml
744970.5744970.50744970.500
¥15,000¥68,000
¥520,000
NucleoMag® NGS Clean-up and Size Selectを用いて作製したNGSライブラリー
断片化DNAのサイズ分画
大腸菌ゲノムDNAをサンプルに、TruSeq DNA PCR Free kit(Illumina社)を用いてNGS用ライブラリーを作製した。その際、DNA精製とサイズ分画は、A社磁性ビーズ(赤)、B社磁性ビーズ(青)、NucleoMag NGS Clean-up and Size Select(緑)を使用した。図Aは、精製前の断片化E. coli DNA
(1 μg)を示す。図Bは、ライブラリー調製後のDNA断片の分布を示す。作製されたライブラリーを用いて実際に塩基配列解析を行った。塩基配列解析はTruSeq Rapid SBS Kit(Illumina社)を用いて、HiSeq 2500で解析を行った。 得られた塩基配列を大腸菌ゲノムにマッピングを行い、各塩基の解析数(depth)を比較した(図C)。3種の磁性ビーズでグラフの形状はほぼ一致しており、ゲノム全体で解析結果に差は見られなかった。 (弊社取得データ)
マウスのゲノムDNAを断片化し、NucleoMag NGS Clean-up and Size Selectを用いて2つの条件でサイズ分画を行った。
緑:精製前の断片化DNA赤:混合比率0.6と0.4で2回のサイズ分画を行った結果(平均460 bp)青:混合比率0.8と0.55で2回のサイズ分画を行った結果(平均340 bp)
DNA断片のサイズ選択
試料と磁性ビーズ溶液の混合比を変化させることで、結合できるDNA断片の大きさが変わる。この混合比を調整することで、目的の大きさのDNA断片を精製できる。
NGSライブラリーの精製、サイズ分画に
NucleoMag® NGS Clean-up and Size SelectNucleoMag® NGS Clean-up and Size Select● 磁性ビーズの使用により、1本のチューブ内で精製可能 ● 150~800 bpのサイズ分画が可能● 少量(17.5 pg)サンプルから利用可能● 手動と自動化装置のどちらにも対応
限外ろ過法によるPCR産物のハイスループット精製
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別)
NucleoSEQ® 10回50回
250回
740523.10740523.50740523.250
¥5,300¥18,700¥78,000
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別)
NucleoFast® 96 PCR Plates
96 well×496 well×1096 well×50
743500.4743500.10743500.50
¥68,000¥76,000
¥300,000
NucleoFast® 96 PCRNucleoFast® 96 PCR● 丈夫な限外ろ過膜の使用によりDNAの回収が容易● ウェル間のコンタミネーションを低減 ● 精製DNAはシーケンスやマイクロアレイスポッティングに
利用可能● 手動または自動化装置による
ハイスループット精製
スピンカラムを用いたダイターミネーター除去
NucleoSEQ®NucleoSEQ®● エタノール沈殿操作なしで、ダイター
ミネーター(BigDye terminatorなど)を効果的に除去
● 便利なスピンカラムタイプ● 室温での長期保存が可能
NucleoSEQ®により精製した試料の塩基配列解析
NucleoSpin Plasmid (製品コード 740588.10)を用いて精製したプラスミドを、ABI PRISM BigDye Terminator Cycle Sequencing kitでシーケンス反応を行い、NucleoSEQで精製した。ABI 310 sequencerで解析したところ、良好な解析データが得られた。
NucleoFast® 96 PCR Clean-up Kit
NucleoFast® 96 PCRの操作フロー
A CB
吸引 or 遠心分離
吸引 or 遠心分離
フィルトレーション
回収
洗浄(オプション)
NucleoFast 96 PCR Plate
PCR反応液
0
10,000
20,000
30,000
0 200 400 600 800
Freq
uenc
y
Insert Size (bp)
35
300
250
200
150
100
50
0
100 200 300 400 500 700 2000 10380
Targetregion size
Higher cut-offLower cut-off
原理、形状 磁性ビーズ法、高反応性超常磁性ビーズ
操作 手動または自動化装置
サンプル量 NGSライブラリーの作製途中の反応液50~150 μl(17.5 pg~5 μg)
回収量 >80%
回収液量 10~100 μl
■製品仕様
http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100009048
| DNA/RNA Clean-upガイド -8--7- | DNA/RNA Clean-upガイド
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別)
NucleoSpin® RNA Clean-up XS10回50回
250回
740903.10740903.50740903.250
¥8,500 ¥38,000
¥170,000
粗抽出RNAの再精製
XSカラムのリング構造は、小径のシリカ膜をもつ特殊構造により、効果的に少量RNAを結合させ、さらに5~30 μlという非常に少量の液量で溶出できる。
RNA 100 ngを、XSカラムおよびMiniカラムを用いて再精製を行い、その回収率を比較した。XSカラムでは5μlの溶出液量でも80%の回収率を示し、高濃度での溶出が可能であることが分かった。
DNAを含む粗抽出RNA溶液 100 μlをDNaseで処理し、NucleoSpin RNA Clean-up XSで再精製した。20 μlで溶出したのち、各RNAの品質をアジレント社のバイオアナライザーで確認した。
粗抽出RNAは、濃度が85 ng/μl、RIN値は9.4であったが、再精製後は濃度404 ng/μl、RIN値は9.7に上昇した。
この結果、NucleoSpin RNA Clean-up XSを使用することで、5倍近くの濃縮を行うことができた。DNAの除去もでき、RIN値も上昇したことから、高品質のRNA溶液を得ることができた。
XSカラムによる微量溶出
RNAのクリーンアップと濃縮
NucleoSpin® RNA Clean-up XSNucleoSpin® RNA Clean-up XS● 抽出RNA、増幅RNA、ラベリングRNA、DNase処理RNAのクリーンアップ、濃縮に XSスピンカラムによる迅速な操作で、~90 μg RNAを精製・濃縮● RT-PCR阻害物質を完全除去● 300 μlまでのRNA溶液を処理でき、わずか5 μlで溶出可能なため、最大55倍の濃縮を実現
抽出RNA、標識RNAのクリーンアップ
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別)
NucleoSpin® RNA Clean-up10回50回
250回
740948.10740948.50740948.250
¥6,000¥29,000
¥127,000
NucleoSpin® RNA Clean-upNucleoSpin® RNA Clean-up● RT-PCR阻害物質を完全に除去して高純度RNAを調製● スピンカラムへの結合、洗浄、溶出の簡単な操作でRNA
を再精製● フェノール・クロロホルム抽出RNA、増幅RNA、
ラベリングRNA、DNase処理後のクリーンアップに● 培養細胞からのRNA精製にも利用可能
大容量RNAサンプルを再精製
NucleoSpin® RNA Clean-up MaxiNucleoSpin® RNA Clean-up Maxi● 35 mgまでのRNAをクリーンアップ● RT-PCR阻害物質を完全に除去して高純度RNAを調製
NucleoSpin® RNAClean-upの操作フロー
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別)
NucleoSpin® RNA Clean-up Maxi 20回 740910.20 ¥52,000
サンプル抽出RNA、反応液など
結合
洗浄
溶出(40~120 μl)
[ ]
L: RNA marker1: 粗抽出RNA2: 再精製RNA
L 1 2
100
80
60
40
20
00 10 20 30
Elution volume [μl]
NucleoSpin RNA XS Clean-upNucleoSpin RNA Clean-up
RNA
revo
very
[ %]
40 50 60
原理、形状 シリカメンブレン法、Maxiスピンカラム
サンプル量 ~35 mg RNA
精製サイズ >200 bases
回収率 >85%
A260/280 1.9~2.1
溶出液量 3~5 ml
精製時間 30分
結合容量 35 mg
■製品仕様
原理、形状 シリカメンブレン法、ミニスピンカラム
サンプル量 ≦200 μl フェノール/クロロホルム抽出液、反応液105個 培養細胞
精製サイズ >200 bases
回収率 85~95%
A260/280 1.9~2.1
溶出液量 40~120 μl
精製時間 20分
結合容量 200 μg
■製品仕様
http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100006703http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100009394
| DNA/RNA Clean-upガイド -8--7- | DNA/RNA Clean-upガイド
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別)
NucleoSpin® RNA Clean-up XS10回50回
250回
740903.10740903.50740903.250
¥8,500 ¥38,000
¥170,000
粗抽出RNAの再精製
XSカラムのリング構造は、小径のシリカ膜をもつ特殊構造により、効果的に少量RNAを結合させ、さらに5~30 μlという非常に少量の液量で溶出できる。
RNA 100 ngを、XSカラムおよびMiniカラムを用いて再精製を行い、その回収率を比較した。XSカラムでは5μlの溶出液量でも80%の回収率を示し、高濃度での溶出が可能であることが分かった。
DNAを含む粗抽出RNA溶液 100 μlをDNaseで処理し、NucleoSpin RNA Clean-up XSで再精製した。20 μlで溶出したのち、各RNAの品質をアジレント社のバイオアナライザーで確認した。
粗抽出RNAは、濃度が85 ng/μl、RIN値は9.4であったが、再精製後は濃度404 ng/μl、RIN値は9.7に上昇した。
この結果、NucleoSpin RNA Clean-up XSを使用することで、5倍近くの濃縮を行うことができた。DNAの除去もでき、RIN値も上昇したことから、高品質のRNA溶液を得ることができた。
XSカラムによる微量溶出
RNAのクリーンアップと濃縮
NucleoSpin® RNA Clean-up XSNucleoSpin® RNA Clean-up XS● 抽出RNA、増幅RNA、ラベリングRNA、DNase処理RNAのクリーンアップ、濃縮に XSスピンカラムによる迅速な操作で、~90 μg RNAを精製・濃縮● RT-PCR阻害物質を完全除去● 300 μlまでのRNA溶液を処理でき、わずか5 μlで溶出可能なため、最大55倍の濃縮を実現
抽出RNA、標識RNAのクリーンアップ
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別)
NucleoSpin® RNA Clean-up10回50回
250回
740948.10740948.50740948.250
¥6,000¥29,000
¥127,000
NucleoSpin® RNA Clean-upNucleoSpin® RNA Clean-up● RT-PCR阻害物質を完全に除去して高純度RNAを調製● スピンカラムへの結合、洗浄、溶出の簡単な操作でRNA
を再精製● フェノール・クロロホルム抽出RNA、増幅RNA、
ラベリングRNA、DNase処理後のクリーンアップに● 培養細胞からのRNA精製にも利用可能
大容量RNAサンプルを再精製
NucleoSpin® RNA Clean-up MaxiNucleoSpin® RNA Clean-up Maxi● 35 mgまでのRNAをクリーンアップ● RT-PCR阻害物質を完全に除去して高純度RNAを調製
NucleoSpin® RNAClean-upの操作フロー
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別)
NucleoSpin® RNA Clean-up Maxi 20回 740910.20 ¥52,000
サンプル抽出RNA、反応液など
結合
洗浄
溶出(40~120 μl)
[ ]
L: RNA marker1: 粗抽出RNA2: 再精製RNA
L 1 2
100
80
60
40
20
00 10 20 30
Elution volume [μl]
NucleoSpin RNA XS Clean-upNucleoSpin RNA Clean-up
RNA
revo
very
[ %]
40 50 60
原理、形状 シリカメンブレン法、XSスピンカラム
サンプル量 ≦300 μl 反応液(≦90 μg RNA)
精製サイズ >200 bases
回収率 85~95%
A260/280 1.9~2.1
溶出液量 5~30 μl
精製時間 20分
結合容量 110 μg
■製品仕様
http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100006698
| DNA/RNA Clean-upガイド -10--9- | DNA/RNA Clean-upガイド
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別)
NucleoSpin® gDNA Clean-up XS10回50回
250回
740904.10740904.50740904.250
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード
NucleoSpin® gDNA Clean-up10回50回
250回
740230.10740230.50740230.250
¥5,800¥15,000¥58,000
価格(税別)¥5,400
¥14,500¥55,000
フェノールを含んだDNA溶液の精製
DNA溶液 50 μlにQIAzolを1%となるように加えて、NucleoSpin gDNA Clean-upで精製した。溶出した50 μlの吸光度を測定し、その回収率と純度を検定した。A260/280が理想的な1.8に近い値となり、混入したフェノールが除去されていることが分かった。また、回収率は87%であった。
NucleoSpin® gDNA Clean-up XSで精製したDNAを用いたSTR解析
口腔スワブ(A)および精液痕(B)より有機溶剤を用いてDNAを抽出し、NucleoSpin gDNA Clean-up XSで精製した。精製DNAを用いてSTR解析を行ったところ、2つのパターンでよく一致しており、信頼性の高い結果が得られた。
フェノール、酵素、塩、dye、標識NTP、短鎖DNAおよび5%までの界面活性剤(例:SDS、Triton、Tween、Lauroylsarcosin)等の除去
長鎖DNAの再精製・濃縮
● ゲノムDNAなど長鎖DNAの効果的なクリーンアップおよび濃縮 精製DNAは、様々なアプリケーションに使用可能● ~90%の高いDNA回収率(100 bp~50 kb)● 微量透析法よりも迅速で簡便、操作時間は15分
NucleoSpin® gDNA Clean-upNucleoSpin® gDNA Clean-up
微量の長鎖DNAを効率よく再精製・濃縮
● ゲノムDNAなど長鎖DNAの効果的なクリーンアップおよび濃縮 精製DNAは、様々なアプリケーションに使用可能● 少量(>6 μl)で溶出可能なXSスピンカラムにより
高濃度DNAを溶出 法医学サンプルなどから抽出された微量DNAの再精製にも使用可能● 微量透析法よりも迅速で簡便、操作時間は20分
NucleoSpin® gDNA Clean-up XSNucleoSpin® gDNA Clean-up XS
NucleoSpin® gDNA Clean-upの操作フロー
NucleoSpin® gDNAClean-up XSの操作フロー
A B
結合 洗浄 溶出DNA溶液
サンプル水溶液
結合
洗浄
溶出
4.0
3.5
3.0
2.5
2.0
1.5
1.0
0.5
0.0MN-QIAzolMN+QIAzolInput -QIAzolInput + QIAzol
OD
※左からA228、A260、A280
原理、形状 シリカメンブレン法、ミニスピンカラム
サンプル量 <150 μl DNA水溶液(<25 μg DNA)
回収率 80~90%
精製サイズ 100 bp~約50 kb
A260/280 1.8~1.9
溶出液量 50~100 μl
精製時間 15分
結合容量 50 μg
■製品仕様
Input+QIAzol Input-QIAzol MN+QIAzol MN-QIAzol
Yield 2.38 2.38 2.08 2.09
A260/280 1.29 1.929 1.769 1.777
A260/228 0.84 1.952 1.957 2.043
Recovery[%] 100 100 87 88
Input+QIAzol : DNA溶液にQIAzolを1%加えたものInput-QIAzol : DNA溶液MN+QIAzol : QIAzol入りDNA溶液をNS gDNA Clean-upで精製MN-QIAzol : DNA溶液をNS gDNA Clean-upで精製
http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100006930
| DNA/RNA Clean-upガイド -10--9- | DNA/RNA Clean-upガイド
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別)
NucleoSpin® gDNA Clean-up XS10回50回
250回
740904.10740904.50740904.250
■製品リスト製 品 名 容 量 製品コード
NucleoSpin® gDNA Clean-up10回50回
250回
740230.10740230.50740230.250
¥5,800¥15,000¥58,000
価格(税別)¥5,400
¥14,500¥55,000
フェノールを含んだDNA溶液の精製
DNA溶液 50 μlにQIAzolを1%となるように加えて、NucleoSpin gDNA Clean-upで精製した。溶出した50 μlの吸光度を測定し、その回収率と純度を検定した。A260/280が理想的な1.8に近い値となり、混入したフェノールが除去されていることが分かった。また、回収率は87%であった。
NucleoSpin® gDNA Clean-up XSで精製したDNAを用いたSTR解析
口腔スワブ(A)および精液痕(B)より有機溶剤を用いてDNAを抽出し、NucleoSpin gDNA Clean-up XSで精製した。精製DNAを用いてSTR解析を行ったところ、2つのパターンでよく一致しており、信頼性の高い結果が得られた。
フェノール、酵素、塩、dye、標識NTP、短鎖DNAおよび5%までの界面活性剤(例:SDS、Triton、Tween、Lauroylsarcosin)等の除去
長鎖DNAの再精製・濃縮
● ゲノムDNAなど長鎖DNAの効果的なクリーンアップおよび濃縮 精製DNAは、様々なアプリケーションに使用可能● ~90%の高いDNA回収率(100 bp~50 kb)● 微量透析法よりも迅速で簡便、操作時間は15分
NucleoSpin® gDNA Clean-upNucleoSpin® gDNA Clean-up
微量の長鎖DNAを効率よく再精製・濃縮
● ゲノムDNAなど長鎖DNAの効果的なクリーンアップおよび濃縮 精製DNAは、様々なアプリケーションに使用可能● 少量(>6 μl)で溶出可能なXSスピンカラムにより
高濃度DNAを溶出 法医学サンプルなどから抽出された微量DNAの再精製にも使用可能● 微量透析法よりも迅速で簡便、操作時間は20分
NucleoSpin® gDNA Clean-up XSNucleoSpin® gDNA Clean-up XS
NucleoSpin® gDNA Clean-upの操作フロー
NucleoSpin® gDNAClean-up XSの操作フロー
A B
結合 洗浄 溶出DNA溶液
サンプル水溶液
結合
洗浄
溶出
4.0
3.5
3.0
2.5
2.0
1.5
1.0
0.5
0.0MN-QIAzolMN+QIAzolInput -QIAzolInput + QIAzol
OD
原理、形状 シリカメンブレン法、XSスピンカラム
サンプル量 <400 μl DNA水溶液(<2 μg DNA)
回収率 60~70%
精製サイズ 100 bp~約50 kb
A260/280 1.8~1.9
溶出液量 6~10 μl
精製時間 20分
結合容量 3 μg
■製品仕様
http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100006931
・本パンフレットで紹介した製品はすべて研究用として販売しております。ヒト、動物への医療、臨床診断用には使用しないようご注意ください。また、食品、化粧品、家庭用品等として使用しないでください。・タカラバイオの承認を得ずに製品の再販・譲渡、再販・譲渡のための改変、商用製品の製造に使用することは禁止されています。 ・ライセンス情報については弊社ウェブサイトにてご確認ください。 ・本パンフレットに記載された社名および製品名は、特に記載がなくても各社の商標または登録商標です。 ・本パンフレット記載の価格は2019年7月1日現在の希望小売価格です。価格に消費税は含まれておりません。
2019年7月作成18K
東京支店 TEL 03-3271-8553 FAX 03-3271-7282関西支店 TEL 077-565-6969 FAX 077-565-6995
テクニカルサポートライン TEL 077-565-6999 FAX 077-565-6995Website http://www.takara-bio.co.jpFacebook http://www.facebook.com/takarabio.jp
取扱店
本パンフレットに掲載した製品はMACHEREY-NAGEL(マッハライ・ナーゲル)社の製品です。MN
DNA/RNA Clean-upガイド
PCR産物もゲルからのDNA抽出も単一のキットで精製
◆ スピンカラムで迅速精製 NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up / Midi / Maxi
ゲノムDNAもtotal RNAもシリカカラムで簡便に再精製
◆ 長鎖のDNAも簡便に精製 NucleoSpin® gDNA Clean-up / XS◆ フェノール抽出後、酵素処理後のRNAを簡単精製 NucleoSpin® RNA Clean-up / XS / Maxi
DNAのサイズ分画を容易に実現
◆ 磁性ビーズを用いたキットで多検体対応も容易 NucleoMag® NGS Clean-up and Size Select
スピンカラムによる迅速・確実なクリーンアップ
www.mn-net.comMACHEREY-NAGEL
■Clean-up関連製品一覧製 品 名 容 量 製品コード 価格(税別)
PCR産物、アガロースゲルからのDNA精製
NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up10回 740609.10 ¥5,30050回 740609.50 ¥13,000250回 740609.250 ¥47,500
NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up Midi 20回 740986.20 ¥32,000NucleoSpin® Gel and PCR Clean-up Maxi 20回 740610.20 ¥48,000PCR産物の精製、シリカカラムによる多検体対応
NucleoSpin® 8 PCR Clean-up8 well×12 740668 ¥30,0008 well×60 740668.5 ¥120,000
NucleoSpin® 8 PCR Clean-up Core Kit 8 well×48 740463.4 ¥85,000
NucleoSpin® 96 PCR Clean-up
96 well×1 740658.1 ¥32,00096 well×2 740658.2 ¥56,00096 well×4 740658.4 ¥90,00096 well×24 740658.24 ¥360,000
NucleoSpin® 96 PCR Clean-up Core Kit 96 well×4 740464.4 ¥85,000PCR産物の精製、磁性ビーズによる多検体対応
NucleoMag® 96 PCR96 well×1 744100.1 ¥16,00096 well×4 744100.4 ¥56,00096 well×24 744100.24 ¥270,000
PCR産物の精製、限外ろ過による多検体対応NucleoFast® 96 PCR Clean-up Kit 96 well×4 743500.4 ¥68,000
NucleoFast® 96 PCR Plates96 well×10 743100.10 ¥76,00096 well×50 743100.50 ¥300,000
DNA断片のサイズ分画、磁性ビーズによる多検体対応
NucleoMag® NGS Clean-up and Size Select5 ml 744970.5 ¥15,00050 ml 744970.50 ¥68,000500 ml 744970.500 ¥520,000
PCR産物の精製、シリカビーズによるバッチ法
NucleoTraP®CR10回 740587.10 ¥5,300100回 740587 ¥30,000
アガロースゲルからのDNA精製、シリカビーズによるバッチ法
NucleoTrap® 10回 740584.10 ¥4,800100回 740584 ¥20,000
NucleoTrap® suspension 100回 740589 ¥17,000シーケンス反応の際のダイターミネーター除去
NucleoSEQ® 10回 740523.10 ¥5,30050回 740523.50 ¥18,700250回 740523.250 ¥78,000
長鎖DNAの精製
NucleoSpin® gDNA Clean-up10回 740230.10 ¥5,40050回 740230.50 ¥14,500250回 740230.250 ¥55,000
NucleoSpin® gDNA Clean-up XS10回 740904.10 ¥5,80050回 740904.50 ¥15,000250回 740904.250 ¥58,000
RNAクリーンアップ
NucleoSpin® RNA Clean-up10回 740948.10 ¥6,00050回 740948.50 ¥29,000250回 740948.250 ¥127,000
NucleoSpin® RNA Clean-up XS10回 740903.10 ¥8,50050回 740903.50 ¥38,000250回 740903.250 ¥170,000
NucleoSpin® RNA Clean-up Maxi 20回 740910.20 ¥52,000
http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100006678http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100009350http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100006676http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100006674http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100006673http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100009048http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100006684http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100006683http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100006675http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100006930http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100006931http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100006703http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100006698http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100009394